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Le Diagnostique Les Bacilles Gram Positifs Classification Aérobie et aérobie facultatif Bacillus Anaérobie stricte Clostridium Aérobie Listeria Sporulants Bacilles Gram Positifs Non-sporulants Caractéristiques des Bacilles Sporulants • Tous sont de gros bacilles Gram positifs • Font des endospores • Principalement retrouvés dans le sol, les eaux et la poussière • Exigences nutrionelles très diverses – Utilisent des sources de carbones simples et complexes – Leurs spores leurs permettent de résister à des conditions extrêmes Morphologies des Endospores • Position: – Terminale (a, d, e) – Subterminale (b) – Centrale (c, f). • Forme: – Circulaire (b, d) – Ellipsoïde (a, c, e, f) • Diamètre: – Non déformant (a, b, c) – Déformant (d, e, f). Les Bacilles d’Importance Médicale • Bacillus – Majoritairement inofensifs – Quelques espèces opportunistes • Bacillus cereus & Bacillus subtilis – Empoisonement alimentaire – Une espèce pathogène • Bacillus anthracis – Anthrax Aérobie et aérobie facultatif Bacillus Anaérobie stricte Clostridium Aérobie Listeria Sporulants Bacilles Gram Positifs Non-sporulants Les Bacilles d’Importance Médicale • Clostridium – Plusieurs espèces pathogènes • Clostridium perfringens – Gangrène gazeuse • Clostridium tetani – Tétanos • Clostridium botulinum – Botulisme • Clostridium difficile – Diarrhée prolonged contraction of skeletal muscle fibers, neurotoxin produced by the bacteria Canned food that has not been sterilized properly; paralytic illness Identification: Tests Métaboliques • Bouillon de phénol rouge – Métabolisme de sources de carbones simples – Source de carbone: • Peptone (protéine acides aminés) • Sucre désiré ajouté – Indicateur de pH • Phénol rouge – Jaune pH acide – Orange pH neutre – Rouge pH alcalin Bouillons de Phénols Rouges • Utilisation de Carbone: – Sucre • Réaction acide (Jaune) • ou neutre (Original) – Protéine • Réaction alcaline (Rouge) Fermentation du Glucose • Fermentation avec accumulation d’acide: – Glucose pyruvate acide lactique et/ou acétique + CO2 • Fermentation avec accumulation de produits neutres – Glucose pyruvate acétoine 2 butanediol + CO2 Test de Méthyl Rouge • Test pour l’accumulation d’acide – Sources de carbones: Glucose et protéines – Indicateur -méthyl rouge; Ajouté après • MR +: rouge (pH < 5.2) • MR - : jaune (pH > 5.2) Neutre Acide Test de Voges-Proskauer Réactifs VP: butanediol + -naphthol + KOH + O2 acétoine VP + = rouge VP - = jaune Résultats habituelle de MR/VP: MR+/VP-; MR-/VP+ MR-/VPAcide produite Pas Neutre d`acétoine Acétoine - + Utilisation d’Urée • Carbone: – Urée + protéin sur la plaque Négatif Positif • Enzyme – Uréase • Indicateur de pH H2 N H2 N – Phénol rouge (rose) C O + 2 H2O CO2 + H2O + 2 NH3 (NH4)2CO3 urée ammonium carbonate Acides aminés (alcalin) Utilisation du Carbone Complexe • Trop gros pour le transport à l’intérieur • Nécessite enzymes exocellulaires pour la dégradation externe en petites unités – Polysaccharides • Amidon (amylase) – Lipides (lipase) • Tributyrine – Protéines (protéase) • Caséine (caséinase) Amylase Avant l’ajout d’iode Après l’ajout d’iode Caséinase Lipase – Spirit Blue La Respiration Aérobie La Chaîne de Transport d’e2 H+ extérieur Fp 2 e- Fe-S 2 H+ intérieur 2 e- Q NADH + H+ FADH2 2 e- Cyt b 3 H+ + 3 OH- 2 e- H+ 2 H+ Cyt o 3 H2O 3 H+ + 1/2 O2 H2O Respiration aérobie: 1) Utilise l'oxygène comme capteur final d'e2) Cytochrome oxydase est impliqué Les bactéries peuvent effectuer la respiration aérobie? Test d’Oxydase phenylenediamine Doit avoir CTE et cytochrome oxydase. Tester pour la présence de cytochrome oxydase. • Cytochrome oxydase catalyse la réduction du capteur final d’e-, l’oxygène • Un donneur artificiel d’e-, la phenylenediamine, est utilisé pour réduire le cytochrome oxydase • Si l’enzyme est présente, le réactif incolore (état réduit) deviendra bleu (état oxydé) Bactéria devient bleu. Le média toujour devient bleu. Vivre dans la présence d'oxygène génére beaucoup de radicaux libres (p. ex. peroxydes). Catalase Catalase décompose le peroxyde en H2O + O2. Bactéries fait-il cela? On ajoute ça. 2H2O2 catalase Détecter les bulles. 2H2O + O2 Produit de la respiration dommageable pour l’ADN Ajout de 3% H2O2 à la croissance bactérienne Bulles (O2) Métabolisme d’aérobie requière la catalase Respiration Anaérobie 2 H+ 2 e- Extérieur Fp Fe-S 2 H+ Intérieur 2 e- Q NADH + H+ FADH2 2 e- Cyt b 2 H+ 3 H+ + 3 OH - 2 e- Nitrate réductase 3 H2O NO3- + 2 H+ (N = +5) nitrate Capteur final d’eNO2- + H2O (N = +3) nitrite Respiration anaérobie : 1) Utilise quelque chose (nitrate) autres que l'oxygène comme capteur final d'e2) Nitrate réductase est impliquée Nitrate Réductase NO3- + 2 H+ + 2 e- H2O + nitrate NO2- nitrite NO, N2O, NH2OH, NH3, N2 Étape 1: Test pour nitrite NO2- + acide sulfanilique et alpha naphthylamine HNO2 Nitrate est réduit Production de Nitrite Rouge Nitrate est réduit au nitrite Nitrite est réduit Absence de Nitrite Jaune Nitrate n’est pas réduit Absence de Nitrite Jaune Nitrate Réductase (suite) NO3- + 2 H+ + 2 e- H2O + nitrate NO2- nitrite NO, N2O, NH2OH, NH3, N2 Étape 2: Test pour présence du nitrate NO3- + Zn (s) NO2- Nitrate est présent Réduction au Nitrite Rouge Nitrate est absent Nitrite a été réduit Jaune Le Diagnostique Les Cocci Gram Positifs Classification Streptococcaceae Catalase - Aérobie & anaérobie facultatif Cocci Gram Positifs Streptococcus Micrococcus Micrococcaceae Catalase + Aérobie Staphylococcus C’est quoi le test de catalase? Caractéristiques des Cocci Gram Positifs • Tous sont non sporulants • Principalement retrouvés parmi la flore naturelle des hommes et des animaux • Exigences nutrionelles fastidieuses – Utilisent des sources de carbones simples Aggrégation Cellulaire des Cocci Gram Positifs Micrococcus & Streptococcus Streptococcus Micrococcus Staphylococcus Les Cocci Gram Positifs d’Importance Médicale • Micrococcaceae – Staphylococcus aureus • Cause plusieurs types d’infections, maladies alimentaires et choc toxique – Staphylococcus epidermidis • Cause des infections opportunistes – Staphylococcus saprophyticus • Cause majeure de cystites chez les femmes Les Cocci Gram Positifs d’Importance Médicale • Streptococcaceae – Streptococcus pyogenes • Pharyngite (strep throat) et infection à bactérie mangeuse de chair – Streptococcus agalactiae • Infections génitales – Streptococcus mutans • Endocardites – Streptococcus pneumonia • Otite, meningite et pneumonie – Enterococcus spp. • Infections opportunistes Identification: Tests Métaboliques • Microccocus Vs Staphylococcus • Test d’oxydase (cyto oxidase) – Micrococci sont + – Staphylococci sont – • Bacitracine (antibiotique) – Micrococci sont sensibles – Staphylococci sont résistants Streptococcus pyogenes (Pharyngite /strept throat) Test de sensibilité à la Bacitracin vs Streptococcus pneumoniae (pneumonie) Test de sensibilité à l`optochin Identification: Tests Métaboliques • Différentitation des espèces de Staphylococcus • Test de coagulase (agglomération de cocci) – Les staphylococci coagulase positifs » S. aureus – Staphylococci coagulase négatifs » Tous les autres Staphylococci • Fermentation du mannitol (géloses de mannitol + sels) – S. aureus et quelques S. saprophyticus sont positifs – S. epidermidis est negatif S. epidermidis S. aureus Identification: Tests Métaboliques • Différentiation des espèces de Streptoccocus • Regroupement sérologique de Lancefield – Fondé sur le type d’hydrate de carbone dans leur paroi » 8 groupes (A-H et K-U) » Groupe A: β-hémolytique - Streptococcus pyogenes » Groupe B: β-hémolytique - S. agalactiae » Groupe C: α ou γ hémolytique- S. viridans » Groupe D: γ –hémolytique – Enterococcus » Pas classifié d’après le regroupement de Lancefield » α hémolytique- S. pneumoniae et S. mutans Hémolyse Sanguine • Gélose de sang: – Discrimination d’après patrons d’hémolyses • Hémolyse alpha - Hémolyse incomplète • Hémolyse beta - Hémolyse complète • Hémolyse gamma - Aucune hémolyse Enzymes = Hémolysines Identification: Tests Métaboliques • Identification de Streptoccocus pneumoniae – Solubilisation par la bile • Strep. pneumoniae est positif • Autres Strep. sont négatifs • Identification d’Enterococcus – Test de bile-esculin • Enterococcus est positif • Autres Strep. sont négatifs