Letní semestr 2014 - modul 1 + 2 - Knihovna Univerzity Palackého v
Download
Report
Transcript Letní semestr 2014 - modul 1 + 2 - Knihovna Univerzity Palackého v
10-LBF/ZUB21 Programové vybavení ordinace zubního lékaře
Základní informační zdroje pro
zubní lékařství
Mgr. Jarmila Potomková, Ph.D.
[email protected]
Knihovna Lékařské fakulty
Ústav lékařské biofyziky
Univerzita Palackého v Olomouci
Poslední aktualizace LS 2014
Web: http://www.lf.upol.cz --- Knihovna - Vzdělávání
1
Vyhledávání stomatologických
informací na Internetu
Seminář a cvičení
2
Obsah
Modul 1
Internetové vyhledávače (search engines)
Modul 2
Oborové bibliografické a znalostní databáze
Bibliografické
Medline/PubMed
BMČ – Bibliographia Medica Čechoslovaca
Znalostní
Dynamed
Uptodate
3
Výzkumná otázka 1
Formulace
Jaká jsou rizika a možnosti prevence vzniku
zubního kazu u školních dětí?
Pro specifikaci dotazu využijte možnosti
vyhledávání v názvu dokumentu.
Maximální stáří dokumentu 10 let.
4
Výzkumná otázka 1
Terminologie
ANGLICKY
(Dental) caries
Dental/tooth/teeth decay
Dental/tooth/teeth cavity(-ies)
ČESKY
Zubní kaz
Karies
Caries
Prevence
Preventivní
Profylaxe
Profylaktický
Riziko, rizika
--------------------------Dítě, děti, pediatrický…
Prevent(ion)
Preventive
Prophylaxis
Prophylactic
Risk(s)
--------------------------Child(ren), pediatric, …..
5
Vyhledávací stroje (search engines)
Definice
Internetový vyhledávač. Wikipedia [online][cit.
28.1.2012]. Dostupné na World Wide Web:
<http://cs.wikipedia.org>
Služba, která umožňuje na Internetu najít webové stránky s požadovanou informací.
Uživatel zadává do rozhraní vyhledávače klíčová slova, která charakterizují
hledanou informaci, a vyhledávač obratem na základě své databáze vypisuje
seznam odkazů na stránky s hledanými informacemi.
text, obrázky nebo jiné typy multimediálních informací.
Databáze je udržována převážně automaticky.
Cílem vyhledávačů je poskytnout uživateli při odpovědi na dotaz co nejrelevantnější
informace, a proto různými způsoby hodnotí důležitost webových stránek (např.
PageRank).
6
Baker L. Comparison of the top three search engines: Bing,
Yahoo, Google?
Search Engine Journal Oct 11, 2011.
http://www.google.com
http://www.yahoo.com
http://www.bing.com
7
Internetové vyhledávače
Search Engines
Google
<http://www.google.com>
8
Google
Zadání 1 : dotaz v češtině : navigace
<http://www.google.com>
Pokročilé vyhledávání (přes Nastavení)
Všechna tato slova
zubní kaz děti
Kterékoliv z těchto slov
prevence profylaxe riziko
Jazyk
česky
Výskyt výrazů
kdekoliv na stránce
9
Google
Zadání 2 : dotaz v angličtině : navigace
<http://www.google.com>
Pokročilé vyhledávání (přes Nastavení)
Všechna tato slova
dental caries children
Kterékoliv z těchto slov
prevention prophylaxis risk
Jazyk
angličtina
Výskyt výrazů
(a) Kdekoli na stránce
(b) V názvu stránky
10
Google
Zadání 3 : kvantitativní a kvalitativní analýza
Kde se zobrazují vaše klíčová slova v angličtině - srovnání
(a) Kdekoliv - ??? záznamů
(b) V názvu stránky – ??? záznamů
Zařazení do kategorií:
Webové stránky
Informační portály zdravotnických zařízení
Pacientské portály
E-knihy (atlasy, manuály, lékařská repetitoria)
Odborné časopisy (obsahy s abstrakty, články)
Doporučené postupy
Odkazy na databáze
Populárně-vzdělávací časopisy, noviny
Další
Ověřujeme
Autorství
Aktuálnost
jsou uvedena jména autorů resp. organizace, která garantuje obsah webové stránky?
je uvedeno datum zveřejnění dokumentu? Je uvedeno datum poslední aktualizace webové
stránky?
Design studie v případě klinického výzkumu
11
Postoj EU ke kvalitě zdravotnických www stránek
eEurope 2002: Quality Criteria for Health Related
Websites
<http://www.jmir.org/2002/3/e15/>
Transparentnost obsahu, důvody pro zveřejnění, příp.
zdroje financování;
Autorství obsahu včetně citací použitých
informačních zdrojů;
Ochrana pacientských dat;
Aktualizace obsahu;
Zajištění validity a spolehlivosti informací;
Technické podmínky přístupu k informacím s ohledem na
cílovou skupinu.
12
Google
Zadání 4 : citování webových stránek
Úprava citací se řídí platnými normami.
ČSN ISO 690, akutalizace 2011
<http://www.citace.com/soubory/csniso690-interpretace.pdf>
Kapitola 3.11.1 – Elektronické informační zdroje
Struktura citace:
Jméno autora stránky (je-li uvedeno). Název stránky [online]. Datum publikování. Datum
poslední aktualizace [citováno dne …]<URL adresa stránky>
Příklad:
DAVIS, John. Ready to print organizer [online]. c1997, poslední revize
20.1.1998 [cit.1999-12-05]. Dostupné z <http://www.ilap.com/nsn>
13
Google
Zadání 5 : anatomie citace článku z časopisu
Jochen W. L. Cals, Marjolein J. C. Schot, Sanne A. M. de Jong,
Geert-Jan Dinant, and Rogier M. Hopstaken
Point-of-Care C-Reactive Protein Testing and Antibiotic
Prescribing for Respiratory Tract Infections: A Randomized
Controlled Trial
Ann Fam Med 2010 8:124-133; doi:10.1370/afm.1090
K diskuzi:
8 = označení svazku časopisu
DOI = digital object identifier
Randomized controlled trial ?
http://www.wikiskripta.eu
14
Pyramida (hierarchie) vědeckého
důkazu
Systematické
přehledy, meta-analýza
Randomizované
kontrolované pokusy
Kohortové studie
Studie případů a kontrol
Kazuistiky, série kazuistik
Odborné posudky, konzultace
Laboratorní výzkum
Pacienti jsou rozděleni náhodně
• skupina intervenční
• skupina kontrolní
• Intervence po určitou dobu
(zpravidla léčba 2 způsoby)
• Srovnání intervencí, vyhodnocení
účinku.
•
15
Internetové vyhledávače hlubokého
webu
Deep Web Search Engines
Google Scholar
Vyhledává jen časopisecké články
<http://www.scholar.google.com>
16
Google Scholar
Zadání 6 : dotaz v angličtině : navigace
<http://www.scholar.google.com>
Rozšířené vyhledávání
Se všemi slovy
dental caries children
Alespoň s jedním slovem
prevention prophylaxis risk
Jazyk
angličtina
Kde se vyskytnou slova
v názvu článku
Datum
2004-2014
17
Scholar Google
Zadání 7 : výsledky a získání vyhledaných dokumentů
Proveďte analýzu prvních 10 vyhledaných výsledků.
Všimněte si, že všechny patří do kategorie Odborné časopisy –
články.
Sledujte tyto parametry:
Název časopisu
Rok vydání
Dostupnost plného textu článku
Volně přístupný (free, open access)
Na základě předplatného (subscription, membership), institucionální licence,
jednorázového poplatku (pay-per-view)
Zdarma do úrovně citace+abstrakt
Typologii článku
Přehledový článek (review)
Původní práce (original paper) - většinou klinické studie
Randomizovaný kontrolovaný pokus
Úkol: najít článek v plném znění a poslat jeho citaci na
adresu: [email protected]
18
Scholar Google
Zadání 8 : citování článků z časopisů
Úprava citací se řídí platnými normami.
ČSN ISO 690, aktualizace 2011
http://www.citace.com/soubory/csniso690-interpretace.pdf
Praktické příklady
Struktura citace:
Autorství. Název článku. Název časopisu. Rok, ročník, číslo svazku, stránky.
Příklady:
VAN DER VET, P. E. – MARS, NJ. I. Condocet query engine: an engine for
coordinated index terms. Journal of the American society for information
science, 1999, vol. 42, no. 6, s. 485–492.
SMEJKAL, V. Proč nový zákon?. CHIP: magazín informačních technologií,
1999, roč. 9, č. 11, s. 54–55.
Jednotlivé odborné časopisy stanovují své požadavky na úpravu citací v
instrukcích pro autory.
19
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 8
Uveďte základní rozdíl mezi vyhledávacími stroji
Google a Google Scholar.
20
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 8 : odpověď
Google Scholar vyhledá pouze články z časopisů,
zatímco
Google shromáždí webové stránky s informacemi různého
zaměření a kvality.
21
Výzkumná otázka 2
Kontext
Council of European Dentists
Rada evropských zubních lékařů zastupuje ca. 300 tis. zubních lékařů
http://www.eudental.eu/
Rozhodnutí 2007 „Profil zubního lékaře budoucnosti“
Souvislost mezi orálním a obecným zdravím
Důkazy o vztahu mezi onemocněním parodontu a :
Srdečními/kardiovaskulárními chorobami, mrtvicí,
cukrovkou, respiračními nemocemi.
Komplexní zubní péče založená na důkazu samostatně i
v úzké spolupráci s ostatními zdravotnickými profesemi.
CED Resolution on the profile of the dentist of the future. November 2007.
22
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9 : výzkumná otázka 2, Google
Použijte Google a zodpovězte
tuto výzkumnou otázku:
Ověření zahraničních
zkušeností za poslední rok
o vztahu mezi orálním
zdravím a výskytem
kardiovaskulárních nemocí.
Klíčová slova v angličtině:
Oral health
Cardiovascular
Heart
Stroke
Atherosclerosis
Pokročilé vyhledávání
Výskyt: v názvu stránky
Datum: minulý rok
23
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9 : Google, řešení
24
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9.1. : jak citovat webové dokumenty?
Otevřete vyhledanou webovou stránku
Např. <http://www.medicinenet.com/script/main/art.asp?articlekey=116695>
Připravte citaci podle normy ISO 690, aktualizace 2011
<http://www.citace.com/soubory/csniso690-interpretace.pdf
Upozornění: webové stránky NELZE citovat pouze s uvedením internetové
adresy.
25
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9.1 : řešení
HENDRICK, Bill. Brushing teeth may keep away heart disease. [online]. c19962011, poslední revize 27.5.2010 [cit. 2011-12-02]. Dostupné z
<http://www.medicinenet.com>
26
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9 : výzkumná otázka 2, Scholar Google
Použijte vyhledávací stroj
Scholar Google a
zodpovězte tutéž výzkumnou
otázku:
Klíčová slova v angličtině:
Oral health
Ověření zahraničních
zkušeností za poslední rok
o vztahu mezi orálním
zdravím a výskytem
kardiovaskulárních nemocí.
Cardiovascular
Heart
Stroke
Atherosclerosis
Rozšířené vyhledávání
Výskyt: v názvu článku
Datum: 2010-2013
27
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9 : Scholar Google, řešení
28
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9.2 : jak citovat časopisecké články?
29
Kontrolní otázky a úkoly
Zadání 9.2 : řešení
TOUGER-DECKER, R. Diet, cardiovascular disease and oral health.
Promoting health and reducing risk. J Am Dent Assoc
2010, vol. 141, no. 2, s. 167-170.
30
Modul 1
Shrnutí poznatků
1.
2.
Formulace výzkumných otázek, příprava odborné terminologie
Internetový vyhledávač Google : pokročilé vyhledávání, zadání
klíčových slov
1.
2.
3.
Internetový vyhledávač Google Scholar : rozšířené vyhledávání,
zadání klíčových slov
1.
2.
4.
Analýza vyhledaných dokumentů a jejich typologie
Citování webových stránek podle normy ISO 690, aktualizace 2011
Analýza vyhledaných dokumentů – časopisecké články
Citování časopiseckých článků podle normy ISO 690
Doporučení Evropské komise k hodnocení kvality webových
stránek se zdravotnickým obsahem.
31
Vyhledávání stomatologických
informací na Internetu
Modul 2
Oborové bibliografické a znalostní
databáze
32
Výběr databází pro praktické ukázky
Bibliografické:
Bibliografie, řecky „βιβλιογραφία“ - bibliographia, doslovně "psaní
knihy„ je v dnešním pojetí tvorba databází o dokumentech za účelem
jejich evidence a zpětného vyhledání.
MEDLINE/PubMed
USA, mezinárodní pokrytí
BMČ – Bibliographia Medica Čechoslovaca
Články českých/slovenských autorů
Znalostní/syntetické/faktografické:
DynaMed
UpToDate
Patří ke světovým špičkám pro medicínu založenou na důkazu
33
MEDLINE/PubMed
Definice (1)
Název portálu: PubMed (Public Medline)
Odkaz: http://pubmed.gov
Producent: National Center for Biotechnology Information
(NCBI) a National Library of Medicine (NLM) - USA
Kategorie: Volně dostupná bibliografická databáze, která
zveřejňuje citace a abstrakta časopiseckých článků v
návaznosti na plné texty článků, pokud jsou k dispozici v
elektronické podobě.
Obory: Medicína, zubní lékařství, ošetřovatelství,
veterinární medicína, zdravotnictví, preklinické obory.
34
MEDLINE/PubMed
Definice (2)
Informačním základem portálu PubMed je bibliografická databáze
MEDLINE®, která zpracovává (indexuje) více než 5500 mezinárodních
časopisů ve 39 jazycích.
Pro obor zubní lékařství je indexováno 90 titulů.
Současný objem citací : 23 milionů záznamů
Retro: 1946 - dosud
Kromě bibliografické citace má uživatel k dispozici abstrakt článku,
doplněný předmětovými hesly MeSH (Medical Subject Headings) a
hypertextové odkazy na plný text článku (služba LinkOut) v závislosti
na nakladatelských licencích.
Vyhledávání je uživatelsky přívětivé
jednoduchý i pokročilý způsob (Advanced Search)
Booleovské operátory pro kombinaci termínů (OR; AND;NOT)
Zpřesňující filtry, např.
výskyt hledaných termínů v jednotlivých polích záznamu (název,
abstrakt,všechna pole)
věkové kategorie
typologie hledaných článků (review, klinické studie…)
aj.
35
Výzkumná otázka
Terminologie
ANGLICKY
(Dental) caries
Dental/tooth/teeth decay
Dental/tooth/teeth cavity(-ies)
ČESKY
Zubní kaz
Karies
Caries
Prevence
Preventivní
Profylaxe
Profylaktický
Riziko, rizika
--------------------------Dítě, děti, pediatrický…
Prevent(ion)
Preventive
Prophylaxis
Prophylactic
Risk(s)
--------------------------Child(ren), pediatric, …..
36
Formulace dotazu
Booleovské operátory
G.Boole 1815-1864
AND (a)
Dokumenty obsahují všechny hledané terminy
dental caries AND prevention
OR (a/nebo)
Dokumenty obsahují jeden (nebo všechny) hledané
termíny.
prevention OR prophylaxis OR risk
NOT (ne)
Vylučuje daný termín
dental caries NOT nutrition
37
MEDLINE/PubMed
Jednoduché vyhledávání
dental caries prevention children
38
MEDLINE/PubMed
Jednoduché vyhledávání : navigace
http://pubmed.gov
Search PubMed : dental caries prevention children
Search
39
MEDLINE/PubMed
Výsledky
Filtry
Před 1 rokem (jaro 2013)
40
MEDLINE/PubMed
Pokročilé vyhledávání /Advanced
http://pubmed.gov
41
PubMed Advanced Search Builder : nástroje
Výskyt termínů v polích, Booleovské operátory
42
PubMed Advanced Search Builder
Vyhledávací postup
All Fields
Title
Termíny v názvu
dental caries
OR
tooth decay
Add to history
All Fields
Title/Abstract
Termíny v názvu/abstraktu
prevention
OR
prophylaxis
OR
risk
Add to history
History
#1 dental caries[Title] OR tooth decay [Title]
#2 ((prevention[Title/Abstract]) OR prophylaxis[Title/Abstract]) OR risk[Title/Abstract]
#1 AND #2 Search
#3 Filters: Ages --- Child 6-12 Search
#4 Filters: Published in the last 10 years Search
43
PubMed Advanced Search Builder
Práce se záznamy
Seznam citací podle data vydání časopisu
Citace + abstrakt
Typologie článků – Publication types
Doplňkové deskriptory – MeSH Terms (Medical Subject Headings)
Chemické látky – Substances
Navigace na plné texty – LinkOut – more resources
Články s podobným obsahem – Related citations
Uložit jako soubor – Send to -- File
Poslat, např. do knihovny k vyřízení – Send to – Email
Vyplnit pole Additional text, např. uvést svůj kontakt. Jinak je zpráva anonymní.
Vytvořit seznam vybraných citací – Send to – Clipboard
Úkol:
Odeslat 1 záznam na adresu: [email protected]
Do pole „Additional text“ napsat svůj kontakt.
44
BMČ – Bibliographia Medica Čechoslovaca
Definice
Producent: Národní lékařská knihovna Praha
URL: http://www.medvik.cz/bmc/
Charakteristika:
Od roku 1947 zachycuje veškeré odborné písemnictví vydávané na území České
republiky a práce českých autorů vydané v zahraničí.
Do roku 1996 byla její součástí i lékařská literatura vycházející na Slovensku.
Rozsah: ca. 250 tisíc záznamů
Součást medicínské virtuální knihovny MEDVIK
Vyhledávání je uživatelsky přívětivé
? - nápověda
jednoduchý i pokročilý způsob
BMČ-články
Booleovské operátory pro kombinaci termínů (OR; AND;NOT)
* pro vyhledání odvozených slov
Zpřesňující filtry
výskyt hledaných termínů v jednotlivých polích záznamu (název, abstrakt,
kdekoliv…..)
rok vydání od-do
45
BMČ-články
Pokročilé hledání - postup
http://www.medvik.cz/bmc/
Zadáte-li více klíčových slov současně, jsou automaticky spojena
operátorem AND.
Lze použít i operátory OR a NOT, ty je však potřeba do dotazu zapsat.
Řádek 1: zub* kaz*
Název
Řádek 2: preven* OR profyla* OR rizik* Kdekoliv
Řádek 3: dět* OR pediatri* OR dítě*
Kdekoliv
Kombinovat: AND
Vyhledat
Výsledky --- zobrazit
46
BMČ-články
Pokročilé hledání – záznam o článku
47
BMČ-články
Pokročilé hledání – navigace na plný text
Vox pediatriae, 2006, roč. 6(č. 9), s. 45-46.
48
Česká stomatologie a Praktické zubní lékařství
Digitální archiv
49
Česká stomatologie a Praktické zubní lékařství
Digitální archiv 2005 -
50
Výběr databází pro praktické ukázky
Bibliografické:
Bibliografie, řecky „βιβλιογραφία“ - bibliographia, doslovně "psaní
knihy„ je v dnešním pojetí studium dokumentů za účelem jejich
evidence a zpětného vyhledání.
MEDLINE/PubMed
USA, mezinárodní pokrytí
BMČ – Bibliographuia Medica Čechoslovaca
Články českých/slovenských autorů
Znalostní/faktografické:
Dynamed
Uptodate
Patří ke světovým špičkám pro medicínu založenou na důkazu
51
Výzkumná otázka 2
Terminologie
Česky
Orální zdraví
Parodont
Onemocnění parodontu
Parodontitida, parodontitis
Dásně
Gingivitida, gingivitis
///////////////////////////
Kardiovaskulární riziko
Onemocnění srdce
Mozková mrtvice
Anglicky
Oral health
Periodont
Periodontal disease
Periodontitis
Gingiva, gums, gingivitis
///////////////////////////
Cardiovascular risk
(Coronary) heart diseases
Stroke
52
Navigace a funkce
Počítačová síť LF UP v Olomouci
http://search.epnet.com + vzdálený přístup (VPN nebo heslo)
Vyhledávání: jednotlivá klíčová slova Search
periodontitis cardiovascular/coronary/heart
Výsledek
Strukturovaný synoptický dokument na základě analýzy a
hodnocení publikovaných studií + citace + plné texty
Značky kvality
Vyhledávání klíčových slov uvnitř dokumentu Search within text
„Levels of evidence“ – úrovně důkazu
Seznamy použité literatury : References including reviews and guidelines
53
Navigace a funkce
http://www.uptodate.com/online
V síti LF UP v Olomouci
V síti FN Olomouc
Vyhledávání: jednotlivá klíčová slova Search
periodontitis cardiovascular/coronary/heart
Přehledy založené na důkazu (tj. aktuálních literárních
pramenech po jejich kritické interpretaci)
Téměř 8 000 zpracovaných specifických otázek
14 lékařských oborů
80 000 stran (text, grafika, prolinkování na abstrakta MEDLINu)
260 000 literárních citací
Léková databáze
Aktualizace 4x ročně
54
Modul 2
Shrnutí poznatků
1. Seznámili jsme se s 2 lékařskými bibliografickými
databázemi (MEDLINE – mezinárodní; BMČ - česká), kde
jsme vyhledávali shodné téma: „Prevence zubního kazu u
školních dětí“.
2. Využívali jsme dostupné nástroje pro přesnou formulaci
vyhledávacího postupu (výskyt termínů v různých částech
záznamu, Booleovské operátory, znak * pro pravostranné
rozšíření, filtry pro věkové kategorie, typ dokumentu a jeho
stáří).
3. Navigací jsme postupovali od základní citace přes abstrakt,
deskriptory obsahu až k pokusu získat plný text
dokumentu.
55
Modul 2
Shrnutí poznatků
Znalostní databáze jsme použili k vyhledání obecnější
výzkumné otázky, která se týkala vztahu mezi orálním
zdravím a kardiovaskulárními riziky.
DynaMed je databáze synoptická; stručné poznatky z
vyhledané literatury; odkazy na články a doporučené
postupy/PubMed, plnotextové portály.
UpToDate je databáze syntetická; logicky strukturovaný
souvislý text; grafika, odkazy na použitou literaturu/
PubMed.
56