Transcript Cours : Champ. Phytopatho.

Connaissance des champignons
phytopathogènes et
mycorhyziens
La phytopathologie
• « La phytopathologie est aux plantes ce que la médecine est à l’homme
et la médecine vétérinaire aux animaux. Chacune de ces disciplines
étudie les causes, les mécanismes et le contrôle des maladies affectant
les organismes auxquels elles se rapportent »
•
Phytopathologie: étude des microorganismes et des facteurs
environnementaux qui induisent des maladies chez les plantes, des
mécanismes par lesquels ces différents éléments agissent et des
méthodes de prévention ou de contrôle des maladies.
Qu’est-ce qu’une plante malade ?
Une plante est malade
lorsque ses fonctions
physiologiques sont
perturbées :
 Fonctions cellulaires :
division, différentiation,
développement, croissance,
reproduction
Absorption de l’eau et des
sels minéraux
Translocations,
photosynthèse
Métabolisme, stockage
Bouleversements de forme, de fonction ou d’intégrité;
La productivité est affectée, mort de la plante ou de certaines parties
Les maladies des plantes
regroupées :
-Par type de symptômes (pourriture racinaire,
flétrissements, tâches foliaires, rouilles…)
-Par type d’organes affectés (maladies racinaires, des
tiges, foliaires…)
-Par type de plantes affectées (herbacées, maraichères,
arbres…)
- Par le type de pathogène responsable (agent causal,
developpement de la maladie, risques d’épidémie et
mesures de contrôle)
Agents
responsables
des
maladies:
-Biologiques: pathogènes, compétition,
prédateurs
(insectes…..)
-Physiques:
nutriments,
eau,
toxiques
Maladies
infectieuses
(biotiques)
Maladies non infectieuses (abiotiques)
Une distinction importante :
 Symptômes
 Dégâts
Nuisibilité :
- Perte de rendement
- Baisse qualitative (Ex : valeur boulangère des grains)
La décision d’une intervention sanitaire ne devrait tenir
compte que de la nuisibilité
Contrôle des maladies des plantes:
- Pesticides
-Approches combinées de génie génétique,
sélection naturelle, cultures raissonnées,
agents biologiques antagonistes.
Les principaux types d’agents phytopathogènes
Virus
Viroïdes
Phytoplasmes
Bactéries
Champignons
Le postulat de Koch : comment prouver la
cause parasitaire d’une maladie
1- L’agent infectieux doit être présent dans les
plantes malades et pas dans les plantes saines
2- Il doit être isolé des plantes malades et
multiplié en conditions axéniques
3- Inoculé à une plante saine, il doit reproduire les
symptômes
4- Il doit pouvoir être réisolé des plantes infectées
artificiellement
Connaissance des champignons
Les champignons
phytopathogènes et apparentés
(Oomycètes)
Organismes fongiformes
Champignons vrais
Ascomycota
Plasmodiophoromycota
Basidiomycota
Deutéromycètes
Oomycota
Zygomycota
Chytridiomycota
?
Algues
Ancêtres des champignons
Les champignons phytopathogènes
Eucaryotes
Thallophytes
Hétérotrophes
- Saprophytes
- Parasites
Biotopes diversifiés
Dissémination : matériel
végétal, vecteurs
animaux, vent, eau ...
Importance économique
majeure
Caractères généraux des champignons parasites
Eucaryotes, thallophytes, hétérotrophes
Saprophytes
Parasites
Matière
organique morte
Matière organique
vivante
Pathogènes
Biotrophes
transitoires
(nécrotrophes)
Biotrophes vrais
Ex : Mildious,
Oïdiums, Rouilles
Symbiotiques
(Mycorrhizes)
Caractères d’adaptation au parasitisme
 Fixation et pénétration
 Colonisation et spoliation des tissus végétaux
 Multiplication , dissémination, expansion dans
l’espace
 Capacités de survie en absence de tissus
colonisables
 Capacités d’adaptation aux fluctuations du
milieu
Les champignons
phytopathogènes (et organismes
apparentés: Oomycètes)
-Les caractères généraux des champignons: Le règne fongique
- l’appareil végétatif ou thalle: structure et rôles
-Les grandes divisions du règne fongiques et les principaux
groupes de champignons phytopathogènes et mycorhiziens:
- Champignons à plasmodes
-Thalles coenocytiques (Chytridiomycota, Zygomycota,
Glomeromycota)
-Thalles filamenteux septés (Ascomycota, basidiomycota,
Deuteromycota)
Principaux organes d’un champignon
théorique
Reproduction
asexuée
Reproduction
sexuée
Thalle
Rôle de l’appareil végétatif
Rôle de l’appareil
reproducteur et propagation
des champignons
Rôle de l’appareil végétatif
Fixation sur l’hôte
Les étapes :
-Mise au contact
-Germination
-Ancrage
-Pénétration
Oïdium de la vigne
Colonisation et spoliation
Septoriose
Invasion de
tissus détruits
Oïdium
Mildiou
Epuisement progressif
des cellules vivantes
Colonisation des organes souterrains
Armillaire des espèces ligneuses
Rhizomorphes
( agrégations du mycelium en cordons
allongés, en lacet, ramifiés)
 Résistance à la concurrence microbienne du sol
Adaptation du thalle à la survie
 Agglomérats d’hyphes mélanisés en vie ralentie :
les sclérotes
 Epaississement des parois et séparation des
articles mycéliens : Les chlamydospores
Rôle de l’appareil
reproducteur
Les deux types de reproduction
DISSEMINATION
MULTIPLICATION
Spores
asexuées
Conditions
favorables
Extension de la
maladie
(Saison
végétative)
Thalle
CONSERVATION
Recombinaisons
génétiques
Organes de
reproduction
sexuée
Conditions
défavorables
(repos
végétatif)
Reproduction asexuée :
Multiplication végétative d’individus identiques
Expansion épidémique
Les spores asexuées (conidies) sont formées sur des conidiophores
arborescents ou dans des conceptacles
Conidiophores
libres
Pycnides
Acervules
Reproduction sexuée et survie
de l’espèce
Les spores sexuées sont :
- soit des cellules œufs (2n) à paroi épaisse :
- oospores des oomycota
(ex : mildious)
- soit des cellules issues de la méiose:
-ascospores endogènes des ascomycota
(ex : tavelure du pommier ou Oïdium du blé )
-basidiospores exogènes des basidiomycota
(ex : rouilles des céréales)
Organes sexués des ascomycota
Les méïospores ou ascospores (n) sont formées et murissent à
l’intérieur de cellules en forme de sac (asques) protégées ou
non à l’intérieur de conceptacles (ascocarpes)
(1)
(2)
Asques libres
Périthèces
(3)
(4)
Cléistothèces
Apothécies
Oïdium
Sclerotinia
Ascospores
Levures
Tavelure
Notions de cycle d’un
champignon phytopathogène
1) CONTAMINATION
Pollution
Germination
2) COLONISATION
DES
TISSUS
Pénétration
Incubation
Latence
Premiers
symptômes
Libération des premières
spores
3) PERIODE
INFECTIEUSE OU
CONTAGIEUSE
Fin de la
sporulation
Les étapes d’un
cycle de base
Cycle annuel
Hiver
Printemps
Maturation
des formes de
conservation
Conservation
Maladies
monocycliques:
Contaminations
primaires
1 cycle annuel sans
contaminations
secondaires
survie
Automne
Reproduction
sexuée
Cycles de
contaminations
secondaires
Eté
Maladies
polycycliques :
plusieurs cycles
secondaires  longs
___ Phase parasitaire
___ Phase saprophytique
Intérêt de la connaissance du cycle :
Cycle annuel
Elimination ou
réduction de
l’inoculum
primaire
Conservation
Premiers
traitements
fongicides
Contaminations
primaires
Cycles
2aires
Prophylaxie et date des premiers traitements
Intérêt de la connaissance du cycle :
cycles secondaires
Traitement préventif
/ Fongicide de surface
Traitement curatif /
fongicide pénétrant
Pénétration
Choix et meilleur positionnement du fongicide actif
Spécificité parasitaire
Espèces ±
polyphages
Espèces spécialisées
Formes spéciales à
spécificité d’hôte
Ubiquistes
Ex : Erysiphe
graminis f.sp. tritici
Ex : Botrytis
cinerea
Ex : Oïdium de la
Vigne
Erysiphe necator
Biotypes moléculaires
Pathotypes
Ex : E.g. tritici, race 4
(Spécificité variétale)
Ex : E.necator biotype 3
B.cinerea s.e. transposa