Transcript ד"ר מעיין גל

‫המעבדה לחקר אינטראקציות בין חלבונים‬
‫בעזרת ‪ NMR‬וכלים חישוביים‬
‫יצירת קשר‬
‫מעין גל‬
‫מכון המחקר מיגל‬
‫טל‪050-7987058 :‬‬
‫‪[email protected]‬‬
‫‪1‬‬
‫המעבדה לחקר אינטראקציות בין חלבונים ופיתוח תרופות‬
‫ד‪.‬נ‪.‬א‬
‫ר‪.‬נ‪.‬א‬
‫חלבון‬
‫‪DNA makes RNA makes Proteins‬‬
‫‪human‬‬
‫‪Cat‬‬
‫ההבדל הינו באינטראקציות‬
‫של החלבונים‬
‫‪Cow‬‬
‫‪Mouse‬‬
‫‪Banana‬‬
‫‪2‬‬
‫חקר אינטראקציות בין חלבונים בעזרת כלים ביו‪-‬פיסיקליים‬
‫הבנת מבנה‪ ,‬דינמיקה‬
‫ואינטראקציות בין‬
‫חלבונים בעזרת ‪NMR‬‬
‫ושיטות חישוביות‬
‫‪3‬‬
β-TrCP1 structure
TrCP1-Skp1—Catenin (destruction motif) Complex
Structure of a -TrCP1-Skp1--Catenin Complex: Destruction Motif Binding and Lysine
Specificity of the SCF-TrCP1 Ubiquitin Ligase
Geng Wu, Guozhou Xu, Brenda A. Schulman, Philip D. Jeffrey, J. Wade Harper, Nikola
P. Pavletich. Molecular Cell. 2003.
4
β-TrCP1 structure
5
‫פרויקטים אפשריים במעבדה‬
‫בבסיס הפרוייקטים במעבדה עומד הצורך באיפיון מבני של אינטראקציות בין חלבונים על מנת למצוא‬
‫מולקולות קטנות שיכולות לעכב קישורים אלו‪ .‬מולקולות אלו ימשיכו ויפותחו לתרופה‪.‬‬
‫‪ .1‬החלבונים ‪ NFAT‬ו‪ calcineurin -‬הינם השער של מערכת החיסון‪ .‬עיכוב האינטראקציה בין חלבונים‬
‫אלו יוביל לתרופה סלקטיבית יותר עבור השתלת אברים‪ .‬עבודת התואר השני ו‪/‬או פרוייקט‬
‫תעסוק באיפיון האינטראקציה של החלבונים ברמה האטומית בעזרת מגוון של כלים ביו‪-‬‬
‫פיסיקליים‪.‬‬
‫‪ .2‬הקישור בין החלבונים ‪ b-TrCP‬ו‪ IkBa-‬חשוב להפעלתם של ‪ .B-cells‬האינטראקציה ביניהם נשענת‬
‫על שילוב של שני מנגנוני העברת האותות‪ -‬פוספורילציה ויוביקוויטינציה‪.‬‬
‫‪ .3‬מעכב "דואלי" לקישור של חלבוני ‪ MDM2‬ו‪ MDM4-‬עם ‪ p53‬לטיפול בטווח רחב של סוגי סרטן‪.‬‬
‫‪‬‬
‫‪‬‬
‫‪‬‬
‫‪‬‬
‫פרויקטים במסגרת תואר ראשון‬
‫יצירת פרוטוקול להפקת וניקוי החלבון ‪.b-TrCP‬‬
‫שיבוט מקטעים שונים של החלבון ‪ NFAT‬לצורך‬
‫איפיון מבני בעתיד‪.‬‬
‫בדיקות קישור של מקטעי ‪ NFAT‬ל‪calcineurin-‬‬
‫איפיון ואנליזה תלת מימדית של חלבונים (מידול‬
‫במחשב)‬
‫‪6‬‬
‫פרויקטים במסגרת תואר שני‬
‫‪ ‬איפיון המבנה של הקומפלקס ‪ b-TrCP‬עם ‪IkBa‬‬
‫בעזרת ‪ NMR‬וכלים חישוביים‪.‬‬
‫‪ ‬איפיון האינטראקציה של החלבון ‪ NFAT‬עם‬
‫‪.calcineurin‬‬
‫‪ ‬השפעת מוטציות בחלבוני ה‪ E3-‬ליגאז‬
‫‪ MDM2/4‬על הקישור למולקולות קטנות‪.‬‬
‫המעבדה לחקר אינטראקציות בין חלבונים‬
‫‪ NMR‬וכלים חישוביים‬
‫יצירת קשר‬
‫מעין גל‬
‫מכון המחקר מיגל‬
‫טל‪050-7987058 :‬‬
‫‪[email protected]‬‬
‫‪7‬‬