מגן לחלבון

Download Report

Transcript מגן לחלבון

‫מ‪ DNA -‬לחלבון‬
‫סינתזת חלבונים‬
: ‫ שלבים‬3 ‫• סינתזת חלבונים כוללת‬
‫ שיעתוק‬Transcription 1.
RNA ‫ עיבוד‬RNA processing 2.
‫ תרגום‬Translation 3.
DNA  RNA  Protein
DNA  RNA  Protein
Nuclear
membrane
DNA
Transcription
‫תא אוקריוטי‬
Pre-mRNA
RNA Processing
mRNA
Ribosome
Translation
Protein
DNA  RNA  Protein
DNA
Transcription
mRNA
Ribosome
Translation
Protein
‫תא פרוקריוטי‬
‫ לחלבון‬DNA -‫מ‬
Beginner's guide to Molecular Biology.htm
: ‫שאלה‬
DNA -‫ שונה מ‬RNA (ribonucleic acid) ‫• כיצד‬
? (deoxyribonucleic acid)
‫‪ RNA‬שונה מ‪: DNA -‬‬
‫‪ RNA 1.‬מכיל את הסוכר ‪ribose‬‬
‫‪ DNA‬מכיל את הסוכר ‪deoxyribose‬‬
‫‪ RNA 2.‬מכיל )‪uracil (U‬‬
‫‪ DNA‬מכיל )‪thymine (T‬‬
‫‪ – RNA 3.‬זוהי מולקולה חד גדילית‬
‫‪ – DNA‬זוהי מולקולה דו‪-‬גדילית‬
Transcription ‫ שיעתוק‬.1
Nuclear
membrane
DNA
Transcription
‫תא אוקריוטי‬
Pre-mRNA
RNA Processing
mRNA
Ribosome
Translation
Protein
‫‪ .1‬שיעתוק ‪Transcription‬‬
‫• העברת האינפורמציה‪ ,‬בגרעין‪ ,‬מ‪ DNA -‬ל‪.RNA -‬‬
‫• רק גדיל אחד של ‪ DNA‬משמש כתבנית לשיעתוק‪.‬‬
‫• כאשר השיעתוק מסתיים גדיל ה‪ RNA -‬נפרד מה‪-‬‬
‫‪.DNA‬‬
‫שיעתוק ושיכפול‬
‫שיעתוק‬
‫שאלה ‪:‬‬
‫• מהו האינזים האחראי לייצור מולקולת ה‪-‬‬
‫‪? RNA‬‬
‫תשובה ‪RNA Polymerase :‬‬
‫• האינזים מפריד את גדילי ה‪ DNA -‬ע"י פירוק‬
‫קשרי המימן שבין הבסיסים החנקניים‪.‬‬
‫• ואז‪ ,‬נע לאורך אחד מגדילי ה‪ DNA -‬וקושר בין‬
‫הנוקלאוטידים של ה‪.RNA -‬‬
1. Transcription
DNA
RNA Polymerase
pre-mRNA
‫שאלה ‪:‬‬
‫• מה יהיה גדיל ה‪ RNA -‬המשלים לגדיל‬
‫ה‪ DNA -‬הבא ‪:‬‬
‫’‪• DNA 5’-GCGTATG-3‬‬
: ‫תשובה‬
• DNA 5’-GCGTATG-3’
• RNA 3’-CGCAUAC-5’
RNA Processing RNA ‫ עיבוד‬.2
Nuclear
membrane
DNA
Transcription
‫תא אוקריוטי‬
Pre-mRNA
RNA Processing
mRNA
Ribosome
Translation
Protein
‫‪ .2‬עיבוד ‪RNA Processing RNA‬‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫יצירת מולקולת ‪pre-RNA‬‬
‫מתרחש בגרעין‪.‬‬
‫חיתוך אינטרונים (‪ ) Introns‬והוצאתם ע"י‬
‫‪ splicesome-enzyme‬וחיבור האקסונים (‪)exons‬‬
‫ביחד‪.‬‬
‫התוצר הסופי – מולקולת ‪ mRNA‬היוצאת מהגרעין‬
‫לציטופלסמה‪.‬‬
2. RNA Processing
pre-RNA molecule
exon
intron
exon
intron
exon
intron
intron
exon
splicesome
exon
exon
splicesome
exon
exon
exo
n
Mature RNA molecule
splicing - II ‫שיעתוק‬
: RNA ‫סוגי‬
:RNA ‫ סוגי‬3
messenger RNA (mRNA) .1
transfer RNA (tRNA) .2
ribosome RNA (rRNA) .3
‫כולם נוצרים בגרעין‬
‫)‪A. Messenger RNA (mRNA‬‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫נושא את האינפורמציה לחלבון ספציפי‪.‬‬
‫אורכו בין ‪ 500‬ל‪ 1000 -‬נוקלאוטידים‪.‬‬
‫בנוי מקודונים (קודון = רצף של ‪ 3‬נוקלאוטידים‪.‬‬
‫לדוג‪ – AUG .‬קודון לחומצה האמינית מתיונין)‪.‬‬
‫כל קודון ספציפי לחומצה אמינית מסויימת‪.‬‬
A. Messenger RNA (mRNA)
start
codon
mRNA
A U G G G C U C C A U C G G C G C A U A A
codon 1
‫חלבון‬
methionine
codon 2
codon 3
glycine
serine
codon 4
isoleucine
codon 5
codon 6
glycine
alanine
codon 7
stop
codon
‫מבנה ראשוני של חלבון‬
aa1
aa2
aa3
‫קשרים פפטידיים‬
aa4
aa5
aa6
‫)‪B. Transfer RNA (tRNA‬‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫אורכו ‪ 80 – 75‬נוקלאוטידים‪.‬‬
‫קושר את החומצה האמינית המתאימה בציטופלסמה‪.‬‬
‫מוביל את החומצה האמינית המתאימה ל‪.mRNA -‬‬
‫בעל אנטיקודונים (‪ )anticodons‬המשלימים את‬
‫הקודונים שב‪.)mRNA codons ( mRNA -‬‬
‫מזהה את הקודונים המתאימים ב‪ mRNA -‬ונקשרים‬
‫אליהם בקשרי מימן‪.‬‬
‫)‪B. Transfer RNA (tRNA‬‬
‫חומצה אמינית‬
‫אתר קשירה‬
‫לחומצה אמינית‬
‫‪methionine‬‬
‫‪U A C‬‬
‫אנטיקודון‬
‫)‪C. Ribosomal RNA (rRNA‬‬
‫• אורכו ‪ 100‬עד ‪ 3,000‬נוקלאוטידים‪.‬‬
‫• מהווה מרכיב מבני חשוב בריבוזום‪.‬‬
‫• נקשר לחלבונים ליצירת הריבוזומים‪.‬‬
‫ריבוזומים ‪Ribosomes‬‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫•‬
‫בעלי ‪ 2‬תת יחידות ‪ :‬קטנה וגדולה‪.‬‬
‫מורכב מ‪ (40%) rRNA -‬ומחלבונים )‪.(60%‬‬
‫‪ 2‬תתי היחידות מתחברות ומסייעות בקשירת ה‪-‬‬
‫‪ tRNA‬ל‪.mRNA -‬‬
‫בריבוזום קיימים ‪ 2‬אתרים לקשירת ה‪: tRNA -‬‬
‫א‪(first and last tRNA will attach) P site .‬‬
‫ב‪A site .‬‬
Ribosomes
Large
Subunit
‫תת יחידה‬
‫גדולה‬
P
Site
A
Site
mRNA
Small subunit
‫תת יחידה‬
‫קטנה‬
A U G
C U A C U U C G
Translation ‫ תרגום‬.3
Nuclear
membrane
DNA
Transcription
‫תא אוקריוטי‬
Pre-mRNA
RNA Processing
mRNA
Ribosome
Translation
Protein
Translation ‫ תרגום‬.3
.‫• סינתזת חלבונים בציטופלסמה‬
: ‫• הגורמים המעורבים בתהליך‬
mRNA (codons) 1.
tRNA (anticodons) 2.
rRNA 3.
ribosomes 4.
amino acids 5.
Translation ‫ תרגום‬.3
: ‫• שלושה שלבים‬
start codon (AUG) : Initiation ‫ התחלה‬.1
elongation ‫ התארכות‬.2
stop codon (UAG) : Termination ‫ סיום‬.3
Translation ‫ תרגום‬.3
Large
subunit
P
Site
A
Site
mRNA
A U G
Small subunit
C U A C U U C G
‫ התחלה‬Initiation
aa1
aa2
2-tRNA
1-tRNA
anticodon
hydrogen
bonds
U A C
A U G
codon
G A U
C U A C U U C G A
mRNA
Elongation
‫התארכות‬
peptide bond
aa3
aa1
aa2
3-tRNA
1-tRNA
anticodon
hydrogen
bonds
U A C
A U G
codon
2-tRNA
G A A
G A U
C U A C U U C G A
mRNA
‫קשר פפטידי‬
aa1
aa3
aa2
1-tRNA
3-tRNA
U A C
(‫)עוזב‬
2-tRNA
A U G
G A A
G A U
C U A C U U C G A
mRNA
‫הריבוזום מתקדם קודון אחד‬
aa1
‫קשר פפטידי‬
aa4
aa2
aa3
4-tRNA
2-tRNA
A U G
3-tRNA
G C U
G A U G A A
C U A C U U C G A A C U
mRNA
aa1
‫קשרים פפטידיים‬
aa4
aa2
aa3
2-tRNA
4-tRNA
G A U
(‫)עוזבים‬
3-tRNA
A U G
G C U
G A A
C U A C U U C G A A C U
mRNA
‫הריבוזום מתקדם קודון אחד‬
aa1
‫קשרים פפטידיים‬
aa5
aa2
aa3
aa4
5-tRNA
U G A
3-tRNA
4-tRNA
G A A G C U
G C U A C U U C G A A C U
mRNA
‫קשרים פפטידיים‬
aa1
aa5
aa2
aa3
aa4
5-tRNA
U G A
3-tRNA
G A A
4-tRNA
G C U
G C U A C U U C G A A C U
mRNA
‫הריבוזום מתקדם קודון אחד‬
aa4
aa3
aa5
aa199
‫מבנה ראשוני‬
‫של חלבון‬
aa200
Termination
‫סיום‬
aa2
aa1
200-tRNA
A C U
mRNA
terminator
or stop
codon
C A U G U U U A G
‫תוצר סופי‬
‫• התוצר הסופי בסינתזת החלבון הוא חלבון בעל‬
‫מבנה ראשוני‪.‬‬
‫• זהו רצף של חומצות אמינו הקשורות בניהן‬
‫בקשרים פפטידיים‪.‬‬
‫‪aa5‬‬
‫‪aa199‬‬
‫‪aa200‬‬
‫‪aa4‬‬
‫‪aa3‬‬
‫‪aa2‬‬
‫‪aa1‬‬
Polyribosome
• Groups of ribosomes reading same mRNA
simultaneously producing many proteins
(polypeptides).
incoming
large
subunit
1
incoming
small subunit
2
3
4
polypeptide
5
6
7
mRNA
‫שאלה ‪:‬‬
‫• האנטיקודון ‪ UAC‬שייך ל‪ tRNA -‬המזהה וקושר‬
‫חומצה אמינית ספציפית‪.‬‬
‫• מהו הקוד בבסיסי ה – ‪ DNA‬לחומצה אמינית זו ?‬
: ‫תשובה‬
• tRNA
• mRNA
• DNA
- UAC (anticodon)
- AUG (codon)
- TAC
‫מבנה ה‪DNA -‬‬
‫נוקלאוטידים‬
‫גודל הגנום האנושי‬
‫• מכיל מעל ‪ 3‬ביליון זוגות בסיסים‪.‬‬
‫• כאשר הוא מתוח לגמרי‪ ,‬אורכו ‪ 1‬מטר‪.‬‬
Scale Comparison
‫מהו גן ?‬
‫‪One Protein‬‬
‫‪One Gene‬‬
‫מעל ‪ 100,000‬גנים נמצאו בגנום האנושי‪.‬‬
‫כל גן (גן = רצף נוקלאוטידים על גבי ה‪)DNA -‬‬
‫מכיל את הקוד הגנטי לחלבון ספציפי (רצף חומצות‬
‫אמיניות)‪.‬‬
‫• מגן לחלבון ‪:‬‬
‫‪transcription‬‬
‫‪translation‬‬
‫קריוטיפ (תמונת כרומוזומים אנושית)‬
‫‪Genomes Guide Homo sapiens.htm‬‬
‫אריזת הכרומוזומים‬
Mutation of
Chromosome
Mitosis
Mitosis