Transcript Document

‫‪ – RNA - 4‬מולקולת השליח‪ ,‬מהקוד הגנטי ליצור חלבון‬
‫א‪ -‬יצירת ‪ – RNA‬תהליך השיעתוק‪ ,‬יצירת ‪ ,pre-mRNA‬מבנה‬
‫אקסונים ואינטרונים‪,‬‬
‫ב‪ -‬חיתוך ה‪ pre-mRNA-‬ל‪ RNA-‬מקודד‪.‬‬
‫חומר עזר וקריאה‬
The Cell, ch-I.6 (RNA Synthesis and Processing)
The Cell, ch I-7. (Protein Synthesis, Processing, and Regulation
‫‪ – RNA - 4‬מולקולת השליח‪ ,‬מהקוד הגנטי ליצור חלבון‬
‫א ‪ -‬מהו רנ"א ?‬
‫ב‪ -‬מבנה הרנ"א‪.‬‬
‫ג‪ -‬סוגי הרנ"א השונים ותפקידם‪.‬‬
‫ד‪ -‬שעתוק של רנ"א מ‪-‬דנ"א‪.‬‬
Ribonucleic Acid - RNA
‫רנ"א מעביר את המידע מה דנ"א לייצור החלבונים‬
‫• הדנ"א‪ ,‬שבו מוצפן הקוד ליצירת החלבונים‪ ,‬מצוי בגרעין‪.‬‬
‫•‬
‫ייצור החלבונים בתא אאוקריוטי מתרחש בציטופלזמה‪.‬‬
‫• קיים חומר שמקשר בין הגרעין לבין הציטופלזמה‪ ,‬זהו חומר מעביר‬
‫את המידע לייצור החלבונים‪.‬‬
‫• ‪ – 1961‬הביוכימאים נירנברג ומאתיי הוכיחו כי מולקולת רנ"א‬
‫מעבירה את המידע ליצירת חלבון‪.‬‬
‫• בכל מקום שבו נוצר חלבון‪ ,‬חלה גם עלייה בריכוז של חומצת‬
‫הגרעין רנ"א‪.‬‬
‫מבנה מולקולת הרנ"א‬
‫•‬
‫בדומה לדנ"א הרנ"א בנוי משרשרת ארוכה של נוקלאוטידים‪.‬‬
‫•‬
‫הנוקלאוטיד בנוי משלושה רכיבים‪:‬‬
‫בסיס חנקני‬
‫סוכר בעל ‪ 5‬פחמנים (דאוקסיריבוז)‬
‫וזרחן‬
‫מולקולת רנ"א שונה ממולקולת דנ"א‪:‬‬
‫‪ .1‬מולקולת רנ"א בנויה לרוב כגדיל יחיד‪ ,‬לעומת מולקולת דנ"א‬
‫שבנויה בדרך כלל כגדיל כפול‬
‫‪ .2‬ברנ"א ‪ -‬הסוכר הוא ריבוז‪ ,‬ובדנ"א –דאוקסיריבוז‬
‫דנ"א‬
‫רנ"א‬
‫חמצן‬
‫‪ .3‬ברנ"א נמצא הבסיס החנקני אורציל ‪ U -‬ואילו במולקולת דנ"א‬
‫נמצא הבסיס החנקני תימין ‪T -‬‬
‫דנ"א‪T G C A :‬‬
‫רנ"א‪U G C A :‬‬
‫סיכום‬
‫מבנה מולקולת הרנ"א‬
‫הנוקלאוטידים קשורים זה לזה‪ ,‬בקשרים כימיים‪ .‬כך‬
‫שהפוספט של נוקלאוטיד אחד נקשר לסוכר של‬
‫הנוקלאוטיד הבא אחריו בשרשרת בדומה ל ‪.DNA‬‬
‫סוגי הרנ"א‬
‫מולקולות רנ"א הן חומצות גרעין שנמצאות בכל תא חי‪.‬‬
‫ניתן להבחין בשלושה סוגים של רנ"א‪:‬‬
‫רנ"א‪-‬ריבוזומי‬
‫רנ"א‪-‬שליח‬
‫רנ"א‪-‬מוביל‬
‫שמו של כל אחד מרמז על פעילותו‪.‬‬
‫)‪ (Messenger RNA , mRNA‬רנ"א שליח‬
‫• הרנ"א‪-‬שליח מעביר את המידע לבניית החלבונים מהדנ"א‬
‫שבגרעין לריבוזומים שבציטופלסמה‪.‬‬
‫שיעתוק רנ"א‬
‫• השעתוק הוא תהליך של העברת המידע התורשתי מן הדנ"א אל הרנ"א‬
‫לצורך בנית החלבונים‪.‬‬
‫• כדי לבנות את החלבונים הדרושים‪ ,‬הגנים הרלוונטיים משועתקים‬
‫ממולקולת הדנ"א למולקולת רנ"א ומתורגמים לתוצרים החלבוניים‪.‬‬
‫• שעתוק מולקולת דנ"א למולקולת רנ"א נעשה על פי עיקרון דומה‬
‫לעקרון השכפול של הדנ"א‪ :‬בניית גדיל משלים על פי קטע של דנ"א‪,‬‬
‫שמשמש כתבנית‪.‬‬
‫• השעתוק נעשה מגדיל דנ"א אחד בלבד‪ ,‬והוא מוגבל לגנים‬
‫המשועתקים‪ .‬לכל גן יש רק גדיל דנ"א אחד שמשמש לו כתבנית‪.‬‬
‫• גנים מסוימים משועתקים מגדיל אחד‪ ,‬וגנים אחרים ‪ -‬מן הגדיל האחר‪.‬‬
‫בכל פעם משמש גדיל אחר כתבנית‪.‬‬
‫השלבים בתהליך השעתוק‬
‫שלב ראשון‬
‫• האנזים רנ"א‪-‬פולימראז נקשר באופן רופף למולקולת דנ"א כאשר‬
‫האנזים "נתקל" ברצף נוקלאוטידים מסוים על גבי מולקולת הדנ"א‪,‬‬
‫הקשר נעשה חזק‪.‬‬
‫• רצף נוקלאוטידים כזה נקרא אתר מקדם (פרומוטר‪.)promoter -‬‬
‫• הפרומוטר "מסמן" לאנזים את נקודת ההתחלה של תהליך השעתוק‪.‬‬
‫שלב שני‬
‫• קטע קצר של סליל הדנ"א "נפרם" סמוך לפרומוטר‪ ,‬כך ששני גדילי‬
‫הדנ"א נפרדים זה מזה‪.‬‬
‫• המקום שבו נפתחים שני גדילי הדנ"א נקרא "בועת שעתוק"‪ .‬אורכה‬
‫של בועת התעתוק הוא כ‪ 17-‬זוגות בסיסים חנקניים‪.‬‬
‫שלב שלישי‬
‫• האנזים רנ"א‪-‬פולימראז מתחיל את פעולת השעתוק‪ :‬ליד כל‬
‫נוקלאוטיד בתבנית הדנ"א‬
‫• מציב האנזים רנ"א‪-‬פולימראז את הנוקלאוטיד המשלים לו‪.‬‬
‫• כך הולכת ונבנית מולקולה של רנ"א על גבי הגדיל המשמש לו‬
‫כתבנית‪.‬‬
‫• הכיוון של השעתוק הוא תמיד מקצה '‪ 3‬של מולקולת הדנ"א לכיוון‬
‫קצה '‪ ,5‬כך שמולקולת הרנ"א מתארכת תמיד בכיוון '‪ 5‬אל '‪.3‬‬
‫• מול גואנין (‪ )G‬מציב האנזים את ציטוזין (‪ ,)C‬מול תימין (‪ )T‬את‬
‫אדנין (‪ ,)A‬מול גואנין (‪ )G‬את ציטוזין (‪ ,)C‬מול אדנין (‪ )A‬את אורציל‬
‫(‪................ )U‬‬
RNA
DNA
‫שלב רביעי‬
‫• לאחר שנוצר קטע קטן של מולקולת רנ"א‪ ,‬בועת השעתוק מתקדמת‬
‫לאורך מולקולת הדנ"א; החלק שעבר תעתוק "נסגר" וקטע חדש‬
‫"נפרם"‪.‬‬
‫• בועת התעתוק מתקדמת יחד עם האנזים‬
‫• רנ"א‪-‬פולימראז‪ ,‬ומולקולת הרנ"א ממשיכה להתארך‪.‬‬
‫שלב חמישי‬
‫• הרנ"א שנבנה‪ ,‬מחובר בקצהו האחד לאנזים ולגדיל הדנ"א‪ ,‬ואילו‬
‫הקצה האחר חופשי‪.‬‬
‫• התארכות השרשרת נמשכת עד שהאנזים מגיע לאתר הסיום‪.‬‬
‫באתר זה הוספת הנוקלאוטידים נפסקת‪ ,‬האנזים רנ"א‪-‬פולימראז‬
‫ומולקולת הרנ"א החדשה ניתקים מגדיל הדנ"א ומולקולת הדנ"א‬
‫חוזרת למצבה המקורי ‪ -‬מולקולה דו‪-‬גדילית‪.‬‬
‫עיבוד הרנ"א באאוקריוטים‬
‫• ביצורים אאוקריוטים‪ ,‬מולקולת הרנ"א‪ ,‬שנוצרה בתהליך השעתוק‪,‬‬
‫עוברת בגרעין התא תהליכי עיבוד‪ ,‬ובסופם נוצרת מולקולת רנ"א‪-‬‬
‫שליח (‪.)mRNA‬‬
‫• תהליכי העיבוד העיקריים כוללים הוספת קטע קטן של נוקלאוטידים‬
‫בתחילת המולקולה ובסופה‪ ,‬וכן תהליכי שחבור‪.‬‬
‫יצירת הכיפה ו הפולי ‪A‬‬
‫• לקצה אחד של מולקולת הרנ"א (קצה '‪ ) 5‬נוסף נוקלאוטיד מטיפוס‬
‫גואנין (‪ ,)G‬ואליו קשורה קבוצה מתילית (‪ .)CH3‬מבנה זה נקרא כיפה‪.‬‬
‫יצירת הכיפה ו הפולי ‪A‬‬
‫• לקצה אחד של מולקולת הרנ"א (קצה '‪ ) 5‬נוסף נוקלאוטיד מטיפוס‬
‫גואנין (‪ ,)G‬ואליו קשורה קבוצה מתילית (‪ .)CH3‬מבנה זה נקרא כיפה‪.‬‬
‫• לקצה האחר של מולקולת הרנ"א (קצה '‪ )3‬נוספים שיירים של‬
‫נוקלאוטידים מטיפוס אדנין (‪ ,)A‬ולרצף שנוצר קוראים זנב ה‪.poly (A(-‬‬
‫יצירת הכיפה ו הפולי ‪A‬‬
‫• לקצה אחד של מולקולת הרנ"א (קצה '‪ ) 5‬נוסף נוקלאוטיד מטיפוס‬
‫גואנין (‪ ,)G‬ואליו קשורה קבוצה מתילית (‪ .)CH3‬מבנה זה נקרא כיפה‪.‬‬
‫• לקצה האחר של מולקולת הרנ"א (קצה '‪ )3‬נוספים שיירים של‬
‫נוקלאוטידים מטיפוס אדנין (‪ ,)A‬ולרצף שנוצר קוראים זנב ה‪.poly (A(-‬‬
‫• תפקידם של הכיפה והזנב‪ ,‬בקצות המולקולה אינו ידוע‪.‬‬
‫• כנראה שהזנב מסייע לרנ"א‪-‬שליח המעובד לצאת מן הגרעין‬
‫לציטופלסמה‪ .‬וכן‪ ,‬הזנב מגן על הרנ"א‪-‬שליח מפני אנזימים המפרקים‬
‫רנ"א (ריבונוקלאזות)‪ ,‬הנמצאים בציטופלסמה‪.‬‬
‫תהליך השחבור‬
‫• הוא תהליך אנזימי של חיתוך באתרים מסוימים ברנ"א המשועתק‪,‬‬
‫והוא כולל הרחקת אינטרונים‪ ,‬ו"הדבקה" של החלקים שלא‬
‫מורחקים ‪ -‬האקסונים‪.‬‬
‫• אורך מולקולת רנ"א בגרעין יכול להגיע עד ל‪ 50,000-‬נוקלאוטידים‪.‬‬
‫לעומת זאת‪ ,‬אורך מולקולות רנ"א‪-‬שליח בציטופלסמה נע בין ‪500‬‬
‫ל‪ 3,000-‬נוקלאוטידים בלבד‪.‬‬
‫• לאחר תהליך העיבוד‪ ,‬עובר הרנ"א‪-‬שליח לציטופלסמה‪ ,‬לשם ביצוע‬
‫תהליך התרגום‪.‬‬
Splicing - ‫שחבור‬
Splicing
‫‪Alternative splicing‬‬
‫היא תופעה בשיעתוק בה משועתקים קטעים שונים של ‪ RNA‬ממקטע ‪ DNA‬יחידי‪.‬‬
‫ולכן קטע ‪ mRNA‬יכול להיות מתורגם למספר חלבונים שונים‪.‬‬
‫השחבור החליפי התגלה בשנת ‪ 1980.‬הדעה המקובלת כיום היא שרוב הגנים‬
‫ביצורים אוקריוטיים עוברים תהליך זה‪ .‬ישנן בסה"כ בין ‪ 70,000‬ל‪ 100,000-‬אפשרויות‬
‫שחבור של ‪ mRNA,‬והן נקראות בכללותן טראנסקריפטום )‪(Transcriptome‬‬
‫בסופו של דבר מתקבל רנ"א שליח בוגר ומוכן לעבור תירגום‬
‫לחלבון בציטופלסמה‬