Transcript Epidémiologie d`intervention

Epidémiologie d’intervention:
La recherche et l’action sont-elles
antinomiques?
Expériences d’une ancienne
doctorante
Judith Mueller, MD MPH PhD
Département d’épidémiologie
Épidémiologie d’intervention
Épidémiologie de terrain
Recherche-action
Epidémiologie appliquée
• Limitée à
- les maladies infectieuses
- la santé environnementale
• Demandée par autorités sanitaires
• Données faible qualité, méthodes
simples
• Descriptive, répétitive
• Mal publiée
• « InVS »
• Cible la décision, l’impact rapide
• L’épidémiologiste touche à tout =>
lien proche avec autres disciplines
Recherche de la source de
contamination par EHEC 2011
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Recherche épidémiologique
Épidémiologie académique
• En distance du besoin Santé Publique
• À l’initiative du chercheur
• Données haute qualité, méthodes
compliquées
• Analytique, innovatrice
• Résultats généralisables
• Coûteuse, lente
• Stratégie de publication
• « Inserm »
• Essaye d’aller au fond des choses
pour un progrès au long-terme
• Cible la qualité
Grandes études de cohorte
Epidémiologie d’intervention
Domaines:
– Surveillance des maladies (à risque épidémique, à
prévention vaccinale, en hausse, d’intérêt particulier)
– Investigation d’épidémies ou de clusters de maladies
– Évaluation de risque environnemental
Epidémiologie d’intervention: Riposte, vaccination
Formation: de terrain: Pays en voie de développement
Epidémiologie
– EPIET (Europe), Profet ou IDEA (France), EIS (US)
– FETP, IEIAA,
…. (Pays
en voie de développement)
Recherche-action:
Capacity
building
Epidémiologie
appliquée: Non théorique
Méthodes épidémiologiques:
– Inclusions: notifications, site sentinelle, registre hospitalier,
sondage en grappe
– Prévalence, incidence en population, OR
– Étude cas témoin, Projets de démonstration
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- Mon expérience
- Conclusions personnelles
- Recherche opérationnelle avec PVD
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Mon expérience - 1
MD, MPH
- 2002: Recherche en épidémiologie maladies chroniques
2002-2011: Agence de Médecine Préventive (AMP)
2004-8: ED393, labo d’accueil à l’Institut Pasteur
Sujet : Emergence du méningocoque du sérogroupe W135 en Afrique
2011: Ecole des Hautes Etudes en Santé Publique (Rennes/Paris)
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Épidémiologie
Microbiologie
Logistique vaccinale
Économie de la santé
www.amp-vaccinology.org
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Mon expérience - 2
Méningite bactérienne
-
N. meningitidis, S. pneumoniae, Haemophilus influenzae type b
-
Ceinture africaine de la méningite:
-
-
endémique (Hib, Sp, Nm)
-
saisonnalité (Nm, Sp)
-
épidémies (Nm): foyers et vagues
Vaccins:
-
Hib (préventif chez enfants)
-
Nm (riposte; => préventif)
-
Sp (=> préventif)
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-
-
Surveillance :
-
riposte vaccinale si épidémie (spécifique par sérogroupe)
-
adapter la stratégie vaccinale (routine) au long-terme
-
recherche explicative des épidémies
Manque de ressources, formation, infrastructure, approche adaptée
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Exemple 1
Surveillance de la méningite
bactérienne
Méthodes variées:
• Étude – inclusion exhaustive, culture+PCR
• Système sentinelle basé sur PCR
• Investigation des flambées
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EHESP
Delrieu et al., PLoS ONE 2011
10
EHESP
Exemple 2
Vaccin Hib: impact assessment (évaluation de l’impact)
Pediatric Bacterial Meningitis network en Afrique (OMS) :
• Selection de sites hospitaliers
•Analyses bactériologiques sur cas inclus
180
•Assistance à l’analyse bactériologiqueUniversal
avec peu
de moyens
infant Hib
160
0.2
0.18
vaccination begins
Purulent
0.14
120
0.12
100
0.1
80
0.08
60
Proportion
Number of cases
0.16
•Analyse des données
140pour démontrer l’effet de l’introduction du vaccin Hib
0.06
40
0.04
20
0.02
0
0
2000
2001
2002
2003
2004
2005
Year
Source: Ghana PBM network, WHO, AMP
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Purulent but culture
negative
Proportion purulent
Proportion purulent but
culture negative
Exemple 3
Sérotypage du pneumocoque par PCR sur liquide
cerebro-rachidien
Burkina Faso and Togo, 2007-8
150
48
38
25F/38
125
35B
Number of cases
25F
100
23F
19F
18C
75
18A
18
14
50
13
12F
12B
25
7F
6B
6A
Quellung all
isolates
PCR all CSF
Njanpop et al., J Clin Microbiol 2010
12
PCR all isolates
PCR all cases
NT
serotyped
neg
PNT
serotyped
neg
PNT
serotyped
neg
PNT
serotyped
NT
serotyped
0
Any technique all
cases
6A/B
5
4
3
2
1
Exemple 4
Rainy season
community level
regional level
Surveillance nationale de cas suspects de méningite
Endemic incidence
3.0
2.5
2.0
1.5
1.0
Incidence x 10-100
Invasiveness
↑ x 10-100
Hyperendemicity
« Epidemic cofactor »,
Orodara
Dry season
Annual incidence (per 100)
Persistent dry, dusty
climate
0.50
e.g.:
- viral respiratory infection
epidemic
Carriage
↑ x 10-100
Incidence x 10-100
Localised epidemic
« Epidemic wave factor »,
expansion and intensity
of localised epidemics ↑
e.g.:
- waves of « epidemic
cofactors »
- meningococcal strain
variations
0.00
13
2005
2006
Incidence x 3-10
Epidemic wave
0.25
2004
Regular meningitis season(s)
2007
2008
Conclusions personnelles
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1. Pourquoi choisir un seul domaine?
Capacity Building
Expertise
Action santé publique
Enseignement
Recherche
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2. Epidémiologie =
Méthodologie générique:
Conclure sans expérimentation en
utilisant les données disponibles
Fréquence et déterminants
de maladies
Appliquée à
- estimation d’incidences
- prédiction
- investigation d’événements sanitaires
- recherche de facteurs de risque
- évaluation d’interventions
- essais cliniques
Attente en précision, validité
Contexte
Budget
Délai
Collecte de données et analyses
+/- avancées
=> Distinction « d’intervention » ou « de recherche » peu pertinente
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3. La pratique de l’épidémiologie
s’applique toujours à d’autres domaines
L’épidémiologiste doit « se mouiller » dans d’autres domaines, si non
il reste isolé et est ingénieur de méthodes épidémiologiques:
- Anthropologie
- Biologie, microbiologie
- Chimie/physique
Recherche
respectant les principes épidémiologiques
- Climatologie
- Economie
Recherche
opérationnelle …
- Médecine
et ses spécialités
Recherche
fondamentale
…
- Pharmacologie
- Politique de santé
- Sociologie
-…
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4. Afin de bien publier sa recherche
opérationnelle
Recherche opérationnelle
• Nouvelles régions
géographiques
• Nouvelles méthodes diagnostics
• Evaluer des interventions
• Nouvelles expositions
• Maladies émergentes
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5. Afin de rendre sa recherche utile
au delà de la publication
Recherche fondamentale
• Se renseigner sur / respecter les
besoins des autorités sanitaires, du
personnel de santé, …
• Retro-information, communication
• Composante capacity building
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Environnement international de la recherche
opérationnelle (pour l’épidémiologiste)
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Recherche opérationnelle en PVD
• Millenium Development Goals
• Financements augmentés pour traitements, vaccins
• Développement et introduction accélérées
• Évidence scientifique disponible n’est pas suffisamment
spécifique pour le contexte des PVD
• Capacité d’évaluer les interventions limitée dans
beaucoup de pays (infrastructure, RH, situation politique)
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Recherche opérationnelle avec PVD
Institutions nationaux/régionaux sanitaires
–InVS, WHO, US-CDC, …
–INRSP (Mali), Centre Muraz (BF)
Universités
–LSHTM, Johns Hopkins
–Univ. de Bobo-Dioulasso, …
ONG/ autres institutions
–AMP
–Epicentre (MSF)
–IRD
–IVI
–MRC (Gambie)
–PATH
–Réseau intl des Instituts Pasteur
– Swiss Tropical Institute, Bâle
–…
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Bailleurs de fonds :
Bill & Melinda Gates Foundation
Fondationd privées
Industrie
Ministères de coopération, de recherche
Union européenne
Recherche requise :
Pragmatique
De bonne qualité
Efficace
Approche multi-disciplinaire
Adaptée au contexte
Merci!
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EHESP