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第17章 氨基酸和肽 目的要求 1. 掌握组成蛋白质的基本单元 — -氨基酸的结构特 点、分类、命名和化学性质 2. 掌握肽的结构和命名,熟悉肽链中C-端和N-端的分 析方法。 3. 了解氨基酸和活性肽在医学上的意义。 本章具体应掌握的内容提要 1. 氨基酸的结构 氨基酸是组成蛋白质的基本单元。天然存在的氨基酸约有数百种,但存 在于生物体内合成蛋白质的氨基酸仅为20种。它们在化学结构上都具有 共同的特点,即属于-氨基酸(脯氨酸为-亚氨基酸),其中有8种为人体 必需氨基酸。除甘氨酸外,其余氨基酸的 -碳原子都是手性碳原子,都 有旋光性,且均属L-构型。不同的氨基酸,只是侧链R基有所不同。氨基 酸分子既含有碱性的氨基又含有酸性的羧基,在生理条件下,一般是以 偶极离子形式存在。 2. 氨基酸的分类 按R基的化学结构,可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环氨基酸; 按氨基和羧基的数目可分为中性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸。氨 基酸还可根据侧链R基的极性及其所带电荷分为非极性R基氨基酸、不带 电荷的极性R基氨基酸、带正电荷的R基氨基酸和带负电荷的R基氨基酸。 3. 氨基酸的化学性质 氨基酸的化学性质与分子中所含有的羧基、氨基和侧链R基有关,其 中羧基和氨基的反应为氨基酸共有的性质。氨基酸是两性化合物, 与酸、碱都可成盐,在等电点时以内盐形式存在的氨基酸溶解度最 小;氨基酸在一定条件下可脱羧生成伯氨,可氧化脱氨生产酮酸, 也可发生分子间相互脱水生成肽类物质。含有某些特殊R基的氨基酸, 还可发生某些特殊的颜色反应。氨基酸的重要化学反应见表1。 表1 氨基酸的重要化学反应 4. 肽的结构和命名 肽是由氨基酸残基通过肽键(酰胺键)连接起来的。肽单位(—C—CO—NH—C—) 的6个原子处于同一平面,这个平面称为肽键平面,肽键中由于氮原子与羧羰基存在 p-共轭效应,限制了C—N键的自由旋转,使与C—N键相连的O与H或两个C原子 形成较稳定的反式构型。肽的命名从N-端开始,将分子中各氨基酸依次称为某氨酰 置于母体名称前,最后以C-端的氨基酸为母体称为某氨酸。肽的名称也常用中文或 英文的缩写符号来表示。 5. 多肽结构的测定 用酸将多肽彻底水解,得到各种游离氨基酸的混合物,通过层析法或氨基酸分析仪 以确定其组成成分,再经相对分子质量的测定计算出各种氨基酸分子的数目。 测定氨基酸在肽链中的排列顺序,往往需末端残基分析和部分水解法配合进行。N端分析可采用2,4-二硝基氟苯(DNFB)法、丹磺酰氯(DNS-Cl)法和Edman降解法等。 而C-端分析则可采用肼解法和羧肽酶催化水解法等。 6. 生物活性肽 生物体内有一些很强生物活性的肽类,统称为活性肽。生物的生长、发育、细胞 分化、大脑活动、肿瘤病变、免疫防御、生殖控制、抗衰老、生物钟规律及分子进 化等均涉及到活性肽。随着多肽的分离纯化、结构分析、化学合成及遗传工程等新 技术的广泛应用,新的生物活性肽不断被发现,对其功能的认识也不断增长。 建议学时 2~ 3学时 17.1 氨基酸的结构、分类和命名 17.2 氨基酸的物理性质 17.3 氨基酸的化学性质 17.4 多肽链的基本结构和肽的命名 17.5 内源性和外源性生物活性肽 17.1 氨基酸的结构、分类和命名 17.1.1 氨基酸的结构 氨基酸(Amino Acid)是一类取代羧酸,可视 为羧酸分子中烃基上的氢原子被氨基取代的一类 产物。根据氨基和羧基在分子中相对位置的不同, 氨基酸可分为-,-,-,…,-氨基酸。 20种编码氨基酸中除甘氨酸外,其它各种氨基 酸分子中的-碳原子均为*C,都有旋光性。 COO- +H N——H 3 R L-型 COO- H——NH3+ R D-型 具旋光活性的编码氨基酸均为L-型,如用 R/S法标记,则除半胱氨酸为R构型外,其余皆 为S构型。 由蛋白质水解得到的氨基酸都具有共同 的结构特点——-氨基酸。结构通式为: R——*CH—COOH NH2 不同的氨基酸只是R不同。仅有一个例外: COO N H H (脯氨酸为-亚氨基酸) R——*CH—COO- NH 3+ 氨基酸在固态或在生理 pH条件下,是一偶极离子 (zwitterion) , 以 内 盐 形 式 存在。 表17-1 20种编码氨基酸的名称和结构式(*为必需氨基酸) 名 称 中文缩写 英文缩写 结构式 非极性氨基酸 Gly G 甘氨酸(Glycine) -氨基乙酸 甘 丙氨酸(Alanine) -氨基丙酸 丙 Ala A CH3 CH COO NH3 亮氨酸(Leucine)* -甲基--氨基戊酸 亮 Leu L (CH3)2CHCH2 CHCOO NH3 NH3 异亮 Ile I 缬氨酸(Valine)* -甲基--氨基丁酸 缬 Val V 脯氨酸(Proline) -吡咯啶甲酸 脯 Pro P 异亮氨酸(Isoleucine)* -甲基--氨基戊酸 CH2 COO CH3CH2CH CHCOO CH3 NH3 (CH3)2CH CHCOO NH3 COO N H H 20种编码氨基酸的名称和结构式(*为必需氨基酸) (续1) 名 称 中文缩 英文缩写 写 苯丙 Phe F 蛋(甲硫)氨(Methionine)* -氨基--甲硫基戊酸 蛋 Met M 色氨酸(Tryptophan) * -氨基--(3-吲哚基)丙酸 色 苯丙氨(Phenylalanine)* -苯基--氨基丙酸 结构式 CH2 CHCOO NH3 CH3SCH 2CH2 CHCOO NH3 Trp W CH2CH COO NH3 N H 非电离的极性氨基酸 丝 Ser S 谷氨酰胺(Glutamine) -氨基戊酰胺酸 谷胺 Gln Q 苏氨酸(Threonine)* -氨基--羟基丁酸 苏 Thr T 丝氨酸(Serine) -氨基--羟基丙酸 HOCH2 CHCOO NH3 H2N C CH2CH2CHCOO NH3 O CH3CH CHCOO OH NH3 20种编码氨基酸的名称和结构式(*为必需氨基酸) (续2) 名 称 中文缩写 英文缩写 结构式 半胱氨酸(Cysteine) -氨基--巯基丙酸 半胱 Cys C HSCH2 CHCOO NH3 天冬酰胺(Asparagine) -氨基丁酰胺酸 天胺 Asn N H2N C CH2CHCOO NH3 O 酪氨酸(Tyrosine) -氨基--对羟苯基丙酸 酪 Tyr Y 天冬氨酸(Aspartic acid) -氨基丁二酸 天 Asp D 谷氨酸(-氨基戊二酸) Glutamic acid 谷 HO CH2 CHCOO NH3 酸性氨基酸 HOOCCH2CHCOO NH3 Glu E HOOCCH2CH2CHCOO NH3 20种编码氨基酸的名称和结构式(*为必需氨基酸) (续3) 名 称 中文缩写 英文缩写 结构式 碱性氨基酸 赖氨酸(Lysine)* ,-二氨基己酸 赖 Lys K NH3 CH2CH2CH2CH2CHCOO NH2 精氨酸(Arginine) -氨基--胍基戊酸 精 Arg R H2N C NHCH2CH2CH2 CHCOO NH2 NH2 组氨酸(Histidine) -氨基--(4-咪唑基)丙酸 组 His H CH2CH N N H NH3 COO 17.1.2 氨基酸的分类 1 根据R基化学结构的不同分为: (1) 脂肪族氨基酸 甘、丙、缬、亮、异亮(不含其它官能团) 丝、苏(含-OH); 半胱、蛋(含S); 天酰、谷酰(含酰胺) 天冬、谷(1氨基2羧基) 精(含胍基) 赖( 2氨基1羧基) (2) 芳香环的氨基酸:苯丙、酪 (3) 杂环的氨基酸:脯、组、色 2 根据分子中所含氨基和羧基的相对数目分为: 中性氨基酸(1氨基1羧基;由于羧基电离能力较 氨基大,其水溶液实际上为弱酸性): 甘、丙、缬、亮、异亮、丝、苏、半胱、 蛋、苯丙、酪、色、天酰、谷酰、脯 酸性氨基酸(1氨基2羧基):天冬、谷 碱性氨基酸(2氨基1羧基):赖、 精、组 3 医学上常根据氨基酸侧链R基的极性及其所带电荷: (1) 非极性R基氨基酸:有甘、丙、亮、异亮、缬、脯、 苯丙、蛋、色9种。含非极性侧链,故具有疏水性,它 们通常处于蛋白质分子内部。 (2) 非极性R基氨基酸:有丝、谷胺、苏、天胺、酪、半 胱6种。侧链中含有羟基、巯基、酰胺基等极性基团, 但在生理条件下却不带电荷,具有一定的亲水性,往往 分布在蛋白质分子的表面。 (1)(2)两类为中性氨基酸。 (3) 带正电荷的R基氨基酸:有精、赖、组3种。为碱性 氨基酸。 (4) 带负电荷的R基氨基酸:有谷、天冬2种。为酸性氨 基酸。 17.1.3 、氨基酸的命名 1 系统命名法: 把氨基当作取代基,以羧酸做母体,称为氨基某酸。 氨基的位置习惯上用希腊字母-,-,-等表示。 2 俗名: 天然产氨基酸更普遍使用俗名,即按其来源或性质 命名。如甘氨酸是因具有甜味而得名的;天冬氨酸最初是 由天门冬的幼苗中发现的。生物体内作为合成蛋白质的原 料的20种编码氨基酸,象元素符号一样,都有国际通用的 符号,中文用简称表示。 20种氨基酸 营养必需氨基酸 亮、异亮、缬、苯丙、蛋、苏、色、赖等8种氨基酸 在人体内不能合成而又是营养所必不可少的,必需依靠食 物供应,若缺少则会导致许多种类蛋白质的代谢和合成失 去平衡,故这些氨基酸称为营养必需氨基酸。 半必需氨基酸:精氨酸、组氨酸是幼儿所必需的。 修饰氨基酸 除20种编码氨基酸外,蛋白质分子中尚含有一些 氨基酸,它们在生物体内均无相应的遗传密码,往往 在蛋白质生物合成前后,由相应的编码氨基酸衍生而 成,称为修饰氨基酸 HO N H H H2NCH2CHCH2CH2CHCOO COO OH 4-羟基脯氨酸 NH3 5-羟基赖氨酸 二者主要存在于骨胶原和弹性蛋白中 COO COO H3N C H H3N C H CH2 S S CH2 I HO I O I CH2CHCOOH I NH2 胱氨酸 由2分子半胱中的巯基经氧化 以二硫键连接而成,对维持 蛋白质的结构具有重要作用 甲状腺素 存在于甲状腺球蛋白中 有些氨基酸不是蛋白质的组成成分,但能以游离或结合的形式存在于生 物界,这些氨基酸统称为非蛋白质氨基酸。它们中有的是L-型-氨基 酸的衍生物,有的是-、-、-氨基酸,有的是D-型氨基酸。 H2NCH2CH2CHCOOH NH2 H2N C NHCH2CH2CH2CHCOOH O 瓜氨酸 NH2 鸟氨酸 -氨基丁酸: 存在于脑中,可用于治疗癫痫、记忆障碍等脑病 -氨基--羟基丁酸:具有解痉作用 D-丙氨酸、D-谷氨酸、 D-赖氨酸和D-鸟氨酸存在于细菌中 生命活动中,人及动物通过消化道吸收氨基酸并通过体内 转化而维持其动态平衡,若其动态平衡失调,则机体代谢 紊乱,甚至引起病变。许多氨基酸还参与代谢作用,不少 已用来治疗疾病。 甘氨酸:对芳香族物质起解毒作用 酪氨酸:合成甲状腺素和肾上腺素的前体 精氨酸:参与鸟氨酸循环,用于因血氨升高引起的肝昏迷 谷氨酸与谷胺酰胺:用于改善脑出血后遗的记忆障碍 谷胺酰胺和组氨酸:用于治疗消化道溃疡 甘氨酸和谷氨酸:调节胃液酸度 亮氨酸:加速皮肤和骨头创伤愈合,降血糖及头晕治疗药 医药上氨基酸主要用于复合氨基酸输液 生命活动中,人及动物通过消化道吸收氨基酸并通过体内 转化而维持其动态平衡,若其动态平衡失调,则机体代谢 紊乱,甚至引起病变。许多氨基酸还参与代谢作用,不少 已用来治疗疾病。 甘氨酸:对芳香族物质起解毒作用 酪氨酸:合成甲状腺素和肾上腺素的前体 精氨酸:参与鸟氨酸循环,用于因血氨升高引起的肝昏迷 谷氨酸与谷胺酰胺:用于改善脑出血后遗的记忆障碍 谷胺酰胺和组氨酸:用于治疗消化道溃疡 甘氨酸和谷氨酸:调节胃液酸度 亮氨酸:加速皮肤和骨头创伤愈合,降血糖及头晕治疗药 医药上氨基酸主要用于复合氨基酸输液 17.2 氨基酸的物理性质 -氨基酸为无色结晶,熔点较高,一般在200~300C之间,这是 因为晶体中氨基酸以内盐形式存在,但往往在熔化前受热分解放出 CO2。每种氨基酸都有特殊的结晶形状,利用结晶形状可以鉴别氨基 酸。 各种氨基酸都能溶于水,其水溶液是无色的,但溶解度不同;酪氨 酸在冷水中很难溶解,而在热水中溶解度较大。除脯氨酸易溶于乙醇 外,其它均不溶解或很少溶解,但氨基酸的盐酸盐比游离的氨基酸易 溶于酒精中。所有氨基酸都不溶于乙醚、氯仿等非极性溶剂,而易溶 于强酸、强碱中。 除甘氨酸外,所有编码氨基酸都具有旋光性,用测定比旋光度的方 法可以测定氨基酸的纯度。 17.3 氨基酸的化学性质 氨基酸除具有氨基和羧基的一些典型反应之外, 还有二者相互影响、相互作用的某些特性。 1、两性解离和等电点 氨基酸分子中含有酸性的羧基和碱性的氨基,因 此氨基酸是两性化合物,能分别与酸或碱作用成盐。 氨基酸溶于水时,氨基和羧基同时解离成为一种 两性离子(zwitterion)。若将此溶液酸化,则两性离子 与H+离子结合成为阳离子;若向此水溶液中加碱,则 两性离子与OH-结合成为阴离子。 R CH COOH NH2 R CH COO H R CH OH NH2 阴离子(pH > pI) COO H R OH COOH NH3+ NH3+ 两性离子(pH = pI) CH 阳离子(pH < pI) 调节溶液的pH值,使氨基酸的酸性解离与碱性解离 相等,所带正、负电荷数相等,此时溶液的pH值称为该 氨基酸的等电点(Isoelectric Point),以pI表示。 pH=pI,主要以两性离子形式存在。在电场中既不向正 极移动,也不向负极移动。 pH>pI,主要以阴离子形式存在。在电场中向正极移动; pH<pI,主要以阳离子形式存在。在电场中向负极移动; 等电点是氨基酸的一个重要特征常数之一,可由实验测得, 也可通过计算得到。每种氨基酸都有其特定的等电点。 酸性氨基酸: pI 2.7 ~ 3.2 (pH<4) 中性氨基酸: pI 5.0 ~ 6.5 (pH<7) 碱性氨基酸: pI 7.5 ~ 10.7 (pH>7.5) 2、氧化脱氨基反应 R CHCOOH NH2 2H R C COOH NH H2O OH R C NH3 COOH NH2 R C COOH O 氨基酸经氧化剂或氨基酸氧化酶作用,可脱去氨基生成酮酸, 此反应在脱氨前涉及脱氢和水解两个步骤。上述过程也是生物体内 氨基酸分解代谢的重要方式。 3、脱水成肽反应 在适当条件下,氨基酸分子间氨基与羧基相互脱水缩合生 成的一类化合物,叫做肽(peptide)。 H2NCHCOOH + H2NCHCOOH R1 R2 H2O H2NCHCO NHCHCOOH R1 R2 肽分子中的酰胺键(—CO—NH—)常称做肽键(peptide bond). 用途:是多肽和蛋白质生物合成的基本反应。 4、与茚三酮反应 O O OH + H2NCHCOOH OH R O O O O OH OH OH H + NH3 + OH O H + NH3 + RCHO + CO2 OH O N O O (ÂÞÂüÊÏ×Ï) O 根据生成紫色化合物颜色的深浅程度,或根据放出 CO2气体的体积,可对-氨基酸进行定量分析。常用于氨 基酸和蛋白质的定性鉴定及标记。 脯氨酸和羟脯氨酸等亚氨基酸(含亚氨基结构)与茚 三酮反应生成黄色化合物。而N-取代的-氨基酸以及β氨基酸、γ-氨基酸等不与茚三酮发生显色反应。 5、与亚硝酸反应 R CHCOOH + HNO2 NH2 R CH COOH + N2 OH 根据放出氮气的体积,可定量分析氨基酸的含量。 也可用来定量测定蛋白质或多肽分子中的游离氨基的含 量(Van Slyke 氨基氮测定法)。 亚氨基酸(如脯氨酸)与HNO2 反应生成N-亚硝基化 合物。 6、脱羧反应 RCHCOOH Ba(OH) 2 RCH2NH2 + CO2 NH2 在肠道细菌的作用下,组氨酸可脱羧生成组胺,过 量的组胺在肌体内易引起变态反应。 CO2 N CH2CH2 NH2 CH2CH COOH N N NH2 N H H 组氨酸 组胺 7、与2,4-二硝基氟苯反应 在室温和弱碱性条件下,氨基酸中氨基上的氢原子可与2,4-二 硝基氟苯(DNFB) 发生亲核取代反应生成稳定的二硝基苯基氨基酸 (DNP-氨基酸)。 F + H2NCHCOOH O2N NO2 DNFB R NHCHCOOH + HF O2N NO2 R DNP-氨基酸 DNP-氨基酸呈黄色,使用纸层析与标准DNP-氨基酸比较,可 用于氨基酸的检出,英国科学家Sanger F用此法首次阐明了组成 胰岛素的氨基酸的种类、数目和排列顺序,为认识蛋白质的结构 作出了重要贡献。 8、侧链 R 基的反应 鉴别具有特殊R基氨基酸的显色反应 反应名称 蛋白黄反应 Millon反应 乙醛酸反应 试 剂 浓硝酸再加碱 硝酸汞、亚硝酸汞 和硝酸的混合物 乙醛酸+浓硫酸 颜 色 深黄色或橙红色 红 色 鉴别的氨基酸 苯丙、酪、色 酪氨酸 两液层界面处呈紫红色环 色氨酸 17.4 多肽链的基本结构和肽的命名 1、多肽的结构和命名 肽是氨基酸残基之间彼此通过酰胺键(肽键) 连接而成的一类化合物。其通式为: H3NCHCO NH CHCO NH CHCO NH CHCO .... NH CHCOO R1 R2 R3 R4 Rn 多肽分子中的酰胺键称为肽键(peptide bond),一般为 -COOH与-NH2脱水缩合而成。多肽链中的每个氨基酸单 元称 HN CH CO 为氨基酸残基(amino acid residue)。 R 肽也以两性离子的形式存在。 通常在多肽链的一端含有一个未结合的—NH3+,称为 氨基酸的N-端,一般写在肽链的左边;在另一端含有一个 未结合的—COO- ,称为羧基酸的C-端,通常写在肽链的 右边。 肽的结构不仅取决于组成肽链的氨基酸种类和数目, 也与肽链中各氨基酸残基的排列顺序有关。 由2种不同的氨基酸可形成2种二肽: CH3 CH3 H3NCH2CONHCHCOO 甘氨酰丙氨酸(甘丙肽) H3NCHCONHCH2COO 丙氨酰甘氨酸(丙甘肽) 3种不同的氨基酸可形成6种不同的三肽 4种不同的氨基酸可形成24不同的四肽 氨基酸按不同的排列顺序可形成大量的异构体,它 们构成了自然界中种类繁多的多肽和蛋白质。 命名时以C-末端的氨基酸残基为母体,由N -端由左 至右依次称为某氨酰某氨酸。 CH3 CH2OH H3NCH2CONHCHCONHCHCOO 命名:甘氨酰丙氨酰丝氨酸(甘丙丝肽) 缩写:Gly—Ala—Ser或G—A—S 2、肽键平面 肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由旋转。 组成肽键的6个原子处于同一平面,称为肽单位(peptide unit)。 肽键一般呈反式构型。 相邻的肽键平面可围绕C旋转,肽键骨架也可视为一系列通 过C原子衔接的肽键平面所组成。 3、多肽结构测定和端基分析 测定多肽结构的一般顺序是首先确定组成多肽的氨基酸种 类和数目,然后确定肽链中氨基酸的排列顺序。 确定氨基酸在肽链中的排列顺序,往往需末端残基分析和部 分水解法配合进行。 末端残基分析法中N-端分析可用2,4-二硝基氟苯(DNFB)法、 丹磺酰氯(DNS-Cl)法和Edman降解法等,而C-端分析可采用肼 解法和羧肽酶催化水解法等。 部分水解法是采用不同的蛋白酶酶切肽链的不同部位,当 有足够的小碎片被鉴定以后,再进行组合、排列对比,找出关 键性的重叠,推断各小片断在肽链中的位置,就可能得出整个 肽链中各氨基酸残基的排列顺序。 17.5 内源性和外源性生物活性肽 在生物体中,多肽最重要的存在形式是作为蛋白质 的亚单位。 但是,也有许多分子量比较小的多肽以游离状态存 在。这类多肽通常都具有特殊的生理功能,常称为 生物活性肽(biological active peptide)。 内源性生物活性肽:如谷胱甘肽、神经肽、催产素、 加压素、心房肽等,在生物体内游离存在。 外源性生物活性肽:微生物、动植物蛋白中分离出 的具有潜在生物活性的肽类,它们在消化酶的作用 下释放出来,以肽的形式被吸收后,参与摄食、消 化、代谢及内分泌的调节,这种非机体自身产生的 却具有生物活性的肽类称为外源性生物活性肽。 饲料和食物是外源性生物活性肽的重要来源,目前研究的主 要外源性生物活性肽有外啡肽、免疫调节肽、抗微生物肽、 抗凝血肽、抗应激肽、抗氧化肽等。 无论是从结构或从功能来说,生物活性肽是自然界中种类、 功能较复杂的一类化合物。生物活性肽在生物的生长、发育、 细胞分化、大脑活动、肿瘤病变、免疫防御、生殖控制、抗 衰老及分子进化等方面起着重要的作用,具有涉及神经、激 素和免疫调节、抗血栓、抗高血压、抗胆固醇、抗细菌病毒、 抗癌、抗氧化、清除自由基等多重功效。 生物活性肽在体内一般含量较低,但功能极其微妙,结构相 同或极为相似的活性肽,由于产生于不同器官,行使的功能 也有所不同。 从生物活性肽的组成来看,小的由二、三个氨基酸残基组成, 大的则为上百个氨基酸残基并含有由亚基组成的糖蛋白。 随着多肽的分离纯化、结构分析、化学合成、放射免疫测定、 免疫细胞化学及遗传工程等新技术的广泛应用,新的生物活 性肽不断被发现,对其功能的认识也不断增长。