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LE B. A. BA de la bactériologie
:
Qu’est ce que la bactériologie?
Dr O. BELLON
Centre hospitalier du pays d’Aix
septembre 2011
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Les micro-organismes
•
•
•
•
Microbiologie : étude des micro-organismes
Bactériologie : étude des bactéries
Virologie, mycologie, parasitologie……
Centré sur la bactériologie mais aussi sur les
autres micro-organismes…
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Définitions générales
• Êtres vivants
• Petite taille
– Microscopes
• Ubiquitaires
– Animaux
– environnement
• Limitation du cours
– Bactéries
– Virus
– champignons
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Les bactéries
• Besoins culturaux
–
–
–
–
Eau
Aliments
Chaleur
Atmosphère
• Classifications
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Les bactéries
• Atmosphère
– Aérobies
• Besoin
d’oxygène
– Anaérobies
• Oxygène
toxique
– Microaérophiles
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Les bactéries
• Température
– Mésophiles
– Cryophiles (froid)
– Thermophiles (chaleur)
• Explication
– Des pathologies observées
– Des modes de dissémination (Yersinia,
Legionella)
– Des modes de contamination (Listeria)
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Les bactéries
• Nourriture
– Nécessaires à la croissance
• Cystéine et légionelle
– Favorable à la croissance
• Glucose : assez mais pas trop……
• Eau
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Les bactéries
• Structure
–
–
–
–
UNICELLULAIRE
procaryotes
Microscope optique
Cytoplasme
• Entouré d’une membrane cytoplasmique
• Protégé par la paroi : support de l’affinité tinctoriale (gram)
– Contenant
• Chromosome circulaire : noyau sans membrane nucléaire
• Plasmides
• Éléments figurés
– Éléments inconstants
• Capsule
• Spore
• flagelles
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9
Coloration de Gram : BGN
10
Coloration de ZIELH
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Les bactéries
• Structure
– La capsule
• Facteur de virulence
• Protection contre la phagocytose
• Support antigénique
– Pneumocoque
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Eléments facultatifs : capsule
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Les bactéries
• Structure
– La spore
• Forme de résistance
– Chaleur
– Pression
– Rayonnements
– Produits chimiques :
• alcool entre autre
• Pas à l’eau de Javel
• Sporulation lors de conditions défavorables
• Germination lors de conditions favorables
• Clostridium :
– gangrène,
– C. difficile
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Eléments facultatifs : spore
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Les bactéries
• Structure
– Les flagelles
• Support de la mobilité
• Support antigènique
– Les pili sexuels
• Conjugaison
• Recombinants génétiques
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Eléments facultatifs : flagelles
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Les bactéries
• Culture
–
–
–
–
Étuves
Milieux de culture
Atmosphère
Multiplication
• E.coli : rapide
• B.K. : lent
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Les virus
•
•
•
•
•
•
•
Unicellulaires
ACARYOTES
Parasites stricts
Un seul acide nucléique en général
Structure particulaire spécifique
Ultrafiltrables
Microscope électronique
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Les virus
• Parasites stricts
–
–
–
–
reproduction à partir de son matériel génétique
détournement du système de la cellule parasitée
Réplication
Ne pousse pas sur les milieux habituels de la
bactériologie
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Les virus
• Stucture
– un seul acide nucléique
• ou ADN
• ou ARN
– protégé dans une capside
• support de la classification morphologique
– cubique
– hélicoidale
– double
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Virus : cubique
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Virus : helicoidal
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Virus : mixte (bactériophage)
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Les champignons
•
•
•
•
•
•
•
Entre le règne végétal et le règne animal
Mycètes
Eucaryotes
Uni ou pluricellulaires
Présence de bétaglucanes et chitine
Paroi constituée d’ergostérol
Deux grands groupes
– Levures
– Champignons filamenteux
25
candida
26
Champignons filamenteux
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Caractéristiques des MO
• Entérobactéries : BGN du tube digestif
– Enterobacter : un des genres parmi les
entérobactéries
• Entérocoque : CGP du tube digestif.
• Staphylocoque : aspect en grappe de raisin, h
stafulh
• Colibacille : le bacille du colon
• Méningocoque : responsable de méningites….
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• Vibrion : BGN en virgule
Modes de vie des MO
• Commensaux : vis en commun sans
produire de maladie
• Pathogènes
– Entraînent une maladie
– Nécessite des conditions particulières pour
exprimer la pathogénicité
• Notions de flores
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Ce qu’on vient de voir
• Les bactéries:
– Leur morphologie
•
•
•
•
Bacilles
Coques
Gram
zielh
– Leur anatomie
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Mise en évidence des MO
• Les voir : diagnostic direct
–
–
–
–
Examen direct
Culture
Antigènes solubles
Biologie moléculaire
• Voir les réactions spécifiques de
l’organisme : diagnostic indirect
– Recherche d’anticorps
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Informations données par
l’examen direct
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Mise en évidence des MO
• Examen direct
– Rapide
– Préciser ce que l’on cherche : colorations
spéciales
– Germe mort ou vivant……
– Nécessite un nombre important de germe
présent……
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Mise en évidence des MO
• Culture
– Milieux spécifiques
– Atmosphères spécifiques
– Le germe DOIT être VIVANT à
l’ensemmencement
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Mise en évidence des MO
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Mise en évidence des MO
Recherche d’antigènes solubles
- mise en évidence
de fragments de bactéries
- par des méthodes immunologiques
- pour certaines bactéries
À demander spécifiquement
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Mise en évidence des MO
• Nouvelles techniques de biologie
moléculaire
–
–
–
–
PCR…….
PCR spécifiques
Attention aux inhibiteurs +++++
Prix…….
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Mise en évidence des MO
• Typages
– Sérotypages
• pour certaines bactéries seulement
– Pyocyanique
– Salmonelle
– Carte d’identité complète
– Biologie moléculaire
• Étude de fragments
• Séquençage
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Mise en évidence des MO
• Sérologie
– Mise en évidence des anticorps
– Préciser lesquels +++++
– Attention à la cinétique de production
• Latence (légionelles)
• Taux
– Différentes classes d’immunoglobulines
• IGM
• IGG…
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Mise en évidence des MO
• Attention
– Demander spécifiquement ce que l’on veut
– Prescription médicale
•
•
•
•
•
Obligatoire
Précise
Concise
Centrée sur la clinique
Respectant la chronologie de l’infection et de son
évolution
– Bien prélever et bien transporter
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Intérêt pour les hygiénistes
• Connaître
– les conditions favorables de développement et
de multiplication des germes
• Comprendre
– Les noms, les examens, les diagnostics, les
délais nécessaires etc…
• Pour pouvoir discuter avec les autres
membres de l’équipe de soin.
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