Transcript 02-第一共研生醫資源中心說明會

顯微影像核心
Imaging Core
基礎醫學大樓R1448
黃呈彦
服務項目: 儀器設備
離線軟體
敎用以及諮詢
委託操作
申請及使用資格
開放時間
收費標準
罰則
螢光顯微鏡
fluorescence Microscopy(Zeiss)
Imager A1(A1)
Reflector:
DAPI,FITC,TRITC
Lens: 10X, 20X, 40X
100X(oil)
Software: AxioVision
Axioplan-2 (A2)
Reflector:
DAPI,FITC,TRITC
Lens: 10X,20X,40X,
100X(oil)
Software: PictureFrame
數位影像整合系統(MicroBrightField)
Reflector:GFP,RFP
Lens: 4X,10X,20X,
40X(oil),60X(oil),100X(oil)
Software: SI-color,SImono, Neurolucida
活細胞影像系統(Live Imaging)
ASTEC
Leica
LED : GFP
Lens: 10X
Software: CCM
Reflector:DAPI,FITC,TRITC
Lens: 10X,20X,40X
Software: MetaMorph
雷射共軛焦顯微鏡
Confocal Microscopy(Leica)
SP2
Laser: Ar,HeNe,GreNe
SP5
Laser:405,Ar,HeNe,GreNe
Lens: 10X,20X(oil),
Lens: 10X, 20X, 63X(oil)
40X(oil),63X(oil),100X(oil)
Software: LAS AF Lite
Software: LAS AF Lite
SP2
DsRed ER
Transmission
SP5
DsRed ER + DAPI
DIC
全內反射螢光顯微鏡TIRF+live (Zeiss)
Laser:405,488,561,635
Lens: 10X, 20X, 40X(oil),
63X(oil), 100X(oil)
Software: AxioVision 4.8
Fluorescence
TIRF
離線軟體(Software)
MetaMorph 7.7
AxioVision 4.8
Image Pro Plus 6.0
Volocity (5.5): 3D image quantitation and
4D tracing
Las AF Lite release
AxioVision 4.8 release
Visulization & Restoration :
Allowers the user to import Z stacks of
flourescently labeled 2D images acquired
using a confocal or wide field microscope and
create an interactive 3D rendering.
→
PerkinElmer
Quantitation:
3D colocalization, ratio and FRET images analyses.
4D (3D time lapse) tracing.
儀器敎用以及諮詢
教育訓練課程
教學影片出借:
Confocal SP5
Live imaging (ASTEC & Leica)
操作手冊
儀器與軟體使用教學與諮詢
申請及使用資格
儀器開放對象為醫學院與附設醫院各系所及
相關研究單位。
親自操作儀器:
參加
R1405
R1448
R1405
教育訓練 紙本預約 使用儀器 交繳費單
夜間使用：
日間使用五次以上
使用儀器時
R1448
且無不良紀錄者 管理員認證 需刷卡進出
委託操作：洽R1448管理員預約
研發分處第一共研網頁
http://www.mc.ntu.edu.tw/staff/ard/
開放時間
日間開放時段：
AM 8:30~ PM 17:00
夜間開放時段：
PM 16:30~ PM 10:30
收費標準(以1小時為計價單位)
儀器設備 (Fluorescence microscopy)
Zeiss Axiophot 2
Zeiss AXIO Imager. A1 , AX10
自行操作
40 / hr
40 / hr
無委託操作。
管理員教學: 每人100/hr
儀器設備
顯微照相數位化整合系統
自行操作
50元/hr
無委託操作。
管理員教學: 每人200/hr
儀器設備(Live image)
ASTEC
Leica DM IRE 2
委託操作: 200/hr(設定時間)。
管理員教學: 每人200/hr
自行操作
50元/hr
50元/hr
儀器設備
共軛焦顯微鏡 Leica SP5 及Leica SP2
Leica SP5
使用aser
自行操作
Leica SP5
不使用aser
SP5 450 / hr SP5 300 / hr
Leica SP2
不使用UV
SP2 150 / hr
委託操作: 200/hr
管理員教學: 每人200/hr
儀器設備
全內反射顯微鏡
4D影像追蹤軟體(Volocity)
自行操作
300 / hr
操作員操作
600/ hr
8:30~13:00 50/hr,
13:00~17:00 100/hr
管理員教學: 每人500/hr
預約之後因故未使用，並且未於登記使用日
前24小時取消預約者，須付50%費用。
罰則
一、若於預約時段開始15分鐘內未使用，則喪失該時段優先使
用權，並視同違約一次，達三次違約者，停止其預約登記
權利一個月。
二、有下列情形者計違規一次：
(1 ) 未經教育訓練就自行使用儀器。
(2 ) 以自己名義登記給他人使用。
(3 ) 自行加裝電腦軟硬體或更動系統設定。
(4 ) 違反操作規定第柒項之任一項。
三、違規者第一次口頭警告，第二次取消使用儀器一個月，第
三次永久取消儀器使用權。
四、若因自行操作不當造成儀器損壞，則提報研發分處會議議
處，使用者即刻停權，並由該實驗室負責人負全部維修與
賠償責任，並支付所有費用。
五、其他規定未盡完全者，悉依臺大醫學院研究發展分處第一
共同研究室與本校 其他相關規定辦理。
管理員
實機操作與軟體教用，軟硬體設
R1448黃呈彦 博士
(88930)
備維護，樣品製備諮詢，夜間與
[email protected] TIRF使用認證，TIRF預約登記
共軛焦顯微鏡，螢光顯微鏡，數
位整合顯微鏡之預約登記，收取
繳費單與開立收據，TIRF繳費
R1405李學良 技士 (88505)
活細胞影像系統預約登記，收取
繳費單與開立收據
R1405陳佳圓 助教(88501)
致謝第一共研影像核心
We thank the staff of the imaging
core at the First Core Labs,
National Taiwan University
College of Medicine, for technical
assistance.
第一共研生醫資源中心
詹琍婷
Outline
 提供索取生物材料
 提供相關技術支援服務
人類疾病模式生物中心服務窗口
◎ 生醫資源中心目前所收集之生物材料種類簡介：
一、各種基因功能分析之質體、載體：（~470個）
(1) 可於細菌、昆蟲及哺乳動物細胞中表現之質體
(2) 可於細胞膜、細胞核、粒腺體…等特定位置標定之質體
(3) 可表現CFP、GFP、YFP、RFP…等質體
(4) 各種基因功能分析之質體
(5) 可表現各種siRNA、miRNA之質體
(6) Adenoviral、lentiviral及retroviral vectors
(7) 酵母菌相關之各種質體
二、細胞株：
(1) 各種適用於轉染及表現特殊蛋白質之細胞株
(2) 哺乳動物之肝癌、乳癌、腸癌、淋巴癌…等細胞株
(3) 血液及神經相關細胞
三、微生物：E.coli competent cell（DH5a and BL21(DE3) ），
Staphylococcus及Streptococcus之標準菌株
四、Yeast two-hybrid cDNA library （pACT2）：
(1) human fetal kidney
(2) human fetal liver
(3) Mouse kidney
(4) Mouse liver
(5) Mouse testis
五、抗體：各種自公司購得及7種由院內老師實驗室自製之抗體
資料庫內容將不對外公開， 若您曾提供生物材料至
本中心，可來信要求瀏覽資料庫內容
陳美麟 小姐，分機 88283
技術支援服務項目
提供實驗技術教學錄影帶
組織細胞初步培養
篩選基因穩定表現細胞株
mini- /midi- kit
CsCl banding
純化質體
質體建構
純化蛋白質
BL21 (DE3)
Baculovirus
酵母菌雙向雜交篩選
建構基因資料庫
cDNA library
Genomic DNA library
申請生物材料：
申請人將欲索取之材料的編號告知資料管理員(陳美麟 小姐，分機
88283 或 [email protected])。
申請技術支援服務：
填寫申請書，用電子信件方式寄送到生醫資源中心信箱(email:
[email protected])，收件人：詹琍婷。
索取生物材料
申請表
台大醫學院第一共同研究室 人類疾病模式生物中心
The Center for Human Disease Modeling
人類疾病的酵母菌模式核心實驗室
Yeast Core Facility for Human Disease Model
諮詢：鄧述諄 博士(微生物所)、李芳仁 博士(分子醫學所)
林育誼 博士(生物化學暨分子生物學所)
呂金盈 醫師(台大醫院檢驗醫學部)
人類疾病的線蟲動物模式核心實驗室
C. elegans Core Facility for Human Disease Model
諮詢：潘俊良醫師(分子醫學所)，詹世鵬博士(微生物所)
人類疾病的果蠅模式核心實驗室
Drosophila Core Facility for Human Disease Model
諮詢：李秀香博士(分子醫學所)、吳君泰醫師(分子醫學所)
人類疾病的小鼠動物模式核心實驗室
Mouse Core Facility for Human Disease Model
諮詢:黃祥博醫師（醫研部）
陳佑宗博士（臨床基因所）
游益興博士、林淑華博士(醫技所）
服務內容：
人類疾病的酵母菌模式核心實驗室
諮詢及評估。
基因改造。
酵母菌雙向雜交測試。
特殊實驗須面議。
人類疾病的線蟲動物模式核心實驗室
協助線蟲操作之基礎訓練。
協助自國際機構(C. elegans Genetics Center/USA, National BioResource Project/Japan)取得基因
變異或基因剔除之線蟲品系。
指導或協助進行線蟲變異表現型之性狀分析。
協助取得線蟲之核糖核酸干擾(RNAi)載體。
指導或協助進行線蟲之核糖核酸干擾實驗。
人類疾病的果蠅模式核心實驗室
果蠅訊息傳遞路徑搜尋工具組幫忙尋找基因功能。
人類疾病的小鼠動物模式核心實驗室
協助完成基因剔除(KO)小鼠。
協助完成基因置入(KI)小鼠。
協助完成表現人類突變基因的小鼠。
協助將自國際機構(KOMP, EUCOMM, NORCOMM etc.)取得的基因剔除 ES 細胞株製成小鼠。
協助完成條件式組織特異基因剔除小鼠(Conditional KO)。
提供雙螢光工具鼠(Dr. 陳佑宗)。
組織細胞分離及初代培養(Dr.游益興)。
目前路徑搜尋工具組由49個是非題組成
Signaling (11) Cell death (4)
•Notch
•p53
•Hedgehog
•Foxo-p
•Wnt
•Grim
•EGFR
•dIAP
•JAK/Stat (Upd)
•PI3K (CA)
Cell motility (8)
•mTOR
Kinases (14)
•Cdc42 (DN, CA)
•Hippo
•CKI (DN, RNAi)
•Rho (DN, CA)
•robo
•GSK3 (DN, CA)
•Rac (DN, CA)
•PKA (DN, CA)
•Pak (CA)
Cell cycle (2)
•S6K (Kinase death, CA) •Dp
•Myosin light
•Mst
chain
•PCNA
•LIM domain kinase
Protein degradation (4)
•Proteasome DTS mutant
•Uba1 RNAi transgenic fly
•Autophagy (atg1, atg7
RNAi)
Histone (2)
•CG8445, H2A Dub
•Poly-Bromo
Microtubule (2)
•Tau
•Lis1
Vesicle trafficking (2)
•DN-Rab5
•DN-dymanin
1個疾病基因，49個是非題從開始做到完成要
1個助理，每天約1小時，4個月，4000NT
研發分處共同儀器
申請模式生物技術服務：
填寫申請書，用電子信件方式寄送到生醫資源中心信箱(email:
[email protected])，收件人：詹琍婷 博士。分機：88931