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第六章
微生物菌种的选育
江南大学生物工程学院
第一节 从自然界中分离筛选菌种
1、生产菌株来源
•
索取或购买
•
自己选育
 用原有菌株进行遗传改造进行育种
 向菌种保藏机构索取、购买出发菌株进行选
 从自然界中分离菌种
从自然界中分离菌种就是从自然界微生物
资源中有目的、快速、准确地选出所需要的菌
种。
从自然界中分离筛选菌种的一般步骤
设计方案→采样→增殖培养*→平板分离
→筛选(初筛、复筛)→单株纯种分离
→性能考察(生产性能试验、毒性试验、
菌种鉴定)
一、采样
从自然界种采集含目的菌的样品
1. 环境条件对土样本中微生物分布的影响
• 营养环境
• 水分
• 温度
• 通风
• 酸碱度
2 .采样方法
(1)去除表层土
(2)取5-15cm土样几十克,装入无菌牛皮低
袋或逆料袋中
3.注意
• 记录:时间,地点,环境情况等
• 样品袋应封好口,防止水分失去
• 土样应在分离前破碎
• 尽快分离
二. 增殖培养(富集培养)
•
适用:样品中目的菌数量不够多时
•
目的:提高样品中目的菌的数量和比例
•
原理:通过控制营养成分或培养条件,使目的菌
得以繁殖和/或非目的菌的生长受到抑制
1、增殖培养的 方法
 控制营养成分
 控制培养基pH
 控制培养温度
 热处理——增殖芽孢细菌
 添加抑制剂
三. 纯种分离
 目的:将目的菌从混杂的微生物中分离出来,
获得纯培养
1. 纯种分离的一般方法
(1)稀释平板法 倾注平板或涂布平板
(2)划线法
(3)组织分离法*
适用于分离高等真菌及植物病原菌
稀
释
分
离
涂
布
平
板
稀
释
分
离
倾
注
平
板
2、平皿反应快速检出法——定性或半定量

纸片培养显色法
 透明圈法
 变色圈法
 生长圈法
 抑制圈
琼
脂
块
培
养
法
筛
选
抗
生
素
产
生
菌
程
序
3、厌氧性微生物的分离法
(1)去除培养基中的溶解氧,降低Eh
(2)创造无氧环境
物理除氧 空气置换法:干燥器或厌氧培养罐
化学除氧 H2 + O2 → H2O (钯作催化剂)
 GASPAK罐除氧:硼氢化钠、柠檬酸,碳酸氢钠
化学反应产生H2 和CO2,H2与O2反应生成水
(3)厌氧分离(培养)技术
 高层琼脂柱技术
 厌氧罐技术
 厌氧手套箱技术
GasPak
厌氧培养装置
厌氧手套箱
四 、筛选
• 初筛、复筛:
初
筛
复
筛
种
子
斜 面 菌 种
液 体 种 子
摇
瓶
每 株 1 瓶
每 株 3 -5 瓶
接 种
量
取 舍 情 况
每 瓶 一 环
留 下 产 量 较 高 的 10- 20% 的 菌 株
3— 5%
每 次 保 留 10— 20% ,
直 至 最 后 3— 5 株
好氧培养
五、培养工艺条件试验与生产试验
1、摇瓶发酵条件
培养基组成、初始pH、通风量(装液量)、接种量、
培养温度…
2、小型台式发酵罐发酵工艺条件
溶解氧控制,pH值控制,原料添加模式,消泡剂…
第二节 基因突变
突变(Mutation)定义:遗传物质核酸(DNA或病
毒中的RNA)的分子结构或数量突然发生了可遗传
的变化。
 突变是一种遗传的状态,是基因由于结构发生改变
从而由原来的存在状态变为另一种存在状态,即它
的等位基因。
 突变体:带有突变基因的细胞或个体
 突变型:突变体的基因型或表型称为突变型,和其
相对的原存在状态称为野生型。
一、 突变类型
按变化范围分突变类型
(一)染色体畸变(chromosome aberration)染色
体数目的变化或染色体结构发生较大片
段的异常改变。
1、染色体数目的变化
1) 整倍体(euploidy):含有完整的染色体组
① 单倍体:haploid
② 二倍体:diploid
③ 三倍体:triploid
④ 四倍体:tetraploid
2) 非整倍体 aneuploidy:含有不完整状态的染
色体组,一般是指二倍体中成对染色体成员
的增加或减少。
① 单体(二倍减一,monosomic diploid): 2n-1
② 缺体(二倍减二,nullisomic dilpoid): 2n-2
③ 三体(二倍加一,trisomic diploid): 2n+1
④ 四体(二倍加二,tetrasomic diploid): 2n+2
⑤ 双二倍加一(double trisomic): 2n+1+ 1
⑥ 部分二倍体(merodiploid):细菌等原核生
物中由一整条染色体和外来的一个染色体片
段所构成的不完整二倍体。
2、染色体结构的变化
①
②
③
④
缺失 deletion:
重复 duplication :
倒位 inversion:
易位 translocation :
b f
(二) 基因突变(gene mutation)
----染色体局部座位内的变化
• 点突变:只涉及DNA分子中一对或少数几对碱
基的改变。突变发生在一个基因范围内。
• 多位点突变:突变超出一个基因范围。
1、碱基置换 base replacement
DNA链上的某一碱基对为另一碱基对所取代。
(1)转换 transition :
(2)颠换 transversion:
A
G
T
C
转换
颠换
图 21-1 转换与颠换
(3) 遗传学效应
① 错义突变 missense mutation:
② 同义突变 silent mutation:
③ 无义突变 nonsense mutation:
表 21-2 点突变的类型(以 Tyr 的密码子为例)
无义突变
DNA TAC→TAA , TAG
↓
↓
↓
↓
RNA UAC UAA UAG
↓
↓
↓
↓
aa Tyr Och
Amb
同义突变
TAC → TAT
↓
↓
UAC
UAU
↓
↓
Tyr
Tyr
错义突变
TAC→ TCC
↓
↓
UAC
UCC
↓
↓
Tyr
Ser
2、移码突变 frameshift mutation:由于一对或
少数几对(不是三的倍数)核苷酸的插入或缺
失而造成此后一系列遗传密码子的阅读框发生
移位错误的突变。
Phe
5’-TTC
Asp
GAT
Glu
GAG
Phe
5’-TTC
Asp
GAT
Lys
AAG
Phe
5’-TTC
Asp
GAT
Lys
AAG
Phe
5’-TTC
Asp
GAT
Lys
AAG
Pro
Leu
Cys
CCC
TTG
TGC
↓G→A mutation
Pro
Leu
Cys
CCC
TTG
TGC
↓C→T mutation
Pro
Leu
Cys
CCT
TTG
TGC
↓C→A mutation
Pro
Leu
Stop
CCC
TTG
TGA
Thr
ACG-3’
Thr
ACG-3’
Thr
ACG-3’
Thr
ACG-3’
Phe
5’-TTC
Asp
GAT
Glu
GAG
Phe
5’-TTC
Asp
GAT
Lys
AAG
Pro
Leu
Cys
Thr
CCC
TTG
TGC
ACG-3’
↓Insertion of A
Thr
Leu
Val
His
ACC
CTT
GTG
CAC G-3’
二、按表型效应分突变类型
•
•
1
2
•
•
野生型 wild type:表现该物种正常表型的生物。
突变型 mutant:由于突变导致其正常的表型发生
了改变的生物。
形态突变型
生化突变型
营养缺陷型 auxotrophic mutant
抗性突变型 resistant mutant
3. 致死突变型
4. 条件致死突变型
5. 调节突变型
三、基因突变的规律
不对应性或自发性、
随机性 、 稀有性、 独立性、
稳定性、 可逆性、 诱变性 、
1、自发突变的证实 随机性、不对应性
1)波动实验
2)涂布实验
3)影印培养实验
波动实验
E.coli B 抗噬菌体a的波动测验结果
培养皿上菌落数
培养皿编号
样品来自同一培养物
样品来自不同培养物
1
14
46
4
1
1
0
2
15
56
2
0
0
0
3
13
52
2
3
0
0
4
21
48
1
0
7
0
5
15
65
5
0
0
8
6
14
44
2
5
303
1
7
26
49
4
0
0
0
8
16
51
2
5
0
1
9
20
56
4
0
3
0
10
13
47
7
6
48
15
11
107
1
0
12
0
4
0
13
0
19
14
0
0
15
1
0
16
0
17
17
0
11
18
64
0
19
0
0
20
35
平均值
16.7
51.4
3.3
11.35
30
3.8
方 差
15
27
3.8
694
6620
40.8
四、突变的频率:
• 突变率(mutation rate):每个细胞每一世代
中发生突变的概率。
世代总数=N2-N1
突变率的测定:
• 固体平板法测突变率:m=(M2-M1)/(N2-N1)
• 液体培养法测突变率:m=2(M2/N2-M1/N1)/(g2-g1)
• 液体稀释法测突变率:P0=e-mN
细胞分裂非同步性效正:突变率=ln2m=0.69m
五、自发突变的机制
环境因素的影响
微生物自身产生的代谢物的影响
转座子所造成的插入突变
DNA复制过程中偶尔发生错误
六、诱变剂及其诱变机制
诱变是指通过人为的方法,利用物理、
化学因素处理微生物而引起的突变。
(一) 物理诱变剂
1)辐射:uv,x-射线γ-射线等
效应:点突变或染色体畸变
机制:直接作用和间接作用
间接作用:辐射作用于染色体外物质,产 生
具有诱变作用的物质;
直接作用:辐射直接作用于染色体,
2)热:机理复杂
3) 离子束:
能量传递、动量交换,离子沉积与电荷积累
过程
1、紫外线 UV
• 有效波长 2650Å,紫外灯波长 2537 Å
• 作用机理 嘧啶二聚体、嘧啶水合物、
交联作用、DNA链断裂
• 效应: 移码突变,碱基置换
紫外线诱发胸苷二聚体
O
H
O
CH3
H
N
O
UV
CH3
O
H
N
N
Thymine
H
O
O
CH3 CH3
H
N
N
H
N
O
N
Thymine
H H
N
Thymine dimer
O
O
4
5
4
5
3
6
6
2
1
Fig. 21- Production of thymine dimer by ultraviolet light irradiation.
O
2、电离辐射:x-射线,g-射线
• 作用机理
直接作用:打断化学键
间接作用:通过自由基打断化学键
• 效应:染色体畸变,碱基置换,移码突变
3、热
• 作用机理:脱嘌呤
• 效应:碱基置换,移码突变
4、离子束
(二) 化学诱变剂
1. 碱基类似物:是指其分子结构同DNA分子
中的碱基非常类似,因此能取代碱基参入
到DNA分子中的一类化合物。
主要诱变剂:5-溴尿嘧啶和2-氨基嘌呤;
可诱发AT
GC的转换。
碱基类似物 base analog
5-溴尿嘧啶(5-BU,BU), 5-氟尿嘧啶(5-FU,FU),
5-氨基尿嘧啶(5-AU,AU), 2-氨基嘌呤(2-AP,AP)
8-氮鸟嘌呤(8-NG,NG)
例:BU
烯醇式:BUe,高频出现,BUe ≡G
酮式: BUk,低频出现, BUk=A
A
A
G
G
T
BUK
BUE
C
酮式
烯醇式
5-BU掺入后的掺入错误
5-BU复制错误
G≡ C
G ≡ BUe
G≡ C
A:T
G≡ C
A=BUk
A=T
G ≡ C→A=T
G ≡ BUe
A: BUk
A:T
A:T
G ≡ BUe
G ≡C
A: T → G ≡ C
G ≡ BUe
2. 移码诱变剂
嵌入DNA 分子相邻碱基对之间,从而有
利于核苷酸的环出,因此可提高移码突
变的突变率。
主要诱变剂:吖啶类化合物;溴化乙锭
(ethidium bromide),ICR系列化合物等
部分移码诱变剂
(a) 增加碱基
DNA
插入剂
插入剂分子
模板链 5’ ATCAG TTACT3’
新合成链 3’TAGTC G AATGA5’
0.68nm
随机选择碱基
嵌入插入剂处
下一轮复制
5’ ATCAG C TTACT 3’
3’TAGTC G AATGA 5’
(b)缺失碱基
模板链 5’ ATCAG T TACT3’
新合成链 3’TAGTC ATGA5’
插入剂失去
后复制
插入剂
5’ ATCAGTACT 3’
3’TAGTCATGA 5’
图 21-15 插入突变导制碱基的增加(a)和减少(b)
3.化学修饰碱基的诱变剂
1)烷化剂:使DNA分子的碱基发生烷化反应,从
而更容易发生错配,是最常用的一类诱变剂。
常用的有:硫酸二乙酯(DES),甲基磺酸乙酯
(EMS),亚硝基乙基尿(NEU), 亚硝基胍(NTG),
乙烯亚胺(EI)等。
NTG(亚硝基胍)诱变作用特强,作用于复制叉,
可诱发多基因并发突变,被称为超诱变剂。
Chemical reactivity of bases is
responsible for some DNA lesion
部分烷化剂和烷化碱基
alkylating agents
Alkylated bases
DNA的脱嘌呤
烷化鸟嘌呤的碱基配对
烷化鸟嘌呤的交联作用
•
如甲基黄酸乙脂(EMS)
使G的第6位烷化,使T的第4位上烷化,结
果产生的O-6-E-G和 O-4-E-T分别和T、G配对,
导致G∶C对转换成A∶T对;T∶A对转换成C∶G
G
O-6-E-G
A
T
O-4-E-T
C
T
T
A
G
C
G
2) 亚硝酸(introus acid, NA)有氧化脱氨作用,
可使G第2个碳原子上的氨脱去,产生黄嘌呤
(xanthine,x),次黄嘌呤 (H) 仍和C配对,
故不产生转换突变。但C和A脱氨后分别产生
U和次黄嘌呤H,产生了转换,使C∶G转换成
A∶T,A∶T转换成G∶C
HNO2
A
H
G
G
A
A
T
C
C
C
U
T
HNO2
3) 羟胺(NH2OH)只特异地和胞嘧啶起反应,在
第4个C原子上加-OH,产生4-OH-C,此产 物可以
和A 配对,使C∶G转换成T∶A
• 作用:与C反应,造成GC→AT转换
HA
C
4-OH-C
T
G
A
A
七、DNA损伤的修复
1、光复活作用 photoreactivation
2、切补修复 excision repair(暗复活)
Damage
Mutant base is mismatched
and/or distorts stractur
Incision
Endonuclease cleaves on
both sides of damaged ba
Excision
Exonuclease removes DNA
Between nicks
Synthesis
Polymerase synthesizes
Replacement DNA
Ligase seals nick
Fig. 21- Excision repar removes and replaces a stretch of DNA that includes the dameged base (s)
第三节
诱变育种
一、诱变育种的一般步骤
出发菌株
↓纯化、活化、同步培养
培养液
↓离心收集细胞、洗涤,制备均一的菌悬液(玻璃株打散、过滤)
单细胞或单孢子悬液
↓活菌计数,诱变预备试验
诱变处理
↓活细胞计数,致死率计算
中间培养(后培养)
↓
平板分离
↓变异率计算
初筛→复筛→ 保藏及扩大试验
(一)
1.
2.
3.
4.
出发菌株的选择
出发菌株的类型
对诱变剂的敏感性
具有特定生产性状的可能性:
要尽量选择单倍体,单核细胞(孢子)
(二)菌悬液的制备
细胞的生长状态
菌悬液的均一性:
菌悬液细胞浓度
酵母、霉菌孢子:106~107个/ml
细菌、放线菌孢子:108个/ml
4. 菌悬液介质:
1.
2.
3.

(三)诱变处理
1.诱变剂的选择
 对于低产或野生菌,uv线往往是首选,烷化剂等
也是常用的诱变剂;对于经多次诱变处理的菌株,
常需要强辐射进行处理。
 碱基置换易回复,染色体畸变、移码等不易回复
 细胞的透性和生理状态
 经常变换诱变剂或复合处理
2.剂量选择
最适剂量因诱变剂的类型、出发菌株及其生理状态的
不同而不同。亚硝基胍在低死亡率剂量时突变率较
高,而uv则在高致死率时才有较高的突变率。
高产菌株在低剂量时效果较好,而对多核细胞处理剂
量不宜过低。质量性状宜选用高剂量。
经多次诱变处理已钝化的菌株可用一次高剂量处理来
激活
突变率/ %
3 处理方法
 单一诱变剂处理;
 复合处理
20
18
16
14
12
10
8
6
4
2
0
1- 对照;
2-乙烯亚胺(浓度1:7000);
3, 5, 7, 9-紫外线;
4, 6, 8, 10-乙烯亚胺加紫外线
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
试验号
乙烯亚胺与紫外线复合诱变处理结果
紫外线的剂量(erg/mm2):
3, 4-2000;5, 6-4000;
7, 8-6000;9, 10-10000
形态突变型
负突变型
正突变型
X-射线的照射剂量与亚热带链霉菌白霉素高产菌株39#变异的关系
紫外线照射剂量与龟裂链霉菌土霉素高产菌株293#变异的关系
(四)后培养
目的使突变基因纯合并表达,消除表型
延迟。
 后培养培养基:营养要求丰富,酪素水
解液(或蛋白胨)可提供大量氨基酸,酵
母膏可提供各种生长因子。
(五)变异菌株的分离及筛选
• 筛选:包括初筛,复筛和终筛等。
• 明确筛选目标:产量突变还是其它突变型;
产量准备提高多少等;
• 一次诱变目标不要太高
• 制定筛选方案:筛选准备分几步;筛选采
用的培养方法和培养条件;每一步准备筛
选多少菌株;每一步准备采用的分析方法
等。
诱变育种工作中应注意的问题
 安全问题:各种诱变剂几乎都有致癌作用,因此在操作中应
时刻注意安全问题:个人安全和环境安全。
 个人安全:操作时注意防护,不同诱变剂要求不同防护方法,
如γ-射线辐射防护要求较高,uv要求较低,而化学诱变剂则
要求不与身体有关部位直接接触;
 环境安全:所用物品要经解毒处理;液体经解毒或充分稀释
才可以排放。
 要养成良好的工作习惯:如仔细观察细微的形态变化、要详
实记录菌株的诱变史和诱变谱系。
 诱变育种技术要和其他育种手段相结合。
 诱变育种由于其筛选的盲目性,突变的不定向性,工作量十
分大,因此要对整个工作进行合理的设计并结合新技术提高
其工作效率。
二 、营养缺陷型突变株的筛选
营养缺陷型(auxotroph)突变株:
是指丧失了合成一种或多种必需生长因子能力
的菌株,它们只能在补充了相应的生长因子的培
养基上才能正常生长。
营养缺陷型突变株的用途
科研上:
研究代谢途径;
基因重组的遗传标记菌种;
AA、碱基、维生素生物测定的试验菌种
生产上:
发酵法生产氨基酸,核苷酸的生产菌种;
生产菌株杂交育种的亲本进行遗传标记
 完全培养基 Complete Medium (CM)
含有满足某微生物的所有营养缺陷型和野生型菌
株生长所需营养物质的天然或半合成培养基。
 基本培养基Minimal Medium(MM):
不含生长因子仅能满足某微生物的野生型菌株生
长需要的最低成分合成培养基。
 补充培养基Supplemented Medium(SM):
补充了一种或数种生长因子,以满足某微生物的
特定的营养缺陷型生长的培养基,其中的生长因子
多是通过直接添加AA、碱基或维生素而提供。
(一) 筛选方法
 后培养
淘汰野生型
检出缺陷型
鉴定缺陷型
1、淘汰野生型
 原理:限制营养成分使缺陷型细胞生
长受抑制,野生型细胞在生长过程中
被杀死或生长后被除去
 方法:
 抗生素法:
 菌丝过滤法:适用于丝状真菌
 差别杀菌:
抗生素淘汰野生型
 饥饿培养:培养细胞经离心、洗涤后,悬浮
于无氮基本培养基中培养1-2小时,耗尽细胞
内氮源,防止加抗生素后的“误杀”;
 加抗生素处理:加入等体积的2N基本培养基
(两倍浓度氮源的基本培养基),同时加入
抗生素,培养一定时间,野生型细胞由于生
长而被杀死,缺陷型细胞处于休止状态而得
以保留。
 制霉菌素可用于处理酵母菌和霉菌。
 注意:培养基应添加渗透压稳定剂而制成高
渗培养基,可避免由于细胞破裂而给缺陷型
提供营养物质。
2、检出缺陷型
1)限量补充法
2)夹层培养法
3)逐个检出法
4)影印培养法
3、鉴定缺陷型----生长谱法
大类的鉴定:
营养因子:
A、酪素水解液(AA混合物)
B、水溶性维生素混合液
C、酵母核酸水解液(碱基)
D、酵母膏水溶液
制备平板:缺陷型菌经CM液体培
养后,离心洗涤,制成107~108个
/ml菌悬液。取0.1ml涂布至MM平
板上
A
D
B
C
方法:分别用无菌小滤片沾取少许各种营养因
子后,放入接种的MM上,适宜温度下培养
判断: A、D生长,AA缺陷型
B、D生长,维生素缺陷型
C、D生长,碱基缺陷型
A~B、D生长,AA、维生素双缺
A~C、D生长,AA、碱基双缺
B~C、D生长,维生素、碱基双缺
详细鉴定
生长因子组合法
组
生长因子
甲
1
2
3
4
5
6
乙
2
7
8
9
10
11
丙
3
8
12
13
14
15
丁
4
9
13
16
17
18
戊
5
10
14
17
19
20
己
6
11
15
18
20
21
营养缺陷型的生长谱鉴定
天冬氨酸
AKase
天冬氨酰磷酸
天冬氨酸半醛
Hse
Met
二氨基庚二酸
Thr
Lys
Ile
钝齿棒杆菌L-赖氨酸生物合成途径及调节
不同类型突变株积累L-赖氨酸的水平
突变菌株
突变型
产量(mg/ml)
钝齿棒杆菌
Hse-
17.93
钝齿棒杆菌
钝齿棒杆菌
Thr Thr - +Met -
2.33
2.00
钝齿棒杆菌
AECr
AECr, HseHseHse-,AECr
20.0
50.0
36.6
45.0
北京棒杆菌
三、 其它类型突变型的筛选
(一)抗代谢类似物突变型的筛选
抗反馈调节突变株:是指一种对反馈抑制不
敏感或对阻遏有抗性的组成型突变株,或兼
而有之的突变株。
 代谢类似物:结构与代谢物类似,因此可起到代
谢物所具有的调节作用的一类化合物。
1、抗反馈抑制突变
发生基因突变的细胞:酶的结构基因发生
突变导致调节酶的调节部位发生改变,不
再与结构类似物(或产物)结合,从而解
除了产物的反馈抑制作用,使产物得以合
成。
突变前
突变后
抗反馈抑制突变的机制
2、抗反馈阻遏突变型
• 由于调节基因发生突变,使产生的阻遏蛋白不
再能和辅阻遏物结合,或由于操纵基因发生突
变,被激活的阻遏蛋白不能作用于已突变的操
纵基因,从而解除产物的阻遏作用,使产物得
以过量积累。
抗反馈阻遏突变的机制
3、 筛选方法
(1)将经过诱变的细胞直接涂布在含有一
定浓度结构类似物的基本培养基平板上,
长出的菌落即为抗结构类似物突变株;
(2)将经过诱变的细胞涂布在基本培养基
平板上,在平板的中央加少量结构类似
物,在抑菌圈内长出的个别菌落即为抗
结构类似物突变株;
注意:
• 如果是协同反馈抑制,则要在基本培养
基中添加起协同反馈抑制作用的产物
• 抗结构类似物突变是数量性状,可通过
逐渐提高结构类似物的浓度使产物的积
累水平逐渐提高
结构类似物和代谢终产物
终产物
精氨酸
结构类似物
D-精氨酸
苯丙氨酸
赖氨酸
酪氨酸
色氨酸
对氟苯丙氨酸,噻吩丙氨酸
脯氨酸
腺苷酸
葡萄糖
3,4-二氢脯氨酸,磺胺胍
2-氟腺嘌呤
2-脱氧葡萄糖
AEC
对氟苯丙氨酸,D-酪氨酸
5-碱基色氨酸,6-甲基色氨酸
蔗糖,麦芽糖
2-脱氧棉子糖
纤维二糖,葡萄糖 甘油
过量积累产物
精氨酸
苯丙氨酸
赖氨酸
酪氨酸
色氨酸
脯氨酸
腺苷酸
b-葡萄糖苷酶
蔗糖酶
纤维素酶
(二)组成型酶突变株的筛选
1、诱导型酶在生产上的缺点
 诱导物往往价格昂贵
 受诱导物种类,浓度及分解产物的影响
2、筛选原理
通过诱变处理,使调节基因发生突变,不
产生有活性的阻遏蛋白,或者操纵基因发生突
变不再能与阻遏物相结合,从而使诱导型酶变
为组成型酶。
3、筛选方法
创造一种有利于组成型菌株生长而不利于
诱导型菌株生长的培养条件,造成对组成型的
选择优势或者适当的识别两类菌落的方法,从
而把组成型突变株选择出来。
 恒化器法
以诱导物作底物,浓度低于起诱导作用浓度,
诱导型菌株生长极弱,而变异株由于能产分解
底物的酶,则能分解底物而得以生长,通过连
续不断加入新鲜基质,使变异株数量逐渐增多,
最后达到能分离的浓度。
 循环培养法
不含诱导物培养基 ↔ 含诱导物培养基
(普通碳源或氮源) (诱导物作唯一碳源或氮源)
两菌都能生长 ,但组
成型变异株已能合成
特定的酶,亲株不能
变异株调整期短,亲株调
整期长,短时间培养后,
变异株所占比例增大
反复循环培养几次后,变异株所占比
例逐渐提高,然后进行分离
(三)细胞膜透性突变型
1、提高细胞膜透性的优点
• 使胞内产物浓度维持较低的水平,有利
于酶促反应的进行,提高产物的生成量
• 使胞内产物浓度维持低于发生反馈抑制
或阻遏的程度,以积累过量的产物
2、提高细胞膜透性 的措施
第四节 基因重组
遗传重组的一般概念
遗传重组(基因重组):遗传重组是指遗传
物质从一个细胞向另一个细胞传递并导致
DNA交换和重排的过程。
遗传改造的手段包括基因突变和基因重组
微生物中基因重组的方式:
• 真核微生物:有性生殖和准性生殖;
• 原核微生物:接合、转化、转导
一、细菌的转化
定义:受体细胞直接吸收裸露的外源DNA
并与其自身遗传物质发生重组,从而使
受体细胞获得共体细胞部分遗传性状的
现象。
1、转化过程
• 感受态受体细胞
• 转化因子的吸附和吸收
• 转化因子的整合及转化子的形成
转化过程
转化因子的整合
二、 转导
Transduction
通过噬菌体作为媒介,而把一个细
菌的基因导入另一个细菌的过程叫转导。
转导的组分:
供体细菌,受体细菌,转导噬菌体
(一)局限性转导specialized
transduction
只能传递供体染色体上原噬菌体整合
位点附近的少数固定基因的转导。
1、转导噬菌体的形成
• Campbell模型(不正确切离)
• 形成频率:10-6
2、转导子的形成
• 稳定转导子的获得——双交换
• 不稳定转导子的获得——溶原化
(二)普遍性转导
generalized transduction
• 能传递供体的任何基因的转导。
1、转导噬菌体的形成
• 选择性包裹模型
• 形成频率:10-6
2、转导子的形成
• 完全转导与完全转导子
Complete transduction
通过双交换而实现
约占1/10
• 流产转导与流产转导子
Abortive transduction
进入受体的供
体DNA片段既
不复制,也不
整合,但能正
常表达。
3、共转导 cotransduction
• 由一个转导噬菌体同时传递两个供体基因
的转导。
• 共转导的频率
普遍性转导与局限性转导的区别
能转导的基因
普遍性转导
局限性转导
供体的任何基因
特定基因, l:gal,bio
噬菌体在供体菌中 无特定的位置
的位置
转导噬菌体的获得 自发裂解或诱导裂解
转导子
有特定的位置
gal-l-bio
诱导裂解
非溶源性
缺陷溶源性
1/10稳定的完全转导子 1/3稳定转导子
9/10不稳定流产转导子 2/3不稳定转导子
三、 细菌的接合
• 供体细胞和受体细胞直接接触后,质粒
从供体细胞向受体细胞转移的过程。
Conjugation is the mechanism by which
genetic material is transferred between two
cells by plasmids.
1、 F- 、F+、 Hfr 菌株
F+菌株
Hfr菌株
F-菌株
F+
Hfr
2、细菌接合作用
(1)F+×F结果:F-转变为F+
(2)Hfr×FHfr DNA的转移
• 形成部分杂合子
• 通过双交换形成重组体
形成lac+ade+重组体
形成lac-ade+重组体
• F+与Hfr菌株的异同点
相同点
不同点
含有F因子,都具有性纤毛,都
具有接合作用
F+
Hfr细菌
对于吖啶橙处理
稳定
F因子易失去
传递供体染色体
基因
F因子本身转移
高频(10-3 ~ 10-4)
低频(10-6 ~ 10-7)
基本不能
频率70%以上
随细菌染色体复制
独立复制
F因子复制
3、F因子转导
•
•
•
F’ 因 子 : 带 有 细 菌 基 因 的 F 因 子 。
例 F-lac,F-gal,F-pro…
F’因子的形成:Hfr菌株中F因子的异常
切除(aberrant excision)
F因子转导(性因子转导、性导)
通过F’因子的转移而使受体细菌改变
其遗传性状的现象
四、 真菌的有性生殖
Sexual reproduction
一、真菌有性生殖过程
二、粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的生活史
五、 真菌的准性生殖
Parasexual reproduction
• 能进行准性生殖的微生物:
Aspergillus nidulans; Asp. niger; Asp. sojae
Penicillium chrysogenum; Fusarium
oxysporum
(一)准性生殖的过程
异核体形成;
(杂合)二倍体形成;
体细胞交换和单元化
1、异核体的形成
• 异核体细胞:并存有两个不同遗传性状
的核的细胞
• 异核体菌丝体:由异核体细胞构成的菌
丝体
• 异核体的无性繁殖:产生亲代类型的单
倍体分生孢子
• 异核体的生物学意义:具有生长优势;
可以储备隐性突变
2、异核体的形成
(1) 选择亲本
A. 亲缘关系近
B. 生活力、产生分生孢子的能力及数量相
似
C. 带不同的遗传标记
(2) 创造形成异核体的条件
A. 限制性培养基
B. 孢子混合数量:106~108
(二)杂合二倍体的形成
1、形成:将106 ~ 107个异核体的分生孢子涂至
MM上,长出的少数菌落即为二倍体
2、检出:
避免异核体分生孢子重新形成异核体的措施
A. MM要十分纯正
B. 采用具有分生孢子颜色突变型和营养缺陷型
作遗传标记
(三)有丝分裂分离
二倍体在有丝分裂过程中发生基因重组,
使隐性基因得以表达,由此产生各种类
型的分离子。
1、体细胞交换与体细胞重组体
(1)体细胞交换:在有丝分裂过程中同源
染色体发生的交换。由此导致部分基因
的纯合化。
2、单元化过程与非整倍体及单倍体分离子
单元化过程:是在一系列有丝分裂过程
中发生的染色体不离开行为的结果。
有性生殖与准性生殖的区别
有性生殖
准性生殖
导致有性孢子的产生,
其形态、生理均与营养
体细胞不同,往往产生
在特殊的囊器中
导致重组体细胞产生,
其和一般营养体细胞相
同,不产生在特殊的囊
器中
减数分裂导致基因重组,有丝分裂导致基因重组,
减数分裂中染色体交换 有丝分裂中,染色体交
和减半是有规律的协调 换和减少是不规则且不
过程,是必然的
协调的过程,是偶然的
六、 原生质体融合技术
1、原生质体融合育种的优势:
• 基因重组频率提高
• 重组的亲本范围扩大
• 融合子集中两亲本优良性状的机会增大
(一)原生质体融合技术的一般步骤
融合亲本的选择与标记;
原生质体的制备;
原生质体的融合;
原生质体的再生;
融合子的选择与鉴定;
目标菌株的筛选。
七、基因工程育种
Genetic engineering
重组DNA技术:recombinant DNA technology
基因工程是将不同生物的基因在体外人
工剪切组合并和载体(质粒、噬菌体、病毒)
DNA连接,然后转入微生物或细胞内,进行
扩增,并使转入的基因在细胞内表达,产生
所需要的蛋白质。
目的基因(DNA)
载体DNA
DNA连接酶
重组DNA
转化、转导或转染
受体细胞
筛选(利用遗传标记或分子生物学方
法等)
具表达目的基因功能的重组菌
基因工程操作的主要过程
一、目的基因的获得
主要方法
• 化学合成
• PCR扩增
• 从DNA文库中筛选
1、PCR体外扩增目的基因
Polymerase Chain Reaction —— 聚合酶链式反应
• 一种体外DNA扩增技术,用于扩增位于两端已知序
列之间的DNA区段(靶序列)
• 在DNA聚合酶催化下,通过两条人工合成的单链引
物的引导而扩增模板DNA片段的方法
(1)基本PCR组成:
• 含目标DNA序列的模板DNA (Template)
• 寡核苷酸引物 ( Primers):
界定复制范围两端的引物
• DNA聚合酶: (Taq. Polymearse)
• DNA合成底物及水:dNTPs
(2) PCR反应——三个主要步骤
• 变性( denaturation):90℃以上
• 退火( annealing):50~65 ℃
• 延伸(extension):72 ℃
20~30 个循环
2. 基因文库法
(1) 从共体菌基因组DNA获取目的基因
DNA文库: 生物染色体基因组各DNA片
段的克隆总体。
• 分离染色体DNA
• 用限制性酶部分水解
• 分离选出一定大小合适克隆的DNA片段
基因文库构建
步骤
• 提取DNA
• 酶解
• 电泳分离
• 与载体连接
• 导入宿主
• 筛选阳性克隆
二、优良载体的选择
• 优良载体应具备的特点
• 对E.coli受体细胞,载体有质粒载体、
λ噬菌体载体、柯斯质粒载体
三、目的基因与载体DNA的体外重组
• 粘性末端连接
• 平齐末端连接
四. 重组载体导入宿主细胞
• 转化或转染
• 体外包装与感染
• 电穿孔法electroporation
五、重组受体细胞的筛选和鉴定
•
•
•
•
遗传学方法:检测选择性标记
免疫化学方法:检测目的基因产物
核酸杂交方法:检测目的基因
直接检出法:检测基因产物
例一
选择性标记筛选
外源基因插入tet
钝化tetr
•受体细胞是Amp、Tetd
的敏感型
•在Amp+Tet培养基上生
长的是野生型质粒
•在Amp培养基上生长的
带有重组质粒
例二、b-半乳糖苷酶显色反应(蓝白斑试验)
检出携带外源DNA的载体
 b-半乳糖苷酶以四聚体形式存在
能将无色底物X-gal(5-bromo-4-chloro-3indolyl-b-D-galactoside)切割成半乳糖和深蓝色
的5-bromo-4-chloroindigo,菌落呈蓝色
宿主lacZDM15基因合成的是缺失N-末端11~41
氨基酸的缺陷型酶,无活性
pUC18等质粒具有lacZ’基因,所编码酶的N-末
端片段与lacZDM15产物组成有活性的酶
pUC18上在lacZ’中间具有MCS,外源DNA片
段的插入,使lacZ’无完整产物,不能与
lacZDM15 产物组成有活性的酶,菌落呈无色
八、基因定位诱变
定位突变site-specific mutagensis
用合成的DNA和重组DNA技术在基
因精确限定的残基上引入突变。包括删
除、插入和置换特定的碱基序列。
第六节 菌种退化、复壮与保藏
一.菌种的退化
1. 菌种退化degeneration的表现
生产性状的劣化,遗传标记的丢失, 原
有的典型性状的不典型等





菌落及细胞形态的改变
生长速度缓慢
代谢产物生产能力下降,即负突变
致病菌对宿主侵染力下降
抗不良环境条件(抗噬菌体,抗低温)能力
减弱
2. 菌种退化的原因:基因自发突变
 退化是发生在群体细胞中的一个从量变
到质变的逐步演变过程。
 自发突变率10-8~10-9
 加速退化的因素
传代次数过多
不适宜的培养条件
3. 防止退化的措施



控制传代次数
创造良好的培养条件
利用不易衰退的细胞传代

采用有效的菌种保藏方法
二. 菌种的复壮 rejuvenation
狭义复壮
在菌种已发生衰退
的情况下,通过纯种分
离和测定典型性状、生
产性能等指标,从已衰
退的群体中筛选出少数
尚未退化的个体,以达
到恢复原菌株固有性状
的相应措施;
广义复壮
在菌种的典型特征或
生产性状尚未衰退前,
就经常有意识地采取纯
种分离和生产性状的测
定工作,以期从中选择
到自发的正突变个体。
也称生产育种
三. 菌种的保藏
(一)目的
使微生物菌种保持原来的性状和活力不退
化、不死亡、不被污染,便于研究、交换和使
用。
(二)原理
挑选典型培养物(typical culture)的优良纯种,
并创造最有利于休眠的环境条件,使微生物处于代谢
不活泼、生长受抑制的休眠状态。
(二)常用的菌种保藏方法
1、斜面保藏法
 方法:接种适宜斜面培养基 → 培养 → 4℃保藏
措施:低温:4℃
适用:各大类
保藏期:1~6个月
 用橡皮塞代替棉塞,可适当延长保藏时间
2、石蜡油封藏法
 方法:斜面或半固体接种 → 培养 → 加无菌液蜡高出培养
基1cm→4~15℃保藏
措施:低温,隔氧
适用:不能利用石油的各大类
保藏期:1~2年
 优点:简便
3、砂土管保藏法

方法:孢子或芽孢悬液 → 加入无菌砂土管中→ 干燥
→ 封口 → 保藏
措施:无营养,缺氧,干燥
适用:产孢子(芽孢)微生物
保藏期:1~10年
4、冷冻干燥保藏

方法:菌种培养 → 用保护剂悬浮 → 加入安醅管中→
低温冻结(-25—-40℃)→抽真空(至0.01mmHg) →
真空封口 → 检查真空度 → 保藏
措施:低温、干燥,缺氧,有保护剂
适用:各大类
保藏期:5~15年或更长
5、甘油悬液低温冷冻保藏法

方法:菌种培养 → 15~30%甘油缓冲液悬浮 → 加入
保藏管中 → 置 -70℃冰箱保藏
措施:低温(-70℃)、保护剂(15~50%甘油)
适用:细菌、酵母菌
保藏期:约10年
6、液氮保藏法
 方法:菌种培养 → 保护剂悬浮 → 加入保藏管中 → 置
液氮瓶中
措施:超低温(-196℃)、保护剂
适用:各大类
保藏期:>15年