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第六章 微生物菌种的选育 江南大学生物工程学院 第一节 从自然界中分离筛选菌种 1、生产菌株来源 • 索取或购买 • 自己选育 用原有菌株进行遗传改造进行育种 向菌种保藏机构索取、购买出发菌株进行选 从自然界中分离菌种 从自然界中分离菌种就是从自然界微生物 资源中有目的、快速、准确地选出所需要的菌 种。 从自然界中分离筛选菌种的一般步骤 设计方案→采样→增殖培养*→平板分离 →筛选(初筛、复筛)→单株纯种分离 →性能考察(生产性能试验、毒性试验、 菌种鉴定) 一、采样 从自然界种采集含目的菌的样品 1. 环境条件对土样本中微生物分布的影响 • 营养环境 • 水分 • 温度 • 通风 • 酸碱度 2 .采样方法 (1)去除表层土 (2)取5-15cm土样几十克,装入无菌牛皮低 袋或逆料袋中 3.注意 • 记录:时间,地点,环境情况等 • 样品袋应封好口,防止水分失去 • 土样应在分离前破碎 • 尽快分离 二. 增殖培养(富集培养) • 适用:样品中目的菌数量不够多时 • 目的:提高样品中目的菌的数量和比例 • 原理:通过控制营养成分或培养条件,使目的菌 得以繁殖和/或非目的菌的生长受到抑制 1、增殖培养的 方法 控制营养成分 控制培养基pH 控制培养温度 热处理——增殖芽孢细菌 添加抑制剂 三. 纯种分离 目的:将目的菌从混杂的微生物中分离出来, 获得纯培养 1. 纯种分离的一般方法 (1)稀释平板法 倾注平板或涂布平板 (2)划线法 (3)组织分离法* 适用于分离高等真菌及植物病原菌 稀 释 分 离 涂 布 平 板 稀 释 分 离 倾 注 平 板 2、平皿反应快速检出法——定性或半定量 纸片培养显色法 透明圈法 变色圈法 生长圈法 抑制圈 琼 脂 块 培 养 法 筛 选 抗 生 素 产 生 菌 程 序 3、厌氧性微生物的分离法 (1)去除培养基中的溶解氧,降低Eh (2)创造无氧环境 物理除氧 空气置换法:干燥器或厌氧培养罐 化学除氧 H2 + O2 → H2O (钯作催化剂) GASPAK罐除氧:硼氢化钠、柠檬酸,碳酸氢钠 化学反应产生H2 和CO2,H2与O2反应生成水 (3)厌氧分离(培养)技术 高层琼脂柱技术 厌氧罐技术 厌氧手套箱技术 GasPak 厌氧培养装置 厌氧手套箱 四 、筛选 • 初筛、复筛: 初 筛 复 筛 种 子 斜 面 菌 种 液 体 种 子 摇 瓶 每 株 1 瓶 每 株 3 -5 瓶 接 种 量 取 舍 情 况 每 瓶 一 环 留 下 产 量 较 高 的 10- 20% 的 菌 株 3— 5% 每 次 保 留 10— 20% , 直 至 最 后 3— 5 株 好氧培养 五、培养工艺条件试验与生产试验 1、摇瓶发酵条件 培养基组成、初始pH、通风量(装液量)、接种量、 培养温度… 2、小型台式发酵罐发酵工艺条件 溶解氧控制,pH值控制,原料添加模式,消泡剂… 第二节 基因突变 突变(Mutation)定义:遗传物质核酸(DNA或病 毒中的RNA)的分子结构或数量突然发生了可遗传 的变化。 突变是一种遗传的状态,是基因由于结构发生改变 从而由原来的存在状态变为另一种存在状态,即它 的等位基因。 突变体:带有突变基因的细胞或个体 突变型:突变体的基因型或表型称为突变型,和其 相对的原存在状态称为野生型。 一、 突变类型 按变化范围分突变类型 (一)染色体畸变(chromosome aberration)染色 体数目的变化或染色体结构发生较大片 段的异常改变。 1、染色体数目的变化 1) 整倍体(euploidy):含有完整的染色体组 ① 单倍体:haploid ② 二倍体:diploid ③ 三倍体:triploid ④ 四倍体:tetraploid 2) 非整倍体 aneuploidy:含有不完整状态的染 色体组,一般是指二倍体中成对染色体成员 的增加或减少。 ① 单体(二倍减一,monosomic diploid): 2n-1 ② 缺体(二倍减二,nullisomic dilpoid): 2n-2 ③ 三体(二倍加一,trisomic diploid): 2n+1 ④ 四体(二倍加二,tetrasomic diploid): 2n+2 ⑤ 双二倍加一(double trisomic): 2n+1+ 1 ⑥ 部分二倍体(merodiploid):细菌等原核生 物中由一整条染色体和外来的一个染色体片 段所构成的不完整二倍体。 2、染色体结构的变化 ① ② ③ ④ 缺失 deletion: 重复 duplication : 倒位 inversion: 易位 translocation : b f (二) 基因突变(gene mutation) ----染色体局部座位内的变化 • 点突变:只涉及DNA分子中一对或少数几对碱 基的改变。突变发生在一个基因范围内。 • 多位点突变:突变超出一个基因范围。 1、碱基置换 base replacement DNA链上的某一碱基对为另一碱基对所取代。 (1)转换 transition : (2)颠换 transversion: A G T C 转换 颠换 图 21-1 转换与颠换 (3) 遗传学效应 ① 错义突变 missense mutation: ② 同义突变 silent mutation: ③ 无义突变 nonsense mutation: 表 21-2 点突变的类型(以 Tyr 的密码子为例) 无义突变 DNA TAC→TAA , TAG ↓ ↓ ↓ ↓ RNA UAC UAA UAG ↓ ↓ ↓ ↓ aa Tyr Och Amb 同义突变 TAC → TAT ↓ ↓ UAC UAU ↓ ↓ Tyr Tyr 错义突变 TAC→ TCC ↓ ↓ UAC UCC ↓ ↓ Tyr Ser 2、移码突变 frameshift mutation:由于一对或 少数几对(不是三的倍数)核苷酸的插入或缺 失而造成此后一系列遗传密码子的阅读框发生 移位错误的突变。 Phe 5’-TTC Asp GAT Glu GAG Phe 5’-TTC Asp GAT Lys AAG Phe 5’-TTC Asp GAT Lys AAG Phe 5’-TTC Asp GAT Lys AAG Pro Leu Cys CCC TTG TGC ↓G→A mutation Pro Leu Cys CCC TTG TGC ↓C→T mutation Pro Leu Cys CCT TTG TGC ↓C→A mutation Pro Leu Stop CCC TTG TGA Thr ACG-3’ Thr ACG-3’ Thr ACG-3’ Thr ACG-3’ Phe 5’-TTC Asp GAT Glu GAG Phe 5’-TTC Asp GAT Lys AAG Pro Leu Cys Thr CCC TTG TGC ACG-3’ ↓Insertion of A Thr Leu Val His ACC CTT GTG CAC G-3’ 二、按表型效应分突变类型 • • 1 2 • • 野生型 wild type:表现该物种正常表型的生物。 突变型 mutant:由于突变导致其正常的表型发生 了改变的生物。 形态突变型 生化突变型 营养缺陷型 auxotrophic mutant 抗性突变型 resistant mutant 3. 致死突变型 4. 条件致死突变型 5. 调节突变型 三、基因突变的规律 不对应性或自发性、 随机性 、 稀有性、 独立性、 稳定性、 可逆性、 诱变性 、 1、自发突变的证实 随机性、不对应性 1)波动实验 2)涂布实验 3)影印培养实验 波动实验 E.coli B 抗噬菌体a的波动测验结果 培养皿上菌落数 培养皿编号 样品来自同一培养物 样品来自不同培养物 1 14 46 4 1 1 0 2 15 56 2 0 0 0 3 13 52 2 3 0 0 4 21 48 1 0 7 0 5 15 65 5 0 0 8 6 14 44 2 5 303 1 7 26 49 4 0 0 0 8 16 51 2 5 0 1 9 20 56 4 0 3 0 10 13 47 7 6 48 15 11 107 1 0 12 0 4 0 13 0 19 14 0 0 15 1 0 16 0 17 17 0 11 18 64 0 19 0 0 20 35 平均值 16.7 51.4 3.3 11.35 30 3.8 方 差 15 27 3.8 694 6620 40.8 四、突变的频率: • 突变率(mutation rate):每个细胞每一世代 中发生突变的概率。 世代总数=N2-N1 突变率的测定: • 固体平板法测突变率:m=(M2-M1)/(N2-N1) • 液体培养法测突变率:m=2(M2/N2-M1/N1)/(g2-g1) • 液体稀释法测突变率:P0=e-mN 细胞分裂非同步性效正:突变率=ln2m=0.69m 五、自发突变的机制 环境因素的影响 微生物自身产生的代谢物的影响 转座子所造成的插入突变 DNA复制过程中偶尔发生错误 六、诱变剂及其诱变机制 诱变是指通过人为的方法,利用物理、 化学因素处理微生物而引起的突变。 (一) 物理诱变剂 1)辐射:uv,x-射线γ-射线等 效应:点突变或染色体畸变 机制:直接作用和间接作用 间接作用:辐射作用于染色体外物质,产 生 具有诱变作用的物质; 直接作用:辐射直接作用于染色体, 2)热:机理复杂 3) 离子束: 能量传递、动量交换,离子沉积与电荷积累 过程 1、紫外线 UV • 有效波长 2650Å,紫外灯波长 2537 Å • 作用机理 嘧啶二聚体、嘧啶水合物、 交联作用、DNA链断裂 • 效应: 移码突变,碱基置换 紫外线诱发胸苷二聚体 O H O CH3 H N O UV CH3 O H N N Thymine H O O CH3 CH3 H N N H N O N Thymine H H N Thymine dimer O O 4 5 4 5 3 6 6 2 1 Fig. 21- Production of thymine dimer by ultraviolet light irradiation. O 2、电离辐射:x-射线,g-射线 • 作用机理 直接作用:打断化学键 间接作用:通过自由基打断化学键 • 效应:染色体畸变,碱基置换,移码突变 3、热 • 作用机理:脱嘌呤 • 效应:碱基置换,移码突变 4、离子束 (二) 化学诱变剂 1. 碱基类似物:是指其分子结构同DNA分子 中的碱基非常类似,因此能取代碱基参入 到DNA分子中的一类化合物。 主要诱变剂:5-溴尿嘧啶和2-氨基嘌呤; 可诱发AT GC的转换。 碱基类似物 base analog 5-溴尿嘧啶(5-BU,BU), 5-氟尿嘧啶(5-FU,FU), 5-氨基尿嘧啶(5-AU,AU), 2-氨基嘌呤(2-AP,AP) 8-氮鸟嘌呤(8-NG,NG) 例:BU 烯醇式:BUe,高频出现,BUe ≡G 酮式: BUk,低频出现, BUk=A A A G G T BUK BUE C 酮式 烯醇式 5-BU掺入后的掺入错误 5-BU复制错误 G≡ C G ≡ BUe G≡ C A:T G≡ C A=BUk A=T G ≡ C→A=T G ≡ BUe A: BUk A:T A:T G ≡ BUe G ≡C A: T → G ≡ C G ≡ BUe 2. 移码诱变剂 嵌入DNA 分子相邻碱基对之间,从而有 利于核苷酸的环出,因此可提高移码突 变的突变率。 主要诱变剂:吖啶类化合物;溴化乙锭 (ethidium bromide),ICR系列化合物等 部分移码诱变剂 (a) 增加碱基 DNA 插入剂 插入剂分子 模板链 5’ ATCAG TTACT3’ 新合成链 3’TAGTC G AATGA5’ 0.68nm 随机选择碱基 嵌入插入剂处 下一轮复制 5’ ATCAG C TTACT 3’ 3’TAGTC G AATGA 5’ (b)缺失碱基 模板链 5’ ATCAG T TACT3’ 新合成链 3’TAGTC ATGA5’ 插入剂失去 后复制 插入剂 5’ ATCAGTACT 3’ 3’TAGTCATGA 5’ 图 21-15 插入突变导制碱基的增加(a)和减少(b) 3.化学修饰碱基的诱变剂 1)烷化剂:使DNA分子的碱基发生烷化反应,从 而更容易发生错配,是最常用的一类诱变剂。 常用的有:硫酸二乙酯(DES),甲基磺酸乙酯 (EMS),亚硝基乙基尿(NEU), 亚硝基胍(NTG), 乙烯亚胺(EI)等。 NTG(亚硝基胍)诱变作用特强,作用于复制叉, 可诱发多基因并发突变,被称为超诱变剂。 Chemical reactivity of bases is responsible for some DNA lesion 部分烷化剂和烷化碱基 alkylating agents Alkylated bases DNA的脱嘌呤 烷化鸟嘌呤的碱基配对 烷化鸟嘌呤的交联作用 • 如甲基黄酸乙脂(EMS) 使G的第6位烷化,使T的第4位上烷化,结 果产生的O-6-E-G和 O-4-E-T分别和T、G配对, 导致G∶C对转换成A∶T对;T∶A对转换成C∶G G O-6-E-G A T O-4-E-T C T T A G C G 2) 亚硝酸(introus acid, NA)有氧化脱氨作用, 可使G第2个碳原子上的氨脱去,产生黄嘌呤 (xanthine,x),次黄嘌呤 (H) 仍和C配对, 故不产生转换突变。但C和A脱氨后分别产生 U和次黄嘌呤H,产生了转换,使C∶G转换成 A∶T,A∶T转换成G∶C HNO2 A H G G A A T C C C U T HNO2 3) 羟胺(NH2OH)只特异地和胞嘧啶起反应,在 第4个C原子上加-OH,产生4-OH-C,此产 物可以 和A 配对,使C∶G转换成T∶A • 作用:与C反应,造成GC→AT转换 HA C 4-OH-C T G A A 七、DNA损伤的修复 1、光复活作用 photoreactivation 2、切补修复 excision repair(暗复活) Damage Mutant base is mismatched and/or distorts stractur Incision Endonuclease cleaves on both sides of damaged ba Excision Exonuclease removes DNA Between nicks Synthesis Polymerase synthesizes Replacement DNA Ligase seals nick Fig. 21- Excision repar removes and replaces a stretch of DNA that includes the dameged base (s) 第三节 诱变育种 一、诱变育种的一般步骤 出发菌株 ↓纯化、活化、同步培养 培养液 ↓离心收集细胞、洗涤,制备均一的菌悬液(玻璃株打散、过滤) 单细胞或单孢子悬液 ↓活菌计数,诱变预备试验 诱变处理 ↓活细胞计数,致死率计算 中间培养(后培养) ↓ 平板分离 ↓变异率计算 初筛→复筛→ 保藏及扩大试验 (一) 1. 2. 3. 4. 出发菌株的选择 出发菌株的类型 对诱变剂的敏感性 具有特定生产性状的可能性: 要尽量选择单倍体,单核细胞(孢子) (二)菌悬液的制备 细胞的生长状态 菌悬液的均一性: 菌悬液细胞浓度 酵母、霉菌孢子:106~107个/ml 细菌、放线菌孢子:108个/ml 4. 菌悬液介质: 1. 2. 3. (三)诱变处理 1.诱变剂的选择 对于低产或野生菌,uv线往往是首选,烷化剂等 也是常用的诱变剂;对于经多次诱变处理的菌株, 常需要强辐射进行处理。 碱基置换易回复,染色体畸变、移码等不易回复 细胞的透性和生理状态 经常变换诱变剂或复合处理 2.剂量选择 最适剂量因诱变剂的类型、出发菌株及其生理状态的 不同而不同。亚硝基胍在低死亡率剂量时突变率较 高,而uv则在高致死率时才有较高的突变率。 高产菌株在低剂量时效果较好,而对多核细胞处理剂 量不宜过低。质量性状宜选用高剂量。 经多次诱变处理已钝化的菌株可用一次高剂量处理来 激活 突变率/ % 3 处理方法 单一诱变剂处理; 复合处理 20 18 16 14 12 10 8 6 4 2 0 1- 对照; 2-乙烯亚胺(浓度1:7000); 3, 5, 7, 9-紫外线; 4, 6, 8, 10-乙烯亚胺加紫外线 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 试验号 乙烯亚胺与紫外线复合诱变处理结果 紫外线的剂量(erg/mm2): 3, 4-2000;5, 6-4000; 7, 8-6000;9, 10-10000 形态突变型 负突变型 正突变型 X-射线的照射剂量与亚热带链霉菌白霉素高产菌株39#变异的关系 紫外线照射剂量与龟裂链霉菌土霉素高产菌株293#变异的关系 (四)后培养 目的使突变基因纯合并表达,消除表型 延迟。 后培养培养基:营养要求丰富,酪素水 解液(或蛋白胨)可提供大量氨基酸,酵 母膏可提供各种生长因子。 (五)变异菌株的分离及筛选 • 筛选:包括初筛,复筛和终筛等。 • 明确筛选目标:产量突变还是其它突变型; 产量准备提高多少等; • 一次诱变目标不要太高 • 制定筛选方案:筛选准备分几步;筛选采 用的培养方法和培养条件;每一步准备筛 选多少菌株;每一步准备采用的分析方法 等。 诱变育种工作中应注意的问题 安全问题:各种诱变剂几乎都有致癌作用,因此在操作中应 时刻注意安全问题:个人安全和环境安全。 个人安全:操作时注意防护,不同诱变剂要求不同防护方法, 如γ-射线辐射防护要求较高,uv要求较低,而化学诱变剂则 要求不与身体有关部位直接接触; 环境安全:所用物品要经解毒处理;液体经解毒或充分稀释 才可以排放。 要养成良好的工作习惯:如仔细观察细微的形态变化、要详 实记录菌株的诱变史和诱变谱系。 诱变育种技术要和其他育种手段相结合。 诱变育种由于其筛选的盲目性,突变的不定向性,工作量十 分大,因此要对整个工作进行合理的设计并结合新技术提高 其工作效率。 二 、营养缺陷型突变株的筛选 营养缺陷型(auxotroph)突变株: 是指丧失了合成一种或多种必需生长因子能力 的菌株,它们只能在补充了相应的生长因子的培 养基上才能正常生长。 营养缺陷型突变株的用途 科研上: 研究代谢途径; 基因重组的遗传标记菌种; AA、碱基、维生素生物测定的试验菌种 生产上: 发酵法生产氨基酸,核苷酸的生产菌种; 生产菌株杂交育种的亲本进行遗传标记 完全培养基 Complete Medium (CM) 含有满足某微生物的所有营养缺陷型和野生型菌 株生长所需营养物质的天然或半合成培养基。 基本培养基Minimal Medium(MM): 不含生长因子仅能满足某微生物的野生型菌株生 长需要的最低成分合成培养基。 补充培养基Supplemented Medium(SM): 补充了一种或数种生长因子,以满足某微生物的 特定的营养缺陷型生长的培养基,其中的生长因子 多是通过直接添加AA、碱基或维生素而提供。 (一) 筛选方法 后培养 淘汰野生型 检出缺陷型 鉴定缺陷型 1、淘汰野生型 原理:限制营养成分使缺陷型细胞生 长受抑制,野生型细胞在生长过程中 被杀死或生长后被除去 方法: 抗生素法: 菌丝过滤法:适用于丝状真菌 差别杀菌: 抗生素淘汰野生型 饥饿培养:培养细胞经离心、洗涤后,悬浮 于无氮基本培养基中培养1-2小时,耗尽细胞 内氮源,防止加抗生素后的“误杀”; 加抗生素处理:加入等体积的2N基本培养基 (两倍浓度氮源的基本培养基),同时加入 抗生素,培养一定时间,野生型细胞由于生 长而被杀死,缺陷型细胞处于休止状态而得 以保留。 制霉菌素可用于处理酵母菌和霉菌。 注意:培养基应添加渗透压稳定剂而制成高 渗培养基,可避免由于细胞破裂而给缺陷型 提供营养物质。 2、检出缺陷型 1)限量补充法 2)夹层培养法 3)逐个检出法 4)影印培养法 3、鉴定缺陷型----生长谱法 大类的鉴定: 营养因子: A、酪素水解液(AA混合物) B、水溶性维生素混合液 C、酵母核酸水解液(碱基) D、酵母膏水溶液 制备平板:缺陷型菌经CM液体培 养后,离心洗涤,制成107~108个 /ml菌悬液。取0.1ml涂布至MM平 板上 A D B C 方法:分别用无菌小滤片沾取少许各种营养因 子后,放入接种的MM上,适宜温度下培养 判断: A、D生长,AA缺陷型 B、D生长,维生素缺陷型 C、D生长,碱基缺陷型 A~B、D生长,AA、维生素双缺 A~C、D生长,AA、碱基双缺 B~C、D生长,维生素、碱基双缺 详细鉴定 生长因子组合法 组 生长因子 甲 1 2 3 4 5 6 乙 2 7 8 9 10 11 丙 3 8 12 13 14 15 丁 4 9 13 16 17 18 戊 5 10 14 17 19 20 己 6 11 15 18 20 21 营养缺陷型的生长谱鉴定 天冬氨酸 AKase 天冬氨酰磷酸 天冬氨酸半醛 Hse Met 二氨基庚二酸 Thr Lys Ile 钝齿棒杆菌L-赖氨酸生物合成途径及调节 不同类型突变株积累L-赖氨酸的水平 突变菌株 突变型 产量(mg/ml) 钝齿棒杆菌 Hse- 17.93 钝齿棒杆菌 钝齿棒杆菌 Thr Thr - +Met - 2.33 2.00 钝齿棒杆菌 AECr AECr, HseHseHse-,AECr 20.0 50.0 36.6 45.0 北京棒杆菌 三、 其它类型突变型的筛选 (一)抗代谢类似物突变型的筛选 抗反馈调节突变株:是指一种对反馈抑制不 敏感或对阻遏有抗性的组成型突变株,或兼 而有之的突变株。 代谢类似物:结构与代谢物类似,因此可起到代 谢物所具有的调节作用的一类化合物。 1、抗反馈抑制突变 发生基因突变的细胞:酶的结构基因发生 突变导致调节酶的调节部位发生改变,不 再与结构类似物(或产物)结合,从而解 除了产物的反馈抑制作用,使产物得以合 成。 突变前 突变后 抗反馈抑制突变的机制 2、抗反馈阻遏突变型 • 由于调节基因发生突变,使产生的阻遏蛋白不 再能和辅阻遏物结合,或由于操纵基因发生突 变,被激活的阻遏蛋白不能作用于已突变的操 纵基因,从而解除产物的阻遏作用,使产物得 以过量积累。 抗反馈阻遏突变的机制 3、 筛选方法 (1)将经过诱变的细胞直接涂布在含有一 定浓度结构类似物的基本培养基平板上, 长出的菌落即为抗结构类似物突变株; (2)将经过诱变的细胞涂布在基本培养基 平板上,在平板的中央加少量结构类似 物,在抑菌圈内长出的个别菌落即为抗 结构类似物突变株; 注意: • 如果是协同反馈抑制,则要在基本培养 基中添加起协同反馈抑制作用的产物 • 抗结构类似物突变是数量性状,可通过 逐渐提高结构类似物的浓度使产物的积 累水平逐渐提高 结构类似物和代谢终产物 终产物 精氨酸 结构类似物 D-精氨酸 苯丙氨酸 赖氨酸 酪氨酸 色氨酸 对氟苯丙氨酸,噻吩丙氨酸 脯氨酸 腺苷酸 葡萄糖 3,4-二氢脯氨酸,磺胺胍 2-氟腺嘌呤 2-脱氧葡萄糖 AEC 对氟苯丙氨酸,D-酪氨酸 5-碱基色氨酸,6-甲基色氨酸 蔗糖,麦芽糖 2-脱氧棉子糖 纤维二糖,葡萄糖 甘油 过量积累产物 精氨酸 苯丙氨酸 赖氨酸 酪氨酸 色氨酸 脯氨酸 腺苷酸 b-葡萄糖苷酶 蔗糖酶 纤维素酶 (二)组成型酶突变株的筛选 1、诱导型酶在生产上的缺点 诱导物往往价格昂贵 受诱导物种类,浓度及分解产物的影响 2、筛选原理 通过诱变处理,使调节基因发生突变,不 产生有活性的阻遏蛋白,或者操纵基因发生突 变不再能与阻遏物相结合,从而使诱导型酶变 为组成型酶。 3、筛选方法 创造一种有利于组成型菌株生长而不利于 诱导型菌株生长的培养条件,造成对组成型的 选择优势或者适当的识别两类菌落的方法,从 而把组成型突变株选择出来。 恒化器法 以诱导物作底物,浓度低于起诱导作用浓度, 诱导型菌株生长极弱,而变异株由于能产分解 底物的酶,则能分解底物而得以生长,通过连 续不断加入新鲜基质,使变异株数量逐渐增多, 最后达到能分离的浓度。 循环培养法 不含诱导物培养基 ↔ 含诱导物培养基 (普通碳源或氮源) (诱导物作唯一碳源或氮源) 两菌都能生长 ,但组 成型变异株已能合成 特定的酶,亲株不能 变异株调整期短,亲株调 整期长,短时间培养后, 变异株所占比例增大 反复循环培养几次后,变异株所占比 例逐渐提高,然后进行分离 (三)细胞膜透性突变型 1、提高细胞膜透性的优点 • 使胞内产物浓度维持较低的水平,有利 于酶促反应的进行,提高产物的生成量 • 使胞内产物浓度维持低于发生反馈抑制 或阻遏的程度,以积累过量的产物 2、提高细胞膜透性 的措施 第四节 基因重组 遗传重组的一般概念 遗传重组(基因重组):遗传重组是指遗传 物质从一个细胞向另一个细胞传递并导致 DNA交换和重排的过程。 遗传改造的手段包括基因突变和基因重组 微生物中基因重组的方式: • 真核微生物:有性生殖和准性生殖; • 原核微生物:接合、转化、转导 一、细菌的转化 定义:受体细胞直接吸收裸露的外源DNA 并与其自身遗传物质发生重组,从而使 受体细胞获得共体细胞部分遗传性状的 现象。 1、转化过程 • 感受态受体细胞 • 转化因子的吸附和吸收 • 转化因子的整合及转化子的形成 转化过程 转化因子的整合 二、 转导 Transduction 通过噬菌体作为媒介,而把一个细 菌的基因导入另一个细菌的过程叫转导。 转导的组分: 供体细菌,受体细菌,转导噬菌体 (一)局限性转导specialized transduction 只能传递供体染色体上原噬菌体整合 位点附近的少数固定基因的转导。 1、转导噬菌体的形成 • Campbell模型(不正确切离) • 形成频率:10-6 2、转导子的形成 • 稳定转导子的获得——双交换 • 不稳定转导子的获得——溶原化 (二)普遍性转导 generalized transduction • 能传递供体的任何基因的转导。 1、转导噬菌体的形成 • 选择性包裹模型 • 形成频率:10-6 2、转导子的形成 • 完全转导与完全转导子 Complete transduction 通过双交换而实现 约占1/10 • 流产转导与流产转导子 Abortive transduction 进入受体的供 体DNA片段既 不复制,也不 整合,但能正 常表达。 3、共转导 cotransduction • 由一个转导噬菌体同时传递两个供体基因 的转导。 • 共转导的频率 普遍性转导与局限性转导的区别 能转导的基因 普遍性转导 局限性转导 供体的任何基因 特定基因, l:gal,bio 噬菌体在供体菌中 无特定的位置 的位置 转导噬菌体的获得 自发裂解或诱导裂解 转导子 有特定的位置 gal-l-bio 诱导裂解 非溶源性 缺陷溶源性 1/10稳定的完全转导子 1/3稳定转导子 9/10不稳定流产转导子 2/3不稳定转导子 三、 细菌的接合 • 供体细胞和受体细胞直接接触后,质粒 从供体细胞向受体细胞转移的过程。 Conjugation is the mechanism by which genetic material is transferred between two cells by plasmids. 1、 F- 、F+、 Hfr 菌株 F+菌株 Hfr菌株 F-菌株 F+ Hfr 2、细菌接合作用 (1)F+×F结果:F-转变为F+ (2)Hfr×FHfr DNA的转移 • 形成部分杂合子 • 通过双交换形成重组体 形成lac+ade+重组体 形成lac-ade+重组体 • F+与Hfr菌株的异同点 相同点 不同点 含有F因子,都具有性纤毛,都 具有接合作用 F+ Hfr细菌 对于吖啶橙处理 稳定 F因子易失去 传递供体染色体 基因 F因子本身转移 高频(10-3 ~ 10-4) 低频(10-6 ~ 10-7) 基本不能 频率70%以上 随细菌染色体复制 独立复制 F因子复制 3、F因子转导 • • • F’ 因 子 : 带 有 细 菌 基 因 的 F 因 子 。 例 F-lac,F-gal,F-pro… F’因子的形成:Hfr菌株中F因子的异常 切除(aberrant excision) F因子转导(性因子转导、性导) 通过F’因子的转移而使受体细菌改变 其遗传性状的现象 四、 真菌的有性生殖 Sexual reproduction 一、真菌有性生殖过程 二、粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的生活史 五、 真菌的准性生殖 Parasexual reproduction • 能进行准性生殖的微生物: Aspergillus nidulans; Asp. niger; Asp. sojae Penicillium chrysogenum; Fusarium oxysporum (一)准性生殖的过程 异核体形成; (杂合)二倍体形成; 体细胞交换和单元化 1、异核体的形成 • 异核体细胞:并存有两个不同遗传性状 的核的细胞 • 异核体菌丝体:由异核体细胞构成的菌 丝体 • 异核体的无性繁殖:产生亲代类型的单 倍体分生孢子 • 异核体的生物学意义:具有生长优势; 可以储备隐性突变 2、异核体的形成 (1) 选择亲本 A. 亲缘关系近 B. 生活力、产生分生孢子的能力及数量相 似 C. 带不同的遗传标记 (2) 创造形成异核体的条件 A. 限制性培养基 B. 孢子混合数量:106~108 (二)杂合二倍体的形成 1、形成:将106 ~ 107个异核体的分生孢子涂至 MM上,长出的少数菌落即为二倍体 2、检出: 避免异核体分生孢子重新形成异核体的措施 A. MM要十分纯正 B. 采用具有分生孢子颜色突变型和营养缺陷型 作遗传标记 (三)有丝分裂分离 二倍体在有丝分裂过程中发生基因重组, 使隐性基因得以表达,由此产生各种类 型的分离子。 1、体细胞交换与体细胞重组体 (1)体细胞交换:在有丝分裂过程中同源 染色体发生的交换。由此导致部分基因 的纯合化。 2、单元化过程与非整倍体及单倍体分离子 单元化过程:是在一系列有丝分裂过程 中发生的染色体不离开行为的结果。 有性生殖与准性生殖的区别 有性生殖 准性生殖 导致有性孢子的产生, 其形态、生理均与营养 体细胞不同,往往产生 在特殊的囊器中 导致重组体细胞产生, 其和一般营养体细胞相 同,不产生在特殊的囊 器中 减数分裂导致基因重组,有丝分裂导致基因重组, 减数分裂中染色体交换 有丝分裂中,染色体交 和减半是有规律的协调 换和减少是不规则且不 过程,是必然的 协调的过程,是偶然的 六、 原生质体融合技术 1、原生质体融合育种的优势: • 基因重组频率提高 • 重组的亲本范围扩大 • 融合子集中两亲本优良性状的机会增大 (一)原生质体融合技术的一般步骤 融合亲本的选择与标记; 原生质体的制备; 原生质体的融合; 原生质体的再生; 融合子的选择与鉴定; 目标菌株的筛选。 七、基因工程育种 Genetic engineering 重组DNA技术:recombinant DNA technology 基因工程是将不同生物的基因在体外人 工剪切组合并和载体(质粒、噬菌体、病毒) DNA连接,然后转入微生物或细胞内,进行 扩增,并使转入的基因在细胞内表达,产生 所需要的蛋白质。 目的基因(DNA) 载体DNA DNA连接酶 重组DNA 转化、转导或转染 受体细胞 筛选(利用遗传标记或分子生物学方 法等) 具表达目的基因功能的重组菌 基因工程操作的主要过程 一、目的基因的获得 主要方法 • 化学合成 • PCR扩增 • 从DNA文库中筛选 1、PCR体外扩增目的基因 Polymerase Chain Reaction —— 聚合酶链式反应 • 一种体外DNA扩增技术,用于扩增位于两端已知序 列之间的DNA区段(靶序列) • 在DNA聚合酶催化下,通过两条人工合成的单链引 物的引导而扩增模板DNA片段的方法 (1)基本PCR组成: • 含目标DNA序列的模板DNA (Template) • 寡核苷酸引物 ( Primers): 界定复制范围两端的引物 • DNA聚合酶: (Taq. Polymearse) • DNA合成底物及水:dNTPs (2) PCR反应——三个主要步骤 • 变性( denaturation):90℃以上 • 退火( annealing):50~65 ℃ • 延伸(extension):72 ℃ 20~30 个循环 2. 基因文库法 (1) 从共体菌基因组DNA获取目的基因 DNA文库: 生物染色体基因组各DNA片 段的克隆总体。 • 分离染色体DNA • 用限制性酶部分水解 • 分离选出一定大小合适克隆的DNA片段 基因文库构建 步骤 • 提取DNA • 酶解 • 电泳分离 • 与载体连接 • 导入宿主 • 筛选阳性克隆 二、优良载体的选择 • 优良载体应具备的特点 • 对E.coli受体细胞,载体有质粒载体、 λ噬菌体载体、柯斯质粒载体 三、目的基因与载体DNA的体外重组 • 粘性末端连接 • 平齐末端连接 四. 重组载体导入宿主细胞 • 转化或转染 • 体外包装与感染 • 电穿孔法electroporation 五、重组受体细胞的筛选和鉴定 • • • • 遗传学方法:检测选择性标记 免疫化学方法:检测目的基因产物 核酸杂交方法:检测目的基因 直接检出法:检测基因产物 例一 选择性标记筛选 外源基因插入tet 钝化tetr •受体细胞是Amp、Tetd 的敏感型 •在Amp+Tet培养基上生 长的是野生型质粒 •在Amp培养基上生长的 带有重组质粒 例二、b-半乳糖苷酶显色反应(蓝白斑试验) 检出携带外源DNA的载体 b-半乳糖苷酶以四聚体形式存在 能将无色底物X-gal(5-bromo-4-chloro-3indolyl-b-D-galactoside)切割成半乳糖和深蓝色 的5-bromo-4-chloroindigo,菌落呈蓝色 宿主lacZDM15基因合成的是缺失N-末端11~41 氨基酸的缺陷型酶,无活性 pUC18等质粒具有lacZ’基因,所编码酶的N-末 端片段与lacZDM15产物组成有活性的酶 pUC18上在lacZ’中间具有MCS,外源DNA片 段的插入,使lacZ’无完整产物,不能与 lacZDM15 产物组成有活性的酶,菌落呈无色 八、基因定位诱变 定位突变site-specific mutagensis 用合成的DNA和重组DNA技术在基 因精确限定的残基上引入突变。包括删 除、插入和置换特定的碱基序列。 第六节 菌种退化、复壮与保藏 一.菌种的退化 1. 菌种退化degeneration的表现 生产性状的劣化,遗传标记的丢失, 原 有的典型性状的不典型等 菌落及细胞形态的改变 生长速度缓慢 代谢产物生产能力下降,即负突变 致病菌对宿主侵染力下降 抗不良环境条件(抗噬菌体,抗低温)能力 减弱 2. 菌种退化的原因:基因自发突变 退化是发生在群体细胞中的一个从量变 到质变的逐步演变过程。 自发突变率10-8~10-9 加速退化的因素 传代次数过多 不适宜的培养条件 3. 防止退化的措施 控制传代次数 创造良好的培养条件 利用不易衰退的细胞传代 采用有效的菌种保藏方法 二. 菌种的复壮 rejuvenation 狭义复壮 在菌种已发生衰退 的情况下,通过纯种分 离和测定典型性状、生 产性能等指标,从已衰 退的群体中筛选出少数 尚未退化的个体,以达 到恢复原菌株固有性状 的相应措施; 广义复壮 在菌种的典型特征或 生产性状尚未衰退前, 就经常有意识地采取纯 种分离和生产性状的测 定工作,以期从中选择 到自发的正突变个体。 也称生产育种 三. 菌种的保藏 (一)目的 使微生物菌种保持原来的性状和活力不退 化、不死亡、不被污染,便于研究、交换和使 用。 (二)原理 挑选典型培养物(typical culture)的优良纯种, 并创造最有利于休眠的环境条件,使微生物处于代谢 不活泼、生长受抑制的休眠状态。 (二)常用的菌种保藏方法 1、斜面保藏法 方法:接种适宜斜面培养基 → 培养 → 4℃保藏 措施:低温:4℃ 适用:各大类 保藏期:1~6个月 用橡皮塞代替棉塞,可适当延长保藏时间 2、石蜡油封藏法 方法:斜面或半固体接种 → 培养 → 加无菌液蜡高出培养 基1cm→4~15℃保藏 措施:低温,隔氧 适用:不能利用石油的各大类 保藏期:1~2年 优点:简便 3、砂土管保藏法 方法:孢子或芽孢悬液 → 加入无菌砂土管中→ 干燥 → 封口 → 保藏 措施:无营养,缺氧,干燥 适用:产孢子(芽孢)微生物 保藏期:1~10年 4、冷冻干燥保藏 方法:菌种培养 → 用保护剂悬浮 → 加入安醅管中→ 低温冻结(-25—-40℃)→抽真空(至0.01mmHg) → 真空封口 → 检查真空度 → 保藏 措施:低温、干燥,缺氧,有保护剂 适用:各大类 保藏期:5~15年或更长 5、甘油悬液低温冷冻保藏法 方法:菌种培养 → 15~30%甘油缓冲液悬浮 → 加入 保藏管中 → 置 -70℃冰箱保藏 措施:低温(-70℃)、保护剂(15~50%甘油) 适用:细菌、酵母菌 保藏期:约10年 6、液氮保藏法 方法:菌种培养 → 保护剂悬浮 → 加入保藏管中 → 置 液氮瓶中 措施:超低温(-196℃)、保护剂 适用:各大类 保藏期:>15年