Transcript 遗传分子基础
遗传的分子基础 第三章 遗传的分子基础 一、DNA的化学组成和分子结构 二、DNA的存在形式 三、真核基因的结构与功能 四、DNA突变及损伤的修复 一、 DNA的化学组成和分子结构 (deoxyribonucleic acid) (一)DNA的化学组成 核酸基本单位 单核苷酸 (nucleotide) 脱氧核糖 磷酸 含氮有机碱 (碱基) 嘧啶:T、C 嘌呤:A、G 嘧 啶 碱 胞嘧啶 C cytosine 胸腺嘧啶 thymine 鸟嘌呤 G guanine 腺嘌呤 A adenine 基 嘌 呤 T 脱氧核糖 酯 键 糖苷键:核糖第 一位碳原子与嘧 啶第一位氮原子 或嘌呤第九位氮 原子形成N—C键 糖 苷 键 单 核 苷 酸 核 苷 3’ 5’磷酸二酯 键:一个核苷 酸中戊糖的5’ 碳原子上连接 磷酸基以酯键 与另一个核苷 酸戊糖的3’碳 原子相接 A=T G≡C (二) DNA的结构 1953年Watson和 Crick提出DNA分子 双螺旋结构模型 一个完整的DNA分子是由两股反向平 行的脱氧核苷酸长链围绕一个“主轴” 向右盘旋形成双螺旋状结构. 二、DNA的存在形式 基因组(genome):含3.0×109 的碱基对. (一)单一序列(unique sequence): 占基因组的60%-65% DNA序列在一个基因组中只有1个或很少 几个拷贝,由800-1000bp组成,大多数为结构基 因(2.5-3万)。 结构基因:单一序列中构成编码细胞中的蛋白 质或酶的基因。 (二)重复序列(repetitive sequence) (占基因组的30%以上) DNA序列在基因组中有多个拷贝,可有几 十份,几百份,甚至几十万份。 有些重复序列与染色体结构有关,大多数 生物学功能有待进一步研究。 1 高度重复序列 (占10%~15%) 由很短的碱基序列重复而成,长度2~200 bp,重复次数106~108。 ①卫星DNA(satellite DNA) 小卫星DNA (minisatellite DNA): 6-25个核苷酸串联重复序列 微卫星DNA (microsatellite DNA) or STR: 2-6个核苷酸串联重复序列 ②反向重复序列(inverted repeat sequence): 反向重复序列:DNA某些部位具有方向 相反但序列相同的区域。 如: …GGTACC… …CCATGG… 回 文 序 列 ②反向重复序列(inverted repeat sequence) G T C C T G A C N N N G T C A G G A T C A G G A C T G N N N C A G T C C T A 每个长约300bp 两个相隔平均12kb 功能:可能构成终止子 ,参与复制、 转录调控。 十 字 结 构 2 中度重复序列 (intermediate repetitive sequence) 占整个基因组DNA序列的20%~30%, 长度为300~7000bp,拷贝数为102~105。 短分散元件(SINE) 长度300-500bp,分散在分布基因组中, 拷贝数目105。 如:人类Alu家族,由300bp构成,每个Alu 序列中含有一个限制性内切酶AluⅠ的识别 序列AGCT,重复达30-50万次,平均5kb就 有一个Alu顺序。 功能:与基因转录的调节、hnRNA的加工、 DNA复制的启动相关。 长分散元件(LINEs) 长度5000-7000bp,重复次数102-104。 如:KpnⅠ家族,平均长度3500~5000bp, 拷贝数为3000 ~ 4000。 存在限制性内切酶 KpnⅠ酶切位点,占 基因组的3% ~ 6%,功能不详。 3 多基因家族 (multigene family) 一个祖先基因(ancestral gene)经过复 制和变异而传递下来的一组来源相同、结构相 似、行使相关功能的基因。 两种类型 1、由一个基因产生多个拷贝,具有几乎 相同的顺序,成簇地排列在同一条染色体上, 这种集中成簇的一组基因称为基因簇。它们 同时发挥作用,合成某些蛋白质。 2、由一个基因产生多次拷贝,序列有所 不同,分散在几条染色体上,编码一组关系 密切的蛋白质。 4 拟基因 拟基因(pseudogene)也称假基因,指在多 基因家族中,某些成员不产生有功能的基因产 物,这些基因称为拟基因,常用ψ表示。 小结 DNA的存在形式 1.单一序列:占基因组的60%-65% 2.重复序列: 卫星DNA 1) 高度重复序列 反向重复序列 2)中度重复序列 3)多基因家族 4)拟基因 三、真核基因的分子结构和功能 外显子 exon:具有编码意义 编 码 区 结构 基因 内含子intron:无编码意义 ( 5/ GT -3/ AG 法则) TATA框 启动子 CAAT框 非编码区 (调控区) 增强子 GC框 mRNA裂解信号 终止子 (AATAAA) 回文结构 (一)真核基因的分子结构特征 enhancer CAAT box TATA box GC box TATA box A TATA A A T T CAAT box G G C C A A T C A T exon intron AATAAA GC box GGCGGG GT — AG law 启动子(promoter) TATA box:上游17—19bp TATAA(T)AA(T) 功能:能被RNA聚合酶Ⅱ识别并准确识 别转录的其始部位,决定转录的起始点 启动子(promoter) CAAT box:上游70—80bp, GGC(T)CAATCT 功能:对转录有促进作用 启动子(promoter) GC box: 位于CAAT box两侧,GGCGGG2个 功能:转录调节区,具有激活转录的 功能 增强子(enhancer) 定义:本身不具启动子活性,但能加速基因 转录的一段特定的DNA调节性序列。 核心序列:GGTGTGGAAA(TTT)G 功能:与特异性蛋白结合提高转录的频率 终止子(terminator) 回文序列 + 5’-AATAAA-3’ 功能:发夹结构可阻 碍RNA聚合酶的移动, 终止转录 (二)真核基因的功能 1.贮存遗传信息 DNA分子中A、T、C、G四种碱基的排 列顺序中蕴藏着遗传信息。 2.复制 DNA分子合成一个与自己相 同的 DNA分子的过程。其结果DNA含量增加一 倍。 DNA----2 DNA DNA复制(replication ): T—A 1)半保留复制(semi-conservative replication) T—A 分别以2条单链为模板按碱基配对 原则形成与亲代DNA分子相同的两 条子链。每条子链中一条多核苷酸 链是亲代DNA分子即模板链,另一 条是互补合成的。 G—C C—G A—T A-T A-T A—T C—G G—C G-C T—A A T T—A T A A T A-T T A A -T T A—T C G G—C CG G—C C—G G C G—C GC C—G A—T C—G TA A—T A-T A—TT A A-T T A T A A-T A T A-T AT A-T A-T T AA—T A—T A—T AT C—G C—G C G C—G G—CC G G—C G—C G C GC C G G—C CG G—C G—C 2)方向性:新合成的链5’—3’ 3)半不连续复制 1、前导链 3’—5’ 合成 5’—3’ 2、后随链 5’—3’ 合成 5’—3’岗崎片段 4)需RNA引物:合成DNA时,先借助RNA聚合 酶,以DNA为模板,合成一小段RNA,具 有引物作用 5)复制子(replicon):含一个复制起点, 能够独立进行复制的DNA区段。 3.基因表达 基因表达:DNA序列所携带的遗传信息, 通过转录和翻译形成具有生物 活性的蛋白质的过程。 转录 DNA 复制 逆转录 翻译 RNA 复制 蛋白质 1) 转录(transcription) 转录:在RNA聚合酶的催化下,以DNA反编码 链为模板,按碱基互补配对原则,以 dNTPs为原料合成RNA的过程。 一个特定基因的DNA双链分子中只有一条 链带有遗传信息,称为编码链,与之互补的 称为反编码链。 编码链:5' - ATG AAA CGA GTC TTA TGA -3' 反编码链: 3'- TAC TTT GCT CAG AAT ACT -5' mRNA: 5'- AUG AAA CGA GUC UUA UGA -3' 转 录 产 物 转 录 过 程 信使RNA(mRNA) 转运RNA(tRNA) 核糖体RNA(rRNA) 核仁以外的常染色质 转录的。 核仁内的常染色质转 录的。 转录初始阶段:DNA----hnRNA 转录加工阶段:hnRNA---mRNA (剪接、戴帽、加尾) DNA 3 5 CAAT框 TATA框 RNA聚合酶结合 控制转录频率 RNA聚合酶结合 决定转录起始点 外显子 1 外显子 2 外显子 3 内含子1(I ) 内含子2(I ) (E1) (E2) (E3) 1 2 1 30 31 104 105 AATAAA 回文顺序 转录 5 3 外显子 1 hnRNA (E1) 1 内含子1(I1) 30 外显子 2 外显子 3 内含子2(I ) (E2) (E3) 2 31 加工 5 104 剪接 105 AATAAA 回文顺序 146 带帽 加尾 3 mGmG 成熟的mRNA 146 外显子 1 外显子 2 外显子 3 外显子 3 外显子 1 AATAAA AATAAA (E1)11) (E22) 内含子2(I (E3) 22) 回文顺序 (E1) 内含子1(I (E3) AAAAAAAAAAAAA 1 30 1 30 31 104 105 146 105 146 戴 帽 5′— 5′ 戴帽:在hnRNA的5'端接上一 个甲基化帽,即7-甲基 鸟 嘌 呤 核 苷 酸 (m7'GpppX)。 戴 帽 有效地封闭 RNA 5'端,使之不再接加核苷 酸,也不受磷酸酶和水解酶的消化,增强了 mRNA的稳定性。 为 核 糖 体 提 供 识 别 mRNA 的 信 号 , 促 进 mRNA和核糖体小亚基的结合。 加 尾 mRNA 3‘端在腺苷酸聚合酶的作用下加接 一连串腺苷酸,形成多聚腺苷酸(polyA) 尾,这一过程称为多聚腺苷酸化反应。 作用:保持mRNA 3‘端末端稳定,不被酶的 破坏,并且可以促使mRNA由细胞核转运 到细胞质中。 2) 翻译(translation) 将mRNA的碱基顺序转变成为多肽链的 氨基酸顺序的过程。 mRNA rRNA tRNA 遗 传 密 码 表 四种碱基以三联体的形式组成一个遗传密码子64个 基因表达的特殊事件 遗传印记(genetic imprinting) 不同性别的亲代传给子代的同一染色 体或基因,当发生改变时可引起不同表型 的现象,也称为基因组印记 (genomic imprinting)。 表现:指来自双亲的基因存在着功能 上的差异。 机制:基因在生殖细胞分化过程中受到 不同修饰的结果。 据推测DNA的甲基化可能遗传印记的分 子机理之一。 Prader-Willi综合征(PWS) & Angleman综合征(AS) PWS 智力低下 AS Anti -PWS Anti -PWS 智力低下 Anti -AS Anti -AS 步态不稳 身材矮小 过度肥胖 小手小足 del(15)( q11-- q13) 大嘴呆笑 红面颊 癫痫 四、DNA的突变与损伤修复 (mutation and repair) DNA突变:是指DNA的核苷酸顺序发生的可 遗传的变异。 基因突变(gene mutation):基因在结构 上发生碱基对组成或排列顺序的 改变。 (一)突变的分类 生殖细胞突变 1.突变在个体发育阶段 体细胞突变 2.引起突变的因素 诱发突变 (induced mutation) 自发突变 (spontaneous mutation) 转换 ①碱基置换 3.基因突变 的方式 颠换 ② 碱基的缺失插入 整码突变 移码突变 ③动态突变 ④染色体的错误配对和 不等交换 ①碱基置换突变 一个碱基被另一碱基取代而造成的突变 转换(transition):嘌呤→嘌呤,嘧啶→嘧啶 类 型 颠换(transversion):嘌呤→嘧啶,嘧啶→嘌呤 T HBE: β 26 GAA→AAA 谷 →赖 A G C HBS:β 6 GAG→GTG 谷 →缬 置换突变的效应 1)同义突变(same-sense ): 碱基的改变并未引起编码的氨基酸改变。 例如,CCA→脯氨酸,A→G,CCG→脯氨酸 2)错义突变(missense mutation) : 碱基的改变引起编码的氨基酸改变。 例如,GAG→谷氨酸,A→T,GUG→缬氨酸 3)无义突变(non-sense mutation): 碱基的改变使该三联体不再构成任何氨基酸的 密码子,而形成终止信号UAG、UAA、UGA。例如: TAT→酪氨酸,T → A,TAA → mRNA → UAA →终 止信号。 4)终止密码突变(termination codmutation): 当DNA分子中一个终止密码发生突变,成为编码 氨基酸的密码子时,多肽链的合成将继续进行下去, 肽链延长直到遇到下一个终止密码子时方停止,因 而形成了延长的异常肽链。也称延长突变 ②碱基的缺失插入 是指在DNA编码顺序中插入或丢失1个 或几个碱基对,从而使插入或缺失点下游 的DNA编码全部改变,结果在转译水平上 引起多肽链的氨基酸顺序和种类也发生了 改变。包括移码突变、整码突变。 移码突变(frame-shift mutation)是 指DNA链上插入或丢失1个、2个甚至多个碱基 (但不是三联体密码子及其倍数),在读码时, 由于原来的密码子移位,导致在插入或丢失碱 基部位以后的编码都发生了相应改变。 移码突变 UAC AGU CCU ACA GAA UGG GAG 酪 丝 脯 苏 谷 色 谷 插入A UAC AAG UCC UAC AGA AUG GGA G 酪 缺失A 精 丝 酪 精 亮 甘 UAC GUC CUA CAG AAU GGG AG 酪 缬 亮 谷酰 天酰 甘 整码突变(codon mutation)在DNA链 的密码子之间插入或丢失一个或几个密码子, 则合成的肽链将增加或减少一个或几个氨基 酸,但插入或丢失部位的前后氨基酸顺序不 变。 A A A C C C T T T G G G C G C A T G T G C T T T G G G A A A C C C G C G T A C A C G A AA AA C A C CC CT TT T T T G G G G GG CC GG CC A A T T GG TT GG C C T TT TT G T G GG GA AA A A A C C C C CC GG CC G G T A A CC AA CC GG C 移码突变 G A AA AA A C C C T TT T T T G G G G GG CC GG CC A A T T G G TT GG C C T T T T T T G G G A A A A C C C G C A A C C C G C G G T T A A C C A C G A C G C C C G G G 整码突变 ③动态突变 动态突变(dynamic mutation):DNA分子 中碱基重复序列拷贝数在一代一代的传递中发 生扩增而导致的突变。 Fra X syndrome (CGG)n 6 ~ 46; normal n= n = 60 ~ 200; pre - mutation n = 230以上; patient ④染色体的错误配对和不等交换 减数分裂期间,同源染色体间的同源部分发生 联会和交换,如果联会时配对不精确,会发生不等 交换,造成一部分基因缺失和部分基因重复。这种 突变常用解释大段多核苷酸的丢失和重复。 a b c a d b e c f d a g e f a a b c g b d e f g b c d e f g a d e f c b c d g e f g (二) DNA损伤的修复 1.光修复 波长300~600nm的可见光 修复 光复活酶 2.切除修复 缺口 缺口 3.复制后修复 复制 重组 再合成 emphasis 1、基因的化学本质及DNA分子结构 2、DNA的分类(排列顺序的重复特点) 3、断裂基因的分子结构特点 4、基因的功能(储存、复制、表达) 5、基因突变的基本概念、类型及生物学意义