Transcript Travail de génétique 2°Doc

Travail de génétique
2°Doc
Doppagne M.L.
Evrard L.
Peduzzi F.
Schoenars P.
Estimation de la variance
génétique et phénotypique de
divers caractères de croissance
chez la chèvre Sicilienne
«Girgentana»
Plan de l’exposé
 Présentation
du sujet
 Commentaires des méthodes
 Résultats & Conclusion
 Applications pratiques
 Bibliographie
I. Présentation du sujet
Animaux populaires dans le passé:
-> élevés en centres urbains
-> vente au détail de viande et lait
 Restrictions sanitaires:
-> interdiction d’élever en centres
urbains
-> interdiction de vendre le lait
=> EXTINCTION (de 30 000 en 83 à 524 en 94)

Pour éviter l’extinction, la race doit
retrouver sa valeur génétique,
zootechnique et économique:
Augmenter la production de viande
 Retarder l’abattage à 45-60 jours

II. Commentaire des méthodes
1998 – 2000
 276 chevreaux: 118 mâles
158 femelles
 élevés en ferme expérimentale
au lait maternel

1. Collecte de données:





Numéro d’identification
Pédigrée
Sexe
Poids corporel
Taille de la portée
2. Analyses statistiques:

Modèle père multi-caractère incluant:
-> des effets fixes:
- année de naissance
- âge de la mère à la naissance
- taille de la portée
- sexe de l’enfant
-> des effets dus au hasard:
- pères dont on ne connaît pas l’âge à la
naissance de l’enfant
- autres
yijklmn = µ + ai + bj + ck + dl + sim + eijklmn








y = caractère de croissance
µ = moyenne générale
a = année de naissance
b = âge de la mère à la naissance
c = taille de la portée
d = sexe des chevreaux
s = effet du père lié à l’année de naissance
e = erreur
Héritabilité (h²) et variance génétique
additive (σ²a)
h² = 4 σ²s / (σ²s + σ²e)
-> σ²s : variabilité entre pères
-> σ²e: variance résiduelle
-> méthode ANOVA, ½ frères paternels
(paternal half-sibs)

σ²a= 4 σ²s /(1 – F)
-> F = consanguinité

Variance erreur de l’héritabilité
(σ²h²)
σ²h²= 32h²/T
-> T = pP où
-p = nombre de descendants de chaque père
-P = nombre de familles de demi-frères


Probabilité que la variance erreur soit
significative:
P0 = 1/(s-1) { P-1/P (Σp²) }
III. Résultats et conclusions
1. Effets de l’environnement:
-
Sur le poids corporel (BW):
-> effets fixes significatifs pour BW 0, 15, 60
-> seuls année et type de naissance
significatifs pour BW 30 et 45
-
Sur le gain quotidien moyen (ADG):
-> taille de la portée significative sauf pour
ADG1
-> année de naissance significative pour
ADG1, 3 et 4
-
Sur le poids corporel ET le gain quotidien
moyen:
-> année de naissance significative sauf pour
BW30
-> âge de la mère significatif sur période pré- et
post-sevrage càd entre 0 et 15 jours puis entre
45 et 60 jours
-> BW augmente en moyenne avec l’âge de la
mère
-> ADG 2-4 augmente avec l’âge de la mère
-> taille de la portée significative sur BW: «
enfants uniques » ont meilleur BW et ADG
2. Effets génétiques
-
Sur BW:
-> h² assez faible (valeur la plus élevée
pour BW0?)
-> corrélation génétique entre tous les
BW significativement différente de 0
-> corrélation phénotypique inférieure à
la corrélation génétique mais toutes
positives, élevées, et significativement
différentes de 0
-
Sur ADG:
-> h² faible inférieure à h² pour BW
-> corrélation génétique négative entre ADG1 et
ADG 2 - 4 , diminue avec l’âge
-> corrélation phénotypique augmente avec
l’âge
- Sur ADG et BW:
-> corrélation génétique négative entre BW et
ADG1 mais pas avec ADG 2 - 4
Conclusions
Effets fixes expliquent 24 à 41% des variances
phénotypiques:
 Année de naissance
 Taille de portée
 Age de la mère à la naissance


Corrélation génétique entre BW0 – 60 et BW30 –
60 permet sélection indirecte des BW 60 en
sélectionnant BW0 ou BW30

Corrélation négative entre BW0 et ADG1 due à
la perte de poids après la naissance
IV. Applications pratiques

Gestion des facteurs d’environnement

Sélection précoce au 30° jour

Sélection des parents limitée car
héritabilité faible

Attention à la consanguinité
V. BIBLIOGRAPHIE
« Estimation of the genetic and phenotypic
variance of several growth traits of the Sicilian
Girgentana goat ». B. Portolano et al. Small
Ruminant Research 45 (2002) 247 – 253
 « Méthodes Statistiques en Médecine Vétérinaire
». P. Leroy, F. Farnir. Les éditions de l’université
de Liège (2000 – 2001)
 « Cours de génétique quantitative ». P. Leroy, J.

Detilleux. (2004– 2005)