Transcript Genetic Mapping 을 위한 교배

Genetic Mapping 을 위한
교배
A 유전자와 B 유전자 사이의 거리(genetic map
교배방법
Double heterozygote x Double homozygote
AaBb
aabb
사람 가계도를 이용한 유전자 지도
작성의 문제점
1) 유전자 mapping을 위해서 인위적으로 필요
한 유전자형을 찾아서 교배할 수 없다.
2) 자연적으로 적절한 교배가 되더라도 자손
의 개체수가 적으므로 통계적 처리가 힘들
며, 구성원의 유전자형을 다 알 수 없으므로
해석이 힘들다.
세균의 유전자 mapping은 다음 3가지
방법에 의해 가능함
ㆍconjugation
ㆍtransduction
ㆍtransformation
Restriction mapping




제한효소 인식부위의 위치를 게놈상에 표시
RFLP marker를 게놈 mapping 에 이용할 수
있다 (단점 : marker 수가 적다)
제한효소 절편의 크기에 제한이 있다(작은
게놈(50 Kb 이하)에 적용이 용이)
50 Kb 이상의 게놈 : seven or eightnucleotide를 인식하는 제한효소 사용
거대 제한효소절편의 분석



OFAGE
CHEF
Optical Mapping- 현미경사용
-gel stretching
-molecular combing
FISH
형광표지를 사용한 probe를 이용
 In situ Hybridization on chromosome
 Metaphase chromosome
고 분해능 FISH
-Mechanically stretched chromosome(원심분리)
-Non-metaphase chromosome(interphase)

STS mapping
High resolution-FISH 보다 우수
STS : sequence tagged site
-EST
-SSLP
-random genomic sequence
STS mapping reagent 가 필요
STS mapping reagent

-

-
-
Radiation hybrid
사람 세포를 방사선 처리
Hamster 세포와 융합
Clone library
High capacity vector 사용하여 평균 insert 가
수백 Kb 되도록 cloning 함
염색체를 분리하여 library를 만들 수 있음
Physical mapping

물리적 방법을 사용하여 유전자를 mapping
1. Restriction mapping
2. FISH
3. STS mapping