Transcript 疾患感受性多型を有する遺伝子

疾患感受性遺伝子の同定
~関節リウマチを例に~
京都大学社会医学健康系
オープンキャンパス
平成17年6月11日
ゲノム情報疫学分野
山田 亮
関節リウマチ
私、リウマチでしょうか？
母のように手の形が変わって
しまうんでしょうか？
治りますか？
いいお薬ありますか？
副作用はありませんか？
医学研究
～遺伝子解析を含め～
病因解明
予後予測・発病予測
治療・発病予防
診断する、最適な治療法を選択するとは
台風の進路予想と”関節リウマ
地震発生の予想と“突発性疾患”?
情報の改善と予測の改善
技術の進歩
• 観天望気
– 夕焼けは晴れ
– 月が暈（かさ）をかぶ
ると雨
ひまわり6号による１億３０００
万画素の写真(H17.3.24)
ヒトゲノムプロジェクト
遺伝子、SNPの推移
プロジェクトスタート
2000
Gene
50k
40k
30k
20k
2001
2002
2003
2004
2005
27,283Genes
10k
dbSNP
10m
7.5m
5.0m
2.5m
>1000万SNPs
DNA
~遺伝・個人差・多型~
mRNA
タンパク質
疾患関連遺伝子とは
疾患感受性遺伝子
(DNAに刻まれたもの）
疾患病態関連遺伝子
(病的状態において特徴的な役割を果たす遺伝子)
全遺伝子
疾患関連遺伝子
トランスクリプトーム・プロテオーム
疾患感受性多型を有する遺伝子
ゲノム・多型
DNA
~遺伝・個人差・多型~
トランスクリプトーム
mRNA
タンパク質
プロテオーム
多数の遺伝子(DNA)
多様な転写調節(mRNA)
複雑な分子機能(タンパク質)
さまざまな疾患の相互関係
民族差・人種差
• 民族・人種を越えて同程度の罹患率の疾患
• 民族・地域により罹患率の異なる疾患
• 同一疾患名の疾患が同じ疾患かどう
か？？？
• 民族・人種で異なる多型構成
遺伝要因 x 環境要因 x 疾患のHeterogeneity ??
多数の遺伝子(DNA)
多様な転写調節(mRNA)
複雑な分子機能(タンパク質)
さまざまな疾患
入り組んだ民族関係
遺伝統計学
A network of protein–protein interactions in yeast
by Benno Schwikowski, Peter Uetz3 & Stanley
Nature Biotechnology 18 :1257 - 1261 (2000)
決定木解析
遺伝子の組換えの歴史を遡る
SLC22A4/5領域に認められた、自己免疫疾患感受性遺伝子座の「祖先組換え歴」的考察
11M11
２人種物理
的分離
Caucasian
Japanese
00W00:55%
00W00:70%
11M00: 5%
11M00:30%
00M11:35%
11M11: 5%
疾患感受性
変異
「祖先組換え歴」のシミュレーション
DNA(String of SNPs)
Time
Chromosomes
100 SNPs
5 generations
1->2->4->7->5 chromosomes
(0+1+1+4)=6 recombinations
青●→赤●にて感受性変異が生じた
ものとし、赤●は伝達された感受性
変異を表す
参考