Transcript PODSUMOWANIE METOD KINETYCZNYCH

PODSUMOWANIE
METOD KINETYCZNYCH
Kuba Skrzeczkowski
Zajęcia 50
PRZED NAMI…
Przybliżenie stanu stacjonarnego (steady-state
approximation)
Metoda szybkości początkowych (initial rates
method)
Metoda pozornych stałych szybkości (apparent
rate constants method).
MECHANIZM
MICHAELISA
- MENTEN
JAK DZIAŁA ENZYM?
Lock and key model. Pobrane z:
http://www.chemistry.wustl.edu/~edudev/LabTutorials/Carbo
xypeptidase/carboxypeptidase.html
KARBOKSYPEPTYDAZA
To przykład enzymu:
Widać tu miejsce
aktywne enzymu:
Zwróć uwagę na
kształt enzymu…
Źródło:
http://www.chemistry.wustl.edu/~edudev/LabTutorials/
Carboxypeptidase/carboxypeptidase.html
Gdyby jej nie było to nasz brzuch
wyglądałby tak:
Ponieważ jest to wygląda to tak: 
 http://gminabraniewo.pl/cms/images/info/odpady_1.jpg
Ewentualnie jak ktoś je za dużo:
 http://bi.gazeta.pl/im/6/8259/z8259726Q,Pojemnikina-rozne-typy-smieci.jpg
Więc …
Karboksypeptydaza pełni rolę maszynki
do przetwarzania aminokwasów!
 Rozwala peptydy, które wchodzą do
organizmu na aminokwasy.
 Z tych aminokwasów budujemy
peptydy, których potrzebujemy.
Ogólne działanie
http://www.chemistry.wustl.edu/~edudev/LabTutorials/
Carboxypeptidase/carboxypeptidase.html
Mechanizm Michaelisa - Menten
Ćwiczenie. Wyprowadź równanie na szybkość
tworzenia produktu w reakcji katalizowanej enzymem?
Wyprowadzone równanie…
Powinno mieć postać:
Ale w tym równaniu mamy [E], którego możemy nie
znać. Tymczasem znamy [E]0 które znamy (bo przecież
wiemy ile wprowadzaliśmy). Jak zmodyfikować
równanie?
ROZWIĄZANIE
Odpowiedź: Na etapie stosowania przybliżenia stanu
stacjonarnego wprowadzamy:
[E]0 = [E] + [ES]
Robienie tego potem może skutkować brakiem
możliwości usunięcia [ES].
STAŁA MICHAELISA
Jak łatwo zauważyć z wyprowadzonego równania:
Stała Michaelisa to takie stężenie substratu przy którym
szybkość jest równa połowie szybkości maksymalnej.
STAŁA MICHAELISA
Km świadczy o
powinowactwie enzymu do
substratu. Im mniejsze tym
łatwiej osiągnąć vmax zatem
powinowactwo większe,
zatem substrat lepiej pasuje
do dziury w enzymie.
ŻART BIOCHEMIKÓW
„Ty to masz takie Km że w każdą dziurę wejdziesz!”
http://media.oampss.tvsport.pl/media/filer_public_thumbnails/filer_public/2013/
04/03/chemicy.jpg__300x199_q85.jpg
INITIAL
RATES
METHOD
METODA SZYBKOŚCI POCZ.
Korzystając z metody szybkości początkowych wyznacz rząd
reakcji względem substratów oraz stałą szybkości.
OGÓLNA METODA…
𝑣 = 𝑘 [𝐴]𝑎 [𝐵]𝑏
log 𝑣 = 𝑙𝑜𝑔𝑘 + a ∗ log A + b ∗ log [B]
Utrzymując stałe stężenie [B] podczas eksperymentu:
log 𝑣 = 𝑎 ∗ log 𝐴 + 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑡
Co jest funkcją liniową (log(v) = f(log[A]))
Współczynnik kierunkowy = a
Taką metodę stosuje się przy dużych ilościach danych.
CHCĄC ZROZUMIEĆ DUŻE ILOŚCI
DANYCH… PRZYKŁAD Z ICHO
40th International
Chemistry Olympiad
Chcąc obliczyć rząd dla [Br2]
Wykres
ZADANIE…
Otrzymaliśmy w ten sposób rząd zero dla
Br2.
Zadanie: Wyznacz graficznie rząd dla
Na2S2O6 oraz jonów wodorowych.
POZORNE
STAŁE
SZYBKOŚCI