Transcript PubMed入门使用

PubMed入门使用
内容纲要
 一、PubMed及相关数据库简介
 二、PubMed数据范围
三、PubMed主页
 四、PubMed检索方法以及检索结果的处理
 五、PubMed Central
PubMed及相关数据库简介
Pubmed是美国国家医学图书馆 (NLM) 所属的国家生物技
术信息中心 (NCBI) 开发的因特网生物医学信息检索
系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。该
系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的自1950
年以来全世界70多个国家4300多种主要生物医学文献
的书目索引和摘要，并提供部分免费和付费全文链接
服务。PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生
物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
 ◦PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一
个。
 ◦PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相
关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条以上
的巨大数据库。
 ◦PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，
来自第三方的生物 学数据，序列中心的数据等等。
PubMed数据范围
 数据类型：期刊论文、综述、以及与其他数
据资源链接。
 特点：
免费提供题录和文摘
提供与原文的网址链接(部分免费获取）
提供检索词自动转换匹配
操作简便、快捷
PubMed数据范围
 MEDLINE
4800余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理、
牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。
这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。
文献量达1千2百多万条记录，并回溯到1966年。
记录中用[indexed for MEDLINE]标记表示
PubMed主页
PubMed 基本检索规则
 在检索栏中输入:
一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索）
如：placenta growth oxygen genbacev o
著者姓名,姓在前,名首字母在后。
如: smith ab
刊名输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式
如：clin exp immunol
布尔逻辑运算式： (运算符须大写）
如 ：Stem [ti] AND neuroscience
基本检索框
多个检索词输入
Moore AM撰写的有关接
触性皮炎的文章
PubMed 基本检索规则
 截词检索：treat*
 强迫短语检索：“brca
配和扩展检索）
1”（不再自动转换匹
PubMed 基本检索规则
 自动转换检索词
（automatic term mapping）
自动对照规范词表,期刊名表，短语，著者名索
引, 依次寻找转
短语寻找转换
单词转换
单词在上述四个字段寻找转换在所有字段中转换
 如：输入stem[ti]
AND neuroscience
 Details显示：
stem[ti] AND (("neurosciences"[TIAB]
NOT Medline[SB]) OR
"neurosciences"[MeSH Terms] OR
neuroscience[Text Word])
 自动扩展检索
系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索，如：
输入“hypertension therapy,系统自动将高血
压的药物治疗、饮食疗法，
Pubmed高级检索
 1.在PubMed主页的搜索框旁点击”
Advanced
Search（高级选项）”
 2.输入作者名、杂志名等，选择其它的限定
条件
 3.点击search
著者检索
moore am[au]
PubMed的辅助检索
 Limits（检索限制选择）
字段限制：著者、刊名、篇名、滤过（filter原
文收藏处）等
数据输入时间：默认检索可回溯到1950年，限制
选择30天-10年
7种文献类型限制
7种语种限制
12种子文档：(01年新增2种Space Life
Sciences and Bioethics ）
编制检索式
主题词型
哮喘的药物治疗（asthma, drug therapy）
asthma/drug therapy
手损伤的治疗（hand injuries, surgery,
therapy）
hand injuries/surgery OR hand
injuries/therapy
阿司匹林治疗心肌梗死（aspirin,
therapeutic use, myocardial infarction,
drug therapy）
aspirin/therapeutic use AND
myocardial infarction/drug therapy
编制检索式
混合型
检索舌根肿瘤的病理学(tongue neoplasms,
pathology, tongue base, base of the
tongue)
tongue neoplasms/pathology AND (“tongue
base” OR “base of the tongue”)
编制检索式
字段限制
查找闻玉梅教授的文献
Wen ym[au]
查找 Jhon Adorn Williams 撰写的文章
Williams JA[AU]
查找英语综述文献
english[la] AND review[pt]
Previw/index（检索策略预览）
 浏览检索式
 改变检索式
 （可用检索式编号#1
 浏览索引（index）
OR #2）
Index（索引字顺表）
 选择限制字段
 输入检索词（词根）
 在字顺表中选择检索词
 选用逻辑算符建立检索式
 点击GO
History（检索史）
 检索式回顾
 编辑检索式
 如#3
AND child
检索式
检索历史
Search details
数据库匹配
过程
PubMed搜索后的结果怎样看

搜索后的结果以summary format显示，默认情况下每页显示20条结果，最近提交
的文章将优先显示的前面
五.检索结果输出
 显示检索结果
 保存检索结果
 保存检索策略
显示字段选择（Display)
 Abstract
report:来源期刊、标题、著者、
著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评
论、PMID或UI、摘要。
 Citation Report: 显示除上述内容外，加
MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字
段。
 MEDLINE Report: (最完整，有标识符）
显示记录选择
 单一记录：著者姓名
 所有记录：选display旁的格式，及每页显示
记录数
 选定记录:
方框内打钩
Pubmed中的免费全文

PubMed上约有5％的文献是可以免费看到全文的，通
常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小
标记（ ）。你只要点击这个图标，系统就自动链接
入该文献的全文。但有两点值得注意的是，第一，
很多时候，这个图标在PubMed处于显示简要
（summary)状态下并不出现，而只有在选择显示摘
要（abstract)时才出现。因此，如果你不只是泛泛
浏览，而希望看到全文的话，我强烈建议你在
display下拉菜单中选择摘要（abstract)状态。第
二，有些时候，小图标上仅标着Full Text，而并没
有Free字样，但仍然可以链接入全文，不妨一试。
可获电子全文的链
接
输出格式选择（send to）
选中题录（或文摘）后
 Text当前网页文本格式，用浏览器文件保存
 File所有记录纯文本格式保存，用对话框保存
 Clipboad 剪贴板，暂存需下载记录，多项检
索后一起保存。 最多允许存储500条，保留8
小时。
 Email: 通过邮件发送
 RSS Feed：检索结果的RSS订阅，通过安装网
络聚合器可接收最新检索结果，不必再次检索。
 Other：全文传递服务等申请，需帐号、收费
保存检索策略
 Details
中的URL ，可以让检索匹配的详细
策略放入检索框，该检索页面可以存储入浏
览器收藏夹。
 My NCBI（Cubby）灰色栏中的功能按钮，存
储在数据库的个人文档中。
PMC (PubMed Central)
 生命科学期刊资源中心
 免费提供130多种期刊的10多万篇全文
 （不包括PubMed动态免费全文）