Transcript Bioinformatics란 무엇인가?

Bioinformatics
자연과학대학 화학과
유전자와 IT 기술이 만난다
DNA 조작하여서 살아간다면?
개 요
1 . Bioinformatics란 무엇인가?
2 . Bioinformatics의 연구분야와 응용분야
3 . Bioinformatics의 문제점과 철학이야기
Bioinformatics ?
생물정보학
"생명현상 연구에 필요한
다양한 전산학/통계학/수학적인 것들"
"컴퓨터 및 전산기법을 이용하여
생명체와 연관된 자료를 체계적으로 정리 
분석  적용하는 방법을 연구하는 학문 "
Biology
Information
science
Modern Biology
*90년대 후반부에 들어오면서
Human Genome Project의 활성화
*DNA chip등 제반 기술들의
발달로 인해 더욱더
풍부한 Data들을 활용
Bioinformatics 목적
연구자들에게 정보를 제공하여주고
연구정보를 입력할 수 있도록 하여
데이터 정보를 구성하여 제공
데이터를 분석하는 도구를 개발
도구를 통하여 데이터를 가공 분석하여
생물학적으로 의미있는 결과를 해석
모든 가용한 데이터를 총체적으로 통합 분석하여
새로운 원리를 찾아내고자 하는 것
Bioinformatics의 연구분야
유사성 검색을 위한 서열 분석 방법
목적 : 서열정렬은 관심대상인 서열과
상동성이 높은 서열들을 알아내어
그 기능을 유추하거나
관련 있는 서열간에 정량적인
상관관계나 관련기능부위등을 예측
유전자 cloning
데이터베이스 검색 및 확인
염기서열 결정
유전자 정보
1 . Smith-Waterman(1981)
Dynamic programing을 이용하여 전체 서열에서 유사성 검색
2 . FASTA(1988)
FASTA는 임의의 서열과 유사성을 가진 서열을 서열 데이터
베이스로 부터 찾는 강력한 소프트웨어
3 . BLAST(1990)
염기서열과 단백질 서열의 상동성 검색을 수행한다
NCBI
National Center for Biotechnology information
( 미국국립 생명공학 정보센터 )
염기 또는 단백질 서열분석,해독
생물의학 문헌이나 논문검색
nr (Genbank,EMBL,DDBJ,Pdb 서열)
month (지난30일간 변동된 서열)
yeast (효모), E. coll (대장균)
Pdb (3차구조 데이터베이스)
등등…
Bioinformatics의 응용분야
Genomics
유전정보의 총체
Structural Genomics( 구조 유전체학 )
Functional Genomics( 기능 유전체학 )
Human Genome Diversity Project( 다형성 )
Pharmacogenomics(유전체약리연구)
개인 유전체 카드
유전정보와 병력을 담은 개인별 유전체카드 등장
-Sandisk사의 사례
Tele-Medicine
유전정보를 통한 원격의료 Tele-Medicine 본격화
- Mediconsult사의 사례
의사
데이터베이스
환자
2. Triage
1. Request
3. Approve
Virtual Clinic
Mail Order Fulfillment
Proteomics
단백질의 총체
DNA chip
한 세포내에서 발현되는 유전 정보의 총체를 밝힘
염기서열 밝힘
유전자형 분석(genotyping)
유전병, 암, 감염병 등의 DNA 진단등에 널리 활용
단백질 chip
센서칩
수십 , 수백 개의 단백질이
작은 표면에 일정한 배열로
결합된 것인데 대부분 슬라이드
글라스 크기의 유리나 플라스틱을 이용
분석 장치
센서칩에 결합하는 단백질의
상호작용을 분석하는 장치
단백질 칩
단백질의
1. 상호 작용의 분석 (protein interaction)
2. 순수 분리 (protein Purification)
3. 특성 분석 (protein characterization)
우리나라의 Bioinformatics
BRIC (포항공대)
진누리
한국생물정보학회
회사 업체
Bioinformatics 문제점
과학발전적 측면
사회적 인식도 크지 못함
관련 분야 연구지원의 미비
충분한 기술적 연구인력의 부재
인권윤리적 측면
유전검사와 개인비밀 보호
유전검사 정도 관리
유전검사 정책
Bioinformatics와 철학
철학과 생물학의 만남
물리주의와 생기론
유기체주의
생물학의 진보 생물철학의 가능성
생물철학의 가능성
생명공학 특허
찬성론
반대론
산전유전자 치료
찬성론
반대론
신중론
감사합니다