Prokariot dan Eukariot Klasifikasi sel Prokariot dan eukariot Sel Prokariot Eukariot.
Download
Report
Transcript Prokariot dan Eukariot Klasifikasi sel Prokariot dan eukariot Sel Prokariot Eukariot.
Prokariot dan Eukariot
Klasifikasi sel
Prokariot dan eukariot
Sel
Prokariot
Eukariot
Sel prokariot: bakteri
Tidak memiliki nukleus - DNA bebas dalam
sitoplasma
Tidak memiliki membrane-bound organelles
Berukuran lebih kecil
Sebagian besar memiliki dinding sel
Polisakarida menutupi dinding sel pada banyak
spesies
Genom:
Kandungan genetik total pada set haploid kromosom pada
eukariot
Kromosom tunggal pada bakteri atau pada DNA atau RNA
virus
Material genetik pada organisme
Genom bakteri terdiri dari kromosom sirkular
Terkondensasi dengan cara supercoiling
dan looping membentuk badan nukleoid
yang terpak secara rapat
Kromosom bereplikasi di dalam sel dan
sel membelah secara biner
Genom bakteri
Circular dsDNA
G+C = 50%
G+C content merupakan struktur genom
Gen transfer pada bakteri
Transduction:
Melalui bacteriophage
Conjugation:
Kontak langsung
Transformation:
Mengintegrasikan free
DNA atau plasmid
(from Redfield, Nat. Rev. Genet. 2001)
Plasmid adalah DNA sirkular kecil
yang terdapat pada sel prokariot
Plasmids
Extra chromosomal circular DNAs
Ditemukan pada bakteri
Ukuran bervariasi dari ~ 3,000 bp sampai 100,000 bp.
Bereplikasi secara otonomi (origin of replication)
Dapat mengandung gen resisten
Dapat ditransfer dari satu bakteri ke bakteri lainnya
Dapat ditransfer kepada kingdom yang berbeda
Multicopy plasmids (~ up to 400 plasmids/per cell)
Low copy plasmids (1 –2 copies per cell)
Digunakan sebagai vektor untuk membawa gen yang
diinginkan
Genom bakteri berukuran kecil dan terpak secara padat dengan gen-gen
Spesies
Fungi
Saccharomyces cerevisiae
Aspergillus nidulans
Protozoa
Tetrahymena pyriformis
Invertebrates
Caenorhabditis elegans
Drosophila melanogaster
Bombyx mori (silkworm)
Strongylocentrotus purpuratus (sea urchin)
Locusta migratoria (locust)
Vertebrates
Takifugu rubripes (pufferfish)
Homo sapiens
Mus musculus (mouse)
Plants
Arabidopsis thaliana (vetch)
Oryza sativa (rice)
Zea mays (maize)
Pisum sativum (pea)
Triticum aestivum (wheat)
Fritillaria assyriaca (fritillary)
Ukuran genom (Mb)
12.1
25.4
190
97
180
490
845
5000
400
3200
3300
125
430
2500
4800
16 000
120 000
ORGANISASI GEN
EUKARIOT dan PROKARIOT
SITOPLASMA
NUKLEUS
DNA
INTRON
EKSON
RNA
TRANKRIPSI
DNA
TRANKRIPSI
RNA
mRNA
PENYAMBATAN
RNA
TRANSLASI
PROTEIN
TRANSLASI
PROTEIN
Eukariot
Genom
Keseluruhan informasi genetik dalam suatu
organisme
Informasi genetik inti: terletak di kromosom
Infromasi genetik organel:
- mitokondria,
- plastid (kloroplast)
Eucaryotic genomes
Berlokasi pada beberapa kromosom
Low gene density
Juga terdapat genom organel
Kromosom
Terlihat di dalam nukleus dengan zat pewarna
dan diamati dibawah mikroskop.
Material kromosom: Kromatin
Kromatin terdiri atas nukleosom
Nukleosome merupakan lilitan DNA pada molekul
protein yaitu protein histon
Nukleosom terorganisasi ke dalam 30 nm benang-
benang
Benang-benang terlipat-lipat membentuk 10,000-fold
compaction yang diperlukan untuk membentuk
kromosom eukariot di dalam nukleus.
Kekompakan genom
Karakteristik
Yeast
Lalat buah
Manusia
Gene density (average number 479
per Mb)
Introns per gene (average)
0.04
76
11
3
9
Amount of the genome that is
taken up by genome-wide
repeats
12%
44%
3.4%
Genom Mitokondria (mtDNA)
Berbentuk circular chromosomes
Terdapat lebih dari satu
Berukuran ~15 Kb pada hewan
Berukuran ~ 200 kb sampai 2,500 kb pada
tumbuhan
Lebih dari 95% protein mitokondria dikode di
genom nuklear.
Genom kloroplas (cpDNA)
Multiple circular molecules
Ukuran berkisar dari 120 kb sampai 160 kb
Mirip dengan mtDNA
Banyak protein kloroplas dikode di nukleus
(separate signal sequence)