MCM 2012-2013 LA LITTERATURE BIOMEDICALE LES STRATEGIES DE RECHERCHE Bibliothèque IMT, septembre 2012 Sujets principaux Obtenir des informations véridiques La littérature biomédicale Revues électroniques (texte.
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 4
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 7
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 9
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 12
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 15
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 17
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 20
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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Slide 21
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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Slide 22
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 23
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 24
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 25
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 28
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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Slide 29
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 31
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 32
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 33
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 36
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 3
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 5
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 8
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 11
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 12
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 13
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 16
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 19
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 20
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 21
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
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Slide 22
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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Slide 23
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 24
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
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Slide 25
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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Slide 26
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 27
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 28
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 29
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
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MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 32
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
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Slide 33
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
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Slide 34
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 35
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
bases de données
“Current awareness” services:
Current
Contents [ISI => Thomson Scientific]
“Citation” databases:
ISI
Web of Science + Journal Citation Reports
Google Scholar
“Knowledgebase”:
Cochrane
Library
Clinical Evidence
Citation databases
En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
Bibliothèque IMT – URL
http://lib.itg.be/journals.htm
links to selected electronic journals
http://lib.itg.be/datab.htm
links to selected databases
http://lib.itg.be/ebooks.htm
links to selected electronic books
http://lib.itg.be/biblinks.htm
links to selected biomedical websites
http://e-lib.itg.be/
login externe
FIN
Slide 36
MCM 2012-2013
LA LITTERATURE BIOMEDICALE
LES STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, septembre 2012
Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
La littérature biomédicale
Revues électroniques (texte intégral)
Bases de données bibliographiques
Livres électroniques (e-books)
Ressources d’information
Se reporter à son éducation
Utiliser sa documentation personnelle
Consulter un collègue (expert?)
Visiter une bibliothèque (disponible?)
Chercher sur internet / W W W:
Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …
Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:
Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique
Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: www.who.int/
Centers for Disease Control and Prevention:
www.cdc.gov/
ONUSIDA: www.unaids.org/
PNUD: www.undp.org/
Banque Mondiale: www.worldbank.org/
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm
La littérature biomédicale
Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives permanentes’)
Source de la recherche biomédicale
future
La littérature primaire
Articles (revues)
Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet
Livres (et autres)
Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet
Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
Essentiel: périodicité; [abonnement]
Filtre de qualité: ‘peer review’
Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase,
Scopus, Science Citation Index, …)
Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)
Revues électroniques
La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour toutes les revues!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-15
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
Disponible
pour tous (avec ou sans embargo)
Disponible uniquement pour les abonnés payants
Revues hybrides: mixe d’articles gratuits et articles
payants
Revues à abonnement
Acta Tropica (1995- )
American Journal of Tropical Medicine and
Hygiene (1921- )
Transactions of the Royal Society for
Tropical Medicine and Hygiene (1995- )
Tropical Medicine and International Health
(1996- ) [mais ‘open access’ après 12 mois]
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Revues ‘open access’
PLoS Neglected Tropical Diseases (2007- )
Malaria Journal (BioMedCentral, 2002- )
Open Tropical Medicine Journal (2008- )
Voir aussi: DOAJ – Directory of Open Access
Journals (>8,000 titres)
See: ‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (ITM)
Portails ‘open access’
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
SCIELO: accès libre pour les revues latinoaméricaines (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: principles of
institutional repositories and self-archiving.
HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
Bases de données
bibliographiques
Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques
Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
ITG Student Dissertations
Tropical Endemic Diseases Control
Health Care in Developing Countries
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Caractéristiques
Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 10,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques
Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus
Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)
ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)
(a): Document(s) spécifique(s)
But: limiter rapidement les options
Déterminez les éléments les plus
spécifiques
Cherchez dans les champs pertinents
Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe
Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Jamison DT et al. Disease control priorities in developing
countries; 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 2006.
Olsen J, Christensen K, Murray J, Ekborn A.
An introduction to epidemiology for health professionals. New
York: Springer, 2010.
Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘priorities in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)
URL? Book – Book-E – Book-H
Trouvez les références suivantes
+ version digitale [PDF]
… l’article de Boelaert-M et al. sur la
leishmaniose viscérale en Inde … [Année=2011]
… l’article de Delvaux-T et al. sur la santé
reproductive au Cambodge publié dans ‘JAIDS’
… [Année=2011]
… la thèse PhD de Hasker-E …[Année=2010]
… le livre publié par CABI sur la maladie de
sommeil … [Année=2004]
(b): Recherche d’un sujet
-
-
Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)
Exercices
Cherchez de la littérature récente (2008-2012)
pour les sujets suivants:
Contrôle vecteur de dengue
Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
L’éradication du ver de Guinée
Mortalité maternelle en Asie
Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun
Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon #1
PY>2002 #2
#1 and #2 #3
Remarques pratiques
Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile
Bases de données
internationales
Avantages
Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides
Désavantages
Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT
Exemples
Medline / PubMed (NLM)
Global Health (CABI)
Popline
Lilacs [Amérique latine!]
Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’
Medline / PubMed
La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>22.000.000 notices)
Thésaurus: 25.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT
Notices PubMed
Options d’affichage
Liens vers le texte intégral
Marquer
Thésaurus ‘MeSH’
‘Journal database’
‘Single citation search’
Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices
Addresses PubMed
URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov/
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/
Autres genres de
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En 2006 Bruno Gryseels et collègues ont
publiés un séminaire sur la bilharziose
(‘schistosomiasis’) dans ‘The Lancet’.
Trouvez le texte entier (PDF) de cet article
et cherchez des articles qui l’ont cités
depuis 2006.
Citation databases & JCR
L’éditeur
PLoS (Public Library of
Science) publie 7 revues en ‘open
access’.
Lesquelles de ces revues ont un
facteur d’impact ‘officiel’ (IF) et quel IF
est le plus élevé?
E-Books – livres digitales
Bookshelf (NCBI)
Free Online Medical Books
Google Book Search; WikiBooks
MYiLibrary
SpringerLink Medical collection
HIV Insite Knowledge Base
World Health Report (WHO)
…
See: ‘http://lib.itg.be/ebooks.htm’
Google Scholar
Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
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Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?
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