MCM 2008/09 LITTERATURE BIOMEDICALE STRATEGIES DE RECHERCHE Bibliothèque IMT, octobre 2008 Sujets principaux Obtenir des informations véridiques  La littérature biomédicale  Bases de données bibliographiques  Revues.

Transcript MCM 2008/09 LITTERATURE BIOMEDICALE STRATEGIES DE RECHERCHE Bibliothèque IMT, octobre 2008 Sujets principaux Obtenir des informations véridiques  La littérature biomédicale  Bases de données bibliographiques  Revues.

Slide 1

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 2

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 3

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 4

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 5

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 6

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 7

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 8

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 9

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 10

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 11

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 12

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 13

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 14

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 15

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 16

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 17

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 18

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 19

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 20

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 21

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 22

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 23

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 24

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 25

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 26

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 27

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 28

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 29

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 30

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 31

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 32

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 33

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 34

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 35

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 36

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 37

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 38

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 39

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 40

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 41

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 42

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 43

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 44

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 45

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 46

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 47

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

Slide 48

MCM 2008/09

LITTERATURE BIOMEDICALE
STRATEGIES DE RECHERCHE
Bibliothèque IMT, octobre 2008

Sujets principaux
Obtenir des informations véridiques
 La littérature biomédicale
 Bases de données bibliographiques
 Revues électroniques (texte intégral)
 Liens entre bases de données (notices) et
le texte intégral (articles)
 Exercices


But de la recherche
Obtenir des informations
pertinentes de façon
efficicace
Tout l’essentiel sans l’inutile

Indexes internet (p.ex. Google)
Quelques désavantages:









Pertinence? Genres d’informations: trop
générales ou fragmentaires – mais pas:
les résultats propres de recherche publiés
Véracité? ‘Peer reviewed’
Complet? Toujours lacunes d’une partie
substantielle, mais on ne sait pas lesquelles
Modalités de recherche limitées (raffinement?)
‘Relevance ranking’ (manipulation?)
Conclusion: inapte pour l’analyse systématique

Ressources d’information
Se reporter à son éducation
 Utiliser sa documentation personnelle
 Consulter un collègue (expert?)
 Visiter une bibliothèque (disponible?)
 Chercher sur internet / W W W:


Moteurs de recherche automatisés, répertoires
hiérarchiques, portails par sujet, sites web
d’organisations pertinentes, …

Sites web d’organisations
& agences internationales
Organsation Mondiale de la Santé: [www.who.int/]
Centers for Disease Control and Prevention:
[www.cdc.gov/]
ONUSIDA: [www.unaids.org/]
PNUD: [www.undp.org/]
Banque Mondiale: [www.worldbank.org/]
…
Voir: http://lib.itg.be/biblinks.htm

Partie 1: la littérature
biomédicale

Littérature biomédicale


Résultat de la recherche biomédicale
(‘publication’ + ‘archives’)



Source de la recherche biomédicale
future

Littérature primaire
Articles (revues)





Etudes spécifiques
Plus à jour
Répertoriés dans des
bases de données
Distribution dans les
bibliothèques ou sur
internet

Livres (et autres)





Portée plus large
Moins à jour
Répertoriés de façon
plutôt limitée
Plus difficiles à localiser
dans les bibliothèques
ou sur internet

Revues biomédicales
> 20.000 revues d’intérêt biomédical?
 Essentiel: périodicité; abonnement
 Filtre de qualité: ‘peer review’
 Status: inclus dans les bases de données
principales (p.ex. Medline, Embase, Biosis,
Science Citation Index, …)
 Status: hiérarchie, souvent sur base de
citations (p.ex. ‘impact factors’)


Revues médicales générales
Annals of Internal Medicine
 BMJ – British Medical Journal
 JAMA – Journal of the American Medical
Association
 Lancet [tiers monde!]
 NEJM – New England Journal of Medicine
 Presse Médicale


Revues spécialisées
AIDS
 Journal of Infectious diseases
 Lancet Infectious Diseases
 Médecine et Maladies Infectieuses
 Médecine Tropicale
 Tropical Medicine & International Health


[IMT!]

Autres publications


Livres
 Monographies [généralement un sujet assez spécifique]
 ‘Textbooks’ [portée plus large]

Dissertations [maîtrise vs PhD]
 Littérature grise [non-publiée ?]


 Compte

rendus de conférences, rapports, …
 Documents de distribution limitée [OMS!]

Littérature secondaire


Index bibliographiques: listes des sommaires de
revues




‘Abstract journals’ : incl. analyses critiques




=> Bases de données bibliographiques
=> Bases de données bibliographiques

‘Review journals’ : analyses systématiques =>
synthèses


=> ‘Knowledge databases’: ‘evidence-based
medicine’ (p.ex. Cochrane Library, Clinical
Evidence, [Gideon], [Kabisa], …)

Partie 2:
les bases de données

Bases de données
bibliographiques






Contenu: couvrent des domaines et des
ressources nettement définis (p.ex. maladies
endémiques; une collection locale ou
(inter)nationale de livres ou de revues)
‘Notices bibliographiques’ bien structurées qui
représentent des publications / champs:
auteur, titre, revue, année de publication, …
Souvent: un thésaurus (mots-clés contrôlés,
organisation hiérarchique) ou des index
alphabétiques

Quelques exemples
ITG Book and Document Holdings
 ITG Student Dissertations
 Tropical Endemic Diseases Control
 Health Care in Developing Countries


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Caractéristiques








Produites par la bibliothèque IMT
Plutôt limitées; p.ex. 5,000-20,000 notices
Sujets et collections pertinents
Orientation tiers monde
Toutes sortes de publications
Mots-clés libres; thésaurus manque
Disponibilité garantie: texte intégral à la
bibliothèque IMT + si disponible, des liens
vers les éditions électroniques

Stratégies de recherche:
1. Où commencer ?
Choisissez la base de
données appropriée
Critères:
- couverture: années + sujets
- disponibilité du texte intégral
- genre de documents inclus

Stratégies de recherche:
2. Combien?
Référence ou location d’un
document spécifique (a)

ou
Information plus ou moins étendue
concernant un sujet (b)

(a): Document(s) spécifique(s)

But: limiter rapidement les options
 Déterminez les éléments les plus
spécifiques
 Cherchez dans les champs pertinents
 Utilisez les index alphabétiques pour
vérifier l’orthographe


Comment trouver les livres
suivants dans la bibliothèque
Beaglehole R, Bonita R. Public health at the
crossroads; achievements and prospects; 2nd ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2004.
Peters W, Pasvol G. Médecine tropicale et parasitologie.
Paris: Médecine-Sciences Flammarion, 2004.






Choisissez la base de données appropriée
Les éléments spécifiques qui distinguent cette référence?
Limiter aux champs appropriés si nécessaire (p.ex.
‘crossroads in TI’)
Notez les coordonnées nécessaires (p.ex. code de sujet)

Trouvez les références suivantes
… l’article de Marleen Boelaert sur la
leishmaniose en Somalie … [PY=2003]
 … l’article sur les médicaments VIH
génériques publié dans le New England
Journal of Medicine … [PY=2005]
 … le livre sur la maladie de sommeil
publié par CABI … [PY=2004]
 …le CD-ROM sur le ‘Schistosomiasis
Control Initiative’ … [PY=2004]


Dissertations
1.

Trouvez la dissertation de Pascal
Lutumba (IMT-MCM 2000-2001)



Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Thèse de maîtrise vs. PhD



(b): Recherche d’un sujet
-

-

Choisissez une base de données appropriée
Décrivez votre sujet; soulignez les mots essentiels
Identifiez les mots-clés ou les descripteurs anglais
correspondants à l’aide du thésaurus ou l’index
Déterminez la relation logique entre les différents
mots-clés; combinez les avec les opérateurs
booléens: AND, OR, NOT
Evaluez les résultats + optimalisez les mots-clés
Limitez si nécessaire (p.ex. langue, année de
publication, type de publication, disponibilité)

Exercices
Cherchez de la littérature récente (2006-2008)
pour les sujets suivants:
 Contrôle vecteur de dengue
 Contrôle du paludisme en Afrique utilisant
des moustiquaires impregnées
 L’éradication du ver de Guinée
 Mortalité maternelle en Asie

Liste des thèses IMT des 10 dernières
années concernant le Cameroun





Ouvrez la base de données appropriée
(‘ITG Student Dissertations’)
Cameroon  #1
PY>1998  #2
#1 and #2  #3

Remarques pratiques







Commencez par l’essentiel, continuez en
étapes logiques; évitez les phrases et mots-clés
très compliqués
Pensez aux synonymes, faites attention à
l’orthographe
Troncature (‘*’) peut augmenter les résultats
N’utilisez que l’anglais, même si vous ne
cherchez que des documents en français
Attention: utilisation de ‘not’, risque de jeter le
pertinent avec l’inutile

Notices bibliographiques
Affichage: sélection limitée de champs
vs. ‘complete record’
 Liens vers le texte intégral (?)
 Marquer
 Imprimer: sélection de notices et de
champs
 Sauvegarder: idem + location


Bases de données
internationales
Avantages





Couverture large
Volume
Système de motsclés bien structuré
Mises à jour
rapides

Désavantages





Uniquement des articles
Biais EU/RU/anglais
Sous-representation
d’autres continents
Aucune relation avec la
collection de l’IMT

Exemples
Medline / PubMed (NLM)
 Global Health (CABI)
 Popline
 Lilacs [Amérique latine!]


Voir: ‘http://lib.itg.be/datab.htm’

Medline / PubMed








La principale base de données bibliographique
des sciences biomédicales
1950 - présent (>18.000.000 notices)
Thésaurus: 20.000 mots-clés ‘MeSH’
(‘Medical Subject Headings’)
Articles (livres et chapitres non inclus!)
Biais fort anglophone
Sous-représentation des revues locales
+ tiers monde
Aucune relation avec la collection de l’IMT

Notices PubMed
Options d’affichage
 Liens vers le texte intégral
 Marquer
 Thésaurus ‘MeSH’
 ‘Journal database’
 ‘Single citation search’
 Options pour imprimer ou sauvegarder
une sélection de notices


Addresses PubMed





URL ‘officiel’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/
URL ‘simplifié’:
http://pubmed.gov
URL ‘tutorials’:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
URL ‘My NCBI’:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/

Autres genres de
bases de données


“Current awareness” services:
 Current



Contents [ISI => Thomson Scientific]

“Citation” databases:
 ISI

Web of Science + Journal Citation Reports
 Google Scholar


“Knowledgebase”:
 Cochrane

Library
 Clinical Evidence

Google Scholar









Combine les caractéristiques d’un moteur de
recherche avec une base de données
bibliographique
Cherche la littérature scientifique, non des sites
web
‘Relevance ranking’ au lieu d’ordre chronologique
‘Citation linking’ (dans un univers limité)
Liens vers le texte intégral (à condition que vous
ayez droit d’accès)
Mais: couverture fragmentaire, critères de sélection
inconnus?

Partie 3: disponibilité des
documents intégraux?


Digital, sur internet?



Papier, à la bibliothèque IMT?

Revues électroniques





La majorité des revues offrent une édition
digitale intégrale à partir de leur site web, mais
ceci n’est pas le cas pour chaque revue!
Couverture généralement limitée (p.ex. 5-10
dernières années)
Politiques d’accès différentes:
 Disponible

pour tous (avec ou sans embargo)
 Disponible pour les abonnés
 Edition électronique à coût supplémentaire
 ‘Electronic only’

Listes de revues
électroniques


‘http://lib.itg.be/journals.htm’ (IMT)



Liste alternative: ‘A-to-Z’ (IMT)



Portails divers: p.ex. FreeMedicalJournals.com,
HighWire Press Free Online Full-text Articles,
FreeFullText.com, …

Codes d’utilisateur IMT
Pour avoir accès à certaines bases de
données ou revues électroniques:
User Name: itguser
 Password: itguser
 Autres (p.ex. Lancet): voir IMT Intranet:
http://intranet.itg.be => Academisch … =>
Bibliotheek => Journal Access Codes


Initiatives ‘Open access’







HINARI – Health Internetwork: conditions
d’accès spéciales pour le tiers monde.
PubMed Central: accès gratuit après 6 mois.
BMC - BioMed Central: série de nouvelles
revues digitales gratuites (‘electronic-only’ + ‘peer
reviewed’, paiement d’auteurs).
PLoS - Public Library of Science: idem,
e.g. PLoS Biology, PLoS Medicine, ..., PLoS
Clinical Trials

… (suite)


SPARC – Scholarly Publishing & Academic
Resources Coalition: nouvelles alternatives pour
certaines revues à prix élevé.




SCIELO: revues de l’Amérique latine (BIREME).
OAI - Open Archives Initiative: ‘self-archiving,
using universal interconnectivity protocols’. Voir
p.ex. les répertoires DOAJ & DOAR (Lund University)

Voir: “http://lib.itg.be/journals.htm”, parties 2 & 3

Publications électroniques
en texte intégral
Bookshelf (NCBI)
 FreeBooks4Doctors (B. Kamp)
 WikiBooks
 Humanity Library Online (Human Info)
 World Development Report (World Bank)
 World Health Report (WHO)
…
Voir: “http://lib.itg.be/ebooks.htm”


Liens entre notices
bibliographiques et articles


Au niveau de la revue:
 Local

holdings: lien vers la liste des revues
électroniques



Au niveau de l’article:
 Champ

‘NT’ (en cliquant)
 PubMed links

Comment trouver des documents
dans la bibliothèque IMT?
1.

Articles de revues


Vérifier si la revue est disponible à la
bibliothèque (voir champ ‘*LHM’ ou catalogue)
 Copier ou imprimer les notices
 Le champ ‘source’ (‘SO’) est essentiel !
 Les revues sont rangées par ordre
alphabétique
Numéros récents: 4e étage
Numéros anciens (reliés): 3e étage

2.

Livres


Copier ou imprimer les notices
 Les champs ‘Code’ (‘CD’) et ‘Publication year
(‘PY’) sont essentiels!
 Les livres sont rangés par sujet
3.

Dissertations IMT


Consultez les listes imprimées ou la base de
données ‘ITM Student Dissertations’ (incl. URL)
 Voir le champ ‘Series’ (‘SE’) pour le numéro
correcte
 A demander au comptoir en utilisant le régistre

4.

Littérature grise


Chercher dans la base de données
‘ITG Books and Document Holdings’
 Vérifier le champ ‘Series’ (‘SE’) pour
identification correcte
 Voir le champ ‘Message’ (‘ME’) en haut des
notices pour des instructions spécifiques
5.

Statistiques, etc.


Consulter les rapports dans la section
‘Reference’, à côté des ordinateurs

FIN

MCM 2008/09 LITTERATURE BIOMEDICALE STRATEGIES DE RECHERCHE Bibliothèque IMT, octobre 2008 Sujets principaux Obtenir des informations véridiques  La littérature biomédicale  Bases de données bibliographiques  Revues.

Transcript MCM 2008/09 LITTERATURE BIOMEDICALE STRATEGIES DE RECHERCHE Bibliothèque IMT, octobre 2008 Sujets principaux Obtenir des informations véridiques  La littérature biomédicale  Bases de données bibliographiques  Revues.

Directory