Transcript Nationellt biobanksråds inventering av biobanker och biobankstjänster

Version 2012-05-22
Biobanker och biobankstjänster
2011
Inventering utförd av Nationellt biobanksråd (NBR)
I inventering inkluderades biobanker med landsting som huvudman
(för vård och/eller forskning) samt Karolinska Institutets Biobank.
1
Version 2012-05-22
1. Biobanken/Biobanksavdelningen
Tabell 1: Inrapporterade biobanker
Typ av biobank
Hälso- och Sjukvårdsbiobank
Forskning*
Summa
Antal
68
31
99
%
69
31
100
* 30 forskningsbiobanker hos landsting, samt KI Biobank
Forksningsbiobank = 30 forskningsbiobanker med landsting som huvudman
samt Karolinska Institutets Biobank
Tabell 2: Typ av verksamhetsområde
Biobank - verksamhetsområde
Patologi/Cytologi
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Klinisk genetik
Immunologi
Transfusion
Transplantation
Gynekologi/Obstetrik
Forskning
Kombination av flera
Annan
Summa
Antal
17
12
10
2
2
3
4
3
31
3
12
99
Tabell 3: Inrapporterade Hälso- och Sjukvårdsbiobanker vid Universitetssjukhus
Patologi/
cytologi
Umeå
Uppsala
Örebro
Stockholm
Linköping
Sahlgrenska
Lund
x
x
x
x
x
x
Mikro
Klin
Kemi
x
x
x
x
x
Klin
genetik
Immunologi
x
x
Trans
fusion
x
x
x
x
x
x
x
x
x
Transplantation
Gyn/
Obs
x
x
X(Tobiasreg)
x
x
x
x
x
Linköping och Lund har Immunologi och transfusionsmedicin i samma biobank
Tabell 4: Biobankens lokalisation
Finns biobanken på flera
orter/sjukhus
Biobanken finns på flera orter/sjukhus
Biobanken finns på en lokalisation
Okänt
Summa
Antal
%
14
81
4
99
14
82
4
100
2
Version 2012-05-22
Tabell 5: Inrapporterade biobanker per landsting (Saknas: Halland, Gotland, Kalmar)
Landsting
Region
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Södra
UÖ
UÖ
Norra
SydÖstra
Södra
Norra
Södra
3
4
3
1
4
3
1
18
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
Stockholm
Stockholm
9
2
KI biobank
(Stat)
Södermanland
Uppsala
Stockholm
1
UÖ
UÖ
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Totalt
Antal
Biobanker
Pat/ Mikro Klin
Kemi
cyt
Klin
gen
Imm
1
1
1
1
1
1
-
-
-
-
4
5
1
1
UÖ
Norra
Norra
UÖ
VG
3
2
2
3
17
UÖ
SydÖstra
Tra
nspl
ant
1
1
Gyn/
Obs
-
Tra
nsfu
s
1
Annan Vad
-
1
1
3
-
-
-
1
-
2
-
-
-
-
-
-
-
1
1
1
-
-
-
1
-
-
1
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
-
-
1
-
1
5
6
10
1
1
1
1
-
1
1
1
1
-
-
1
1
99
17
11
10
2
2
3
4
3
Kombination
Öron - utbildning
Kombination
Infektionssjukvård
Minnesmottagning
PKU-biobanken
Karolinska biobanken
Forsk
ning
1
2
9
3
1
Infektionssjukvård
Assisterad
reproduktion
Övergripande biobank
Vad
Reumatologi
Kombination, Odontologi
Kombination
Endokrinologi, Kirurgi
Transglutaminas registret
Capio - hjärtmottagning
Vuxenpsykiatri
Osteoporosforskning
Klinisk forskning BMC
Södersjukhusets fo.biobank
Danderyds biobank
SLSO-biobank
Forskningsprov
-
1
1
7
Onkologi
Medicinska biobanken
-
1
5
Kliniskt forskningscentrum
Närsjukvården
Barn och ungdomssjukhuset
Öronkliniken
Njurmedicin SU/S
Anestesi och
operationscentrum
15
31
Kombination
Gastrokirurgi
Hematologi
Neuropsykiatri
Stressmedicin, Folktandvården
Ögon, Ortopedi, Thoraxkirurgi
Njurmedicin
3
Version 2012-05-22
2. Ackreditering/certifiering
Tabell 6: Ackrediterad/certifierad biobank
Är biobanken/avdelningen
ackrediterad/certifierad
Ja
Ja, som en del i ackrediterad verksamhet
Nej, men förbereder
Nej
Saknas
Summa:
Vård
biobank
15
25
5
20
3
68
%
22
37
7
29
4
100
Forsknings %
biobank
2
6
3
10
2
6
22
71
2
6
31
100
Tabell 7: Gällande ackreditering/certifiering
Av vem
SWEDAC
Det norske Veritas
Saknas
Summa:
Vård
biobank
37
Forsknings
biobank
3
1
0
30
68
28
31
Enligt standard
151 89
170 25
151 89 + 170 25
9001
WMDA
-
Vård
biobank
20
11
4
1
1
31
68
Forsknings
biobank
1
1
0
0
0
29
31
Tabell 8: Verksamheten blev ackrediterad/certifierad
Ackrediterad
sedan år
1993-1995
1996-2000
2001-2005
2006-2010
Saknas
Summa:
Vård
biobank
5
13
9
10
31
68
Forsknings
biobank
0
0
1
1
29
31
3. Prov i biobankerna
Tabell 9: Lagring av prov i biobanken
År då lagring av
prov påbörjades
1921-1930
1931-1940
1941-1950
1951-1960
1961-1970
1971-1980
1981-1990
1991-2000
2001-2010
2011Saknas
Summa:
Vård
biobank
3
2
1
11
10
9
10
16
6
68
Forsknings
biobank
1
1
2
8
16
1
2
31
4
Version 2012-05-22
Figur 1: Fördelning av biobanksprov per verksamhetsområde
Forskning 3%
Mikrobiologi 2%
Övrigt* 0.2%
Kombination 2%
Klinisk kemi 0.5%
Patologi/Cytologi
90%
PKU 2%
* I gruppen övrigt finns prov från klinisk genetik,
transplantation, immunologi, transfusion,
gynekologi/obstetrik
Uppgifterna bygger på antal prov och alikvoter, ej enbart moderprov
Information saknas från Halland, Gotland, Kalmar. Tre huvudmän har kombinations-biobanker där flera
discipliner ingår.
4. Information om lagrade prov
Tabell 10: Elektroniskt lagrad information
Information
lagrad
elektroniskt
Ja
Nej
Saknas
Summa:
Vård
biobank
Forsknings
biobank
50
16
2
15
15
1
68
31
Elektronisk
information
sedan år
1921-1930
1931-1940
1941-1950
1951-1960
1961-1970
1971-1980
1981-1990
1991-2000
2001-2010
2011Saknas
Vård
biobank
2
5
7
23
9
4
18
68
Forsknings
biobank
1
2
9
1
18
31
5
Version 2012-05-22
Tabell 11: System för lagring av information
Typ av System
LIS-system
Vård
biobank
39
Forsknings
biobank
2
Ex. SafirLis, Analytix, Symapthy, ADBakt,
Flexlab, Labstudio, Genesis, Labware
LIMS, Prosang, Sapphire, DoReMi, Kebo
Datamanagement program
6
1
5
11
Ex. BC-gene, Linnéfiler, Prometheus,
eget system
Kontorsprogram
Ex.SAS, Access, Excel, Filemaker, SPSS
1
SBR
Svenska biobanksregistret
Summa:
50
15
Tabell 12: Typ av information lagrade i systemen
I systemet/filen finns
Information finns på individnivå*
Information om diagnos**
Information om analysresultat**
Vård
biobank
49
28
43
%-andel med
informationen
98
56
86
Forsknings %-andel med
informationen
biobank
13
87
6
40
7
47
* Information saknas från 9 vårdbiobanker och 7 forskningsbiobanker
** Information saknas från 10 vårdbiobanker och 7 forskningsbiobanker
Tabell 13: Kodning som används vid lagring av information på individnivå i
system/fil
Typ av kodning
Enbart personnummer
Enbart annan kodning
Båda ovanstående förekommer
Saknas
Summa:
Vård
biobank
27
6
16
19
68
Forsknings
biobank
1
7
6
17
31
Tabell 14: Förvaringstemperatur i biobanken
Förvaringstemperatur
(flera kryss möjliga)
Rumstemperatur
-4ºC till -8 ºC
-18ºC till -35 ºC
-60ºC till -85ºC
Flytande kväve/-140º
Vård
biobank
24
3
23
40
8
Forsknings
biobank
2
1
12
22
7
6
Version 2012-05-22
Tabell 15: Förvaringstemperatur i biobankerna/verksamhetsområde/huvudman
(Flera val möjliga per biobank)
Region
Landsting
Verksamhetsområde
Norra
Jämtland
Norrbotten
Västerbotten
Kombination
Annan
Pat/cyt
Forskning
Pat/cyt
Klinisk kemi
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Forskning
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Pat/cyt
Mikrobiologi
Transplantation
Annan
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Annan (2)
Pat/cyt
Mikrobiologi
Forskning
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Pat/cyt
Klinisk kemi
Immunologi
Transfusion
Gyn/obs
Forskning
Pat/cyt
Transplantation
Annan
Forskning (4)
Pat/cyt
Mikrobiologi
Forskning (2)
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk genetik
Immunologi
Gyn/Obs
Forskning (5)
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Transfusion
Gyn/Obs
Forskning (7)
Annan (5)
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Pat/cyt
Klinisk kemi
Transplantation
Västernorrland
UÖ
Dalarna
Gävleborg
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västmanland
Örebro
Stockholm
SydÖstra
Stockholm
Jönköping
Östergötland
VG
Södra
Västra Götaland
Blekinge
Kronoberg
Rums
temp
+4 till
+8ºC
-18 till
-35ºC
1
1
1
1
1
1
1
-60 till
-85ºC
Flytandekväve
/
-140ºC
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
1
1
1
1
1
1
1
3
1
1
4
1
3
1
1
1
1
1
2
1
1
1
5
1
1
1
1
1
4
1
1
1
3
1
1
1
4
3
1
1
1
1
1
1
1
1
1
7
Version 2012-05-22
Region Skåne
Pat/cyt
Mikrobiologi
Klinisk kemi
Klinisk genetik
Tarnsfusion
Transplantation
Forskning (9)
Annan (3)
1
1
1
1
1
1
1
6
2
1
5
3
1
1
5. Information om provsamlingar för vård
Blid 2: Fördelning av provtyp i provsamlingar för vård. Avser prov och alikvoter, ej enbart
moderprov
Serum
2 200 000
Blod/Plasma
4 530 000
DNA/RNA
69 000
Celler
31 100 000
Övrigt
166 000
Vävnad
116 150 000
Benmärg
110 000
*3 700 000 av 4 530 000 prov i kategorin blod/plasma är prov från PKU-biobanken
**Likvor, urin, äggceller, spermier, embryon, feaces
Region Skånes biobank har enbart information om prov sparade från 1992 inom patologi och från 2009 inom cytologi.
Två patologibiobanker har ej delat upp antalet glas i biobanken på vävnad respektive cytologi. I dessa två fall har
beräkningen med antagandet att 1/5 av glasen är celler och att resten är vävnad.
Tabell 16: Antal prov/provtyp i provsamlingar för vård
Typ av prov
Vävnad
Cytologiprov/celler
Serum
Blod/Plasma*
Benmärg
DNA/RNA
Övrigt**
Summa:
Antal
117 150 000
31 100 000
2 200 000
4 530 000
110 000
69 000
166 000
154 325 000
*Av dessa är 3 700 000 PKU-prov
** Likvor, urin, äggceller, spermier, embryon, feaces
8
Version 2012-05-22
6. Information om provsamlingar insamlade för forskning
Figur 3: Fördelning av provtyp i provsamlingar insamlade för forskning.
Provsamlingar för forskning finns sparade i forskningsbiobanker, men även i vårdbiobanker.
Uttag av prov för forskning från provsamlingar tagna för vård och behandling finns redovisade här.
Serum
2 338 000
Urin
230 000
DNA/RNA
572 000
Övrigt*
47 000
Vävnad
51 000
Saliv
112 000
Blod/Plasma
4 222 000
*benmärg, bröstmjölk, celler, dialysat,
embryon, faeces, hår, sputum, tänder
Tabell 17: Antal prov per provtyp i provsamlingar för forskning
Typ av prov
Antal
Blod/Plasma
4 222 000
Serum
2 338 000
RNA/ DNA
572 000
Urin
230 000
Saliv
112 000
Vävnad
51 000
Övrigt*
47 000
Summa
7 572 000
* benmärg, bröstmjölk, celler, dialysat, embryon, faeces, hår, sputum, tänder
Tabell 18: Lagras information om forskningsprovsamlingar integrerat med
Sjukvårdsinformation
Ja, helt eller delvis
Nej
Saknas
Summa
Vård
biobank
21
15
32
68
Forsknings
biobank
3
24
4
31
9
Version 2012-05-22
7. Service för biobankning för forskning
Tabell 19: Följande service erbjuds för forskning
X = Rutinen finns hos minst en biobank hos huvudmannen
blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Rådgivning:
skapande av
ny
provsamling
Rådgivning:
Design av
etikansökan, specifika
utformning av remisser
forskningspersoninformation
Design och
tryckning av
etiketter
Kallelse av
studiedeltagare
Registrering
av samtycke
Annat t.ex.
biobanksansökan,
studiedesign,
lagring mm
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – vård mm
2
1
1
1
1
3
1
3
2
3
2
2
2
1
1
1
1
2
3
2
2
19
11
1
2
3
2
1
1
1
2
1
3
1
1
2
1
8
2
2
1
1
3
1
1
1
2
1
1
8
2
1
2
1
4
1
1
18
4
2
7
Biobanker för
forskning mm
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – Forsk
mm
1
2
1
1
1
1
1
1
1
4
7
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
3
14
1
1
2
9
1
1
1
3
2
8
2
Tabell 20: Service vid biobankerna vård respektive forskning
Rådgivning vid skapande av ny provsamling (logistik, provtyper etc.)
Rådgivning vid etikansökningar och utformning av patientinformation
Design av specifika remisser?
Design och tryckning av etiketter?
Kallelse av studiedeltagare
Registrering av samtycke
Annat: Biobanksansökan, studiedesign, lagring mm
Vård
19
11
8
8
4
17
7
Ja
Nej, men vi skulle
önska
Forskning
14
9
4
7
3
8
2
Vård
5
3
6
3
2
3
1
Forskning
2
3
7
5
2
2
0
10
Version 2012-05-22
Tabell 21: Prislista service för forskning
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Ja, enligt fast
prislista
Ja, enligt
överenskommelse
Ja, för viss
service
Nej, men
önskar/planerar
Nej
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
2
2
1
1
1
1
1
2
1
4
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
3
1
19
11
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
1
1
Antal – Forsk mm
3
Antal – vård mm
4
2
1
2
1
1
2
1
1
1
4
2
6
3
2
3
21
2
2
8
1
Biobanker för
forskning mm
1
1
1
1
6
1
2
1
1
4
4
21
11
Version 2012-05-22
8. Klinisk kemi/motsvarande - om blod och andra flytande
provtyper
Tabell 22: Vilken provhantering/provberedning erbjuds forskare när det gäller
blod och andra flytande provtyper?
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Provregistrering
Centrifugering
Alikvotering
1
DNA/RNA
extraktion
Annan
2
Hantering
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – vård mm
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
21
3
3
4
1
1
1
1
1
11
1
1
1
2
1
1
16
1
1
2
11
1
17
1
2
5
5
1
1
1
1
2
1
1
3
2
1
1
1
1
2
1
11
1
1
1
1
1
2
8
1
2
9
1
2
9
1
1
8
1
1
1
12
1
1
1
1
1
1
1
Biobanker för
forskning mm
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – Forsk mm
1
3
1. Automatiserad alikvotering: 1 biobank vardera hos Kronoberg, Uppsala, Örebro och hos KI biobank erbjuder
automatiserad alikviotering. Övrig alikvotering är manuell.
2. Kan vara urinmätning, frysförvaring, ackrediteringsbevis, referensintervall, packning av prov för transport, buffy coat/
ficoll-lymfoprep, Preparering av vita blodkroppar från helblod eller benmärg, övrigt enligt överenskommelse
12
Version 2012-05-22
Tabell 23: Begränsningar i hantering angående provtyp eller mängd – blod och
andra flytande provtyper
Forsknings
biobank
Vård
biobank
Ja
13
4
Nej
7
5
Om ja…..





Manuellt arbete
Begränsade resurser
Kan ej utföra vissa analyser storskaligt
Svårt att hantera forskningsprov jourtid
Personalbrist
Tabell 24: Rutiner för lagring och uttag – blod och andra flytande
provtyper/huvudman.
X = Rutinen finns i minst en biobank hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Lagring erbjuds i
biobankens frys
Vård
Forskning
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal
Plats för egen frys
Rutiner finns för uttag
Vård
Vård
Forskning
Forskning
1
1
1
1
1
1
1
1
4
1
1
1
2
2
4
1
4
2
1
1
1
1
1
1
2
1
1
14
1
1
1
2
9
1
1
1
3
5
1
1
2
15
1
3
13
13
Version 2012-05-22
Tabell 25: Lagringstemperaturer som erbjuds för forskning av blod och andra
flytande prov per huvudman
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Rums temp
-18 till -35ºC
-60 till -85ºC
Flytandekväve /
-140ºC
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – vård mm
1
1
2
2
2
3
1
1
1
1
1
1
1
1
9
1
1
2
1
1
12
1
1
Biobanker för
forskning mm
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – Forsk mm
1
1
1
3
1
1
2
2
1
1
1
1
1
1
1
2
9
1
2
10
1
1
5
* Övrigt : Örebro, +4 till +8ºC
14
Version 2012-05-22
9. Patologi – frågor om vävnad och andra fasta provtyper
Tabell 26: Vilken provhantering/provberedning erbjuds forskare, när det gäller
vävnad och andra fasta provtyper?
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Provregistrering
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – vård
mm
Biobanker för
forskning mm
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – Forsk
mm
1
1
Infrysning
1
Snittning
TMAtillverkning
1
1
1
1
1
1
1
1
2
1
2
1
1
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
10
12
1
1
1
1
1
1
14
DNA/RNA
extraktion
Histologiska/ Molekylärimmunohist genetisk
analys
okemiska
färgningar
1
1
1
1
1
1
1
1
5
2
1
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
14
1
3
1
1
1
2
1
1
1
2
1
0
1
1
1
2
1
1
1. Infrysningsmetod
- Stockholm
- Uppsala 1
- Uppsala 2
- Västerbotten
- Västernorrland
- Västmanland
- Västra Götaland
- Örebro
- Örebro - forskning
- 80ºC
Kontrollerad nedfrysning, i samarbete, inte som service
- 80ºC och kväve
Gasol kyld i flytande kväve
- 80ºC eller enligt önskemål
- 80ºCl
- 70ºC
Kolsyreis/isopentan, -80ºC frys
Snabbinfrysning i köldblandning
15
Version 2012-05-22
Tabell 27: Begränsningar i hantering angående provtyp eller mängd – vävnad och
andra fasta provtyper
Vård
biobank
Forsknings
biobank
Ja
9
0
Nej
6
3
Om ja…..






Personalbrist, resursfråga
Begränsningar vid stora mängder
Prov måste finnas kvar för patientens vård
Klossar lämnas ej alltid ut
Begränsat antal stansningar för TMA-tillverkning
Bedöms från fall till fall
Tabell 28: Rutiner för lagring och uttag – vävnad och andra fasta
provtyper/huvudman.
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Lagring erbjuds i
biobankens frys
Vård
Forskning
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal
Plats för egen frys
Rutiner finns för uttag
Vård
Vård
Forskning
1
1
1
Forskning
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
2
2
1
1
3
2
1
1
1
1
2
1
1
16
1
1
5
1
2
1
1
1
1
2
1
1
12
2
2
2
2
11
16
Version 2012-05-22
Tabell 29: Lagringstemperaturer som erbjuds för forskning av vävnad och andra
fasta provtyper per huvudman
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Rums temp
-18 till -35ºC
-60 till -85ºC
Flytandekväve /
-140ºC
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – vård mm
1
1
1
1
1
1
1
2
1
1
1
1
1
1
1
10
3
1
1
2
1
1
1
1
1
7
1
1
Biobanker för
forskning mm
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – Forsk mm
1
1
1
1
4
1
10. Planerad utveckling av biobanken
Tabell 30: Planerat förändringsarbete 2011-2012 och vad finns det vinster att
samarbeta kring
Ja, angående
Organisation
LIS-system/datasystem
Lokaler
Lagring
Rutiner
Provhantering
Annan
Vård
10
19
13
17
15
12
3
Forsk
7
6
7
6
4
1
Vinster av
samarbete
Ja/Nej
Ja/Nej
Ja/Nej
Ja/Nej
Ja/Nej
Ja/Nej
Ja/Nej
Vård
5/1
19/4
5/7
13/5
13/4
14/5
4/2
%
83/17
83/17
42/58
72/27
76/24
74/26
67/33
Forsk
0/2
6/3
3/6
5/5
5/3
4/3
1/3
%
0/100
67/33
33/67
50/50
63/37
57/43
25/75
17
Version 2012-05-22
Tabell 39: Planerat förändringsarbete 2011-2012 per huvudman
Siffra = Rutinen finns hos minst detta antal biobanker hos huvudmannen
Blank = Rutinen finns ej eller svar saknas
Organisation LIS /
datasystem
Biobanker för
sjukvård mm
Blekinge
Dalarna
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Stockholm
Södermanland
Uppsala
Värmland
Västerbotten
Västernorrland
Västmanland
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – vård
mm
Biobanker för
forskning mm
Dalarna
Jönköping
Region Skåne
Stockholm
KI biobank
Värmland
Västerbotten
Västra Götaland
Örebro
Östergötland
Antal – Forsk
mm
Lokaler
Lagring
Rutiner
Provhantering
3
2
4
1
4
2
1
1
1
1
1
1
3
1
2 (SBR)
1 (SBR)
4
5
2
4
1
1
1
1
1
3
2
10
2
2
3
19
1
5
1
13
1
1
4
3
17
1
1
5
1
15
1
12
1 (SBR)
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
2
1
2
1
1
1
1
1
1
1
1
6
7
1
1
6
1
4
1
1
0
1
7
18
Version 2012-05-22
Medverkande biobanker:
Medverkande biobanker:
Landsting
Blekinge
Blekinge
Blekinge
Dalarna
Dalarna
Dalarna
Dalarna
Gävleborg
Gävleborg
Gävleborg
Jämtland
Jönköping
Jönköping
Jönköping
Jönköping
Kronoberg
Kronoberg
Kronoberg
Norrbotten
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
Region Skåne
KI
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Stockholm
Södermanland
Biobank nr
462BD49
462BD49
462BD49
874
874
874
873
534
536
353
398
868
868
510
868
340BD28
340BD45
340BD5
3
136BD11
136BD1
136BD33
136BD41
136DB44
136SC967
136BD31
136BD9
136BD10
136BD47
136
136BD22
136BD40
136BD17
136BD50
136BD35
136BD3
136BD34
222
406
366
406
628
589
407
514
406
237
475
Namn
Avdelning för patologi och cytologi
Avdelningen för klinisk mikrobiologi
Provsamling klinisk kemi
Biobank för diagnostiska prover
Mikrobiologi
Klinisk kemi och Transfusionsmedicin
Biobank för klinisk forskning och kliniska prövningar
Laboratoriemedicin, Patologi/cytologi
Laboratoriemedicin, Bakteriologi/virologi
Laboratoriemedicin, Klinisk kemi
Jll´s Biobank
Laboratioriemedicinsk kobinationsbank
Laboratoriemedicinsk kombinationsbank/Serologien
Odontologiska Institutionen
Laboratoriemedicinsk kombinationsbank
Klinisk patologi och cytologi
Klinisk kemi och Transfusionsmedicin
Ortopedkirurgen CLV
ÖNH-mottagningen
BD 11, BD 24, BD 43
Region Skånes biobank, klinisk mikrobiologi
BD 33,Klinisk kemi
Biobanksavdelning Klinisk immunologi och transfusionmedicin (KIT),
Vävnadsbanken i Lund (SC967 regionalt biobankscentrum)
BD31
Klinisk forskning BMC
Kirurgiska klinikens forskningsavdelning SUS Malmö ing.72
VO biobank
Transglutaminasregistret vid medicinska kliniken, gastroenheten, MAS
Capio Citykliniken
BD 40
Vuxenpsykiatri Lund
Enheten för osteoporosforskning
Diabetes och endokrinologi BD 35
Infektionskliniken Lund
BIKEMA
KI Biobank
Karolinska universitetssjukhuset
Biobank Sankt Eriiks ögonsjukhus
Karolinska universitetssjukhuset
Tobias registret
SLSO Biobank
Södersjukhusets biobank
Danderyds sjukhus AB:s biobank
Karolinska universitetssjukhuset
PKU-biobanken
Patolog avd Eskilstuna
19
Version 2012-05-22
Södermanland
Södermanland
Södermanland
Uppsala
Uppsala
Uppsala
Uppsala
Uppsala
Värmland
Värmland
Värmland
Västerbotten
Västerbotten
Västernorrland
Västernorrland
Västmanland
Västmanland
Västmanland
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
VG
872
872
872
827
827
827
827
827
35
36
39
472
472
437
438
554
84
442
226
309
302
355
448
133
764
830
361
672
172
376
342
VG
VG
VG
VG
Örebro
Örebro
Örebro
Örebro
Örebro
Örebro
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
Östergötland
563
559
248
313
454
454
454
454
454
458
413
647
413
417
185
421
499
416
516
697
Klinisk kemi/mikrobiologi
Infektionsmottagningen Mälar sjukhuset Eskilstuna
Landstinget Sörmlandsbiobank/ Avd. Ortopeden MSE/KSK
Klinisk patologi och cytologi
Uppsala Biobank
KKF virituella BB
Reproduktionscentrum
Uppsala Biobank
Klinisk patologi, Karlstad
Klinisk mikrobiologi Centralsjukhuset, Karlstad
Onk klin
Biobanken VL/Klinisk patologi
Biobanken VL/medicinska biobanken
Biobank vid avdelningen för patologi och cytologi
Biobank Laboratoriemedicin Västernorrland
Klinsk Patologi
Klinisk mikrobiologi Centralsjukhuset, Karlstad
Klinisk kemi och Transfusionsmedicin
Patologkliniken NU-sjukvården Trollhättan
Bakteriologiska laboratoriet
Biobank för klinisk kemi
Transfusionsmedicin SU
Gynekologi och Reproduktionsmedicin
institutet för Stressmedicin
VC Nygård
Folktandvårdens biobank
Ögonforskning
Ortopedi
Thoraxkirurgi
Njurmedicin SU/S
Neuropsykiatri Sahlgrenska Universitetssjukhuset
Biobank Gastrikirurgisk forskning och utbildning, verksamhetsområde
kirurgi
Biobank Laboratoriemedicin NU-sjukvården
klinisk laboratoriemedicin
klinisk laboratoriemedicin
klinisk laboratoriemedicin
klinisk laboratoriemedicin
klinisk laboratoriemedicin
Klinskt forskningscetrum
Klinisk Patologi och Klinisk genetik
Klinisk mikrobiologi
Klinisk Patologi och Klinisk genetik
Klinisk immunologi och transfusionsmedicin
Kvinnokliniken i Österögtland/avd. för obstetrik och gynekologi
Anestesi och operationscenterum i Östergötland
Njurmedicin SU/S
Öronkliniken
Baran och ungdomssjukhuset
Biobank Närsjukvården i västra sjukvårdsdistriktet
20