Transcript Morphologie et identification des poissons dans FishBase

© Thad Zajdowicz
Morphologie et identification
des poissons dans
FishBase
Musée Royal de l’Afrique Centrale (MRAC Tervuren)
Formation “FishBase et la Taxinomie des Poissons”
Session 2014
1
1. Morphométrie et méristiques
© www.taclatch.com
• les caractéristiques les plus importantes pour la description et
l’identification des poissons:
1. caractéristiques morphométriques: réfèrent à des variables
continues
From Musschoot&Laleye 2008
Musée Royal de l’Afrique Centrale (MRAC Tervuren)
From Boden et al. 2004
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2
1. Morphométrie et méristiques
© Rajesh Dangi
• les caractéristiques les plus importantes pour la description et
l’identification des poissons:
2. caractéristiques méristiques: réfèrent à des variables
discontinues
© G. Pavlineris (modified)
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1. Morphométrie et méristiques
Quelques méristiques fréquemment utilisés: Écailles
A. Écailles longitudinales
B. Écailles laterales
C. Écailles transversales
supérieures
© Rajesh Dangi
© J. Snoeks (2004)
D. Écailles transversales
inférieures
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E. Écailles entre la
nageoire pectorale et la
nageoire pelvienne
Mais aussi: nombre d’écailles
prédorsales, autour du
pédoncule caudale,…
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1. Morphométrie et méristiques
Quelques méristiques fréquemment utilisés: Branchiospines
Arche branchiale - filaments - branchiospines
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© M.J. Guinan
© Rajesh Dangi
Ceratobranchiale
© www.meer.org
Epibranchiale
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1. Morphométrie et méristiques
© Rajesh Dangi
© P. Skelton (1993)
© Silas Alben
Arius proops © D. Blundell
Quelques méristiques fréquemment utilisés: Nageoires
Epine(s), “spinelet”, rayon(s)
(branchus ou non),…
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1. Morphométrie et méristiques
Nombre de vertèbres
(pré)caudales, préanales,
prédorsales, structure de
l’appareil de Weber,…
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© P. Skelton (1993)
© Rajesh Dangi
© www.palaeos.com
Quelques méristiques fréquemment utilisés: Vertèbres
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1. Morphométrie et méristiques
Hydrocynus sp.
© www.meer.org
Quelques méristiques fréquemment utilisés: Dents
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Dents prémaxillaires, vomériennes et palatines chez
Chrysichthys sp. © MRAC
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1. Morphométrie et méristiques
© The State of Queensland
(Department of Primary Industries
and Fisheries) 1995 - 2007
Cynotilapia afra © Zietto
• les caractéristiques les plus importantes pour la description et
l’identification des poissons:
3. caractéristiques descriptives: réfèrent à des variables
distinguables
Position relative des nageoires,
longueur relative des barbillons,…
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2. La table MORPHOMÉTRIE dans FishBase
Basé sur les mensurations des images dans FishBase
Les données morphométriques publiées dans des journaux sont
dans la table MORPHOLOGIE, mais seulement quand ils ont une
valeur diagnostiques.
Clarias gariepinus © Uriah Yaniv
Page de
Présentation
d’Espèce
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Clarias gariepinus © Uriah Yaniv
2. La table MORPHOMÉTRIE dans FishBase
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
1
1. information sur les
différences
entre les sexes
2. caractéristiques descriptives
(inclus les caractéristiques
morphométriques si elles
sont diagnostiques)
3. caractéristiques méristiques
(ligne latérale, barbillons,
branchiospines, vertèbres)
4. nageoires
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Structure générale
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Ponte de:
© Seaworld Inc.
Oreochromis squamipinnis © Denis Tweddle
© George Burgess
Apparence/couleurs différentes:
Pseudotropheus saulosi © Gerard Delany
Oncorhinchus nerka © Peter Essick
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Haplophryne mollis © Peter David
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Structure générale
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Melanostomias bartonbeani © www.pbs.org
Dibranchus cracens © California Acad. Sc.
Farlowella sp. © koti.kapsi.fi
Remora © Havhest
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Structure générale
© www.iim.csic.es
Platy © Wes/www.practicalfishkeeping.co.uk
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Structure générale
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
A
B
D
C
E
A. Mudskipper © Wiljo Jonsson - B. Astyanax jordani © National Park
Service (NPS) U.S. Department of the Interior - C. Clupeiform adipose
eyelid © Michigan Science Art - D. Anableps anableps © Paul
Zahl/National Geographic/Getty Images - E. Flatfish © K. Telnes.
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
A
B
C
D
E
A. Lamprey © Steve Smith/ECHO - B. Blue spot
Chaetostoma © Practical Fishkeeping - C. Rubyfish,
Plagiogeneion sp. © T. Trnski/Australian Museum D. Halfbeak Hemiramphus depauperatus © J.E. Randall - E. Blue marlin,
Makaira sp. © Tony Arruza/Corbis.
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Male Oreochromis tanganicae © Arthur Tagø
Atopochilus savorgnani
© T.R. Vigliotta
Epiplatys fasciolatus fasciolatus © Anton Lamboj
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Structure générale
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Structure générale
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Structure générale
Tylochromis sp. © Mark Hanssens/MRAC
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Synodontis njassae © www.akvariefisk.net
Gadus morhua © J.C. Schou
Malapterurus electricus © N. Sloth
Blue-lined goatfish
Upeneichthys lineatus © Ian Skipworth
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Barbus cf. ablabes © Anton Lamboj
Corydoras sterbai © G.J. Reclos
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
A
E
B
D
C
A. Eagle ray © Yongala Dive - B. Grey nurse shark, Carcharias taurus © www.wallpaperfishtalk.com C. Galapagos shark, Carcharhinus galapagensis © Doug Perrine - D. Scalloped hammerhead, Sphyrna
lewini © Duiops - E. Manta ray, Manta birostris © www.yunphoto.net
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
© M.J. Guinan
Oreochromis macrochir from Maar et al. 1966
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© www.meer.org
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Chromis abyssus © Richard L. Pyle & Brian D. Greene
© www.xrayprocessing.com
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
From Skelton (1993)
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
A
B
C
D
E
F
G
A. Stonogobiops yashia © Underground Art Studio - B. Mastacembelus armatus © Balaram Mahalder - C. Oarfish, possibly
Trachypterus © Orkney Marine Life Aquarium - D. Melanocetus johnsonii © E.A. Widder - E. Nematalosa nasus © J.E.
Randall - F. Remora © lprynne - G. Leatherjacket spine © J. King/Australian Museum
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Merluccius merluccius © www.superfumy.com
Structure générale
Bluefin tuna © Census of Marine Life
© M.H. Sabaj
Leuciscus cephalus © Tino Strauss
Musée Royal de l’Afrique Centrale (MRAC Tervuren)
Bagrus docmac
© A. Tinkoudgou Kabre /
P. Clovis Nitiema
Phenacogrammus
interruptus © Fabio Ghidin
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Porbeagle shark © Canadian
Shark Research Lab
Swordtail
© Tony Terceira
Hemiancistrus pankimpuju © Nathan Lujan
Musée Royal de l’Afrique Centrale (MRAC Tervuren)
Phenacogrammus
interruptus © Fabio Ghidin
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Apistogramma cacatuoides © Montana Exotic
Tropicals
Alectis ciliaris © blogs.yahoo.co.jp/
tak755/folder/674985.html
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Juvenile batfish © Jaroslaws
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Polynemus multifilis
© www.aquadesignz.com
Eagle ray © Yongala Dive
Periophthalmus modestus © Marli Tanabe
Flying gurnard © dic.academic.ru
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Synodontis kogonensis
© T. Musschoot/MRAC
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3. La table MORPHOLOGIE dans FishBase
Structure générale
Atopochilus
savorgnani
© T.R. Vigliotta
Gadus morhua © J.C. Schou
Bregmaceros mcclellandi © Gloerfelt-Tarp
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4. L’identification des poissons
• Taxinomie: la science qui essaie de dénommer correctement les
espèces
© Waterworldsports
• souvent confondue avec l’identification des poissons qui réfère à
l’utilisation des révisions les plus récentes pour identifier un poisson.
• FishBase offre 2 méthodes pour l’identification d’un poisson:
- L’identification rapide des espèces (=Quick Identification
Routine)
- L’identification à base de la morphométrie
- Les clés d’identification
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4. L’identification des poissons
L’identification rapide des espèces (=Quick Identification Routine)
• S’il n’y a pas de données du poisson à identifier, on peut utiliser des
pictogrammes pour une comparison visuelle rapide; FishBase fournit
aussi une explication compréhensible des différents groupes.
• Une fois qu’on a déterminé la famille du poisson inconnu, une liste
des poissons assortis est générée (avec image, si disponible).
• L’identification ultérieure se fait en utilisant les images et les
descriptions des espèces.
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4. L’identification des poissons
L’identification rapide des espèces en ligne
Page de
Recherche
Quelques données concernant le spécimen
inconnu peuvent être fournies (région FAO, pays,
nombre de rayons de la nageoire dorsale et anale)
pour limiter les résultats.
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4. L’identification des poissons
L’identification rapide des espèces en ligne
la formule des
nageoires (basé sur
Smith et Heemstra,
1986): nombre des
rayons des
nageoires dorsales
et anale
relativement stable
et facile à obtenir;
information dans la
table
MORPHOLOGIE.
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4. L’identification des poissons
L’identification rapide des espèces en ligne
Résultat: liste avec les espèces
assorties, avec image, au niveau
de la famille.
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4. L’identification des poissons
L’identification à base de la morphométrie
- Système d’identification
nouveau/expérimentale
- Entrées comparées aux
données morphométriques
obtenu des images dans
FishBase
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4. L’identification des poissons
L’identification à base de la morphométrie
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4. L’identification des poissons
Les clés d’identification
• version digitale des clés publiées
• clés assorties par région FAO, ordre, famille, pays ou écosystème
• actuellement FishBase contient 1666 clés au total, y inclus plus que
300 pour les poissons d’eaux douces de l’Afrique.
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4. L’identification des poissons
Les clés d’identification
Page de
Recherche
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4. L’identification des poissons
Les clés d’identification
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4. L’identification des poissons
Les clés d’identification
Identification des oeufs et des larves:
www.larvalbase.org
Aussi disponible dans FishBase
Larves d’un Scorpaenidae et de Neoepinnula americana © Cedric Guigand
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4. L’identification des poissons
Les clés d’identification
Les clés pour l’identification des
larves sont également présentes
dans FishBase.
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