Transcript スライド 1

人獣共通感染 E型肝炎ウイルス (HEV)検出システム
２００８年１２月の段階で、DNA data bankに登録されているE型肝炎ウイルス
のORF2遺伝子全てを解析し、HEVのウイルス遺伝子をRealtimeRT-PCRで
特異的に検出できるprimer set (HEV Universal RealtimeRT-PCR primer)、
Genotype 3およびGenotype 4 を特異的に検出できるprimer set (HEV
Genotype3/4 detection primer)を考案、設計しました。
Avian
AvianHEV
3c
E116-YKH98C
swX07-E1
swMN06-C1056
Osh205
Genotype3
HE-JA04-1911
swJ12-4
swJ8-5
swMN06-A1288
E088-STM04C
Arkell
HE-JA10
JMY-Haw
JKN-Sap
HEV-US1
HEV-US2
3b
HEV検出システム
swMeng
pSHEV-3
wbJYG1
pSHEV-2
pSHEV-1
swJ570
E097-OSA05C
JRA1
JBOAR1-Hyo04
JMO-Hyo03L
JJT-Kan
JSO-Hyo03L
JDEER-Hyo03L
JTH-Hyo03L
JYO-Hyo03L
swDQ
swGX40
HEVN2
JYI-ChiSai01C
Ch-S-1
3a
HEVN1
wbJSG1
wbJTS1
JE03-1760F
p5B
JE03-1760F
p13-3
JMNG-Oki02C
p5
JE03-1760F
JE03-1760F
JE03-1760F
114-A549
p10JE03-1760F
p0
wt
118d-Alex
JKO-ChiSai98C
swGX32
T1
HEV Universal RealtimeRT-PCR primer set
↓
HEV Genotype3/4 detection primer set
Mex-14
swCH25
IND-SW-00-01
I1
Genotype2
swCH31
C4
E067-SIJ05C
C1
SAR-55
SH-SW-zs1
pSK-HEV-2
P1
C5
C3
E087-SAP04C
CCC220
HE-JA28
HE-JA36
HE-JA41
HE-JA37
HE-JA19 HE-JF4
JSW-Sap95
JKK-Sap
JTS-Sap02
JYW-Sap02
HE-JF5
HE-JA2
JAK-Sai
HE-JF3
HE-JI4
HE-JA1
swJ13-1
JSN-Sap-FH02C
JSN-Sap-FH
JYN-Sap01C
JSF-Tot03C
JYN-Nii02L HE-JK4
Morocco
Genotype4
HPESVP
B1I3
I4
P2
India
TK15-92l
T3
Genotype1
0.1 substitutions/site
HEV遺伝子ORF2塩基配列による分子系統樹
（Genoype1~4が明確に分離できます）
0.1
左図の、発現しているHEV遺伝子を全て
検出でき、さらにGenotype3および
Genotype4の遺伝子を特異的に検出･同
定できます。