Transcript Gene Handout - Botany @ Chula

Gene expression and signal transduction
(4 hr)
- Basic of plant gene expression
- Fundamental of plant signal transduction
- Phytochrome and blue-light responses in plants
http://5e.plantphys.net/
Gene expression คืออะไร
genes
gene
expression
“DNA sequence that
encode protein & RNA”
“turning gene on”
อะไรบ้ างที่มีผลให้ ยีนแสดงออก
turning “flowering genes” on
turning “heat shock protein genes” on
turning “growth & development genes” on
ภาวะปกติ
Growth & development
ภาวะผิดปกติ
Environmental change
รู ปแบบการแสดงออกของยีน
Constitutive expression
มีการแสดงออกอย่ างถาวรและเหมือนกันทุกเซลล์
(ได้ แก่ housekeeping genes)
Regulated expression
มีการแสดงออกเมื่อได้ รับสัญญาณกระตุ้น
(internal / external signals)
พืชมีระบบรับรู้ปัจจัยสิ่งแวดล้ อม
การรับสัญญาณ
(signal perception)
การถ่ ายทอดสัญญาณ
(signal transduction)
การตอบสนองต่ างๆ
(gene expression, responses)
“chemical communication”
การตอบสนองต่อสัญญาณจะเกิดขึ ้นรูปแบบใดนัน้ ขึ ้นกับ
ระดับ (dose, level)
เวลา
ประสบการณ์
ตัวอย่ าง:
Temperature-dependent extracellular pH change of cells
threshold
level of stress sensed by plant cells
physiological
: 25°C
non-physiological
: >45°C
(Chaidee and Pfeiffer 2006)
signal
receptor
signal
transduction
responses
Sung et al. 2003
Basic of plant gene expression
1. Transcription: การสังเคราะห์ mRNA (transcript)
2. Translation: การสังเคราะห์ โปรตีน
Gene expression in eukaryotes
Gene expression in eukaryotes
รู ป 14.4 Gene expression in eukaryotes
1. อ่ านคาอธิบายภาพและเขียนอธิบายด้ วยภาษาตัวเอง
2. ข้ อดีของการเติม poly-A tail มีอะไรบ้ าง
Transcription factors
DNA-binding motifs
การควบคุม
gene expression
การควบคุมที่ขัน้ transcription
เพื่อให้ ได้ mRNA ที่ถกู ต้ อง
1. mRNA processing เพื่อให้ ส่งออกไปที่ไซโทพลาซึมได้
[5′ capping, addition of poly-A tail, excision of introns,
splicing together of exons]
2. Posttranscriptional regulation
[mRNA degradation (turnover)]
3. Binding to cis-acting regulatory sequences
[transcription factor]
การควบคุมขัน้ posttranscription
ควบคุมปริมาณ mRNA และ translatability
mRNA turnover rate
mRNA folding
codon usage
cellular location