Transcript 生物統計学11のパワポ

生物統計学・第12回
エクセルを使いこなす
ワークシート操作、ワークシート関数、マクロ、VBA
2013年12月25日
生命環境科学域 応用生命科学類
尾形 善之
本日の予定
★ノートパソコン組
♦ 実習
★スクリーン組
♦ 実演
本日の内容
★座学
♦ チェックポイントがあります
★ノートパソコン組
♦ 予め課題を見せるので、挑戦してください
♦ 何かあればTAに尋ねてください
★スクリーン組
♦ これまでの統計解析のうち、エクセルで実行でき
るものを実演します
♦ 最後に課題を出します
外れ値
★グラブスの検定
♦ 目的
• データセット中でひとつだけ離れた値を外す
• 纏めて省くとき
– クラスタリング、主成分分析
♦ 手順
• 離れていると予想される値の𝑍値を計算
• グラブスの表で𝑝値を得る
グラブスの検定
A
B
1
35
31
2
26
27
3
41
8
平均
34
22
SD
6
10
長さ
60
42
26 − 34
= 1.333
6
8 − 22
= 1.400
10
どちらも1%の危険率で有意に外れる
実験数
5%
1%
3
1.153
1.155
チェックポイント・I
1. データセットからひとつだけ外れたデー
タを外す手順は？
2. データセットからふたつ以上の外れた
データを外す方法は？
2種類のエラーの話
声
が
大
き
い
ウ
ェ 教
ッ
ト 授
リ
ー
ダ
ー
シ
ッ
プ
犬 ア
声
嫌 ロ
ハ が
い
か
四
十
代
か
ず
さ
Ｄ
Ｎ
Ａ
研
究
所
馬
好
き
教
員
植
物
コ
ン
ピ
ュ
ー
タ
微
生
物
バ
イ
オ
イ
ン
フ
ォ
マ
テ
ィ
ク
ス
Ｓ
Ｎ
ジ 生 Ｓ
ブ 物 嫌
リ 統 い
好 計
き 学
…
な
り
大
き
い
…
…
視
力 若
さ
酒
に
ト 呑
マ ま
ト れ
る
眼
鏡
青木先生が王様だったら…
正解！
偽陽性 False Positive
偽陰性 False Negative
5
5
=
9 + 5 14
5
5
=
7 + 5 12
Recall
Precision
私が王様だったら…
正解！
偽陽性 False Positive
偽陰性 False Negative
5
5
=
9 + 5 14
5
5
=
7 + 5 12
Precision
Recall
2種類のエラー
★PrecisionとRecallは対になっている
★王様（理論値）がいる場合
♦ PrecisionとRecallは意味がある
★王様（理論値）がいない場合
♦ PrecisionとRecallは向きによって異なる
♦ ふたつの指標を合わせると相関指標になる
♦ F-measure（ふたつの指標の調和平均）
5
5
=
9 + 5 14
5
5
=
7 + 5 12
5+5
10
5
𝐹=
=
=
14 + 12 26 13
生物統計学と2種類のエラー
★ある病気の検査方法の信頼度は？
実際に
陽性
実際に
陰性
検査で
陽性
検査で
陰性
True Positive
False Negative
8
0
False Positive
True Negative
12
80
20
80
8
𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛 =
= 40%
20
8
𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙 = = 100%
8
8
92
生物統計学と2種類のエラー
偽陽性
偽陰性
検査で陽性
検査で陰性
精密検査で陰性
実は陽性
ほっとひと息
これは困る
情報学と2種類のエラー
★あるブラウザの検出の信頼度は？
目的の
ページ
関係ない
ページ
ブラウザで
ヒット
ブラウザで
ノーヒット
8
0
8
992
999,000
999,992
1000
999,000
8
𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛 =
= 0.8%
1000
8
𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙 = = 100%
8
情報学と2種類のエラー
★あるブラウザの検出の信頼度は？
目的の
ページ
関係ない
ページ
ブラウザで
ヒット
ブラウザで
ノーヒット
3
5
8
7
999,985
999,992
10
999,990
3
𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛 =
= 30%
10
3
𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙 = = 37.5%
8
2種類のエラーの纏め
★偽陽性 False Positive
♦ 検査で陽性だが実際は陰性
• 「第一種の過誤（誤り）」「あわてんぼうのエラー」
★偽陰性 False Negative
♦ 検査で陰性だが実際は陽性
• 「第二種の過誤（誤り）」「うっかりもののエラー」
★意識しないとどちらかのエラーを忘れがち
チェックポイント・II
3. 偽陽性とは？
4. 偽陰性とは？
今日の自習のポイント
★今日は特にありません！
アンケート・III
★次回からは解析環境の話です
5. いま学校や自宅でエクセルが使える
環境かどうか教えてください。
6. この講義にノートパソコンを持ってこら
れるかどうか教えてください。
本日の課題
★下の検査結果について以下の問いに答えなさ
い。
♦ PrecisionとRecallを計算し、この検査方法の信頼度について
考察しなさい。検査で陽性
検査で陰性
実際に
陽性
True Positive
False Negative
7
1
実際に
陰性
False Positive
True Negative
3
89
10
90
8
92