Transcript No Slide Title

TRANSKRIPCIJA
RNK nukleotidi
RNK polimeraza
3’
pravac transkripcije
sintetisana RNK
matrični
lanac DNK
rastući RNK lanac
RNK
polimeraza
formiranje
fosfodiestarske
veze
ribonukleozid trifosfat
5’-3’ pravac
polimerizacije
matrični lanac DNK
PROKARIOTSKI G E N
DNK
5’
promotor RNK kodirajuća sekvenca
3’
terminator
nematrični lanac
3’
5’
matrični lanac
mesto otpočinjanja
transkripcije
mesto završetka
transkripcije
OSNOVNE FAZE TRANSKRIPCIJE
1. Prepoznavanje promotora
PROMOTOR
5’
3’
3’
5’
RNK polimeraza
2. I n i c i j a c i j a
5’
3’
3’
5’
DNK matrica
RNK transkript
3. E l o n g a c i j a
5’
3’
3’
5’
4. Terminacija
5’
3’
5’
3’
RNK transkript
STARTNI SIGNAL
DNK
start
matrični DNK lanac
transkripcija
RNK
Inicijacija transkripcije kod prokariota
RNK polimeraza
DNK
promotor
- 35
s faktor
- 10
DNK
s
faktor
inicijalni
ribonukleotid
smer transkripcije
DNK
s faktor
oslobadjanje s faktora
RNK
DNK/RNK hibrid
segment sa
dvostrukom
simetrijom
DNK
RNK
transkript
formiranje
terminalne
petlje
EUKARIOTSKI G E N
5’
promotor
egzon 1
intron
egzon 2
DNK
intron
egzon 3
nematrični lanac
3’
5’
3’
matrični lanac
mesto otpočinjanja
transkripcije
poly (A) mesto
RNK polimeraze u eukariotskoj ćeliji
lokalizacija
produkti
RNK pol I
nukleolus
28S , 18S , 5.8S rRNK
RNK pol II
nukleus
iRNK i neke snRNK
nukleus
tRNK , 5S rRNK i neke snRNK
RNK pol III
promotor
GC
-90
CAAT
-75
DNK
II D
početak transkripcije
TATA box
- 30
RNK polimeraza II
TF IIB
+
TF IIF
II D II B II F
TATA box
TF IIE
+
TF IIH
II D II B II F
II E
II H
kompletni preinicijalni
kompleks (PIK)
PROKARIOTE
EUKARIOTE
DNK
DNK
transkripcija
transkripcija
iRNK
pre-iRNK
obrada
polipeptid
translacija
iRNK
translacija
polipeptid
metil grupa
g
u
a
n
i
n
početak iRNK
CAP
(7’ metil-guanozin)
metil grupe
baza
SINTEZA poly (A) REPA
pre-iRNK
RNK polimeraza
sinteza RNK
jedinica transkripcije
5’
egzon 1
intron
egzon 2
3’
intron egzon 3
DNK
3’
5’
promotor
transkripcija
5’
egzon 1
intron
egzon 2
egzon 1
intron
egzon 2
intron egzon 3
(Cap)
5’
pre-i RNK
obrada
egzon 1
intron
3’
hn RNK (primarni transkript)
obrada
m7GpppN1
intron egzon 3
egzon 2
intron
OH
3’
egzon 3
Cap
5’
3’
isecanje introna
egzon 1
Cap
5’
egzon 2
zrela iRNK
egzon 3
AAAAA….
poly(A) rep
AAAAA…. poly(A) rep
3’
RNK transkript (pre-iRNK)
Egzon 2
Egzon 1
protein
drugi proteini
snRNK
snRNK
splajsozom
komponente
splajsozoma
isečeni intron
iRNK
Egzon 1
Egzon 2
pre-iRNK
zasecanje na 5’
egzon-intron granici
zasecanje na 3’
egzon-intron granici
2’ - 5’
PROKARIOTSKI RIBOZOM
EUKARIOTSKI RIBOZOM
70s
80s
30s
50s
40s
60s
5S RNK
23S RNK
16S RNK
5S RNK
5,8 S RNK
18S RNK
28S RNK
34 proteina
21 protein
49 proteina
33 proteina
repetitivna jedinica ribozomske DNK
transkripciona jedinica ribozomske DNK
DNK
gen za
gen za
18S gen za 5,8S 28S
transkripcija
45S pre-rRNK
41S pre-rRNK
20S pre-rRNK
32S pre-rRNK
28S rRNK
18S rRNK
5.8S rRNK
3’
A
C
C
5’
antikodon
mesto vezivanja
aminokiseline
petlja IV
C
C
A
petlja I
petlja III
antikodon
3’ kraj za koji
se vezuje AMK
TRANSLACIJA
DNK
matrični
lanac
A
C
C
A
A
A
C
C
G
A
G
T
3’
5’
kod
TRANSKRIPCIJA
kodon
iRNK
5’
3’
U
tRNK
G
G
U
U
U
G
G
C
U
C
Trp
ACC
TRANSLACIJA
antikodon
polipeptid
Trp
Phe
Gly
Ser
A
5’
3’
II nukleotid
III nukleotid
I nukleotid
U
C
A
G
U
Phe
Phe
Leu
Leu
Ser
Ser
Ser
Ser
Tyr
Tyr
STOP
STOP
Cys
Cys
STOP
Trp
U
C
A
G
C
Leu
Leu
Leu
Leu
Pro
Pro
Pro
Pro
His
His
Gln
Gln
Arg
Arg
Arg
Arg
U
C
A
G
A
Ile
Ile
Ile
Met
Thr
Thr
Thr
Thr
Asn
Asn
Lys
Lys
Ser
Ser
Arg
Arg
U
C
A
G
G
Val
Val
Val
Val
Ala
Ala
Ala
Ala
Asp
Asp
Glu
Glu
Gly
Gly
Gly
Gly
U
C
A
G
5’
1.
3’
CUC
AGC
Leu
GUU ACC
Ser
Val
AU
Thr
5’
3’
C
2.
UCA
Ser
G C GU U A
Ala
Leu
CCA
Pro
5’
3.
CU
U
3’
CAG
Gln
CGU
Arg
UAC
Tyr
CAU
His
AMK
tRNK
AMK
antikodon
antikodonska
petlja
antikodon
kodon
iRNK
kodoni za leucin
kodoni za glicin
iRNK
I = inozin
AMK
(triptofan)
tRNKTrp
aminoaciltRNK
sintetaza
(specifična za
triptofan)
antikodon
kodon
iRNK
aminoacil-tRNK
sintetaza
aminokiselina
pirofosfat
tRNK
cAMP
aminoacil tRNK
SHINE-DALGARNO SEKVENCA
startni kodon
3’ kraj 16S rRNK
INICIJACIJA TRANSLACIJE KOD E. coli
SHINE-DALGARNO SEKVENCA
AUG
5’
iRNK
3’
f Met
inicijator tRNK
2
1
UAC
3
f Met
GTP
5’
30S
UAC
AUG
3’
3
30S inicijalni kompleks
faktori inicijacije
INICIJACIJA TRANSLACIJE KOD E. coli
50S
f Met
5’
UAC
AUG
f Met
5’
3’
UAC
AUG
P
1
2
3’
A
GDP + P
70S inicijalni kompleks
peptidna veza
ELONGACIJA KOD E. coli
f Met
Ser
UAC
AUG UCC AAG
P
+
AGG
GTP
EF
Ser
GDP
A
EF-Tu
AGG
f Met
Ser
UAC AGG
AUG UCC AAG
P
A
ELONGACIJA KOD E. coli
peptidna veza
f Met
Ser
UAC AGG
AUG UCC AAG
P
A
f Met
Ser
UAC AGG
AUG UCC AAG
P
A
ELONGACIJA KOD E. coli
f Met
Ser
EF-G
AGG
AUG UCC AAG
P
GDP + P
A
GTP
EF-G
f Met
Ser
AGG
AUG UCC AAG
P
A
INICIJACIJA
kod eukariota
Met
Met
inicijator tRNKMet
UAC
5’
AUGCUGUUU
iRNK
+
3’
UAC
AUGCUGUUU
P A
mala subjedinica
ribozoma
velika subjedinica
ribozoma
ELONGACIJA
peptidna veza
Met
Leu
UAC GAC
AUG CUG UUU
P A
Met
Leu
UAC GAC
AUG CUG UUU
P A
ELONGACIJA
pomeranje za jedan kodon
Met
Leu
UAC GAC
AUG CUG UUU
P
A
Met
Leu
GAC
AUG CUG UUU GAC
P A
ELONGACIJA
Met
Leu
Phe
GAC AAA
AUG CUG UUU GAC
P
A
Met
Leu
Phe
GAC AAA
AUG CUG UUU GAC
P
A
ELONGACIJA
pomeranje za jedan kodon
Met
Leu
Phe
AAA
AUG CUG UUU GAC
P
A
Met
Leu
Phe
AAA
AUG CUG UUU GAC
P A
TERMINACIJA
Ala
Tyr
Asp
Cys
Val
Phe
Leu
Gly
Ala
Ala
Tyr
Asp
Phe
Gly
Ala
Cys
Met
faktor
terminacije
Val
CAA
GUU UAG
P
Leu
A
CAA
Met
DNK
transkripcija
RNK polimeraza
RNK transkript
RNK obrada
egzon
pre-iRNK
intron
aminoaciltRNK-sintetaza
nukleus
AMK
citoplazma
tRNK
m RNK
ribozomske
subjedinice
aktivacija
AMK
polipeptid
translacija
antikodon
m RNK
RNK polimeraza
transkripcija
DNK
poliribozom
ribozomi
m RNK
polipeptid
sintetisani
polipeptid
60S
40S
stop kodon
startni kodon
iRNK
polipeptid
100 nm
ribozom
m RNK
signalni peptid
SRP
odvajanje signalnog peptida
citosol
membrana ER
SRP receptori
lumen
cisterne ER
ANTIBIOTICI KOJI DELUJU SAMO NA PROKARIOTE
Deluju na translaciju
Tetraciklin
blokira vezivanje aminoacil-tRNK za A mesto
Streptomic in
blokira prelazak sa inicijacije na elongaciju
Hloramfenikol
blokira peptidil-transferaznu aktivnost
Eritromicin
blokira translociranje duž ribozoma
Deluju na transkripciju
Rifamicin
blokira inicijaciju kompetitivnim vezivanjem
za RNK polimerazu
ANTIBIOTICI KOJI DELUJU I NA PROKARIOTE I NA EUKARIOTE
Deluju na translaciju
Piromic in
dovodi do prerane terminacije translacije
Deluju na transkripciju
Aktinomicin D
blokira kretanje RNK polimeraze
K r a j