中文生物医学文献数据库检索
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Transcript 中文生物医学文献数据库检索
文摘数据库检索
北京大学医学图书馆
信息咨询部
主要内容
(一)中国生物医学文献服务系统
(SinoMed)
(二)中文生物医学期刊文献数据
库(CMCC)
(一)中国生物医学文献服务系统
研制单位:该系统由中国医学科学院医学信息研
究所开发研制。
整合了中国生物医学文献数据库(CBM)、西文生
物医学文献数据库(WBM)、北京协和医学院博硕学
位论文库等多种资源
检索、个性化定题服务、全文传递服务
文摘库 VS 全文库
名称
类型 起始时间 医学期刊 更新
SinoMed
文摘 1978年 > 1600种 1-2月
清华同方 全文 1989年 < 1300种 2-6月
重庆维普 全文 1994年 < 1300种 2-6月
万方数据 全文 1999年 < 1300种 2-6月
CNKI
全文 1994年 < 1300种 1-2月
• 文献数据全,更新速度快。
• 检索效率高
• 注意:全文库CNKI大多数期刊的更新频率要超过
SinoMed
中国生物医学文献服务系统
系统概况
检索技巧和方法
检索结果的处理
检索实习
1. 系统概况
中国医学科学院医学信息研究所开发研制
内容覆盖:
中国生物医学文献数据库(CBM)
西文生物医学文献数据库(WBM)
日文生物医学文献数据库
俄文生物医学文献数据库
英文文集汇编文摘数据库
英文会议文摘数据库
北京协和医学院博硕学位论文数据库
中国医学科普文献数据库
1. 系统概况——整合数据库介绍
(1)中国生物医学文献数据库(CBM)
收录范围:收录1978以来2000余种中国生物医
学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,数据
每月更新,全部题录均进行主题标引和分类标引
等规范化加工处理。截止到2014年10月,收录文
献800多万篇。年增文献近万篇 。
学科范围:涉及基础医学、临床医学、预防医
学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领
域。
1. 系统概况——整合数据库介绍
(2)北京协和医学院博硕学位论文库
收录范围:1981年以来协和医学院培养的博士
、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医学、药
学各专业领域及其他相关专业,内容前沿、丰富,
可在线浏览全文。每季更新。截止到2014年10月
,收录论文一万余篇。
1. 系统概况——整合数据库介绍
(3)中国医学科普文献数据库
收录范围:收录 2000年以来国内出版的医学科
普期刊近百种,重点突显养生保健、心理健康、
生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食
品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。截
止到2014年10月,文献总量27万余篇。
2. 检索技巧和方法
基本检索
主题检索
分类检索
期刊检索
作者检索
我的空间
2.1 基本检索
跨库检索:
逻辑组配检索 :
“AND”(逻辑与)、“OR”(逻辑或)、“NOT”(逻辑非)
通配符检索
单字通配符(?):? 替代一个字符 ,如“血?动力 ”
任意通配符(%): %替代任意个字符 ,如“肝炎%疫苗”
短语检索
检索词中含有“-”、“(”、“,”等特殊符号时
半角双引号 (””)
二次检索
在已有检索结果的基础上再检索,逐步缩小检索范围
智能检索
自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的
同步检索
限定检索
限定年代、文献类型、研究对象、性别等
2.1.1跨库检索
2.1.2 通配符检索
输入“血?动力”
输入“肝炎%疫苗”
2.1.3短语检索
输入"1,25-(OH)2D3"
含有特殊字符的检索必须在
检索词上加引号(半角),
否则检索无效
2.1.4智能检索
2.1.5 限定检索
CBM限定条件详细说明
2.1.6 检索练习
2000-2010年发表的关于美托洛尔治疗高血压的
综述文献
1. 限定条件
2000-2010年
综述
2. 输入关键词
美托洛尔
高血压
基本检索练习
1. 北京大学第三医院发表的文章
(北京%大学%第三%医院) and (100083 or
100191)
比较直接输入“北京大学第三医院”结果有何
不同
2. 1992-2005年发表的有关成年人艾滋病
合并肺炎的文献
2.2 主题检索
主题检索是基于文献内容的主题概念进行
检索,有利于提高查全率和查准率。
主题检索的依据 :
美国国立医学图书馆编著的《医学主题
词表》(即MeSH词表)。
中国中医研究院中医药信息研究所编著
的《中医药学主题词表》。
主题词:(规范主题词subject headings)
——经系统规范词表控制的统一检索用词
关键词(自由词)
艾滋病
AIDS
爱滋病
主题词
获得性免疫缺陷综合征
2.2 主题检索
主题索引中提供中、英文两种形式。
主题词检索的功能:
1、提供主题词的定义、注释;
2、显示主题词之间的族性关系(上位词
、下位词、同位词);
3、将非主题词引见到主题词形式
2.2 主题检索
副主题词(subheading):限定
规范主题词某一方面研究内容的规范
词。
例如:
诊断:诊断,放射摄影术,放射性核
素成像,超声诊断等
治疗: 治疗,药物治疗,放射治疗,
外科学,膳食疗法,康复,中医治疗相关副主题
词等
药物作用: 治疗应用,副作用,毒性
,中毒等
规范化处理之前
标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像
表现
著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微
著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069
文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录
病毒治疗(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特
征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在
HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像
表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及HAART联合治
疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在
HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病
情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。
出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151
利用《中国图书馆分类
法 · 医学专业分类表》
规范化处理之后
分类号: R442.8; R512.91; R52; *R734.2
标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现
著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微
著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069
文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗
(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特征及影像表现。方法:
回顾分析4例AIDS并发结核患者在HAART中发生IRIS的临床及影像资料。
结果:以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及
HAART联合治疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在
HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病情监测、疗
效评价及治疗具有重要的作用。
出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151
主题词:结核/并发症; 结核/*放射摄影术; 获得性免疫缺陷综合征/并发症; 获得性
免疫缺陷综合征/*放射摄影术; 综合征; 回顾性研究; 炎症/病因学; 炎症/*放射摄
影术
利用主题词表
主题词 :
结核/并发症;
结核/*放射摄影术;
获得性免疫缺陷综合征/并发症;
获得性免疫缺陷综合征/*放射摄影术;
综合征;
回顾性研究;
炎症/病因学;
炎症/*放射摄影术
2.2 主题检索
主题词/副主题词组配检索
主题词:自然语言的规范化用语
如主题词“获得性免疫缺陷综合征”涵盖了“艾滋病”、
“AIDS”、“爱滋病”等词语。
副主题词:用于对主题词的某一特定方面
加以限定
如:治疗、诊断、药物作用等
主题词/副主题词组配检索
如:“肝/药物作用”表明文章讨论药物对肝脏的影响
CBMdisc数据库主题词检索
2.2 主题检索
单主题
肾炎的药物治疗
甲型肝炎的诊断
宫外孕的诊断
复合主题
胸腺素治疗肺炎
前列腺增生与表皮生长因子的关系
加权检索
主要论述骨折康复的文献
主题词加权检索
2.2 主题检索
权,然后知轻重.
“权”是表示重要程度的数值。而所谓“加权检
索”,是对参加组配检索的各个标识(检索词)
,依据检索要求分别给予不同重要程度的数值。
这是对检索质量进行控制的有效方法。
加权的意义:检出文献必须主要论述该检索主题
。可提高查准率。
主题词加权检索
2.2 主题检索
主要论述骨折康复的文献
1.标题:跟骨距下关节内移位骨折的手术治疗与术
后康复
主题词:跟骨/*损伤;骨折/*外科学;骨折/康复
;距下关节/*损伤;手术后期间
2.标题:膝关节内骨折术后的系统康复训练
主题词:骨折/*康复;骨折/外科学;手术后医护
;膝损伤/*康复;膝损伤/外科学
2.2 主题检索
主题词加权检索
仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检
索
非加权检索表示对加星号和非加星号主题词
(非主要概念主题词)均进行检索
A文献
标题: RNA干扰血管紧张素受体对肾血管性高血压大鼠
血压及心肌肥厚的影响
主题词: *RNA干扰; 高血压, 肾血管性/*病理生理学;
高血压, 肾血管性/遗传学; 高血压, 肾血管性/治疗; 心
脏扩大/*病理生理学; 血压/*生理学; 血压/遗传学
B文献
标题:肾动脉直接支架置入治疗肾血管性高血压5例
主题词:高血压, 肾血管性/*治疗; 可行性研究; 气囊扩张术;
*肾动脉; *支架
若使用“高血压,肾血管性/治疗”的加权检索就检索不到A文献
2.2 主题检索
扩展检索
主题词扩展检索:对当前主题词及其下位主题
词进行检索
副主题词扩展检索:对当前副主题词及其下位
副主题词进行检索
2.2 主题检索
例 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》
中利用主题途径检索有关“骨关节结核治疗”
的文献。
1、词条中带有“见”字时,前面的词为主题词
的款目词(同义词),后面的词为正式主题词;
2、词条中无“见”时,前后均为主题词。
选择恰当的主题词
“结核, 骨关节”
后,点击进入该主
题词的注释信息显
示界面
加权检索:仅对加星号(*)主题
词(主要概念主题词)检索
扩展检索:对当前主题词及其下位
主题词进行检索
副主题词选择窗
副主题词扩展检索:对当前
副主题词及其下位副主题词进
行检索
主题词树状结构
本例“结核,骨关节”有下位词“结核,
脊柱”
选择“加权检索”、“扩展检
索”,添加组配相应的副主题
词“治疗”后,点击“主题检
索”按钮进行文献检索。
主题检索练习
检索有关肾血管性高血压的诊断的文献
肾血管性高血压
诊断
检索有关雷公藤治疗类风湿性关节炎的文
献
类风湿性关节炎
雷公藤
2.3 分类检索
通过分类导航逐级展开来实现
在类名、类号输入框输入学科类名或类号
分类号扩展检索 :对该类号及其下位类号进行查找
复分组配检索 :对于可复分的类号,选择复分组配
检索(可选择多个复分号)
2.3 分类检索
例 查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的文
献
分类检索界面,选
择“类名”检索字
段并输入检索词
“麻疹”
类名列表中选择准
确类名“小儿麻疹”
选择复分组配检索
(可选择多个复分
号);最后点击
“分类检索”按钮
2.4 期刊检索
目标期刊定位:
可通过检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、
期刊主题词或者ISSN直接查找期刊;
也可通过“期刊分类导航”或“首字母导航”逐级
查找浏览期刊;
期刊文献查找:
可以直接指定年、卷期进行浏览;
也可以输入欲检索的内容后在指定的年卷期中查找
浏览具体文献。
2.4 期刊检索
例 通过《中华医院管理杂志》了解农村医
疗机构管理方面的研究进展情况。
2.5 作者检索
二次检索法
作者机构限定检索法
与二次检索法相比,作者机构限定检索支
持作者精确定位,能够比较有效地解决
“同名著者”、“同构异名”问题,提高
查准率与查全率。
2.5 作者检索
例5. 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》
中查找“中国医学科学院基础医学研究所沈岩
教授”以第一著者身份发表的论文情况。
高级检索
作者机构限定检索法
(1)高级检索法
“高级检索”界面,选择
“第一作者”检索入口,
输入“沈岩”,点击
“发送到检索框”按钮
“高级检索”界面,选择“作者单
位”检索入口,输入“中国医学
科学院基础医学研究所”,点击
“发送到检索框”按钮
(2)作者机构限定检索法
(2)作者机构限定检索法
作者列表中选择作
者“沈岩”,并点
击“下一步”按钮
(2)作者机构限定检索法
作者机构列表中选
择该作者所在机构,
然后点击“完成”
按钮。
2.6 我的空间
“个人用户” 直接使用系统注册时所用的用
户名和密码即可登录“我的空间”;但
“集团用户”下的子用户则需要单独注册
后才可登录使用
定题检索
在开展某项课题研究时,需要及时跟踪国内外在该
领域的研究进展,把握最新研究动态和成果
创建个人数据库来保存感兴趣的检索结果
可以对感兴趣的文献进行保存、管理与再利用。
2.7 检索历史
最多允许保存100条检索表达式 ,
按照时间顺序从上到下依次显示检索式,
最新的检索式总在最上方。
根据需求选择一个或多个有意义的检索表
无意义的检索表达式
达式保存成特定的“检索策略”。在“我
选中后点击“清除检
的空间”中可定期调用该检索策略
索史”可进行删除
可从中选择一个或多个检索式用逻辑算符
AND、OR或NOT组配
3. 检索结果的处理
检索结果的分析
从不同角度(作者、出版时间、作者单位、
来源期刊、加星主题词和文献类型)对检索
出来的文献进行分析
检索结果显示、打印和保存
结果显示格式:“题录格式”、“文摘
格式”、“详细格式”
结果输出方式: 打印、保存和E-mail
排序方式:“年代”、“作者”、“期
刊”、“相关度”
全文获取 :
CBM数据库与维普科技期刊全文数
据库链接
提供北京协和医学院博硕学位论文
的在线原文阅读功能
原文索取 :
通过填写“全文申请表”、“文件
导入”等方式申请所需要的文献
4. 检索实习
例1:腹痛的并发症
检索课题中包含两个主要概念:腹痛、并发症
采用主题词途径和基本途径相结合方法进行检
索。
第一步,输入相应的中文主题词 “腹痛”为了不
遗漏文献,主题检索有关设置为:主题词扩展、
不加权 ,组配相应的副主题词“并发症”, 并
设置为“扩展副主题词” ;
第二步,在缺省字段中输入(腹痛 OR 腹疼)AND
并发症进行基本检索;
第三步,点击“检索历史”,根据尽量不遗漏文
献的需要, 在检索框中输入 #1 OR #2
或者点选相应检索式前的方框,再点击“OR”按
钮,进行检索。
例1:腹痛的并发症
检索策略:
#1 主题词=="腹痛/CO/全部树"
#2 (腹痛 OR 腹疼)AND 并发症
#3 #1 OR #2
习题
1. 检索有关“新生儿窒息的诊断”的综述
文献
2. 检索“女贞子治疗老年便秘”的文献
3. 检索发表在2006 至2012年的关于“头针
治疗老年痴呆”的文献(主题检索结合自
由词检索)
(二)中文生物医学期刊文献数据库
CMCC简介
检索方法与技巧
检索结果的显示
CBM与CMCC的比较
1.CMCC简介
是由解放军医学图书馆数据库研究部开发的中文
生物医学文献目录型数据库。
收录范围:基础医学,临床医学,预防医学,医
学生物学,中医药学,药学,医院管理,医学信
息学等卫生相关信息。
CMCC新,更新速度快,收录期刊全(1400余种)
CMCC由1994年正式出版,半月一期,按年度存放
文献数据。
CMCC有三个版本:
单独的CMCC
与CMCI集成在一起
与CMAC集成在一起
2007年以
前的数据
最新的
数据
单独的CMCC系统
检索界面
2. 检索方法与技巧
基本检索
高级检索
引文检索
2.1 基本检索
2.1 基本检索
2.1 基本检索
检索示例
检索胡大一以第一作者身份发表的文献
检索北京大学第三医院发表的文献
北京*第三*医院
2.2.高级检索
高级检索示例:禽流感的流行病学
3.检索结果的处理
4. CBM与CMCC的比较
一般中文生物医学文献课题的检索过程
课题的主题分析和策略制定——检索
CBMdisc数据库(课题的回溯检索,了解课题的主
要文献)——结合现刊和网检文献的阅读,每半
月检索一次CMCC(掌握最新文献信息,定题跟踪
检索)——课题修正——循环检索——课题完成
4.1 CBM的特点
主题检索功能强:CBM是受控的检索数据库,
具有主题检索功能。它既可对单个主题词
加权检索,也可扩展检索,还可以选择副
主题词进行方面组配,对查全率和查准率
都有一定保证。
CBM,界面友好,方便操作,检索途径多,
还可以进行分类途径检索,还可以进行年
限的限制。
4.1 CBM的特点
收录1978年以来的文献题录 ,可进行课题
的回溯检索。
CBM属于浅标引,用主题词检索途径易造成
漏检,要配合自由词检索。
4.2 CMCC的特点
新、快、全。更新快,半月一期。与印刷
版比较,平均时滞为3个月,能够补充一部
分CBM的时间差。收录生物医学期刊1400余
种,几乎囊括了(90%以上)生物医学正式
出版的期刊。
采用关键词标引,非受控数据库,没有主
题词和分类检索途径,查全率和查准率难
以保证。