中文生物医学文献数据库检索

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Transcript 中文生物医学文献数据库检索

中文生物医学文献数据库检索
北京大学医学图书馆
信息咨询部
主要内容
中国生物医学文献服务系统(SinoMed)
中国生物医学文献数据库(CBM)
北京协和医学院博硕学位论文数据库
中国医学科普文献数据库
中文生物医学期刊文献数据库(CMCC)
(一)中国生物医学文献服务系统
系统概况
检索技巧和方法
检索结果的处理
检索实习
1. 系统概况
 中国医学科学院医学信息研究所开发研制
 内容覆盖:
 中国生物医学文献数据库(CBM)
 西文生物医学文献数据库(WBM)
 日文生物医学文献数据库
 俄文生物医学文献数据库
 英文文集汇编文摘数据库
 英文会议文摘数据库
 北京协和医学院博硕学位论文数据库
 中国医学科普文献数据库
1. 系统概况
 中国生物医学文献数据库(CBM) 收录1978年以来
1600余种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献
题录530余万篇,全部题录均进行主题标引和分类标引等
规范化加工处理。年增文献40余万篇,每月更新。
 中国医学科普文献数据库 收录2000年以来国内出版的医
学科普期刊近百种,文献总量8万余篇,重点突显养生保
健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家
庭、食品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。
 北京协和医学院博硕学位论文库 收录1981年以来协和医
学院培养的博士、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医
学、药学各专业领域及其他相关专业,内容前沿、丰富,
可在线浏览全文。每季更新。
2. 检索技巧和方法
基本检索
主题检索
分类检索
期刊检索
作者检索
我的空间
2.1 基本检索
 美托洛尔治疗高血压的文献
 关键词
 美托洛尔
 高血压
2.1 基本检索
 跨库检索:
 逻辑组配检索 :
 “AND”(逻辑与)、“OR”(逻辑或)、“NOT”(逻辑非)
 通配符检索
 单字通配符(?):? 替代一个字符 ,如“血?动力 ”
 任意通配符(%): %替代任意个字符 ,如“肝炎%疫苗”
 短语检索
 检索词中含有“-”、“(”、“,”等特殊符号时
 半角双引号 (” ”)
 模糊检索
 输入的检索词包含在命中文献的检索字符串中
 二次检索
 在已有检索结果的基础上再检索,逐步缩小检索范围
 智能检索
 CBM
 自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索
 限定检索
 限定年代、文献类型、研究对象、性别等
跨库检索
通配符检索
输入“血?动力”
输入“肝炎%疫苗”
短语检索
输入"1,25-(OH)2D3"
模糊检索
智能检索
如:在CBM的“缺省”字段输入“艾滋病”,勾选
“智能主题”后点击“检索”按钮,系统自动检出“中
文标题”、“摘要”、“关键词”、“主题词”等字段
中含“艾滋病”、“AIDS”和“获得性免疫缺陷综合征”
的所有文献。
限定检索
CBM限定条件详细说明
检索练习
 2000-2010年发表的关于美托洛尔治疗高血压的
综述文献
 限定条件
 2000-2010年
 综述
 关键词
 美托洛尔
 高血压
基本检索练习
1. 北京大学第三医院发表的文章
(北京%大学%第三%医院) and (100083 or
100191)
2. 1992-2005年发表的有关成年人艾滋病
合并肺炎的文献
2.2 主题检索
主题检索是基于文献内容的主题概念进行
检索,有利于提高查全率和查准率。
主题检索的依据 :
《医学主题词表(MeSH)》中译本
《中国中医药学主题词表》
规范化处理之前
 标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像
表现
 著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微
 著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069
 文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录
病毒治疗(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特
征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在
HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像
表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及HAART联合治
疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在
HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病
情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。
 出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151
利用《中国图书馆分类
法 · 医学专业分类表》
规范化处理之后
 分类号: R442.8; R512.91; R52; *R734.2
 标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现
 著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微
 著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069
 文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗
(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特征及影像表现。方法:
回顾分析4例AIDS并发结核患者在HAART中发生IRIS的临床及影像资料。
结果:以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及
HAART联合治疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在
HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病情监测、疗
效评价及治疗具有重要的作用。
 出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151
 主题词:结核/并发症; 结核/*放射摄影术; 获得性免疫缺陷综合征/并发症; 获得性
免疫缺陷综合征/*放射摄影术; 综合征; 回顾性研究; 炎症/病因学; 炎症/*放射摄
影术
利用主题词表
 主题词 :
 结核/并发症;
 结核/*放射摄影术;
 获得性免疫缺陷综合征/并发症;
 获得性免疫缺陷综合征/*放射摄影术;
 综合征;
 回顾性研究;
 炎症/病因学;
 炎症/*放射摄影术
关键词(自由词)
艾滋病
AIDS
爱滋病
主题词
获得性免疫缺陷综合征
2.2 主题检索
主题词/副主题词组配检索
主题词:自然语言的规范化用语
如主题词“获得性免疫缺陷综合征”涵盖了“艾滋病”、
“AIDS”、“爱滋病”等词语。
副主题词:用于对主题词的某一特定方面
加以限定
如:治疗、诊断、药物作用等
主题词/副主题词组配检索
如:“肝/药物作用”表明文章讨论药物对肝脏的影响
2.2 主题检索
主题词加权检索
仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检
索
非加权检索表示对加星号和非加星号主题词
(非主要概念主题词)均进行检索
A文献
标题: RNA干扰血管紧张素受体对肾血管性高血压大鼠
血压及心肌肥厚的影响
主题词: *RNA干扰; 高血压, 肾血管性/*病理生理学;
高血压, 肾血管性/遗传学; 高血压, 肾血管性/治疗; 心
脏扩大/*病理生理学; 血压/*生理学; 血压/遗传学
B文献
标题:肾动脉直接支架置入治疗肾血管性高血压5例
主题词:高血压, 肾血管性/*治疗; 可行性研究; 气囊扩张术;
*肾动脉; *支架

若使用“高血压,肾血管性/治疗”的加权检索就检索不到A文献
2.2 主题检索
扩展检索
主题词扩展检索:对当前主题词及其下位主题
词进行检索
副主题词扩展检索:对当前副主题词及其下位
副主题词进行检索
2.2 主题检索
例1. 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》
中利用主题途径检索有关“骨关节结核治疗”
的文献。
选择恰当的主题词
“结核, 骨关节”
后,点击进入该主
题词的注释信息显
示界面
加权检索:仅对加星号(*)主题
词(主要概念主题词)检索
扩展检索:对当前主题词及其下位
主题词进行检索
副主题词选择窗
副主题词扩展检索:对当前
副主题词及其下位副主题词进
行检索
主题词树状结构
本例“结核,骨关节”有下位词“结核,
脊柱”
选择“加权检索”、“扩展检
索”,添加组配相应的副主题
词“治疗”后,点击“主题检
索”按钮进行文献检索。
主题检索练习
检索有关肾血管性高血压的诊断的文献
肾血管性高血压
诊断
2.3 分类检索
通过分类导航逐级展开来实现
在类名、类号输入框输入学科类名或类号
分类号扩展检索 :对该类号及其下位类号进行查找
复分组配检索 :对于可复分的类号,选择复分组配
检索(可选择多个复分号)
2.3 分类检索
例3. 查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的
文献
分类检索界面,选
择“类名”检索字
段并输入检索词
“麻疹”
类名列表中选择准
确类名“小儿麻疹”
选择复分组配检索
(可选择多个复分
号);最后点击
“分类检索”按钮
2.4 期刊检索
目标期刊定位:
可通过检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、
期刊主题词或者ISSN直接查找期刊;
也可通过“期刊分类导航”或“首字母导航”逐级
查找浏览期刊;
期刊文献查找:
可以直接指定年、卷期进行浏览;
也可以输入欲检索的内容后在指定的年卷期中查找
浏览具体文献。
2.4 期刊检索
例4. 通过《中华医院管理杂志》了解农村
医疗机构管理方面的研究进展情况。
2.5 作者检索
二次检索法
作者机构限定检索法
与二次检索法相比,作者机构限定检索支
持作者精确定位,能够比较有效地解决
“同名著者”、“同构异名”问题,提高
查准率与查全率。
2.5 作者检索
例5. 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》
中查找“中国医学科学院基础医学研究所沈岩
教授”以第一著者身份发表的论文情况。
二次检索法
作者机构限定检索法
“基本检索”界面,选
(1)二次检索法
择“第一作者”检索
入口,输入“沈岩”,
点击“检索”按钮
(1)二次检索法
检索结果界面,选择“作者单位”
检索入口,输入该作者所在机构
名称“中国医学科学院基础医学
研究所”,勾选“二次检索”后
点击“检索”按钮
(2)作者机构限定检索法
(2)作者机构限定检索法
作者列表中选择作
者“沈岩”,并点
击“下一步”按钮
(2)作者机构限定检索法
作者机构列表中选
择该作者所在机构,
然后点击“完成”
按钮。
2.6 我的空间
“个人用户” 直接使用系统注册时所用的用
户名和密码即可登录“我的空间”;但
“集团用户”下的子用户则需要单独注册
后才可登录使用
定题检索
在开展某项课题研究时,需要及时跟踪国内外在该
领域的研究进展,把握最新研究动态和成果
创建个人数据库来保存感兴趣的检索结果
可以对感兴趣的文献进行保存、管理与再利用。
3. 检索结果的处理
 检索结果的分析
 CBM
 从不同角度(作者、出版时间、作者单位、
来源期刊、加星主题词和文献类型)对检索
出来的文献进行分析
 检索结果显示、打印和保存
 结果显示格式:“题录格式”、“文摘格式”、
“详细格式”
 结果输出方式: 打印、保存和E-mail
 排序方式:“年代”、“作者”、“期刊”、
“相关度”
 全文获取 :
 CBM数据库与维普科技期刊全文数据库链接
 提供北京协和医学院博硕学位论文的在线原文
阅读功能
 原文索取 :
 通过填写“全文申请表”、“文件导入”等方
式申请所需要的文献
4. 检索实习
例1:腹痛的并发症
检索课题中包含两个主要概念:腹痛、并发症
采用主题词途径和基本途径相结合方法进行检
索。
 第一步,输入相应的中文主题词 “腹痛”为了不
遗漏文献,主题检索有关设置为:主题词扩展、
不加权 ,组配相应的副主题词“并发症”, 并
设置为“扩展副主题词” ;
 第二步,在缺省字段中输入(腹痛 OR 腹疼)AND
并发症进行基本检索;
 第三步,点击“检索历史”,根据尽量不遗漏文
献的需要, 在检索框中输入 #1 OR #2
或者点选相应检索式前的方框,再点击“OR”按
钮,进行检索。
例1:腹痛的并发症
检索策略:
#1 主题词=="腹痛/CO/全部树"
#2 (腹痛 OR 腹疼)AND 并发症
#3 #1 OR #2
习题
1. 检索有关“新生儿窒息的诊断”的综述
文献
2. 检索“北京大学的王宪2002年发表的有
关动脉粥样硬化”的文献
3. 检索“女贞子治疗老年便秘”的文献
(二)中文生物医学期刊文献数据库
CMCC简介
检索方法与技巧
检索结果的显示
CBM与CMCC的比较
1.CMCC简介
 是由解放军医学图书馆数据库研究部开发的中文
生物医学文献目录型数据库。
 收录范围:基础医学,临床医学,预防医学,医
学生物学,中医药学,药学,医院管理,医学信
息学等卫生相关信息。
 CMCC新,更新速度快,收录期刊全(1400余种),
可弥补CBM时滞长的缺点,特别有利于课题的查新
和追踪检索。
 CMCC由1994年正式出版,半月一期,按年度存放
文献数据。
CMCC有三个版本:
单独的CMCC
与CMCI集成在一起
与CMAC集成在一起
2007年以
前的数据
最新的
数据
单独的CMCC系统
检索界面
2. 检索方法与技巧
基本检索
高级检索
引文检索
2.1 基本检索
2.1 基本检索
2.1 基本检索
检索示例
检索胡大一以第一作者身份发表的文献
检索北京大学第三医院发表的文献
北京*第三*医院
2.2.高级检索
高级检索示例:禽流感的流行病学
3.检索结果的处理
4. CBM与CMCC的比较
一般中文生物医学文献课题的检索过程
课题的主题分析和策略制定——检索
CBMdisc数据库(课题的回溯检索,了解课题的主
要文献)——结合现刊和网检文献的阅读,每半
月检索一次CMCC(掌握最新文献信息,定题跟踪
检索)——课题修正——循环检索——课题完成
4.1 CBM的特点
主题检索功能强:CBM是受控的检索数据库,
具有主题检索功能。它既可对单个主题词
加权检索,也可扩展检索,还可以选择副
主题词进行方面组配,对查全率和查准率
都有一定保证。
CBMWIN,界面友好,方便操作,检索途径
多,还可以进行分类途径检索,还可以进
行年限的限制。
4.1 CBM的特点
收录1979年以来的文献题录 ,可进行课题
的回溯检索。
CBM属于浅标引,用主题词检索途径易造成
漏检,要配合自由词检索。
CBM更新慢,平均每四个月更新一次。
4.2 CMCC的特点
新、快、全。更新快,半月一期。与印刷
版比较,平均时滞为3个月,很好地补充了
CBM的时间差。收录生物医学期刊1100余种,
几乎囊括了(90%以上)生物医学正式出版
的期刊。
采用关键词标引,非受控数据库,没有主
题词和分类检索途径,查全率和查准率难
以保证。