Transcript les gènes fonctionnels codant les enzymes de dégradation des HAP

UMR CNRS 6143 « Morphodynamique continentale et côtière »
Maïté NIEPCERON
Interactions entre la diversité microbienne et la contamination diffuse aux HAP
(Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques) dans les sols agricoles contrastés.
Les objectifs de la thèse sont :
 Caractérisation des communautés
bactériennes impliquées dans la
dégradation des HAP à l’échelle de :
Naphtalene
- la communauté bactérienne totale,
Phenanthrene
- le genre bactérien Pseudomonas,
f
b
a
a
d
a
HAP
a
e
e
g
h
c
Fluorescence (Qté Gène amplifié)
1
2
3
4
HAP
E
.
c
5 o6
l
i
7
8
9
10
11 12
13 14 15
16
HAP
- les gènes fonctionnels codant les
enzymes de dégradation des HAP, les
dioxygènases.
 Identification et quantification des
biosurfactants produits par les
bactéries en présence ou non de HAP.
Cycle de PCR
1
2
3
4
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PCR
Directeurs : J. BODILIS et S. BARRAY