Transcript TP1

TP1, Recherche de Parenté chez les Vertébrés
Etablissement de Phylogénie
Rappel du cours :
1. Comment appelle-t-on les caractères communs pour plusieurs
espèces qui appartiennent aussi à leur ancêtre commun ?
Des caractères homologues
2. A quel échelle peut-on comparer les caractères des vertébrés ?
Macroscopique (anatomie, morphologie, embryon), cellulaire, moléculaire
3. Qu’est ce qu’une analogie ?
Deux caractères qui se ressemblent mais qui ne sont pas hérités d’un ancêtre
commun.
4. Pourquoi parle-t-on d’état primitif (ancestral) ou évolué (dérivé)
pour un caractère ?
Etat primitif : état le plus anciennement apparu
Etat évolué : état apparu plus récemment par modification de l’état primitif
Schéma d’un arbre phylogénique
Espèce 1
Espèce 2
Espèce 3
Espèce 4
Espèces
actuelles ou
fossiles
Schéma d’un arbre phylogénique
Espèce 1
Espèce 2
fossile
Espèce 3
Espèce 4
Espèces
actuelles ou
fossiles
Schéma d’un arbre phylogénique
Espèce 1
Espèce 2
fossile
Espèce 3
Espèce 4
Espèces
actuelles ou
fossiles
Nœud : ancêtre commun
Innovation génétique
Passage d’un état ancestral à un état dérivé
Plus vieil ancêtre commun
4. Quels caractères doit-on choisir pour représenter la phylogénie la
plus probable ?
Des caractères homologues
Identifier les innovations génétiques
Repérer pour chaque innovation l’état dérivé et l’état ancestral
Lien vers tableau de caractère de l’exo 2 du TP1
1. Remplir la matrice des taxons : sardine, aigle, chat, dauphin
et caractères : organes respiratoires, placenta et pièces basales
2. Coder les états de caractères de la matrice.
Choisir un taxon extra-groupe (celui avec le plus d’états ancestraux)
Colorer les états primitifs suivant l’extra-groupe
Choisir une couleur pour les états dérivés
Choisir « Colorer de la même manière les états identiques » (plutôt que
« colorer case par case »)
Cliquer sur les états dérivés à colorer dans le tableau
Vérifier
Remplir la matrice de la feuille de TP
3. Editer l’arbre
Suivre les indications de la fiche de TP
Pour indiquer les évolutions génétiques sur l’arbre, vous pouvez vous
aider en cliquant sur « exploration de l’arbre »
A chaque nœud apparait alors les innovations nouvelles acquises par
l’ancêtre commun.
Schéma d’un arbre phylogénétique
Placenta
Pièce basale unique et poumons
Choisir un caractère supplémentaire : fenêtre temporale
Remplir la matrice ainsi formée
Plumes
Fen. md.
Allaitement
et 1 fen.temp.
et poils
2 fen. temp.
Amnios
Doigts
Squelette osseux
Schéma de l’arbre
phylogénétique des
vertébrés
Mammifères
Oiseaux
Reptiles
Amphibiens Poissons
Plumes
Fen. md.
Allaitement
et 1 fen.temp.
et poils
2 fen. temp.
Amnios
Doigts
Squelette osseux
Schéma de l’arbre
phylogénétique des
vertébrés
Mammifères
Oiseaux
Reptiles
Amphibiens Poissons
Plumes
Fen. md.
Allaitement
et 1 fen.temp.
et poils
2 fen. temp.
Peau à
mucus
Amnios
Doigts
Squelette osseux
Schéma de l’arbre
phylogénétique des
vertébrés
Tétrapodes
Amniotes
Sauropsides
Mammifères
Oiseaux
Amphibiens
Plumes
Fen. md.
Allaitement
et 1 fen.temp.
et poils
2 fen. temp.
Peau à
mucus
Amnios
Doigts
Squelette osseux
Schéma de l’arbre
phylogénétique des
vertébrés
A partir de la page 28 et 29 :
Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés
Temps
(millions
d’année)
- 150
Plumes
Fen. md.
Allaitement
et 1 fen.temp.
et poils
2 fen. temp.
- 220
Peau à
mucus
Amnios
Doigts
Squelette osseux
- 300
- 360
Tableaux :
Poste de travail,
Commun srv jules,
Biologie
cochard
Arbre correspondant au tableau de caractère TS1-1
Amniotes
Sauropsides
Mammifères
1 fen.temp.
2 fen. temp.
Amnios
Une pièce basale
Arbre correspondant au tableau de caractère TS1-2
Amniotes
Mammifères
Tétrapodes
Placenta
3 cavités
cardiaques
Amnios
et 4 cavités
cardiaques
Présence de pattes
Amphibiens
Correction du sujet 2A Pondichéry 2004
Matrice des distances :
Homme Manchot Chimpanzé Tortue
Homme
Manchot
Chimpanzé
Tortue
Kangourou
Homme
Chimpanzé
Kangourou
Manchot
Tortue
0
Kangourou
8
0
10
4
0
8
10
8
0
10
4
0
9
0
Arbre phylogénétique de quelques vertébrés