Transcript 關於醫學標題MeSH
Search EBM in Medline 李紹廸 Judy Lee [email protected] 飛資得資訊 Agenda 關於MeSH及Ovid Medline檢索方式 兼顧完整與精確的文獻檢索步驟 挑選出實證文獻的方式 實用檢索小技巧 My Work Space 關於醫學標題MeSH • MeSH(Medical Subject Heading) – NLM用以分析生物醫學方面之期刊文獻、圖書、視聽資 料、電子資源等資源的主題內容之控制語彙表，亦為 MEDLINE/PubMED資料庫主題檢索的索引典。 – 每篇文獻會被賦予數個主要MeSH與次要MeSH 標示為 主要MeSH MeSH 搭配前方MeSH 的副標題 樹狀結構MeSH： - 以階層方式（hierarchical）展現廣義詞和狹義詞間的關係 Broader Term 廣義主題 表示同時查詢 狹義主題 Narrower Term 狹義主題 屬於同一個 Broader Term的 相關主題 每個MeSH會有對應的副標題可做進階分類 使用副標題精確檢索內容 Ovid Medline 檢索方式 Basic Search Advanced Search ●最嚴謹的搜尋方式 ●詳細比對醫學標題詞 ●取得最完整的文獻資料 ●最直覺的搜尋方式 ●快速取得想票的資訊 ●自動化的搜尋 OVID Medline 特定欄位搜尋 ●Find Citation ●Search Fields ●Multi-Field Search Search Tools ●醫學標題詞的延伸應用 ●尋找醫學標題詞的定義 ●醫學標題詞的樹狀結構 Basic Search 基本檢索 • 適用於： – 資料庫使用新手 – 迅速查詢相關文獻 • 查詢方式 – 輸入所有查詢內容 • 輸入所有的關鍵字 • 一個完整的句子 • 複製某篇文章的篇名 – 自然語言智慧搜尋 (Natural Language Processing) treatment for childhood obesity • 建議選項 – Check Spelling • 提示拼字錯誤 – Include Related Terms • • • • • 同義之字/詞/片語查詢 單複數與詞性變化形查詢 英美語系之異體字查詢 專業縮寫/全寫查詢 可對應之標題詞查詢 每篇文獻標示關聯等級 •黃底字標示查詢之關鍵字 •紫底字標示延伸查詢之關鍵字 以自然語言處理關鍵字 9 在Basic Search找到最佳檢索結果之技巧 • 檢索簡潔化 – 排除無關緊要的形容用詞. 例如:really big ekg changes in highly advanced hypokalemia.可以改成:ekg changes in hypokalemia. • 多使用名詞而非動詞 – 名詞可說是一個概念最原始的型態, 比較容易被辨識且代表 的意義不會含糊不清. 相關研究指出在檢索時若使用名詞作 為檢索詞彙, 可以得到品質較佳的檢索結果. • 不強制片語化 – 當使用引號, 括弧, 或連字號(-)來連接兩個檢索詞彙時, 將 無法擴展查詢相關的詞彙. 例如查詢weather related migraine時, 若強制加上連字號如weather-related, 將當作 單一詞彙來查詢, 因此而漏失掉所有關於 weather 這個關鍵 字的所有相關詞彙檢索結果. Advanced Ovid Search • 適用於一般或資深使用者 • 查詢方式：查詢完整資料 – Keyword： • 主題詞自動比對：提高查詢精確度 • 關鍵字查詢 – Author：以作者查詢 – Title：以題名查詢，只查詢題名上的關鍵字 – Journal：以期刊名查詢，不可使用縮寫 Enterovirus 11 MeSH的使用 • Map Term to Subject Heading比對規則 ：先比對後統計 – 先一一比對在MeSH中有無可對應的標準主題。 – 如果比對不到標準主題時，先收集在文章篇名、摘要等書目欄位中 有出現過我們所輸入的關鍵字的所有文獻。 – 再統計這些文獻中所有標準主題出現的次數。 – 出現最多次的這些標準主題就會被列入MeSH的建議選單中。 – 如果我們在主題建議清單中還是沒有找到適合的，Ovid還是會把 關鍵字帶入資料庫中的重要欄位進行查詢。 • 何時使用Explode – 點選MeSH進入Tree樹狀表中確認主題包含範圍 – 通常適用於多個關鍵字查詢，可擴展查詢範圍 • 何時使用Focus – 指定文獻的主要主題時使用 – 通常適用於單一關鍵字查詢，精確鎖定查詢範圍 12 MeSH比對結果 選擇適合的副標題 – 訂定查詢方向 兼顧完整與精確的文獻檢索步驟 A. 選擇 Basic Search(基本檢索) 1. 完整輸入查詢的主題/概念/問題 2. Filter (篩選) 5 starts的結果 3. 加入檢索歷史 (Add to History) B. 選擇Advance Search(進階檢索) 1. 每一個關鍵字主題個別單一查詢 2. 將每一主題的查詢結果以And交集 3. 善用Limit功能篩選查詢結果 C. 將A與B的結果以OR聯集，獲得所有結果 A. 選擇 Basic Search(基本檢索) 1 3 2 B. 選擇Advance Search(進階檢索) 1 2 查詢範圍包括勾選的主 題以及附屬的子主題 1. 建議用於單一主題查 詢時使用 2. 多個主題查詢時，若 檢索結果過多，可指 定主要查詢主題 3 4 5 6 關於此類主題的所有 資料 合併 Basic Search 與 Advanced Search查 詢結果兼顧關鍵字與主題精確查詢效果 挑選出實證文獻的方式 1. 利用限制功能(Limit)篩選證據等級 1) EBM Reviews 2) 文獻類型 a) b) c) Systematic Review Publication Type MeSH 3) 問題種類 a) Clinical Queries 年齡層 動物 期刊類別 發表語言 2b.出版類型 研究範疇 3.問題種類 文獻索引 1.實證文獻 2a.特定主題類別 2. 依文獻類型篩選 Based on material from SUNY Downstate Medical Center/Medical Research Library of Brooklyn Pyramid modified from "Navigating the Maze", University of Virginia, Health Sciences Library 與實證有關之文獻類型 • Systematic Review – – – – – – – Cochrane System Review Health Technology Assessments ACP Journal club Meta-Analysis Consensus Development Reports Decision Analyses Guideline/Practice Guideline --------Clinical Queries-------• RCTs – Double Blind studies – (therapy, diagnosis) • Cohorts Studies (prognosis, etiology, prevention) – Longitudinal Studies • Follow-Up Studies • Prospective Studies • Case Control Studies (prognosis, etiology, prevention) – Retrospective Studies • Cross-Sectional Survey • Review • Case Series/Case Reports • Controlled Clinical Trials – Multicenter Studies – Crossover Design 1. 使用Limits/Additional Limits中的Publication Type篩選，例如RCTs 2. 使用Map Term to Subject Heading查詢，再以And交集，如Cohorts Studies a) Systematic Review in Medline • Systematic Review in Medline – 包含以下類型文獻 • • • • • • systematic reviews meta-analyses reviews of clinical trials evidence-based medicine consensus development conferences Guidelines – 使用方式： • Additional Limits Subject Subsets Systematic Reviews 詳細檢索策略可參考： – http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_subsets/sysreview s_strategy.html 選擇Systematic reviews b) 使用Publication Types 選擇RCTs c) 利用MeSH查詢 未設置在Publication Type中的使用MeSH查詢 3. 臨床問題類型：Clinical Queries 31 Clinical Queries (I) Strategy Type Therapy 治療 Diagnosis 診斷 Prognosis 預後 Optimizatio n Sens / spec / prec / acc(%) Sensitivity 99 / 70 / 10 / 71 clinical trial.mp. OR clinical trial.pt. OR random:.mp. OR tu.xs Specificity 93 / 97 / 54 / 97 randomized controlled trial.pt. OR randomized controlled trial.mp. Optimized 96 / 95 / 39 / 95 randomized controlled trial.pt. OR randomized.mp. OR placebo.mp. Sensitivity 99 / 74 / 1 / 74 sensitiv:.mp. OR diagnos:.mp. OR di.fs. Specificity 65 / 98 / 11 / 98 specificity.tw. Optimized 93 / 92 / 3 / 92 sensitiv:.mp. OR predictive value:.mp. OR accurac:.tw. Sensitivity 90 / 80 / 2 / 80 incidence.sh. OR exp mortality OR follow-up studies.sh. OR mortality.sh. OR prognos:.tw. OR predict:.tw. OR course:.tw. Specificity 52 / 94 / 3 / 94 prognos:.tw. OR first episode.tw. OR cohort.tw. Optimized 83 / 84 / 2 / 84 prognosis.sh. OR diagnosed.tw. OR cohort:.mp. OR predictor:.tw. OR death.tw. OR exp models, statistical Ovid Syntax Sensitivity/sens = 敏感度; Specificity/spec = 特異性; Optimized=最佳化; prec = 精確性; acc = 準確性 Clinical Queries (II) Strategy Type Reviews 評論 Clinical Prediction Guides 臨床預測指引 Qualitative Studies 質化研究 Optimization Sens / spec / prec / acc(%) Ovid Syntax Sensitivity 99.9 / 52 / 3 / 53 search:.tw.OR meta analysis.mp,pt.OR review.pt.OR di.xs. OR associated.tw. Specificity 71 / 99.2 / 57 / 99 MEDLINE.tw.OR systematic review.tw.OR meta analysis.pt. Optimized 98 / 91 / 14 / 91 meta analysis.mp,pt.OR review.pt.OR search:.tw. Sensitivity 96 / 79 / 1 / 79 predict:.mp. OR scor:.tw. OR observ:mp. Specificity 54 / 99 / 12 / 99 validation.tw. OR validate.tw. Optimized 90 / 90 / 2 / 90 predict:tw. OR validat:.mp. OR develop.tw. Sensitivity 95 / 70 / 2 / 70 interview:.tw. OR px.fs. OR exp health services administration Specificity 61 / 99 / 37 / 99 qualitative.tw. OR themes.tw. Optimized 92 / 92 / 7 / 92 interview:.mp. OR experience:.mp. OR qualitative.tw. Sensitivity/sens = 敏感度; Specificity/spec = 特異性; Optimized=最佳化; prec = 精確性; acc = 準確性 Clinical Queries (III) Strategy Type Etiology 病因 Costs 成本 Economics 成本效益 Optimization Sens / spec / prec / acc(%) Sensitivity 93 / 63 / 2 / 63 risk:.mp. OR exp cohort studies OR between group:.tw. Specificity 51 / 95 / 6 / 95 relative risk:.tw. OR risks.tw. OR cohort stud:.mp. Optimized 83 / 83 / 3 / 83 risk.mp. OR mortality.mp. OR cohort.tw. Sensitivity 100 / 96 / 13 / 96 ec.fs. OR cost.tw. OR health care costs.sh. Specificity 57 / 99.5 / 37 / 99 cost effectiveness.tw. OR health care costs.sh. Optimized 98 / 98 / 18 / 98 exp "costs and cost analysis" OR costs.tw. OR cost effective:.tw. Sensitivity 100 / 94 / 1 / 94 randomized controlled trial.pt. OR cost effectiveness.tw. OR cost effective.tw. Specificity 51 / 99.4 / 6 / 99 cost effective.tw. OR sensitivity analys:.tw. Optimized 97 / 96 / 2 / 96 Ovid Syntax cost:.mp. OR cost benefit analys:.mp. OR health care costs.mp. Sensitivity/sens = 敏感度; Specificity/spec = 特異性; Optimized=最佳化; prec = 精確性; acc = 準確性 實用檢索小技巧 • 關鍵字檢索技巧 • 布林邏輯的應用 – 輸入查詢詞彙時(不適用於Basic Search) – 在Search History使用And/OR/NOT • SubHeading的進階應用 關鍵字檢索技巧 • 切截字：$或* – 可以查出所有字首相同之關鍵字 • depress $：depress, depressive, depressants, depressor…… • rat$：rat , rate, rationalize, ratify…… – 查出有相同字首且字尾不少於特定字母數的關鍵字 • dog$1 ：dog, dogs…（但是不會查dogma） • #和? ( 前方最少需2個字元以上) – #：關鍵字有一個字母不確定或單複數變化 • wom#n ：woman、women • dog# dogs（但是不會查到dog） – ?：美式與英式英文的差異或不確定關鍵字是否包含該字母 • colo?r ：color, colour • dog?：dog, dogs 布林邏輯與運算元 運算元 範例 OR •(pregnancy or birth).ti. •1 or 2 or 3 or 5＝or/1,2,3,5＝or/1-3,5 AND •(pregnancy and birth).ti. •1 and 2 and 3 and 5＝and/1,2,3,5＝and/1-3,5 Not 排除 •(education not patient education).ti. •safety not patient safety.ti.⇒safety.mp not patient safety.ti •safety not patient safety⇒safety.mp not patient safety.mp •1 not 2 AdjN 指定距離 •physician adj5 relationship •(information adj3 retrieval).tw. Freq 關鍵字出 現頻率 •blood pressure.ab./freq=10 •(information adj3 retrieval).tw./freq=5 一次僅指定一個欄位；且組合型欄位如SO無法使用Freq. 在Search History中以And/Or合併查詢 • 勾選兩個以上檢索項目時會顯示And/Or功能 • 例外：使用Basic Search表示已輸入所有關鍵字， 故不顯示And/Or功能 手動輸入Not指令 副標題詞（SubHeadings）的進階應用 • MeSH除了目前已提供的標題詞（Subject Heading），另外 亦提供83個對應主題上的副標題 (http://www.nlm.nih.gov/mesh/topsubscope2008.ht ml) • 副標題詞幫助讀者找尋描述某一標題詞特定觀點資料 • 這些副標題給予2個字母的代碼來表示，如副標題Nursing 即以NU表示，更能方便檢索進行。 • 副標題詞的查詢： – Floating Sub-Heading (FS)：指定特定副標題詞查詢 – Exploded Sub-Heading (XS)：某些副標題詞實際上又可以被歸類成 同一類主題，目前共有31類。當我們需要查詢同一類的副標題，譬 如ae.xs，就表示查詢包含Adverse Effects、Poisoning和Toxicity這 三類副標題的文獻。 例：Viagra在臨床上被用於治療女性哪些疾病？ • 建議步驟： 1. 2. 3. 4. 利用Basic Search查詢Viagra，以協助獲得正式學名 使用Advanced Search嘗試精確查詢 將1和2的結果以OR聯集合併 使用Search Field功能，勾選 Floating Subheading欄位，輸 入Drug Therapy 5. 將3的結果與4以And合併 6. 指定女性或排除男性的文獻 1. 2. 指定女性：Limit指定Female 排除男性：先Limit男性，再將5的結果以Not排除掉Limit男性的結 果 7. 篩選臨床文獻的證據等級/問題類型 My Workspace 1. 註冊個人帳號： 使用My Workspace之前，必須建立一個專屬的帳 號密碼 2. My Projects： 本空間用來儲存個人研究專案資訊 3. My Searches & Alerts： 本空間用來儲存主題研究的檢索歷史，以及設定資 料庫自動查找個人正在研究的資訊 4. My eTOC： 若對於特定Ovid收錄期刊有興趣，可透過此功能設 定，讓系統自動通知我們期刊的新訊 1. 註冊個人帳號 • - 說明： 1.如已有個人帳密，請直接於欄位中輸入個 人的帳號密碼 2.若忘了個人帳密，可以點選上方Forgot your Personal Account password？來查詢 3.如還未有個人帳密，請點選上方Create a new Personal Account建立 建立個人帳密 說明： 1.依序填入各欄位資訊 2.其中有 * 號欄位為必填欄位 2. My Projects 說明： 1.My Project提供讀者一個專屬的個人知識中心，可以 用以儲存個人有興趣的資訊、建立研究專案。 2.除了Ovid資料庫查詢到的結果資料可以儲存於My Projects裡之外，非Ovid資料庫查找到的資料，或是原 本已經儲存在個人電腦的文獻、圖片，統統可以上傳至 本空間，已達到資訊有效的管理 3.由外部（即非Ovid資料庫）來源的資料，有50MB的 總量管制。 2. My Projects-三大主要分類 顯示現在正在執行的專案 （若沒有現行專案，可透過點選Creat a New Project建立。 已完成，或是不再進行的專案，可以放至於此區，以與現行 專案區隔開。 取消的專案或資料夾會置於此 --項目放置於垃圾欄內30天后將被永久刪除 2.1 My Workspace-專案建立 點選建立新的 專案 Caries & Xylitol Can Xylitol to be used to prevent caries ? 輸入專案名稱與說明 2.2 My Projects進一步做資料夾分類 透過點選Manage Projects上方的Actions可以新增專案主題 資料夾(New Folder)，作為資料進一步分類。 2.3 My Projects-進行資料儲存 v 說明： 1.勾選上方的All，可以一口氣 選取所有檢索結果 2.點選Add to My Projects以指 定儲存專案 指定儲存在現有 專案名稱下 2.4 My Workspace-資料儲存完成！ 2.5 My Projects-從個人電腦上傳 透過Manage Projects上的Actions指 令，選擇Upload Files，可以將儲存 在個人電腦中的資料，上傳道My Projects已達到資訊集中管理！ 選擇欲上傳的檔案後，點選Add 最後再點選Attach to Project 數量從279變成280囉！ （上傳成功！） 2.6 My Project- 手動輸入文獻資料 透過Create Citation功能，可以自 行手動新增文獻資訊 選擇類型 輸入文獻篇名 如有附加 檔案，可 由此一併 上傳 作者名 期刊名 出版卷 出版期 文獻頁碼資訊 輸入出版日期 數量從280變成281囉！ （手動建置成功！） **哪些資料可以加入到My Projects？ – – – – – – – – – – – Uploaded files （上傳檔案） Ovid Results （Ovid檢索結果） Ovid Universal Search results （ Ovid Universal檢索結果） Saved Searches （儲存的檢索歷史） Journal Articles – PDF or HTML （期刊文章全文– PDF or HTML ） Images （圖像） Text Snippets （文本剪貼） User-created Citations （客戶自己生成的書目） Book Chapter （電子書章節） Journal Issue List result （期刊目次結果） Auto-Alert results （儲存專題摘錄） Ovid資料庫的全文 加入期刊全文中的圖像Journals@Ovid • 加入期刊全文中的圖像Journals@Ovid 文章中的特定一段文字 • 利用剪貼工具來剪貼全文中的一段文字 ** My Projects儲存空間:50 MB • 備註： 從OvidSP加進的參考資料，全文，圖像等， 並不佔用儲存空間（而是用鏈接指向原有參考資 料） • This minimizes storage overhead – and Assures access is based on a current subscription ** My Projects如同個人資料庫 除了可以儲存資料，還可匯出 • 當您選擇某一專案時，專案內容將顯示 • 用戶可編輯或刪除項目 • 輸出– 列印，電子郵件，輸出或移除 3. My Searches & Alerts • My Searches & Alerts記錄我們曾經儲存過的檢索歷史 • 方便我們重新登入資料庫時，系統自動協助我們重新執行查詢的動作 • 同時，也可以利用所謂的Auto Alerts功能，讓系統訂期執行查找動作，並將 新的資訊通知我們，節省我們經常查資料庫的時間！ 3.1 儲存新的檢索歷史 在檢索作業全部完成後，點 選Save Search History進 行檢索歷史儲存 說明： 1.Temporary (24 hours)：系統暫時儲存資料，24小時候自動刪去 2.Permanent：永久儲存，直到手動刪除 3.AutoAlert (SDI)：專題選粹服務，系統定期重新執行查詢動作，併通知或匯入專案資料 中 4.My Projects：單純將檢索歷史儲存於My Projects中 3.1 儲存檢索歷史為AutoAlert I. 1 2 3 4 5 1. 選擇儲存為AutoAlert (SDI) 2. 選擇系統自動查詢的週期 3. 新的查詢結果通知的方式 3.1利用Email 3.2利用RSS (需要有RSS Reader) 3.3 利用My Projects(系統自動將新的 檢索結果匯入特定專案資料夾） 4. Email的方式：以附加檔案or 直接顯示 於信件內文中 5. 是否包含檢索歷史 3.1 儲存檢索歷史為AutoAlert II. 6 7 9 8 6. 7. 8. 9. Email內文是否包含資料連結 Email的內容要包含資料哪些欄位 Email的文獻格式 文獻資料排序準則（可不選） 3.1 儲存檢索歷史為AutoAlert III. • 若Delivery Options（傳送選項）同時有勾選My Projects • 請記得指定之後新資料要匯入的資料夾，最後點選SAVE即完成 Searches & Alerts 新增完成！ 問題與討論 飛資得資訊 [email protected]