Transcript Proteiner og enzymer

Proteiner
- Opbygning og Funktion
Af Christian Bukh
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 2
Det Centrale Dogme
- Fra gen til protein
Raven & Johnson
http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/bil150.htm
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 3
Strukturelementer - Byggeklodser
Primær
- sekvensen
NH3+
COO-
R
Aminosyre
Sekundær
Tertiær
Kvartenær
Raven & Johnson
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 4
Primær struktur –
Dannelse af Peptidbindingen
Aminosyre
Peptidbinding
Garrett & Grisham
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 5
Sidekæderne - R
Lehninger
Voet & Voet
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 6
Aminosyrerne - Oversigt
Lehninger
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 7
Stabilitet af den tertiære
struktur
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 8
Sekundær struktur - α-helix
3.6 aminosyre per
turn med en
afstand på 5.4 Å
O(i) til N(i+4):
hydrogen binding
Voet & Voet
Lehninger
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 9
Sekundær struktur – α-helix
Myoglobin – α-Helix-holdigt protein
1mbo.pdb
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 10
Sekundær struktur - β-sheet
Parallel
Anti-parallel
Stryer
Stryer
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 11
Sekundær struktur - β-sheet
β-Sheet – immunoglobolin
8fab.pdb
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 12
Tertiær struktur
• Den overordnede
3-dimentionelle
struktur
• Rummelig
opbygning
• Nærmeste
rummelige nabo
kan have primær
adresse langt
væk !?
Myoglobin
1mbo.pdb
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 13
Kvartenær struktur
Hæmoglobin
- Kompleks med 4 subunits
1bab.pdb
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 14
Denaturering
• Stabilitet af proteinstrukturen ødelægges
• Faktorer i spille:
– pH – påvirker hydrogenbindinger og
ladninger af sidekæder (Destabiliserende)
– Detergenter (sæbe og alkoholder) –
hydrofobe regioner påvirkes
(Destabiliserende)
– Salte – Kan have positiv
(stabiliserende) eller negativ
(destabiliserende) effekten
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 15
Insulin
• Peptid-hormon
• Regulering af glucose-niveau i blodet
• Udtrykkes ikke ved Type 1 diabetes
(almindelig sukkersyge)
• Udtrykkes i bugspytkirtlen som
proinsulin - peptidstreng på 84
aminosyrer
Proinsulin  Insulin
Enzym


Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 16
Enzym
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 17
Ekspression af insulin
Gen fra menneske klones
http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/150/gene/c7.20.4.insulin.jpg
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 18
Enzym - funktion
Ikke katalyseret
Katalyseret
Pr. sec
Raven & Johnson
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 19
Enzym - katalyse
Raven & Johnson
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 20
Enzymer og pH
Giver normalt information om sidekæderne, der indgår i reaktionen
Raven & Johnson
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 21
Enzymer og Temperatur
Stabilitet af termostabile enzymer. Ofte grundet øget antal hydrogenbindinger.
Raven & Johnson
Chr Bukh
KU-LIFE
Slide 22
Alkohol dehydrogenase
Substratbinding og adgang for substrat
1adb.pdb