Transcript 核酸等温扩增技术(三)
LAMP的优点 操作简单,LAMP核酸扩增是在等温条件下进行,产 物检测用肉眼观察或浊度仪检测沉淀浊度即可判断。 对于RNA的扩增只需要在反应体系中加入逆转录酶 就可同步进行(RT-LAMP),不需要特殊的试剂及仪器。 快速高效,因为不需要预先的双链DNA热变性.避 免了温度循环而造成的时间损失.核酸扩增在l h内 均可完成。 高特异性,由于是针对靶序列6个区域设计的4种特 异性引物。6个区域中任何区域与引物不匹配均不能 进行核酸扩增。故其特异性极高。 高灵敏度,对于病毒扩增模板可达几个拷贝,比PCR 高出数量级的差异。 LAMP的缺点 •由于LAMP扩增是链置换合成,靶序列长度最 好在300 bp以内。>500 bp则较难扩增。故不能 进行长链DNA的扩增。 •由于灵敏度高。极易污染而产生假阳性结果。 故要特别注意严谨操作。 •在产物的回收鉴定、克隆、单链分离方面均 逊色于传统的PCR方法。 •引物设计复杂。 依赖于核酸序列的扩增 依赖于核酸序列的扩增(nucleic-acid sequence-based amplification, NASBA)是一项 以RNA为模板的快速等温扩增技术。 由加拿大Can-gene公司1991年首先发明。 主要用于RNA检测,具有高度敏感性和特异 性。 NASBA技术原理 NASBA技术是由2个引物介导的、连续均一的 特异性体外等温扩增核酸序列的酶促反应。 反应主要依赖于AMV逆转录酶、RNase H、 T7 RNA聚合酶和2个特殊设计的引物。 其中引物1长度为45个碱基左右,3’端约20个 碱基与靶序列互补,5’端具有被T7 RNA聚合 酶识别的启动子序列;引物2长约20个碱基, 5’端与靶序列RNA相同。 NASBA扩增过程 NASBA反应分为2个作用相:非循环相和循环相。 非循环相:引物1与模板RNA结合,经AMV逆转录 合成一条cDNA,形成DNA-RNA杂合体,RNase H 将杂合体中的RNA降解。引物2再与单链DNA结 合,AMV催化合成双链DNA。引物1带有T7 RNA 聚合酶的识别位点,T7 RNA聚合酶以DNA链为模 板合成RNA。然后由此进入循环相。 产物检测 电泳分析 杂交技术 电化学发光 NASBA技术的优点 等温扩增 快速高效 特异性高 灵敏度高 设备简单 NASBA的缺点 扩增长度受到限制 最适长度一般为100—250bp 随着检测技术的发展扩增产物对检测技术提出了更高 的要求。 酶不耐热。 扩增产物是单链RNA,后续操作较复杂.