Transcript 核酸等温扩增技术(二)
扩增原理
60—65℃是双链DNA复性及延伸的中间温度,DNA在
65℃左右处于动态平衡状态。因此,DNA在此温度下合
成是可能的。利用4种特异引物依靠一种高活性链置换
DNA聚合酶。使得链置换DNA合成在不停地自我循环。
扩增分两个阶段
第1阶段为起始阶段,任何一个引物向双链DNA的
互补部位进行碱基配对延伸时,另一条链就会解离,
变成单链。上游内部引物FIP的F2序列首先与模板
F2c结合。在链置换型DNA聚合酶的作用下向前延
伸启动链置换合成。外部引物F3与模板F3c结合并
延伸,置换出完整的FIP连接的互补单链。FIP上的
F1c与此单链上的Fl为互补结构。自我碱基配对形成
环状结构。以此链为模板。下游引物BIP与B3先后
启动类似于FIP和F3的合成,形成哑铃状结构的单
链。迅速以3’末端的Fl区段为起点.以自身为模板,
进行DNA合成延伸形成茎环状结构。该结构是
LAMP基因扩增循环的起始结构。
第2阶段
是扩增循环阶段。以茎环状结构为模板,FIP与
茎环的F2c区结合。开始链置换合成,解离出的
单链核酸上也会形成环状结构。迅速以3’末端
的B1区段为起点,以自身为模板。进行DNA合
成延伸及链置换.形成长短不一的2条新茎环状
结构的DNA,BIP引物上的B2与其杂交。启动新
一轮扩增。且产物DNA长度增加一倍。在反应
体系中添加2条环状引物LF和LB,它们也分别与
茎环状结构结合启动链置换合成,周而复始。
扩增的最后产物是具有不同个数茎环结构、不
同长度DNA的混合物。且产物DNA为扩增靶序
列的交替反向重复序列。
产物检测的原理
电泳分析
荧光检测
浑浊度检测