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Recherche documentaire en médecine 2014

[email protected]

Poste 68920

“Citing Wikipedia Don’t do it—Wikipedians wouldn’t”

• Rasberry L. Citing Wikipedia. BMJ [Internet]. 6 mars 2014 [cité 20 mars 2014];348(mar05 4):g1819-g1819. Disponible sur: http://www.bmj.com/cgi/doi/10.1136/bmj.g1819

Problématique

• Rechercher une info ou faire une recherche biblio ?

Une bibliographie prend du temps et doit se faire en amont.

« Interroger PubMed demande du temps si vous formulez selon le langage et la syntaxe de l’interface et si vous reformulez en fonction du résultat. Un temps acceptable quand il s’agit d’établir la bibliographie d’un article ou d’une thèse. Un temps considéré (à juste titre ?) comme trop long pour répondre à une question clinique. » Eveillard P. PubMed : les Clinical Queries en perdition [Internet]. 2013 [cité 13 janv 2014]. Disponible sur: http://docedu.fr/WordPress/archives/1081

Formuler sa question

• • • Les trois premières étapes d'une recherche documentaire sont : Formuler son sujet Dégager les concepts liés au sujet Traduire les concepts en mots-clés http://arbradoc.bu.univ-paris8.fr/#nid5231

Formuler sa question : les critères PICO

http://goo.gl/uL0pcg

scholar.google.fr

pubmed.gov

Quelle source utiliser ?

Contenu

Toutes disciplines

Langage

Toutes

Nombre de références

?

>100 millions

Accès à l’information

Payant et gratuit Accès facilité aux PDF Biomédecine et santé >80% 23 Millions Indirect Payant et gratuit Santé 100 000 Gratuit www.cismef.org

Vocabulaire contrôlé

Non Oui Oui www.bdsp.ehesp.fr

Santé publique majoritairement 470 000 1/6 en accès libre Oui

www.cismef.org

http://www.chu-rouen.fr/cismef

Recenser et décrire les principales ressources en accès libre et gratuit dans le domaine médical de sources institutionnelles et professionnelles.

+ 1000 pages surveillées par jour 100 000 Ressources

Reconnaissance des concepts médicaux Gestion synonymie et singulier/pluriel

Explosion Recherche implicite

Tri basé sur la date et sur l’adéquation avec les termes de recherche, score de « pertinence »

Facettes pour affiner les résultats

Exercices pratiques

• • • • Trouver des ressources sur l’anatomie de la colonne vertébrale Combien recense-t-on de sites associatifs qui traitent des MICI ?

Trouver des ressource pour informer des patients sur les sarcomes Quel sont les conclusions actuelles de la collaboration Cochrane concernant le dépistage du cancer du sein par mammographie ?

L’indexation MeSH Un concept peut être transcris de 1001 façons. Utiliser un vocabulaire contrôlé permet de pallier cette difficulté.

  

Portail Terminologique de Santé

www.hetop.eu/ (Health Terminology / Ontology Portal) Une source d’information (+ ou – un dictionnaire médicale) Un outil d’interrogation de CISMeF et PubMed.

Pour retrouver un terme, il est possible de ne taper qu’une partie de ce terme (troncature gauche et droite par défaut) Description du terme correspondant Navigation dans les arborescences Accès vers les ressources Zone des résultats

Options de recherche Les choix proposés diffèrent selon les termes

Exercices pratiques

- Quelle est le nom de la substance active du DISTILBENE ? De quelle sorte de composé chimique s’agit-il ?

- Qu’est-ce que la Maladie de Kawasaki ?

- Touver les bons termes MeSH pour : • « Excès de Choléstérol » • « Enfant diabétique » • « Chirurgie de l’obésité » • « Chirurgie des Polypes intestinaux » • « corticothérapie » • « e-cigarette »

www.pubmed.gov

PubMed

principal accès gratuit à Medline

Medline

Medical Literature Analysis and Retrieval System Online U.S. National Library of Medicine base de données bibliographiques (articles uniquement)

Contenu de PubMed

biomédecine et santé De 1966 à aujourd’hui + de 4800 journaux scientifiques indexés 23 millions de références 9 articles sur 10 sont publiés en anglais 70% des références ont des résumés

Recherche simple : interprétation

• Une recherche simple est interprétée pour apporter le maximum de réponse : « Automatic Term Mapping Process » Explosion :

Limitations

Disponibilité Date Nature des articles Langue(s) Regroupements thématiques ou pratiques Autres : tranches d’âge etc.

[TIAB] [journal] [title] [TI] [author] [affiliation] [Abstract] [pmid] [Publication type] [MeSH Terms] [MH] [MeSH Major Topic] [MAJR]

Recherche avancée

Construction pas à pas de l’équation Liste de propositions : auteurs, titres de journaux etc.

AND OR NOT

Related Articles

Tous les articles sur le même sujet, triés par pertinence.

Méthode efficace pour commencer une bibliographie.

Exercices pratiques

• • • Quelles sont les dernières publications de Françoise Barré Sinoussi ?

“The New England journal of medicine” a-t-il publié sur Ebola ?

Quelles sont les options médicamenteuses pour traiter la maladie de Crohn ayant fait l’objet d’une meta-analyse ?

Clipboard, le « panier »

Le « clipboard » conserve une sélection temporaire de références.

500 références sont conservées.

Le panier est vidé au bout de 8 heures d’inactivité.

Export

« file » Fichier texte sans mise en forme « clipboard » sélection temporaire (panier) « collections » sélection durable « e-mail » envoi direct par courrier (200 réf max.)

My NCBI

Sauvegarde des recherches Alerte par courrier électronique

Manier les résultats

http://www.zotero.org/

Les +

Tri « pertinent » Accès facile aux PDF Export biblio

Les -

Limites floues Pas de vocabulaire contrôlé Références incorrectes http://scholar.google.com/scholar?q=TGFBR1 VS http://scholar.google.com/scholar?q=+transforming+growth+factor+beta+type+I+receptor

Accéder aux articles

Le lien vers l’éditeur est souvent payant Utiliser les canaux : - Bibliothèques hospitalières et universitaires.

- Demande aux auteurs - Commandes BIUS http://www.biusante.parisdescartes.fr/ http://goo.gl/yMdXxk - RefDoc http://www.refdoc.fr/

2 nouveaux outils

Projet BDBfr • La littérature secondaire en langue française • http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/ Constructeur de Requêtes Bibliographiques Médicales • http://cispro.chu-rouen.fr/querybuilder/ (URL non définitive)

Des questions ?

http://www.chu-rouen.fr/documed/tdcismef.ppt

Gaétan Kerdelhué bibliothèque médicale / équipe CISMeF Cour Leschevin, porte 21, 3ème étage [email protected]

02 32 88 89 20 (68920)