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6.2 Transcription : Transferring Information From DNA To RNA * Ribonucleic Acid (RNA) . mRNA . DNA의 coding or sense strand ---- RNA ----- protein synthesis . cistron . monocistronic mRNA polycistronic mRNA . leader . attenuator 함유 . spacer .intercistronic sequence (보통 10개 염기) . tRNA . primary transcripts 가아닌증거 . posttranscriptional modification processing . Processing of tRNA Molecules . E. coli tRNATyr . 85 nucleotides . Two copies of the tRNATyr 350 nucleotides 200 nucleotides ; spacer . 3단계 성숙단계 1. Formation of the 3'-OH terminus endonuclease ; hairpin loop 인지 exonuclease ; CCA 인지 (RNase D) 2. Formation of the 5'-P terminus RNase P ; 3차원구조 전체를 인식 Ribozyme ( 86% RNA, 14% Protein) 5‘ 말단형성 ---- RNase D 가 두개의 3 말단 nucleotide 제거 ---- 완전한 tRNA분자 형성 3. Production of the modified bases 2 uridine ; pseudouridine (ψ) 2 uridine ; 4-thiouridine (4tU) 1 adenosine ; isopentenyladenosine (2ipA) . CCA-3'-OH 가 아닌경우 . tRNA nucleotidyl transferase ; CCA 첨가 . rRNA . Processing of Ribosomal RNA in E. coli . 3종류의 rRNA 5S ; 120 16S ; 1541 23S ; 2904 여러개의 tRNA분자들과 함께 . 16S rRNA-tRNAIie-tRNAAla-23S rRNA-5S rRNA-tRNAAsp-tRNATrp * Synthesis of RNA * Enzymatic synthesis of RNA . RNA 합성의 화학적 특징 . precursors ; the four ribonucleoside 5'-triphosphates (rNTP) . 5' ---> 3' phosphodiester bond . DNA 염기서열에의해 결정 . 한가닥만 주형으로 사용 . primer 불필요 . 5’ 말단은 3인산 . E.coli RNA polymerase . 2개의 α subunits, β 와 β‘, σ ; 5개의 단위체 . σ ; 쉽게분리 . 매우크다 * Initiation and Termination of Transcription . RNA합성 4단계 . RNA polymerase 결합 . chain elongation . initiation . chain termination and release * Transcription signals . DNA 분자에 RNA polymerase 결합 . promoter . RNA polymerase 특정 염기서열인식 부착-----> DNA open ----> transcription ( σ 단위체와 보조단백질에의해) . pribnow box . 전사될 첫번째 염기부터 5-10번째 . TATAAT의 변형 ;consensus sequence 진핵세포 ; TATAAA (TATA or Hogness box) . conversed T (6-9 번째) . RNA polymerase 의 방향성 (downstream, upstream) open-promoter complex . promoter에따라 다르지만 대략 -21 과 -4 사이에있다. . -35 sequence . 9개의 염기로구성 (TCTTGACAT) . RNA polymerase 붙는 최초의 자리 . σ 단위 결합 --- pribnow box 와 붙는다 ---- 가장 왼쪽 인지 자리 로부터 분리 . Open-promoter complex * RNA 합성개시 . RNA polymerase initiation site ; ATP,GTP와 결합 대개 ATP가 첫번째 염기 elongation site . 첫번째 전사되는 DNA ; T . 상보적인 DNA와 수소결합 . 신장단계 * Termination of Transcription . Simple terminator Termination factor 요구 . 100종의 특정염기서열 . 3 주요부위 1 inverted-repeat base sequence containing a central nonrepeating segment 2 high G + C content 3 A.T pairs . 2가지 종결유형 1 DNA 염기서열에만 의존 2 Rho ; terminatin protein . core enzyme 이 DNA 로부터 분리 σ 와 다시 결합 * Post-Transcriptional Modification of RNA . Summary of Processing in Prokaryotes 1. All stable RNA molecules are processed; mRNA molecules are not processed, except for a few phage RNAs. 2. About ten nucleases account for all of the cuts. The endonucleases always genrate a 5'-P and a 3'-OH group. 3. The 3'-OH ends are generally formed by exonucleases; 5S rRNA may be an exception. 4. Many processing enzymes are not sequence-specific but recognize large structural features. 5. Bases other than A, U, G, and C are formed by enzymatic modification of bases already present in otherwise completed molecules.