Transcript RM_2dan_Pronalazenje_informacija_2014

Pretraživanje medicinskih
informacija na internetu:
baza podataka MEDLINE
Zdravstveni studiji
Split, srpanj 2013.
Što su baze podataka?




Organizirane zbirke podataka
Svaka se baza podataka sastoji od zapisa
Zapisi sadrže određena polja s točno
određenim podatcima
Svako polje ima:



Nepromjenjivi naziv (npr. Authors)
Promjenjivi sadržaj (npr. Tomic S, Markotic A…)
Neka polja nose različite nazive u različitim
bazama iako im je sadržaj isti
Kako nastaju?


Baze podataka izrađuju strukovna udruženja,
knjižnice, profitne i neprofitne udruge…
Stvaraju ih stotine stručnjaka različitih profila:



Knjižničari – definiraju strukturu baze podataka
kako bi bili uključeni svi potrebni elementi koji
opisuju rad
Računalni stručnjaci – izrađuju bazu i sučelja te
brinu o tehničkoj podršci
Indekseri – radovima pridodaju ključne riječi
kojima opisuju sadržaj
Vrste baza podataka

Osnovne vrste su:





Bibliografske baze podataka
Citatne baze podataka
Baze podataka s cjelovitim tekstom
Postoje i druge (npr. tekstualno-numeričke), ali su tri
navedene najvažnije za pronalaženje podataka o
izvornim znanstvenim i stručnim radovima
Mnoge baze podataka su kombinacija dviju ili više
osnovnih vrsta
Bibliografske baze podataka




Temeljni sekundarni izvor podataka
Sadrže osnovne podatke o primarnim izvorima
(objavljenim radovima): autor/i, naslov rada, naslov
časopisa, godina/svezak/stranice, naziv ustanove i sl.,
ključne riječi, sažetak…
Razlikuju se prema znanstvenim područjima koja
obuhvaćaju, broju časopisa, knjiga i drugih publikacija
koje obrađuju, strukturi i opsegu bibliografskoga zapisa
(neke baze opisuju svaki rad s desetak polja, a neke s
tridesetak i više) te dodatnoj obradi (predmetnice)
Služe za stjecanje uvida u određeno znanstveno
područje
Najvažnije bibliografske baze u
području medicine



MEDLINE
EMBASE
Current Contents




Clinical Medicine
Life Sciences
PsycINFO
CINAHL
Kako pristupiti?
Centar za online baze podataka
http://www.online-baze.hr
ili preko mrežnih stranica
knjižnice
Mogućnosti pristupa

S računala iz mreže ustanove koja je unutar sustava
znanosti i visokoga školstva (unutar CARNetove mreže)

S bilo kojeg računala preko proxy servera za sve
korisnike koji imaju elektronički identitet u sustavu
AAI@EduHr

Preko CARNetovih modemskih ulaza

S bilo kojeg računala za ustanove članice
biomedicinskoga konzorcija za dio baza dostupnih preko
Ovida (potrebna lozinka)
Što je MEDLINE?


Najveća i najpoznatija medicinska baza podataka
MEDLINE obuhvaća:






medicinu
stomatologiju
veterinarske znanosti
sestrinstvo
biološke znanosti
Dostupna nam je preko četiri različita sučelja:




OvidSP
Web of Knowledge
EBSCOhost
PubMed
Osnovni podatci








Stvara je i održava: National Library of Medicine,
Washington, DC.
Pokriva razdoblje od 1940-ih do danas
Sažetke sadržava >75% uključenih bibliografskih zapisa
Obuhvaća časopise iz oko 80 zemalja (oko 50% iz
SAD-a!) na 30-ak jezika
Indeksira oko 5.500 časopisa
Trenutno ima oko 21 milijun zapisa
10 hrvatskih časopisa
Dnevno se ažurira
PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed



PubMed je servis koji pored baze MEDLINE sadrži i
zapise iz časopisa zastupljenih u arhivu
PubMedCentral, podatke uredništava časopisa o tek
objavljenim člancima koji još nisu indeksirani za
MEDLINE i sl.
Sadrži poveznice s arhivom PubMed Central (PMC),
časopisima koji su u slobodnom pristupu i
pretplaćenim časopisima na mrežnim sjedištima
agregatora ili izdavača
Slobodno je dostupan svima
MeSH - Medical Subject Headings





MeSH je jedna od glavnih odlika MEDLINEA
To je kontrolirani rječnik (tezaurus) koji se koristi za
indeksiranje (opisivanje sadržaja) i pretraživanje
biomedicinske literature
Preko 20.000 deskriptora koji su organizirani
abecedno i hijerarhijski
Glavne predmetnice (headings) i potpredmetnice
(subheadings)
Javno dostupan MeSH Browser na adresi
http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html
PubMed
Osnove pretraživanja
Jednostavno tematsko pretraživanje
music therapy pain
U polje za pretraživanje upišu se
odabrane ključne riječi bez
interpunkcija ili operatora.
Što PubMed radi s vašim upitom?
Mapiranje
PubMed najprije traži
odgovarajuće MeSHpredmetnice ako one
postoje, a zatim ih
kombinira s našim
ključnim riječima.
Mapiranje



Mapiranje (engl., mapping) je postupak
povezivanja slobodno odabranih ključnih
riječi s odgovarajućim pojmovima
(predmetnicama) u kontroliranom rječniku
(tezaurusu).
Može se koristiti jedino u bazama koje takav
rječnik imaju (MEDLINE, PsycINFO, ERIC…)
Mapiranje je obično zadana postavka koja se
može prema potrebi isključiti.
Ograničavanje rezultata
Ograničavanje rezultata
postiže se odabirom
nekog od ponuđenih
filtera u lijevom stupcu
PubMeda.
S desne su strane
izdvojeni radovi koji u
naslovu sadrže naše
ključne riječi, kao i radovi
koji su potpuno slobodno
dostupni.
Ograničavanje rezultata
Što se dogodilo?
Broj rezultata je s početnih
442 smanjen na 43.
Klikom na naslov nekog
članka otvaramo njegov
potpuni zapis u bazi.
Ograničili smo
dobivene rezultate na
sustavne pregledne
članke klikom na
Systematic Reviews.
Bibliografski zapis članka
Naslov časopisa, godina,
svezak, broj, stranice, naslov
članka, autori
Sažetak
Izvori cjelovitoga teksta
članka na webu
Tematsko pretraživanje iz MeSH-a
Tematsko pretraživanje
iz MeSH-a možemo
postaviti koristeći
MeSH Database na
početnoj stranici
PubMeda.
Tematsko pretraživanje iz MeSH-a
U polje za
pretraživanje
upišemo našu ključnu
riječ, u ovom slučaju
breast cancer.
Baza nam nudi
dodatni izbor
ključnih riječi koje
možemo odabrati ili
ostaviti svoju.
Baza nam je ponudila
nekoliko MeSHpredmetnica među kojima
izaberemo onu koja nam
najviše odgovara.
U ovom slučaju
odabiremo
Breast
Neoplasms.
Klikom na
predmetnicu
otvaramo njen
zapis.
Dobili smo našu predmetnicu s
popisom svih potpredmetnica
koje uz nju možemo koristiti kako
bismo usmjerili pretraživanje.
Klikom na Add to search
builder dodajemo našu
predmetnicu u polje za
izgradnju strategije
pretraživanja.
Upišemo zatim
drugi ključni
pojam. Klikom na
Search dobivamo
popis predmetnica.
Odaberemo
Early
Detection of
Cancer.
Klikom na Add to
search builder i
odabirom operatora
AND dodajemo drugu
predmetnicu te
pokrenemo
pretraživanje klikom na
Search PubMed.
Dobili smo 764
rezultata koje po
potrebi možemo
dodatno filtrirati.
Da smo isto pretraživanje
postavili na početnoj
stranici PubMeda,
koristeći naše ključne
riječi…
…dobili bismo
15 688 rezultata.
Operatori




Operatori su riječi ili znakovi koji tijekom
pretraživanja vrše točno određenu funkciju
unutar sintaktičke cjeline.
Određuju odnos između ključnih riječi koje se
koriste unutar pojedine sintaktičke cjeline i
unutar same strategije.
Omogućuju preciznije pretraživanje.
Najpoznatiji su i najčešće korišteni Booleovi
operatori.
Booleovi operatori

AND

OR

NOT

George Boole (1815. – 1864.) – engleski matematičar, razvio algebru
sustava koji se sastoji od samo dva moguća stanja
Operator
AND
OR
NOT
Funkcija
 Sužava pretraživanje
 U rezultate su uključeni samo oni radovi koji
sadrže sve riječi ili izraze koji su povezani tim
operatorom
 Proširuje pretraživanje
 Rezultati uključuju sve radove koji sadrže bilo
koju riječ ili izraz koji su povezani tim operatorom
 Uključuje i radove koji sadrže sve korištene
riječi
 Isključuje iz rezultata sve radove koji sadrže
riječ ili izraz koji se nalaze iza tog operatora
 Treba se koristiti veoma oprezno
 Obično se rijetko koristi
Single Citation Matcher
Single Citation Matcher je
koristan alat koji
omogućuje pronalaženje
nekoga članka prema
podatcima kojima
raspolažemo.
Upisali smo elemente
koji su nam poznati,
npr. naslov časopisa,
godinu izdanja i broj
prve stranice članka
te kliknuli na Go.
Locirali smo traženi
članak, odnosno zapis o
njemu u PubMedu.