Transcript 多媒体技术在《结构化学》课程中的应用

《结构化学》多媒体
的制作
Nankai University
§1 《结构化学》素材特点与应用
• 好素材使问题的理解变得非常容易
Atkins “Atkins’ Physical Chemistry”
Nankai University
• 准确：正确表述概念
• 精确：函数、分子和晶体的空间结构等要
求精确反映其特点
• 素材制作要尽可能用专业绘图软件
1s
D(r)
0.4
2p
0.2
2s
3d
3p
3s
0.0
0
Nankai University
5
10
15
r/a0
20
25
结构化学素材类型
矢量图
位图
A. 图片类
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A3堆积中的正八面体空隙
丁二烯电环合反应
该视频来源于PD Dr. Stefan Immel网站
GIF格式
视频格式
体积小,不能控制播放
体积大,不能控制播放
B. 动画类
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氢原子4dz2轨道轮廓图
CaF2型晶体结构
嵌入对象
链接对象
通过嵌入插件播放
通过链接调用外部程序
B. 动画类
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晶体结构数据
MSV
CIF
ENT，PDB
MSI
CSD
Accelry, Viewerlite
Crystallographic Information file
Brookhaven Protein Data Bank
Accelrys, Cerius2
Cambridge Structural Database Crystallographic files
分子结构数据
MSV
ENT，PDB
MOL
MOL2
HIN
Accelry, Viewerlite
Brookhaven Protein Data Bank
Molecular Design, Ltd. (MDL)
Tripos
Hyperchem
C. 结构数据类
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可应用各种
分子模拟软
件处理
常用分子模拟软件
• CS Chemoffice
商业
• Hyperchem 商业
DEMO10天
• GaussView
商业
•
•
•
•
•
•
•
•
学术版Free http://www.knowitall.com/academic/
不再提供支持
注册下载(需要专业显卡) http://accelrys.com/
Free http://www.arguslab.com/
Free http://molekel.cscs.ch/
Free http://www.cmbi.ru.nl/molden/
Free http://gabedit.sourceforge.net/
Free http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
KnowItAll
DS ViewerLite
DS Visualizer
ArgusLab
Molekel
Molden
Gabedit
VMD
Nankai University
http://www.hyper.com/
§2《结构化学》多媒体制作技巧
2.1 图片：矢量图与位图
矢量图—放大不失真，优先选择
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矢量图种类与来源
•
化学结构式、方程式
Chemwin，ChemDraw，ChemSketch等
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• 2D函数图
Origin, Sigmaplot, Excel等
 (x)
| (x)|
2
n=4
+
n=3
+
+
E4= 16E1
-
-
2 2
r R30
3s(n=3, l=0)
0.10
+
-
E3= 9E1
0.05
+
n=2
0.00
0
5
10
r/a0
15
20
25
+
n=1
0
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E2= 4E1
-
x
E1 =
l
0
x
l
h
2
8ml
2
• 示意图等
CorelDraw Chemwin 绘图等
E4 = 
E3 = 

2pz
E2 = 
E1 = 
晶体
石墨
铅准直器
电离室
X射线源
0.0709nm
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0.0731nm
• 3D函数、结构矢量图
Surfer，Chem3D(4.5以前版本)
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•
文件形式的矢量图
可直接使用
WMF
Windows图元文件
EMF
增强图元文件格式
SWF
Flash格式 转化为位图或上面矢量格式
PDF
可携式文件格式
PS
PostScript
CDR
CorelDraw
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• 从PDF文件中截取矢量图的技巧
10%
25%
75%
200%
选择快照工具，选择截取区域，放大，^C拷贝
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• 矢量图调色技巧
x
x
x
鼠标右键—设置图片格式—重新着色
可调整颜色和填充颜色
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x
• 矢量图修改技巧（巧用选择性粘贴）
如得到的矢量图有问题，可利用Powerpoint绘图简单修改，
利用选择性粘贴重新合成新矢量图，拆合自由
CH3
鼠标右键—组合—取消组合，
同意转换对象
再次重复上一操作，将原图拆
为多个元素
修改需要修改的地方，如将C
改为N，将3改为2
将所有元素选上，^X剪切，
Edit—选择性粘贴为Windows
元文件
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NH2
位图类型
BMP、TIFF、PNG、JPEG、GIF等
优先选用没有压缩、单一背景、高像素的图片
位图—放大失真
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• 修饰位图—使用好图片工具栏
亮度
对比度
原图
去单色背景
剪裁
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旋转
2.2 GIF动画与视频
视频来源于Stefan Immel网站 http://csi.chemie.tu-darmstadt.de/ak/immel/
GIF按图片插入
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视频格式：插入—影片和声音—
文件中的影片，可选播放的方式
2.3 嵌入Flash动画
视图—工具栏—选控件工具箱
其它控件按钮—Shockwave Flash Object—鼠标变为十字指
针，拖动鼠标选择嵌入Flash窗口的大小(可用鼠标右击—
设置控件格式精确大小)—鼠标右击—设置属性—movie输
入对象文件名称(包括扩展名)
如双击打开了VB窗口，关闭即可！
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2.4 嵌入VRML对象
注:预先已安装Cortona VRML Client !
控件工具箱“其它控件按钮”—
ParalleGraph Cortona Control—十
字鼠标拖动设窗口的大小(窗口无
边框)
或插入—对象—ParalleGraph
Cortona Control—调整窗口大小
鼠标右击窗口—设置属性—
Scene—浏览…输入对象文件
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2.5 嵌入ViewerActiveX 5.0对象
注:预先已安装Viewer ActiveX 5.0 !
控件工具箱“其它控件
按钮”—Accelrys
Viewer Control50—十字
鼠标拖动设窗口的大
小—鼠标右击窗口—设
置属性—Source—输入
MSV文件
嵌入对象的特点
优点：指定窗口位置显示，版面整齐
缺点：播放不可调窗口
资源占用多
多为绝对路径(改变文件目录位置就出问题)
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2.6 采用链接打开对象
• 建议设定对象（而不是文字）的链接
• 链接打开对象的前提是预先在系统中设定了打开该类型
文件的软件
Flash
Flash
石英晶体外型
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原子轨道VRML