Transcript alela

Péče o biodiverzitu
Jan Plesník
Agentura ochrany přírody a
krajiny ČR Praha
[email protected]
http://www.chm.nature.cz
Genetická diverzita


a)
b)
Týká se
rozmanitosti
genů v rámci
populací a druhů
Popisuje:
odlišné populace
v rámci téhož
druhu
rozdílné jedince v
rámci určité
populace
Genetická diverzita


a)
b)
Obvykle roste se zvyšující se početností
(abundancí) populace
Genetické termíny:
alela – různé formy téhož genu
mutace – změna v DNA, která do
genofondu vnáší změny: je výhradním
zdrojem genetické variability
Genetická diverzita



genofond – soubor všech genů a alel v
populaci
genotyp – určitá kombinace alel jedince
fenotyp – soubor znaků a charakteristik
jedince: anatomické, morfologické,
fyziologické a biochemické vlastnosti,
které jsou projevem jeho genotypu v
určitém prostředí
Genetická diverzita
Kolik genů obsahuje
genom (veškerá
genetická
informace) u
některých druhů?
• Bakterie
1 000
• Cévnaté rostliny
nebo
mnohobuněční
živočichové
400 000
Genetická diverzita
Genomika
• až dosud byl úplný
genom popsán jen u
více než 150 druhů
• člověk
26 000–38 000 genů
(2001)
• dalších 600 projektů
sekvencování genomu
prokaryotních a
eukaryotních
organismů
Genetická diverzita
Nejlépe známa
•
u modelových
druhů molekulární
a vývojové
biologie (E. coli,
Caenorhabditis
elegans)
•
u plemen
hospodářských a
domácích zvířat a
odrůd a kultivarů
plodin
Genetická diverzita
Nejlépe známa
• u hospodářsky
významných
dřevin
• u hospodářsky
významných
mořských ryb
Genetická diverzita

Naše znalosti
genetické diverzity
planě rostoucích
rostlin a volně
žijících živočichů
zůstávají značně
omezené: každý
druh zahrnuje v
průměru 220
odlišných populací
Genetická diverzita
Ochranářská genetika (conservation
genetics)
představuje aplikaci genetiky s cílem
zachovat druhy jako samostatné jednotky
schopné se vyrovnat s měnícím se
prostředím
 zaměřuje se na málo početné populace
cílových druhů planě rostoucích rostlin,
volně žijících živočichů a dalších
organismů

Genetická diverzita
Pokles genetické diverzity se projeví :
• ztrátou konkrétních alel
• poklesem zdatnosti (fitness) organismu
• sníženou přirozenou obnovou populace
 Inbríding (příbuzenské křížení, příbuzenské
oplodnění, příbuzenská plemenitba): koeficient
inbrídingu, inbrední deprese
Genetická diverzita




efekt hrdla láhve
efekt zakladatele kolonizace nového
prostředí nebo
pěstování či chov v
lidské péči
zubr: 12 jedinců,
bělověžská linie 7
jedinců, z toho 3
samice
kůň Převalského: 12
jedinců, projevy
zdomácňování
Genetická diverzita
pravidlo 50/500
 Izolované populace
by měly mít
nejméně 50 a
ideálně 500
jedinců, aby si
udržely svou
genetickou
diverzitu
Genetická diverzita




vír vymírání (vortex)
účinná početnost
populace (EPS) –
počet jedinců,
kteří se v populaci
skutečně
rozmnožují
závisí na více
činitelích
obvykle 10 %
skutečné
početnosti
populace
Genetická diverzita



genetický drift - zvláštní typ přírodního výběru,
založený na náhodě při produkci potomstva,
který nesouvisí s vlastnostmi nebo projevy
selektovaného znaku
U málo početných populací se frekvence alel
náhodně mění z generace na generaci
v závislosti na tom, kteří jedinci se rozmnožují
Jde o kolísání v četnosti výskytu určitého genu
v populaci během určité doby, způsobené spíše
náhodnými událostmi než přírodním výběrem.
Během dalších generací může vést ke změně
složení dané populace
Genetická diverzita

Nezbytný předpoklad pro udržení
evolučních procesů v rámci druhů:
ulehčuje přizpůsobení (adaptace)
druhu na měnící se podmínky
prostředí v průběhu mikroevoluce
„evoluční polévka“
mikroevoluce – současná evoluce
Genetická diverzita

•
•


Zdroj přírodního genetického materiálu
pro zemědělství, lesnictví a rybářství
tradiční postupy (šlechtění, křížení)
moderní biotechnologické postupy:
genové inženýrství (cílené genetické
modifikace
syntetická biologie: tvorba umělých počítačem
navržených organismů (poprvé květen 2010,
dnes viry, bakterie, sinice, řasy)
Genetická diverzita

Biopirátství
Činnost, kdy je konkrétní
genetický materiál nebo
tradiční znalost jeho
využívání získány
bezplatně v rozvojové
nebo postkomunistické
zemi bez jejího
předcházejícího souhlasu a
poté patentován v určitém
hospodářsky vyspělém
státě, nejčastěji
nadnárodní
farmaceutickou nebo
zemědělskou firmou

Bioprospektorování
Genetická diverzita

Genetický zdroj - jakýkoli materiál
rostlinného, živočišného, mikrobiálního
nebo jiného původu, který obsahuje
funkční geny (jednotky dědičnosti), a to
včetně produktů soudobých
biotechnologických postupů
Genetická diverzita




Rovnoprávné a spravedlivé rozdělování
přínosů plynoucích z využívání
genetických zdrojů včetně odpovídajícího
přístupu k nim (ABS): příprava
mezinárodního režimu
Poměr
Sever : Jih
vlastnictví
1
: 4
spotřeba
4
: 1
Genetická diverzita


Více než 70 % léčiv, které vykazují
nadějné výsledky při léčení a předcházení
rakovině, pochází z rostlin, žijících v
tropických deštných pralesích
Alkaloidy z madagaskarské rostliny
Cataranthus roseus zvyšují
pravděpodobnost přežití leukémie u dětí z
původních 5–25 % na 80 %: čistý zisk
farmaceutické firmy 100 milionů USD (2
miliardy Kč) ročně
Genetická diverzita


Geny z rajčete, rostoucího planě
v peruánských Andách, zvýšily roční
prodej této zeleniny v USA z 5 milionů na
8 milionů dolarů (ze 100 na 160 milionů
Kč).
Jediný gen, importovaný z jisté odrůdy
ječmene z Etiopie, se používá na ochranu
kalifornského ječmene před žlutým
trpasličím virem: díky tomuto opatření se
v Kalifornii ročně sklízí ječmen v hodnotě
160 milionů dolarů (3,2 miliardy Kč).
Genetická diverzita



Brazílie křovinář
žararaka: jed ředí
u obětí krev a
snižuje krevní tlak
USA, Velká
Británie izolován
toxin a
syntetizován
analog captocril
1981 USA patent
captoten
Genetická diverzita
V USA patentování částí lidského
genomu
 otázka patentů – pouze inovace
 cena patentů: nejméně milion USD
(20 milionů Kč)
 Světová obchodní organizace
(WTO): uznává pouze patenty

Genetická diverzita
Vhodný příklad
ABS
 sukulent Hoodia
gordonii
 roste v poušti
Kalahari v Namibii
a Botswaně
Sány (Křováky)
využíván k tlumení
pocitu hladu a
žízně

Genetická diverzita


nejúčinnější
prostředek na
snižování
hmotnosti
Jihoafrická rada
pro vědecký a
průmyslový
výzkum, která
preparát z rostliny
patentovala,
vyplácí Sánům 10
% ze zisku
Genetická diverzita
Tři hlavní cíly Úmluvy o biologické rozmanitosti
(CBD)
 ochrana biodiverzity na všech jejích úrovních
(genetická, druhová, ekosystémová + kulturní)
 2) udržitelné (rozumné, moudré) využívání jejích
složek
 3) spravedlivé a rovnoprávné rozdělování
přínosů z využívání genetických zdrojů,
zahrnující spravedlivý přístup ke genetickým
zdrojům, odpovídající přenos významných
technologií, přičemž je nutné brát v úvahu
všechna vlastnická práva, a přiměřené
financování (ABS)
Genetická diverzita
10. zasedání konference smluvních stran CBD,
Nagoja, říjen 2010
 Sjednán Protokol pro přístup ke genetickým
zdrojům a spravedlivému sdílení přínosů z jejich
využívání
 kompromisní text po 12 letech vyjednávání
 úprava vztahů mezi poskytovateli a uživateli
genetických zdrojů
 souhlas poskytovatele nutný ještě před získáním
zdroje
 v platnost měl vstoupit 2012, k 7.1.2013 jej
ratifikovalo 11 zemí, z významných jen Indie