Transcript pobierz plik

GRUPA BADAWCZA – (ZMO)
w Zakładzie Mikrobiologii Stosowanej
dr Magdalena Popowska
SKŁAD OSOBOWY
ZESPÓŁ I
• prof. dr hab. Zdzisław Markiewicz
(emeritus)
• dr Magdalena Popowska (p. 319A)
• dr Agata Krawczyk-Balska (p. 325A)
• dr Dorota Korsak (p. 325A)
ZESPÓŁ II
• prof. dr hab. Roman Mycielski
(emeritus)
• Dr Hanka Boszczyk-Maleszak
• dr Marzena Rzeczycka (p. 414A)
• dr Antoni Miernik (p. 431A)
• mgr Agnieszka Suszek
• mgr Adam Kopera
TEMATYKA BADAWCZA
Poszukiwanie nowych celów działania dla
chemioterapeutyków w leczeniu listeriozy:
I.
• Badanie fizjologicznej funkcji enzymów o charakterze hydrolaz mureiny oraz
wybranych białek powierzchniowych w komórkach L. monocytogenes (udział w
I etapie tworzenia biofilmów)
• Charakterystyka biochemiczna białka Lmo0946 (klonowanie, oczyszczanie,
zbadanie zdolności wiązania/oddziaływania z kwasami nukleinowymi)
• Badanie wpływu mutacji w genie lmo0946 na strukturę i budowę osłon
”
Listeria monocytogenes
(Grant zakwalifikowany do realizacji: 2010-2013)
II. Mechanizmy oporności na wybrane antybiotyki w szczepach
Listeria monocytogenes izolowanych z żywności
• Mutacje warunkujące oporność na sulfonamidy i trimetoprim
Oporność bakterii izolowanych ze środowiska na
antybiotyki stosowane w medycynie i weterynarii:
III.
(Projekt międzynarodowy w ramach Akcji COST TD0803: 2010-2013)
• Molekularna charakterystyka oporności na wybrane antybiotyki bakterii
wyizolowanych ze środowiska (osady denne stawów hodowlanych i innych
zbiorników wodnych, oczyszczalnie ścieków komunalnych, mleczarskich,
mięsnych i przemysłowych)
COST Action TD0803: Detecting evolutionary hot spots of
antibiotic resistances in Europe (DARE)
Action details
Parties
Country
MoU : 273/08
CSO Approval date : 24/11/2008
Entry into force : 24/02/2009
End of Action : 22/09/2013
Date
Status
Austria
13/11/2009 Confirmed
Belgium
24/02/2009 Confirmed
Cyprus
10/08/2009 Confirmed
Denmark
01/04/2009 Confirmed
Estonia
10/09/2009 Confirmed
Finland
13/05/2009 Confirmed
France
24/02/2009 Confirmed
Germany
24/02/2009 Confirmed
Israel
28/10/2009 Confirmed
Italy
05/10/2009 Confirmed
Lithuania
13/05/2009 Confirmed
Norway
27/03/2009 Confirmed
Poland
25/11/2009 Confirmed
Portugal
30/09/2009 Confirmed
Spain
24/02/2009 Confirmed
Switzerland
24/02/2009 Confirmed
Poland (MC Member) dr Magdalena Popowska
United Kingdom 24/02/2009 Confirmed
Total
17
„COST (European Cooperation in Science and Technology) is one of the
longest-running European instruments supporting cooperation among
scientists and researchers across Europe „
http://w3.cost.esf.org/index.php?id=205&action_number=TD0803
TEMATYKA BADAWCZA
IV. Biodegradacja nitrozwiązków, charakterystyka fizjologiczna
oraz molekularna szczepów bakterii wyizolowanych z
rejonów skażonych (poligony wojskowe), zdolnych do
rozkładu nitrozwiązków (materiały wybuchowe)
(ZGŁOSZENIE PATENTOWE)
• Opracowanie składu oraz warunków wytwarzania efektywnej szczepionki
bioremediacyjnej jako skutecznej metody bioremediacji gleb skażonych
nitrozwiązkami
Badania bioróżnorodności i aktywności mikroorganizmów
środowiskowych z wykorzystaniem min. metod biologii
molekularnej (amplifikacja PCR, klonowanie, sekwencjonowanie)
WSPÓŁPRACA
Badania te realizowane są we współpracy:
• Współpraca naukowa w ramach COST z 20 państwami UE
• prof. prof. Juan A. Ayala, Universidad de Buenos Aires,
Hiszpania
• prof. M. Nguyen-Disteche - Centrum Inżynierii białek,
Uniwersytet w Liege, Belgia
• dr hab. Mickael Desvaux – Instytut INRA, Francja
• dr Krystyna Pappelbaum - Oddział Badania Żywności,
Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna, Bydgoszcz
Stosowana metodyka:
• Szeroki zakres technik mikrobiologicznych, analitycznych,
fizjologicznych, biochemicznych i molekularnych
Tematy prac licencjackich
• Prace teoretyczne związane z kierunkiem badań danego zespołu, a także z
przyszłym tematem pracy magisterskiej
- Molekularne mechanizmy regulacji struktury i budowy osłon
komórkowych Listeria monocytogenes
• Praca praktyczna polegająca na wykonaniu jednego zadania badawczego:
- Określenie wrażliwości na wybrane antybiotyki szczepów z kolekcji
Grupy Badawczej ZMO
- Klonowanie produktów amplifikacji PCR (geny oporności na wybrane
antybiotyki)
- Molekularne mechanizmy oporności, szczepów Listeria monocytogenes,
izolowanych z żywności, na fluorochinolony
- Stworzenie konstruktów genetycznych służących do nadekspresji białka
Publikacje oryginalne
•
•
•
•
•
•
•
Krawczyk-Balska A., Popowska M., Markiewicz Z., 2012 Z. Re-evaluation of the
significance of penicillin binding protein 3 in the susceptibility of Listeria monocytogenes
to beta-lactam antibiotics. BMC Microbiol. punkty MNISW – 27; IF – 3.331
Maćkiw E, Rzewuska K, Stoś K, Jarosz M, Korsak D. 2011. Occurrence of Campylobacter
spp. in poultry and poultry products for sale on the Polish retail market. Journal Food
Protection. 4(6):986-9
Popowska M., Rzeczycka M., Miernik A., Krawczyk-Balska A., Walsh F., Duffy B. 2011.
Influence of soil use on prevalence of tetracycline, streptomycin, and erythromycin
resistance and associated resistance genes. Antimicrob. Agents Chemother. 56(3):14341443; DOI:10.1128/AAC.05766-11; punkty MNISW – 32; IF – 4.680
Popowska M., Osińska M., Rzeczkowska M. 2011. N-acetylglucosamine-6-phosphate
deacetylase (NagA) of Listeria monocytogenes EGD, an essential enzyme for the
metabolism and recycling of amino sugars. Arch. Microbiol. DOI : 10.1007/s00203-0110752-3. punkty MNISW – 20; IF – 2.125;
Popowska M., Miernik A., Rzeczycka M. 2010. The impact of environmental
contamination with antibiotics on levels of resistance in soil bacteria. Journal of
Environmental Quality. 39:1-9; punkty MNISW – 24; IF – 2.236; liczba cytowań 0
Korsak D, Z. Markiewicz, G.O Gutkind, J.A Ayala. 2010. Identification of the full set of
Listeria monocytogenes penicillin-binding proteins and characterization of PBPD2
(Lmo2812). BMC Microbiol 10:239 ; punkty MNISW =27; IF=2.96
Popowska M., Kusio M., Szymańska P., Z. Markiewicz. 2009. Inactivation of the wallassociated de-N-acetylase (PgdA) of Listeria monocytogenes results in greater
susceptibility of the cells to induced autolysis. J. Microbiol. Biotechnol. 9:932-945; punkty
MNISW – 20; IF – 2.062
Międzynarodowe doniesienia zjazdowe
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
H. Buergmann, N. Czekalski, H.-P. Grossart, V. Kisand, A. Lupo, C.M. Mania, M. Popowska, T. Schwartz, F. Walsh, T.U.
Berendonk. 2011. COST Action TD0803 'Detecting evolutionary hot spots of antibiotic resistances in Europe'. Antibiotic resistance as
an emerging environmental contaminant. 4th FEMS Congress of European Microbiologists - 2011, Topic: Antibiotic resistance and
resistome, Genewa, Szwajcaria. Oral presentation.
Korsak D. 2011. „Antimicrobial susceptibilities of Lsteria monocytogenes strains isolated from 2003 to 2010 in Poland”. 2011. 4th
FEMS Congress of European Microbiologists. Advancing Knowledge on Microbes. Genewa, Szwajcaria. Poster presentation.
Krawczyk-Balska, A., M. Popowska. 2011. Effect of lmo1941 knock-out on the structure of cell wall and susceptibility of Listeria
monocytogenes to β-lactam antibiotics. 4th Congress of European Microbiologists -FEMS 2011, Topic: Microbial cell biology and cell
structure, Genewa, Szwajcaria. Poster presentation.
Maćkiw E., Korsak, D., Tomczuk, K.,. Rzewuska, K. 2011. Antibiotic resistance in Campylobacter spp. isolated from poultry products
in Poland, MoniQA International Conference „Food Safety and Consumer Protection”, Warna, Bułgaria. Poster presentation.
Popowska M., Desvaux M., Chrzanowska N., Tarnowska A. 2011. The role of Listeria monocytogenes EGD murein hydrolases
Lmo1521 and Lmo2591 in autolysis and biofilm formation. XIII International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology –
IUMS 2011, Topic: General Microbiology (B-25), Sapporo, Japan. Poster presentation,
Popowska M., Miernik A., Rzeczycka M., Walsh F., Duffy B. 2011. Tetracycline, streptomycin and erythromycin resistance in soil
bacteria. 4th FEMS Congress of European Microbiologists - 2011, Topic: Antibiotic resistance and resistome, Genewa, Szwajcaria.
Poster presentation,.
Rożynek E., Korsak D., Kamińska W., Maćkiw E., Dzierzanowska-Fangrat K. 2011. Mechanisms of macrolide resistance in Polish
Campylobacter jejuni and C. coli strains isolated from chicken meat, 2006–2009. 21 Congress of the European Society of Clinical
Microbiology and Infectious Diseases and the International Society of Chemotherapy, Mediolan, Włochy. Poster presentation
Tomczuk, K., Maćkiw, E., Korsak, D., Rzewuska, K. 2011. Occurrence of Campylobacter spp. in pork, beef and poultry meat
available in retail trade in Poland. MoniQA International Conference „Food Safety and Consumer Protection”, Warna, Bułgaria. Poster
presentation
Popowska M. and Czajka A. 2009. The role of internalins Lmo0732 and Lmo2026 of Listeria monocytogenes EGD with mucin
binding domain in biofilm formation. 3rd Congress of European Microbiologists - FEMS 2009. Poster presentation
D. Korsak, M. Popowska, Z. Markiewicz. 2009 . Contribution of penicilling-binding protein 5 and Lmo2812 of Listeria
monocytogenes EGD to cell morphology, and antibiotic resistance 3rd Congress of European Microbiologists-FEMS 2009.
Gothennburg, Sweden. Poster presentation
Kontakt: dr M.Popowska (III piętro, p. 319A)
kierunek biotechnologia
licencjat: 6-7 osób
pracownia magisterska: 6-7 osób
Strona naszej grupy badawczej:
www.zmo.bio.uw.edu.pl
Spotkanie informacyjne dla zainteresowanych, odbędzie
się 19 marca br. o godz. 10.00, sala 346A, III piętro