Transcript Zakład Mikrobiologii Stosowanej

Prof. dr hab. Jacek Bielecki – kierownik
(22) 554 13 04 e-mail: [email protected]
Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
(22) 554 13 10 e-mail: [email protected]
Dr hab. Magdalena Popowska
(22) 55 41 320 e-mail: [email protected]
Dr Tomasz Jagielski
(+22) 554 1311 e-mail: [email protected]
Dr Dorota Korsak
(22) 55 41 326 e-mail: [email protected]
Dr Agata Krawczyk-Balska
(22) 55 41 326 e-mail: [email protected]
Dr Antoni Miernik
(22) 55 41 431 e-mail: a.miernik@ biol.uw.edu.pl
Dr Adrianna Raczkowska
(22) 554 13 10 e-mail: araczko@ biol.uw.edu.pl
Dr Marzena Rzeczycka
(22) 55 41 414 e-mail: [email protected]
Dr Radosław Stachowiak
(+22) 554 13 12 e-mail: [email protected]
Mgr Adam Kopera
(22) 55 41 420 e-mail: a.kopera@ biol.uw.edu.pl
Mgr Agnieszka Suszek
(22) 55 41 414 e-mail: [email protected]
Doktoranci:
Mgr Michał Kamiński [email protected]
Mgr Katarzyna Roeske [email protected]
Mgr Karolina Skorek [email protected]
Mgr Zofia Bakuła [email protected]
Skład osobowy
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Problematyka badawcza
Zespół badawczy – Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Konstrukcja i charakterystyka uniwersalnego bakteryjnego wektora do wykorzystania w
szczepionkach najnowszej generacji (Bacillus subtilis).
Badanie mechanizmów patogenezy Listeria monocytogenes; ocena współzależności funkcji
determinantów patogenezy w środowisku wewnątrzkomórkowym.
Wykorzystanie toksyn bakteryjnych w biotechnologii medycznej.
Zespół badawczy - Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Czynniki zjadliwości Yersinia enterocolitica – badanie roli białek Inv, Yop, YadA, poryn,
sideroforów oraz funkcji dwuskładnikowego systemu regulacji EnvZ/OmpR, a także
regulonu maltozy w procesie patogenezy.
Zespół badawczy Dr hab. Magdalena Popowska
Znaczenie deacetylaz peptydoglikanu w biosyntezie oraz modyfikacji ściany komórkowej
Badania lekooporności szczepów L. monocytogenes izolowanych z żywności
oraz ze środowiska (gleba i zbiorniki wodne)
Zastosowanie mikroorganizmów tlenowych w bioremediacji in situ gleby skażonej
produktami naftowymi.
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Zajęcia dydaktyczne
Biotechnologia
Mikrobiologia przemysłowa
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Stosowana metodyka
a) podstawowe techniki inżynierii genetycznej w ramach
- klonowania DNA,
- konstrukcji wektorów genetycznych,
- konstrukcji wektorów bakteryjnych,
- syntezy DNA (PCR),
- izolacji białek z metryczką histydynową,
- elektroforezy DNA i białek.
b) badanie wektorów bakteryjnych w hodowlach tkankowych
przy użyciu technik fluorescencyjnych i mikroskopii
(klasycznej, fluoroscencyjnej i elektronowej).
c) immobilizacja patogenów bakteryjnych
d) diagnostyka molekularna
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Wybrane publikacje
Brzostek K., Brzóstkowska M., Bukowska I., Karwicka E., Raczkowska A. 2007. OmpR negatively
regulates expression of invasin in Yersinia enterocolitica . Microbiology SGM 153, 2416-2425.
Raczkowska A., Skorek K., Bielecki J., Brzostek K. 2010. OmpR controls Yersinia enterocolitica
motility by positive regulation of flhDC expression. Antonie Van Leeuwenhoek., 99:381-394.
Wiśniewski J., Krawczyk-Balska A. & Bielecki J., 2006. Associated roles of hemolysin and p60 protein
for the intracellular growth of Bacillus subtilis. FEMS Immunology & Medical Microbiology , 46(3),
330 – 339.
Stachowiak R., Wiśniewski J., Osińska O., Bielecki J. (2009) Contribution of cysteine residue to the
properties of Listeria monocytogenes listeriolysin O. Can. J. Microbiol., 55 (12),
1153-1159
Granicka L.H., Stachowiak R., Wisniewski J., Lyzniak M., Bielecki J., Kawiak J. 2010. Functioning of
microorganisms encapsulated in membrane system for antitumor purposes.
Int. J. Art. Org. 33 (7): 482-492
Stachowiak R., Granicka L. H., Wiśniewski, J., Łyżniak, M., Kawiak J. and Bielecki J. 2011
Cytotoxicity of listeriolysin o produced by encapsulated in membrane bacillus subtilis on leukemia
cells. J. Microbiol. Biotechnol., 21, (11), 1193-1198
Jagielski T., Buzzini P., Lassa H., Malinowski E., Branda E., Turchetti B., Polleichtner A., Roesler U.,
Lagneau P., Marques S., Silva E., Thompson G, Stachowiak R. and Bielecki J. 2012. Multicenter Etest Evaluation of In Vitro Susceptibility of European bovine mastitis Prototheca sp. Isolates Towards
Antifungal Drugs", J. Antimicrob. Chemother., 67(8):1945-57
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Projekty badawcze
MNiSW - „Wykorzystanie cytotoksycznych produktów bakterii do zabijania komórek
nowotworowych oddzielonych membraną” (2009 – 2012)
NCBiR - „Nowy uniwersalny wektor i jego zastosowania do konstrukcji szczepionki
nowej generacji” (2009 – 2013)
UE EFRR/Innowacyjna Gospodarka
„Innowacyjne metody wykorzystania komórek macierzystych w medycynie” –
konsorcjum z PUM, UJ i CMKP (2009 – 2014)
NCN - Identyfikacja oraz analiza genetyczna mutacji warunkujących lekooporność w
szczepach klinicznych Mycobacterium tuberculosis typu MDR (Juventus Plus 2012).
NCN - Uniwersalna platforma dostarczająca geny do komórek eukariotycznych,
(EXTERIUS/POZA SZLAKIEM 2012).
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Warunki przyjęcia na pracownię licencjacką
uzyskanie zaliczeń z przedmiotów:
Mikrobiologia
Biotechnologia lub Biochemia
Mikrobiologia Przemysłowa lub Podstawy. Immun.
Genetyka Bakterii lub Genetyka z Inż. Gen. *
mogą być przyjęte:
3 osoby do zespołu Yersinia (K. Brzostek)
4 osoby do zespołu Listeria (J. Bielecki)
*w przypadku nadmiaru kandydatów brane będą pod uwagę średnie z przedmiotów
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Przykładowe prace licencjackie
Ewa Karwicka (2006) „Wpływ warunków środowiska na ekspresję inwazyny Yersinia
enterocolitica O:9 – rola białka OmpR w osmoregulacji”
Paulina Nojek (2006) „Białka YOP Yersinia enterocolitica i ich rola w procesie
patogenezy – właściwości biologiczne cytotoksyny YopE”
Izabela Zasada (2008) „Molekularny mechanizm termoregulacji ekspresji
bakteryjnych genów wirulencji”
Kamila Prymas – (2009) Leki antybakteryjne XXI wieku – nowe strategie w walce z
chorobami infekcyjnymi
Zuzanna Maniecka (2010) „Rola acetylofosforanu w kontroli aktywności
dwuskładnikowych systemów transdukcji sygnału”
Maria Karwowska (2007). „Konstrukcja nowego wektora umożliwiającego
klonowanie dowolnych genów w Bacillus subtilis”.
Gabriela Szmyd (2008) „Listeria monocytogenes jako narzędzie w biotechnologii
medycznej”
Sebastian Mielnicki (2008) „Strategie klonowania oraz wektory ekspresyjne dla
Bacillus subtilis”
Paweł Rudowski (2009) „Wpływ białek internalinopodobnych na morfologię komórek
Listeria monocytogenes”:
Zofia Bakuła (2010) „Immobilizacja Bacillus subtilis BR1-S, Escherichia coli BP1 i
Listeria monocytogenes 1044S w polipropylenowych membranach kapilarnych.
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Warunki przyjęcia na studia magisterskie
Przyjmujemy do 7 osób, warunkiem jest uzyskanie zaliczeń z:
1. Genetyki bakterii lub Genetyki molekularnej
2. Ruchomych elementów genetycznych lub Immunologii
3. Mol. pod. bak. patogenezy lub Fizjologii bakterii *
i oczywiście zdanie wydziałowego egzaminu
* W przypadku nadmiaru kandydatów będą brane pod uwagę oceny
Zakład Mikrobiologii Stosowanej
Instytutu Mikrobiologii UW
Przykładowe prace magisterskie
Ewa Karwicka (2006) „Wpływ warunków środowiska na ekspresę inwazyny Yersinia
enterocolitica O:9 – rola białka OmpR w osmoregulacji”
Agnieszka Szymańska (2008) „Udział białka RovA Yersinia enterocolitica w regulacji
ekspresji genu kodującego inwazynę”
Karolina Monika Skorek (2009) „Rola białka OmpR w regulacji ekspresji genów
regulonu rzęski Yersinia enterocolitica”
Dorota Nowak (2010) „Regulacja ekspresji genu filA Yersinia enterocolitica”
Paulina Godzik (2007) „Rola białka Lmo0409 we wczesnych etapach patogenezy
Listeria monocytogenes”.
Paweł Wawrzyniak (2008) „Modyfikacja wektora ekspresyjnego pSW12
umożliwiającego produkcję listeriolizyny O w Bacillus subtilis”
Daliva Humoodi (2009) „Charakterystyka biologiczna szczepów Bacillus
produkujących różne typy listeriolizyny O Listeria monocytogenes”.
Justyna Lesiak (2010) „Escherichia coli jako uniwersalny wektor skonstruowany
metodami biologii syntetycznej”.
Kinga Dymecka (2010) „Analiza ekspresji genu actA Listeria monocytogenes w
szczepie Bacillus subtilis”.
Zofia Bakuła (2012). „Projektowanie układów immobilizacyjnych w kierunku
bakteryjnych terapii implantacyjnych i doustnych”.