Transcript aaRS_dan_serligase

Aminoacyl tRNA synthetase (aaRS)
Oleh:
Ertanti Rizki P.
20512033
Suci Rizki Nurul Aeni 20512044
KK Biokimia-Institut Teknologi Bandung
Outline
What is aa RS ?
What the
development?
How kinetics
parameter of aa
RS ?
What is aa RS ?
Lokasi
Fungsi
defisiensi
Berperan dalam proses
• Kesalaham Koding
translasi RNA Asam amino
PL
• Protein berubah
jenis dan fungsi
Pengikatan asam amino
Terdapat dalam sel makhluk
hidup, yaitu pada Ribosom spesifik ke tRNA
Tahapan pengikatan tRNA dengan
asam amino
1) Sisi aktif enzim mengikat asam amino dan
molekul ATP.
2) ATP kehilangan dua gugus fosfat dan
bergabung dengan asam amino sebagai AMP.
3) tRNA berikatan kovalen dengan asam amino
menggeser AMP di sisi aktif enzim.
4) Enzim melepaskan tRNA-aminoasil, disebut
juga “asam amino teraktivasi”
Mekanisme
Perbedaan Kelas Asam Amino
Kinetika
kinetic of Enzyme
•
•
•
•
•
Suhu
Konsentrasi enzim
Konsentrasi Substrat
Inhibitor
Jumlah Pyrophosfat
What the development?
• Inhibitor enzim ini dapat berguna bagi
treatment untuk beberapa penyakit antara
lain Malaria dan HIV 1
• Inhibitor enzim ini berpotensi untuk zat
antibiotik
Spesific Enzyme Name of IUBMB
• EC 6
• EC 6.1
• EC 6.1.1
•
•
•
•
: Class Ligase
: Subclass Forming Carbon-Oxygen Bonds
: Ligases forming aminoacyl-tRNA and
related compounds
EC 6.1.1.11
: Serine-tRNA ligase
Nama lain
: seryl-tRNA synthetase; SerRS; seryltransfer ribonucleate synthetase;
seryl-Transfer RNA synthetase; seryl-transfer ribonucleic acid
synthetase; serine translase
Nama Sistematik : L-serine:tRNASer ligase (AMP-forming)
Serine-tRNA ligase Fungtion
• Mengakatalisis pengikatan kovalen dari serin ke
gugus 3’-OH dari nukleotida tRNA-nya dalam
suatu proses yang digerakan oleh hidrolisis ATP.
Reaction of Serine-tRNA ligase
ATP + L-serine + tRNASer  AMP + diphosphate + L-seryl-tRNASer
Characteristic of Serine-tRNA ligase
• Terdapat dua domain yang terikat pada active
side dan pada antikodon
• Domain N-terminal terdiri dari rantai yang
sangat panjang
• Seryl-tRNA synthetase memiliki setidaknya
lima spesies yang berbeda yang secara kolektif
mengakui enam kodon berbeda untuk asam
amino
Kinetic of Serine-tRNA ligase
Suhu
pH
pI
Konsentrasi Enzim
Konsentrasi Substrat
Konsentrasi Pyrophosfat
Application of Serine-tRNA ligase
Sintesis SerylAdenylate
Sintesis
Diadenosine
Tetraphosphate
(Ap4A)
Modification of Serine-tRNA ligase
Proses
aminoasilasi
Sintesis
Selenocystein