생활속의 미생물-2010
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2010년 1학기 생활 속의 미생물
미생물로 살아가기:
증식과 대사
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1. 서
론
증식 (growth,생장,성장) : 세포가 다양한 자원(C,H,O,N)을 이용하여
성장하는 것
대사 (metabolism) : 세포 내에서 일어나는 유기물의 분해와 합성 과정
‘대사를 통한 증식’ = ‘증식을 위한 대사’
핵심 포인트
(1) 미생물의 개수 또는 농도의 측정방법
(2) 미생물의 생장곡선의 이해
(3) 미생물의 생장과 관련된 요인
(4) 탄소(포도당) 대사를 통한 에너지의 생성과정
(5) 생존을 위한 노력 에탄올의 생산
세포의 정량
1. Cell number density
1) Hemocytometer (Petroff-Hausser Slide)
- Microscopic counting
세포의 정량
2) Plate count (colony count)
- Viable cell counting (bacteria/yeast)
- not for mold
- colony-forming unit (CFU, number/volume)
세포의 정량
2. Cell mass concentration
1) Direct method
A. Cellular dry weight (or dry cell mass)
~ The most commonly used direct method
~ In solids-free medium
~ Cell harvest by centrifugation or filtration
washing the cells
drying the washed wet cell at 80oC for 24 hr
measurement
세포의 정량
Y(DCM,g/L) = slope*OD
Dry cell mass (g/L)
B. Optical density (OD)
~ The absorption of light by suspended cells
at a visible wavelength (600 ~ 700 nm)
~ Fast, inexpensive, simple
slope
Optical density (600nm)
2) Indirect method
- For mold fermentation
- DNA, RNA, protein concentration cell concentration
- Viscosity of culture broth for extracellular polysaccharide
formation (PHB, PHA...)
2. 미생물 생장
(1) 개체군 생장
생장곡선 (growth curve) : 생명체 개체군의 수(또는 농도)의 변화를 시간의 함수로 표현
한 그래프
- 세균 (이분법), 효모 (출아법), 곰팡이류(균사체 성장, 유사분열),
진핵세포(무성/유성생식)을 통하여 생장
- 모든 생물체의 개체군은 생물체 특유의 생장곡선을 보유함
- 세포의 성장은 수학적으로 예측가능함
A
B
C
지수성장기
세포
농도
시간
그림. 생물체군의 성장 곡선
2. 미생물 생장
(1) 개체군 생장
세포의 증식 단계
(1) 유도기 (lag phase)
- 개체수의 증가가 거의 없음 (생성=소멸)
- 새로운 환경에 대한 적응단계
(온도/산도에 대한 적응,
영양소 분해용 세포 구성성분 및 효소의 생합성)
(2) 지수생장기 (exponential (log) phase)
- 개체수가 최대의 속도로 증가하는 구간 (생성≫소멸)
- 배가 시간(doubling time)으로 생장함
- 각 세포 내의 구성성분의 분포는 거의 동일함
- 세포 생장의 수학적 분석이 가능한 구간
(3) 정지기 (stationary phase)
- 개체수의 증가가 없음 (생성=소멸)
- 원인 : 영양분의 고갈, 환경의 변화, 부산물의 생성
- 대부분의 항생제 생산이 이루어지는 구간
(4) 사멸기 (death phase)
- 개체수가 줄어듬 (생성≪소멸)
- 환경의 악화에 따라 포자 생성
2. 미생물 생장
(2) 물과 온도
물과 온도의 중요성
- 물 : 세포질의 주요 구성성분, 수용액 상에서 효소반응이 일어남
- 온도 : 효소 활성(activity)에 절대적인 영향을 미침,
* 너무 낮은 경우 : 반응속도가 느림
* 너무 높은 경우 : 반응속도의 급격한 감소 후 열에 의해 영구적으로 변형됨
온도에 따른 미생물의 분류
(1) 저온성 미생물 (psychrophiles)
- 0℃ ~20℃ 에서 가장 잘 생장
- 남극, 북극, 깊은 바다 표면
- 냉장고(5℃)에 서식 연쇄상구균 (우유 산패),
일부 포도상구균 (독소 생산)
(2) 중온성 미생물 (mesophiles)
- 20℃ ~45℃ 에서 가장 잘 생장
- 대부분의 배양 가능한 미생물
- 대부분의 인체 병원균 (체내(37℃)에서 잘 생장)
(3) 고온성 미생물 (thermophiles)
- 45℃ 이상에서 생장, 100℃ 이상에서도 성장
- 대부분의 고세균 (archaea)
- 퇴비, 온천, 대양의 열구멍
고온성 algae
2. 미생물 생장
(3) 산소와 산도
산소와 산도의 중요성
- 산소 (oxygen) : 생물체의 종류에 따라 반드시 공급 또는 제거해야 함
- 산도 (acidity, pH) : 효소 활성(activity) 및 반응속도에 영향을 미침
산소의 필요성에 따른 미생물의 분류
(1) 호기성 (aerobic) 미생물
- 대사를 위해 반드시 산소필요
- 많은 미생물 (인간, 식물)
(2) 혐기성 (anaerobic) 미생물
- 산소결핍 시에만 생장, 산소존재 시 사멸
- 일부 유산균, 파상풍균, 쓰레기 부패균
(3) 통성 혐기성 (facultative) 미생물
- 산소가 존재와 결핍과 관계없이 생장
- 호기적이나 혐기적이나 빠르게 적응하여 생장
- 대부분의 미생물
산도에 따른 미생물 분류
(1) 대부분의 세균은 약산성/알칼리에서 성장 (pH6~8)
(2) 진균류 (예로 효모)는 pH5.0이 최적
(2) 호산성 (acidophilic) 미생물 : 산성 pH에서 생장
- 유제품 제조에 이용되는 미생물
- Helicobacter pylori : 위점막 내에서 증식, 위괘양의 원인균
Helicobacter pylori
2. 미생물 생장
(3) 기타 요인
염도와 압력의 중요성
- 염도 : 세포의 삼투압 유지
- 압력 : 세포의 형태관련 요인
염도에 따른 미생물의 분류
(1) 일반적인 미생물
- 일반 원핵/진핵 생물은 1%의 염도 필요
(2) 호염성 (halophilic) 미생물
- 높은 염의 환경에서 서식하는 미생물
- 바다의 염도(약3.5%) 보다 높은 염도에서 생장
압력에 따른 미생물 분류
(1) 일반적인 미생물
- 1 기압에서 생장
(2) 호압성 (barophilic )미생물
- 바다 속 6 마일 아래에서도 생장
- 실험실에서 배양하기 어려움
남샌프란시스코 만에 위치한
salt pond의 색변화
3. 미생물 대사
대사 (metabolism) : 세포의 생육 동안 세포에서 일어나는 모든 화학적 반응
- 인간세포의 대사와 미생물 대사가 유사함
- catabolism : 거대분자 소분자
에너지와 세포구성을 위한 단위성분(아미노산 등), 보효소 생산이 목적
- anabolism : 소분자 거대분자
catabolism에서 제조된 성분을 이용하여 유기물 중합체 생산
- 대사는 다양한 방법에 의해 견고하게 조절됨
그림. Catabolism vs. anabolism
그림. 세포 내 대사경로
3. 미생물 대사
(1) 효소
효소 (enzyme) : 반응을 활성화시키는 생물학적 촉매, 단백질로 구성됨
- 미생물 대사의 반응을 촉매하는 단백질
- 기질특이성 : 특정 기질에 대해서 반응성을 가짐
- 단백질 변성에 의해서 효소 역가를 상실함
그림. 효소의 작용기전
3. 미생물 대사
(2) 에너지
대사의 중요목표: 에너지의 일정한 공급을 통한 생명의 유지
ATP (adenosine triphosphate) : 주요 에너지 저장 수단
- ATP분자는 이동성 건전지와 유사
- 다양한 반응에 이용 : 영양소 수송, 폐기물의 제거, 단백질 합성 등
- 대사과정 중 호흡 (respiration) 또는 광합성 (photosynthesis)를 통하여 생성
- 구성 : 아데닌 + 리보스 + 인산
- 인산기의 분해/결합으로
에너지를 전달/저장 함.
Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)
- A storing molecule of electron
erupted in sugar metabolisms
- Moves to electron transport system
and is used for ATP synthesis.
그림. ATP의 구조
및 에너지 전달/저장 메커니즘
3. 미생물 대사
(3) 해당과정
해당과정 (glycolysis)
- 포도당 분자(C6)가 분해되어 피루빅산(pyruvic acid, C3)가 되는 과정
- 포도당은 주요 화학적 에너지를 보유한 원료
- 세포의 세포질 (cytoplasm)에서 일어남
- 산소를 필요로 하지 않음
- 산화환원(oxidation-reduction) 반응을 통하여 포도당을 분해
- 반응 중 생성된 전자를 NAD(nicotinamide adenine dinucleotide)에 저장
- 최종 반응식
포도당(C6H12O6) + 2NAD+ + 2ADP +2Pi
2 피루빅산(C3H4O3) + 2ATP + 2NADH +2H+ + 2 물(H2O)
그림. 해당과정 및 호흡, 발효
그림. 포도당/과당 등의 대사
3. 미생물 대사
(4) 발효
발효 (fermentation)
- 산소결핍 시 일어나는 포도당 분해 반응
- (1) 산소가 풍부할 경우 해당과정에 생성된
NADH는 전자전달계로 이동하여 ATP 생성에
이용. 생성된 NAD는 해당과정에 이용
(2) 산소가 없을 경우 전자전달계 멈춤
피루빅산을 이용한 부산물 생성으로
NADH를 NAD로 재순환시켜 해당과정에 이용
- 알코올(에탄올), 초산, 젖산 생성 메커니즘
그림. NADH/NAD의 재순환
그림. 산소결핍시 피루빅산의 운명
3. 미생물 대사
(5) 크랩스 회로와 전자전달계
크랩스 회로 (Krebs cycle)
전자전달계 (electron transport system)
- 피루빅산을 완전산화시키는 과정
- 해당과정과 크랩스회로에서 생성된
- 1 pyruvic acid 3 이산화탄소
NADH가 보유한 전자에너지를
+ 4NADH + 1ATP
ATP형태로 전환시키는 반응
- 산소가 필요 없음
- 발생한 전자는 산소원자와 결함
- 주요 아미노산 생산 경로
- 산소를 이용하여 물을 생성
- 최종적으로 다량의 ATP 생성
(1분자 포도당 36~38개 ATP)
- 세포막(원핵생물) 또는 미토콘드리아
(진핵생물)에서 일어남
그림. 크랩스 회로를 이용한
피루빅산 분해 및 아미노산 생산
그림. 전자 전달계