Document 7853777

Download Report

Transcript Document 7853777

SciFinder 使用介绍
CAS上海代表处
高级培训专员
俞靓
Tel:021-64453167
Email:[email protected]
www.cas.org
A division of the American Chemical Society
Chemical Abstract Service化学文摘社
我们专注于:
推动研究、发展与创新
为全球科技与创新领域提供领先的、整合的,全面的信息
解决方案
To encourage the increase and diffusion of chemical
knowledge for the benefit of industry and education
A division of the American Chemical Society
Chemical Abstract Service化学文摘社今天:
全球最大的学协会组织
本部拥有800多博士从
事文献编辑工作
为全球超过1200多个
学校提供SFS桌面检索
平台
A division of the American Chemical Society
提纲
SciFinder 数据库介绍
SciFinder 检索方法及信息挖掘手段
SciFinder 中的检索方式
SciFinder 中的文献检索及后处理
SciFinder 中的物质检索及后处理
SciFinder 中的反应检索及后处理
SciFinder 的运行
SciFinder Web介绍
A division of the American Chemical Society
SciFinder 数据库背景
纸本
1907年
光盘
1977年
1995年
2007年
2009年
SciFinder Web
SciFinder
SciFinder
2007
A division of the American Chemical Society
SciFinder 包含的内容
期刊
Chemcats
专利
论文
CAPlus
Medline
会议报告
提炼出溶剂,催化剂,
产率等反应信息
Chemlist
Registry
结构信息
CASReact
物性数据
合成信息
A division of the American Chemical Society
SciFinder 包含的内容
12000
10400
10000
8000
6000
6000
4500
4400
4000
3000
2000
1600
0
Literature
总量(万)
3000
1700
Registry
CASReact
有机无机物
CAplus
24
Chemlist
生物序列
Chemcats
Medline
A division of the American Chemical Society
提纲
SciFinder 数据库介绍
SciFinder 检索方法及信息挖掘手段
SciFinder 中的检索方式
SciFinder 中的文献检索及后处理
SciFinder 中的物质检索及后处理
SciFinder 中的反应检索及后处理
SciFinder 的运行
SciFinder Web介绍
A division of the American Chemical Society
SciFinder 的检索方式
主题
机构名
专利号
作者名
文献
物质
俗名
反应
分子式 相似结构 结构,亚结构 官能团
A division of the American Chemical Society
所以,
在SciFinder 中,
只要得到一点信息,就可以获得最为全面的
文献……
物质……
反应……
A division of the American Chemical Society
SciFinder 中文献检索及后处理
SciFinder 中文献检索的方法
通过文献标示符去找文献
浏览核心期刊
通过主题,作者名,机构名去找文献
A division of the American Chemical Society
通过文献标示符去找文献
A division of the American Chemical Society
浏览核心期刊
A division of the American Chemical Society
通过主题,作者名,机构名去找文献
A division of the American Chemical Society
主题检索举例
A division of the American Chemical Society
提出问题
获得有关稀土催化剂的参考文献
存在问题:
获得专利文献以及反应
是否可以用系统的方法对这些文献进行分类
是否可以获得一些催化剂的信息
A division of the American Chemical Society
我们用rare
earths with catalysts来做初次的检索
“Closely associated
with one another”
表示在同一个句子当中出
现
A division of the American Chemical Society
我们注意到所列
文献中出现了rare
earth,catalytic
这样的词
获取文摘
获取全文
那是SciFinder能
够自动识别同义
词,近义词,缩
写,并有截词,
断词等功能
分析/限定
A division of the American Chemical Society
系统分类工具
A division of the American Chemical Society
一共11种分析手段
分析工具提供11种分析方法,包括索引词,
作者名,机构名,文献类型,期刊名称,
出版年限等。
在这些分析工具中,
索引词(Index Term):可以帮助我们对
文献的内容进行大致的了解
学科分析(CA Section Title):可以帮助
我们对文献进行学科分类
A division of the American Chemical Society
一共7种限定手段
限定工具提供7种限定方法,包
括主题词,作者名,机构名,文
献类型等。
在这些限定工具中,
主题词(Research Topics):可
以让我们用我们关心的主题词再
次限定文献
文献类型(Document Type):
可以让我们直接获得我们感兴趣
的文献类型
A division of the American Chemical Society
使用年限限定,可
以获得2005年以后
的文献
A division of the American Chemical Society
对于2005年后的文献,再用分析功能分析一下类型
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
还可以继续用Index Term分析一下文献的内容
A division of the American Chemical Society
系统分类工具Categorize
一级目录
点击感兴趣的二级分
类,在这里可以出现
一些索引词条
二级目录
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
文献检索小结
SciFinder 文献检索小结
向SciFinder 提一个最为广泛的问题
可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来不断的修正我们 的检索
思路
可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围
可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵感
尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用,会有更多的收益
使用Categorize可以让系统来实现自动分类
通过Get Related来获得更多的信息,可以实现从文献到物质,反应,
引文的链接
A division of the American Chemical Society
文献检索 ----Tips
一般最佳在2-3个Concepts(关键词),最多不超过5个
最好使用介词而不用Boolean运算符,如AND 、OR、NOT;介词能被识别;
识别常用缩写、单复数、过去式等;
支持同意词,近义词检索;
不能用!或*(删减字符或通配符)
可用括号,括号内为前词的同义词;
修饰语不能自行分配,需各自写明;
A division of the American Chemical Society
SciFinder 中物质检索及后处理
SciFinder 中物质检索的方法
通过物质标示符去找物质
通过结构和分子式找物质
A division of the American Chemical Society
通过物质标示符去找物质
可以输入物质名称,
CAS No,俗名,商
品名
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
通过结构和分子式找物质
A division of the American Chemical Society
结构检索举例
A division of the American Chemical Society
结构工具
A division of the American Chemical Society
结构相关工具
铅笔
元素周期表
碳链工具
可变基团
常用基团
重复基团工具
R基团定义工具
可变位置连接工具
结构模版
多元环工具
橡皮
索套选择工具
选择工具
旋转工具
正电子
负电子
原子锁定工具
环锁定工具
A division of the American Chemical Society
精确结构检索
A division of the American Chemical Society
得到物质的盐,或者其他的混合物
A division of the American Chemical Society
亚结构检索
A division of the American Chemical Society
得到物质的修饰信息
33246种修饰信息
A division of the American Chemical Society
强大的后处理功能
我们做科研
往往是希望得到我们不知道的信息
那么对于这33246种物质,我们如何去分析来获得
我们需要的信息呢?
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
6大分析功能
分析功能提供6大功能,其中
真实原子附属分析(Real-atom attachments):能
够分析出原子的修饰情况
可变基团分析(Variable Group composition):
能分析结构中定义的可变基团
R基团分析(R-Group Composition):可以分
析结构中定义的R基团
环骨架分析(Ring Skeletons):可以分析结构
的环结构,包括环上的原子和环上的单双键。
A division of the American Chemical Society
7大限定功能
限定功能提供结构再次限定,同
位素是否包含限定,金属是否包
含限定,理化性质限定等。
通常可以通过结构的再次限定
(Chemical Structure)去对
结构再次修饰
或者通过理化性质(Property
Date)去找到符合理化性质要
求的物质
A division of the American Chemical Society
实际上
我们有的时候,更多关注的是结构上面的信息
修饰信息?
修饰上某一特定原子后该原子的修饰信息?
……
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
修正结构
A division of the American Chemical Society
对所得结果再次使用真实原
子附属性分析
A division of the American Chemical Society
有的时候,
我们对我们关心的结构只有一定的了解,不确定的信息太多
我们来看我们所要找的结构:
结构中含有苯环,苯环上含有一个杂环
杂环为5元环,6元环或7元环,且杂原子不能直接接在苯环上
杂环上原子必须是O或者S
苯环上与杂环相邻的位置接个Br
苯环上某2个处于间位的C必须有1个C接卤素,但是接什么卤素不确定
该2个位置之间的C必须接一个基团,该基团可以是H,OH,X
A division of the American Chemical Society
得到具备一定条件的结构信息
问题:
存在多少种环结构
X= F,Cl, Br,I 分别有多少种物质
R2=H,OH,X分别有多少物质
R1= O,S
R2= H,OH,X
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
环骨架分析
A division of the American Chemical Society
可变基团分析
A division of the American Chemical Society
R基团分析
A division of the American Chemical Society
相似结构检索
A division of the American Chemical Society
得到相似结构信息
A division of the American Chemical Society
物质检索小结
 精确结构检索:
获得物质的盐,聚合物,混合物,配合物等
 亚结构检索:
所画的结构必须存在
 相似结构检索:
获得相似度在60分以上的结构
A division of the American Chemical Society
分子式检索举例
A division of the American Chemical Society
分子式输入规则
• CH写在前面,其他按
照字母顺序
• 对于多组分物质,用“.”
将不同的组分分开
• 聚合物括号表示,括号
外用x表示起始物,用n
表示终产物
• 区分大小写
A division of the American Chemical Society
物质检索---Tips
 最多输入25条;
 Read File必须是 .txt文件;
 每个条目输入<200字符;
 可以有空格,不区分大小写;
 如果检索结果不理想,也可在主题检索中再检;
支持俗名,商品名检索
A division of the American Chemical Society
SciFinder 中反应检索及后处理
A division of the American Chemical Society
SciFinder 查询举例----反应信息的查询
反应查询工具
A division of the American Chemical Society
SciFinder 查询举例----反应信息的查询
反应位置标记工具
反应箭头
反应角色工具
反应原子标记工具
反应官能团列表
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
一共10种分析手段
分析工具提供反应中的催化剂
(Catalyst),溶剂(Solvent),
反应步数(Number of steps) ,产
率( Product Yield) 等的分析
A division of the American Chemical Society
一共4种限定手段
限定工具,可以根据进一步的条
件去限定反应中出现的物质
(Reaction Structure),以及反应
类型(Reaction Classification)
等
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
溶剂分析
A division of the American Chemical Society
拓展思路的反应检索
通常
我们需要一些对我们科研有参考意义的反应
官能团之间的反应
亚结构反应检索
对反应位置和原子有特定要求的反应
A division of the American Chemical Society
官能团之间的反应
A division of the American Chemical Society
假如我们只想得到一
步反应
A division of the American Chemical Society
假如我们规定反应物必须是乙酰氯
A division of the American Chemical Society
亚结构反应检索
想获得1步合成
该物质的反应
A division of the American Chemical Society
亚结构反应检索
必须的条件:
羟基接的C必须是CH2
整个C链不允许是某个环结构的部分结构
其余的3个C原子链接什么基团对反应没
有影响
据此,我们修改我们的检索方式
A division of the American Chemical Society
亚结构反应检索
用环锁定功能,锁定C链,
保证其不成为环结构的
一部分
用原子锁定功能,锁
定C原子,保证C 原子
上两个H不被取代
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
对反应位置和原子有特定要求的反应
O原子反应前后必须配对
C=O键必须发生反应
除已有的环外,不能成环
A division of the American Chemical Society
对反应作出条件
限定
用mapping tool
键标示O原子反应
前后位置
用site marking
tool键标示C=O
键反应的位置。
用Lock out ring
tool键锁定环
A division of the American Chemical Society
A division of the American Chemical Society
SciFinder 反应检索小结
多用Analyze/Refine,来获得催化剂,溶剂,产率等信息
如果反应只涉及基团之间的变化,用官能团反应可以获得更多的参考
 信息
当无法找到具体反应,或者检索结果并不满意,尝试用亚结构反应查
 询,可以获得更多的参考信息
A division of the American Chemical Society
提纲
SciFinder 数据库介绍
SciFinder 检索方法及信息挖掘手段
SciFinder 中的检索方式
SciFinder 中的文献检索及后处理
SciFinder 中的物质检索及后处理
SciFinder 中的反应检索及后处理
SciFinder 的运行
SciFinder Web介绍
A division of the American Chemical Society
SciFinder 的程序安装
SciFinder 客户端程序:
SciFinder 2007.exe
安装过程中,提示:
Do you have a disk labeled Custom Site Files? (选择 No)
site.prf (site)文件
只需将 site.prf 文件复制粘贴到
X:\CHLR目录下
还可安装 ViewerLite用于查看3D结构
A division of the American Chemical Society
运行SciFinder
A division of the American Chemical Society
可能1:(并发用户数限制)
解决方法:请耐心等候 !
A division of the American Chemical Society
可能2:(网络故障)
解决方法:检查网络
A division of the American Chemical Society
可能3:网络故障
解决方法:点击OK,再次运行SciFinder/
A division of the American Chemical Society
可能4: IP地址未被授权
解决方法:确认IP地址是否在校内, 并与图书馆管理员联系。
A division of the American Chemical Society
请合理使用SciFinder !!!
千万不要过量下载!
只下载自己要看 的记录(缩小范围)
不要用工具下载
不使用请关闭客户端程序
其他注意事项(参看使用协议)
A division of the American Chemical Society
提纲
SciFinder 数据库介绍
SciFinder 检索方法及信息挖掘手段
SciFinder 中的检索方式
SciFinder 中的文献检索及后处理
SciFinder 中的物质检索及后处理
SciFinder 中的反应检索及后处理
SciFinder 的运行
SciFinder Web介绍
A division of the American Chemical Society
SciFinder Web介绍
SciFinder Web是通过Web来访问SciFinder数据库的方式
友好的用户界面
更加详尽的文献信息和详尽的物质信息
即时跟踪特定研究领域的全球最新动态
永久的信息分享链接
……
A division of the American Chemical Society
SciFinder Web是通过Web来访问SciFinder数据库的方式
A division of the American Chemical Society
友好的用户界面
A division of the American Chemical Society
更加详尽的文献信息和详尽的物质信息
对于苯这个物质,在哪些文献类型
中有过报道
对于苯这个物质,在专利和非专
利文献中的情况
A division of the American Chemical Society
即时跟踪特定研究领域的全球最新动态
A division of the American Chemical Society
永久的信息分享链接
A division of the American Chemical Society
谢谢!
CAS中国代表处
上海市肇嘉浜路798号406
电话: 021-64453167
传真: 021-64155180
Email:[email protected]
A division of the American Chemical Society