Transcript Presentatie array uitleg

Klinische Genetica
Vooraanstaand in erfelijkheidsvraagstukken
Array als test bij invasieve prenatale diagnostiek
Refereeravond RGOC 30 september 2014
Karin Diderich, klinisch geneticus
NIPT
Trisomie 21, 18 en 13
Geen miskraamrisico
NIPT vs. invasieve PND I
Trisomie 21, 18 en 13
RAD
Geen miskraamrisico
Miskraamrisico
Uitslag sneller
NIPT vs. invasieve PND II
Trisomie 21, 18 en 13
Array
Geen miskraamrisico
Miskraamrisico
Uitslag sneller
Van chromosoom naar array
Resolutie: Karyotypering ~5-10Mb => Array ~0,5 Mb
Casus 1
Indicatie voor prenatale diagnostiek: schisis
Amniocentesis bij 21 weken AD
Uitslagen cytogenetica:
RAD: normaal vrouwelijk
karyotypering: 46,XX
Postnataal: bilaterale schisis en dysmorfieën
Consult klinische genetica:
DD Wolf-Hirschhorn syndroom
Wolf-Hirschhorn syndroom
Tyische kenmerken: IUGR, microcephalie, verstandelijke beperking,
aangeboren afwijkingen, gehoorverlies ~40%, epilepsie
Array uitslag
8,3Mb loss in 4p16: Wolf-Hirschhorn syndrome
AMA/ ETS
1330 samples geanalyseerd met 0.5 Mb SNP array na RAD
36/1330 afwijking
2.7%
7/1330
2/1330
6/1330
3/1330
18/1330
0.5%
0.15%
0.5%
0.2%
1.4%
early-onset severe disease
mozaiek Turner/ Klinefelter
CPM
HNPP, a late-onset disorder
SL
Casus 2
Indicatie: 1:81 Down; NT 1.7 mm
Array: 17Mb deletie in 12q21.1q21.33: groeiachterstand,
ontwikkelingsachterstand, milde MR, gedragsproblemen,
hartafwijkingen, dysmorfieën
Casus 3
Indicatie: AMA en 1:31 Down, NT 2.8
Array: 17.3Mb deletie in 13q14.13q21.31: hypotonie,
voedingsproblemen, ontwikkelingsachterstand, dysmorfieën, infecties,
macrocephalie, hypoplastisch corpus callosum, ledemaatsafwijkingen
Casus 4
Indicatie: 1:73 Down, NT 2 mm
Array: mos +i(8)(p10): rib- en wervelafwijkingen, CCA,
ventriculomegalie, hartafwijkingen, ontwikkelingsachterstand,
dysmorfieën
Casus 5
Indicatie: AMA
Array: Mos +i(5)(p10): ontwikkelingsachterstand/ verstandelijke
handicap, epilepsie, spierzwakte, groeiachterstand, hersenafwijkingen,
hand- en voetafwijkingen, dysmorfieën
Casus 6
Indicatie: AMA
Array: arr 15q13.3q22.2(31,188,947-59,055,156)x2 hmz,
15q26.1q26.3(87,181,637-100,338,915)x2 hmz
DNA ondz: Mat UPD 15 passend bij PWS
A
A
B
B
A
B
B
A
A
A
B
B
A
A
B
B
Prader-Willi syndroom
Casus 7
Indicatie: CMV infectie
Array: 1,6 Mb deletie in 7q11.23 > Williams syndrome
Williams syndroom
Casus 8
Indicatie: 1:68 Down, NT 2.5 mm
Array: een afwijkend mannelijk profiel met een 428kb deletie in Xp21.1
de exonen 51 tot 61 van het DMD gen
Spierdystrofie van Duchenne
Frequent voorkomende erfelijke ziekte: 1 op 3500 - 4000 jongens
7 casus (0.5%)
Casus 9
X en Y
NIPT elders:
XO
Vlok
extra (korte arm v/h) Y-chromosoom
XO
XO/cellijn met een isodicentrisch Y chromosoom
RAD:
array CT:
array MCK:
X
Y
X
der(Y)
X
Vroege embryonale ontwikkeling
X
X
Zygote
Trophoblast
(STC vlok)
ICM
Foetus
EEM
(Vruchtwater)
(LTC vlok)
der(Y)
Casus 9
X en Y
NIPT elders:
XO
Vlok
extra (korte arm v/h) Y-chromosoom
XO
XO/cellijn met een isodicentrisch Y chromosoom
RAD:
array CT:
array MCK:
Amnio:
een isodicentrisch chromosoom Y
Navelstrengbloed:
een isodicentrisch chromosoom Y
X
Y
X
der(Y)
X
Casus 9
NIPT elders:
XO
Vlok
XO
XO/cellijn met een isodicentrisch Y chromosoom
array CT:
array MCK:
Navelstrengbloed:
een isodicentrisch chromosoom Y
SNP array prenataal
Zwangeren met indicatie
leeftijd
verhoogd risico ETS (- verdikte NT)
hebben het bevolkingsrisico op microdeleties / microduplicaties.
Detectie extra ziekteveroorzakende genetische afwijkingen: ~1%.
NIPT vs. invasieve PND
Trisomie 21, 18 en 13
RAD, karyogram, array
Geen miskraamrisico
Miskraamrisico
Bij afwijking invasieve PND
Klinische Genetica, prenatale genetica
Laboratoriumspecialisten Klinisch genetici
Psycholoog
Mw. dr. D. van Opstal
Mw. dr. K.E.M. Diderich Mw. dr. S.R. Riedijk
Mw. dr. M. Srebniak
Mw. dr. L.C.P. Govaerts
Mw. dr. F.A.T. de Vries
Mw. dr. A.M.S. Joosten
Dr. R.J.H. Galjaard
Mw. G. G. Oudesluijs
Dr. R.J.H. Galjaard