Transcript 1. Méthodes et techniques

Création de nouveaux cépages,
résistants aux maladies cryptogamiques,
pour s’adapter au contexte environnemental
C Schneider, E Prado, C Onimus, L Ley, D Forget, G Barbeau et D Merdinoglu
INRA Colmar, Bordeaux, Angers
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
Objectifs variétés de Cuve (fixés en 2000)
 Résistance durable au mildiou et à l’oïdium
Géniteurs complémentaires pour les gènes de résistance
 Bonnes aptitudes culturales et qualité du vin
Géniteurs possédant un fonds génétique cultivé majoritaire
 Adaptation aux vignobles français
Géniteurs complémentaires pour la précocité
Gamme de 20 nouvelles variétés (blancs, noirs) pour
2015-2020
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Sources de résistance au mildiou et à l’oïdium
chez les Vitacées
Vitis américains
Vitis asiatiques
Muscadinia rotundifolia
Analyse génétique des résistances
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
QTL de résistance naturelle chez les Vitacées
QTL de résistance au mildiou
QTL de résistance à l’oïdium
Muscadinia rotundifolia (Merdinoglu et al. 2003, 2006)
Regent cv. (Fischer et al. 2004)
Regent cv. (Welter et al. 2007)
Muscadinia rotundifolia (Pauquet et al. 2001)
Vitis amurensis (Blasi et al. 2011)
Christophe Schneider
(Riaz et al. 2011)
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Sélection assistée par marqueurs (SAM)
Plantule 6
semaines
extraction ADN
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Sélection assistée par marqueurs (SAM)
Chr 12
a
d
VMC4f3.1
Parent résistant
c
g
a
spv1
Rpv1
VMC8g9
a
b
e
g
f
g
Chr 12
c
b
VMC4f3.1
c
d
VMC8g9
f
g
e
f
Parent sensible
c
b
a
Parent résistant
b
e
g
e
g
X
c
d
Parent sensible
f
g
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Connaissance du Déterminisme génétique et de
marqueurs moléculaires associés
permet :
1. Choix des géniteurs de résistance
2. Tri précoce des descendants
3. Pyramidage de gènes de résistance
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Performances de la SAM : cas d’une descendance
en ségrégation pour Rpv2
Comportement vis-à-vis du
mildiou (plateforme
phénotypage)
Allèle de résistance aux marqueurs
flanquants
absent
présent
recombinant
Très sensible
à sensible
52 %
0%
3%
Moyennement
résistant
1%
0%
0%
Résistant à
très résistant
0%
43 %
1%
INRA - UMR SVQV 2012
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Sélection assistée par marqueurs pour le
pyramidage de gènes de résistance au mildiou
Croisement :
Parent A (Rpv1 ; -)
X
Parent B (- ; Rpv3)
Chromosome 12
Rpv1- Rpv3
Rpv1 – spv3
Rpv1
Chromosome 18
spv1
spv3
Rpv3
spv1 - Rpv3
spv1 – spv3
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
Plan de croisements pour le pyramidage de gènes
de résistance au mildiou et à l’oïdium = RESDUR
sensible
Vitis vinifera
résistant
4 ou 5 RC
x
F1,
RC1
etc
x
G1
X
Vitis américains
SAM
Variété
résistante
2 + 2 QTL de R
1
SAM
x
F1,
RC1
etc
x
F1,
RC1
etc
x
Muscadinia
rotundifolia
x
X
G2
SAM
X
G3
Variété
résistante
3 + 3 QTL de R
3
Variété
résistante
2 + 2 QTL de R
2
RC : rétro-croisement
SAM : Sélection Assistée
par Marqueurs
Vitis asiatiques
Introgression des QTL de
résistance au mildiou et à
l’oïdium
Christophe Schneider
Géniteurs de
résistance
Programme de
création variétale
TechniLoire 15/11/ 2013
1. Méthodes et techniques
année 1
1 pied
de
RESDUR
semis
Réalisation des croisements
INRA Colmar
Sélection précoce
INRA Colmar
Sélection
assistée par marqueur
: un schéma de sélection
accélérée
:
(SAM)
Années
15 ans
2 : 3 au lieu de 25 Bioessais mildiou/oïdium
Multiplication pour essais vignoble
4 souches x
4 lieux
90 souches
x 2 lieux
Étape 2
INRA
Réseau Resdur
années
4:9
Étape 3
INRA - IFV - Parten.
Réseau national
Résistances/sensibilités
Phénologie, architecture, production
Caractéristiques et qualité du vin
Valeur Agronomique, Technologique et
Environnementale (VATE)
années
10 : 15
Présentation au
Catalogue (CTPS)
Christophe Schneider
TechniLoire 15/11/ 2013
2016
Réseau UE INRA
150 individus
2011
2100 pépins
10 variétés candidates
Source de
résistance
rotundifolia
2M.QTL
de R
Vitis américains
Géniteur
QTL
mildiou
QTL
oïdium
BC4 /BC5
Rpv1
Run1
cv Regent
Rpv3
Ren3
2019
20 variétés candidates
Réseau UE INRA
250 individus
2 QTL de R
2022
6000 pépins
2014
Réseau UE INRA
350 individus
2017
2009
5500 pépins
Série3
2006
(coll. JKI Geilweilerhof)
Série2
2000
série1
2. Evaluation des obtentions de RESDUR
20 variétés candidates
3 QTL de R
2013
Christophe Schneider
6/11/ 2013
2. Evaluation des obtentions de RESDUR
Réseau INRA : Série 1, résistance au mildiou sur feuille
Christophe Schneider
6/11/ 2013
2. Evaluation des obtentions de RESDUR
Réseau INRA : Série 1, évaluation de la qualité des vins
(jury de 12 dégustateurs)
Christophe Schneider
6/11/ 2013
2. Evaluation des obtentions de RESDUR
Réseau INRA : Série 2, époque de maturité
Christophe Schneider
6/11/ 2013
2. Evaluation des obtentions de RESDUR
INRA RESDUR : Bilan 2000 – 2013
50 croisements en 3 séries
14 000 pépins triés par SAM
700 obtentions évaluées dans le réseau INRA RESDUR
10 + ≈ 40 variétés candidates dans le réseau national VATE
12 – 25 variétés présentées à l’inscription entre 2016 et 2023
Christophe Schneider
6/11/ 2013
3. Perspectives d’inscription au catalogue
INRA UR
Resdur INRA UE
Reims
Colmar
Angers
Le réseau national VATE :
partenariat INRA – IFV – org. régionaux
Partenaires rég.
IFV
Bordeaux
Montpellier
Christophe Schneider
6/11/ 2013
3. Perspectives d’inscription au catalogue
Réseau National VATE en 2013 : Nombre de variétés candidates installées
CA33
CA84
Témoins
Merlot
Raisins N
Raisins B
CIVC
INRA
Angers
Grenache Gamay
Chard.
Chard.
Cab franc
Chenin
5
5
3
1
2
/
/
5
5
5
2011
2011/12
2011/12
2012
Plantation 2011
Sicarex
Bj
Soutien financier Ministère Agriculture (A2PV)
Ainsi que :
Château Duvivier + INRA Bordeaux (4 variétés candidates)
Christophe Schneider
6/11/ 2013
Merci pour votre attention
© photo C Schneider