Transcript Proteiners egenskaper och funktion 15p

Preliminärt schema HT 2013.
Proteiners egenskaper och funktion 15p
Kursansvarig: Mikael Oliveberg, Tel: 08 162459. mail: [email protected]
Kursbok: utdelat material. Övrigt: millimeterpapper, linjal och miniräknare.
Lärare:
MO, EG, Jens, Astrid, Stefan N.
Assistenter: Lina, Xin, Ye, Walter.
Lokaler:
Lectures (black text), K 206.
Molecular-graphics sessions (orange), Computer room ?.
Grupparbete, konferens etc (röd text), K 206.
Labbar (blå text), folding labbet.
4/11
v. 1
Mikael
09-12. Grundläggande egenskaper: hur känns det att
klämma på ett protein ?
5/11
6/11
Walter
Ye
Mikael
Walter
Ye
7/11
Mikael
8/11
Walter
Ye
13-16. Introduktion till molekylgrafik. Grupp A.
Enkla strukturelement.
09-12. Kooperativitet. Levinthals paradox.
Stabilitetbestämning.
13-16. Introduktion till molekylgrafik. Grupp B.
Enkla strukturelement.
09-12. Vad motverkar veckning. Varför behövs
sammanhållande krafter ?
09-12. Molekylgrafik. Strukturell evolution. Grupp A + B.
13-16. Datorlab, blast. Grupp A + B.
Gröna datarummet
11/11 v. 2
Lisa
Xin
12/11 Lisa
Xin
Walter
Ye
13/11 Lisa
Xin
Walter
Ye
14/11 Mikael
15/11 Mikael
09-12. Labplanering, proteinstabilitet. Grupp A.
13-16. Labplanering, proteinstabilitet. Grupp B.
09-17. Stabilitetslab, GdmCl denaturering vid jämvikt. A.
13-16. Analys och kurvanpassning, Grupp A. Gröna
datarummet
09-17. Stabilitetslab, GdmCl denaturering vid jämvikt. B.
13-16. Analys och kurvanpassning, Grupp B. Gröna
datarummet
09-12. Svante Arrhenius antagande. Hur proteiner spelar
tärning.
09-12. Chevron plots.
1 (4)
Preliminärt schema HT 2013.
18/11 v. 3
Mikael
Lisa
Xin
19/11 Lisa
Xin
20/11 Lisa
Xin
21/11 Mikael
Lisa
Xin
Ye
Walter
22/11 Mikael
Lisa
Xin
Ye
Walter
Jens
10-12. Labplanering, proteinkinetik. A/B.
13-16. Övningstillfälle med handledare. Gröna datarummet.
09-17. Kinetiklab, Proteinveckning. A.
09-17. Kinetiklab, Proteinveckning. B.
09-12. Molekylgrafik, bestämning av transition-state struktur
Grupp A + B.
13-16. Molekylgrafik, bestämning av transition-state struktur
Grupp A + B.
09-12. Förberedelse av labpresentation.
Gröna datarummet.
13-16. EM lab. Preparation of aggregates A/B.
25/11 v.4
Mikael
Lisa
Xin
Ye
Walter
26/11 Mikael
Ye
Walter
27/11
28/11 Lisa
Jens
29/11
09-12. Labpresentation, Proteinveckning. Paradoxens
lösning.
13-16. EM lab. Preparation of aggregates A/B.
2/12
v. 5
Mikael
3/12
Astrid
9-12. Proteinsjukdomar, ALS.
Individuellt arbete, Proteinsjukdomar.
Röda seminarierummet
09-12. Prioner.
Individuellt arbete, Proteinsjukdomar.
Röda seminarierummet
Individuellt arbete, Proteinsjukdomar. .
Röda seminarierummet
Individuellt arbete, Proteinsjukdomar.
Röda seminarierummet
09-12. PEER REVIEW, Proteinsjukdomar.
Röda seminarierummet
4/12
5/12
6/12
Exam.
Mikael
09-12. ‘Negative-design’. Hur proteiner undviker felveckning
och aggregering.
13-16. Sequence propensities Grupp A + B.
Reserv/inläsning
09-16. EM lab. Preparation of grids and EM A/B.
Reserv/inläsning
2 (4)
Preliminärt schema HT 2013.
9/12
v. 6
EG
Walter
Ye
10/12 EG
Walter
Ye
11/12 EG
12/12 Walter
Ye
13/12 Walter
Ye
16/12 v. 7
Walter
Ye
17/12 Walter
Ye
18/12 Exam.
Walter
Ye
19/12
20/12
09-12. Proteinets liv 1: från syntes till degradering.
Cellens inre miljö, effekter av confined space och crowding.
13-16. Molekylgrafik, Chaperonfunktion Grupp A + B.
Gröna datarummet
09-12. Proteinets liv 2: housekeeping. Chaperoner och
kvalitetskontroll. Hur kan en chaperon katalysera veckningen
av olika proteiner? Hur känner chaperonerna igen sina
proteinsubstrat?
13-16. Övningstillfälle med handledare.
Gröna datarummet
09-16. Grupparbete, övning runt utdelade uppgifter om
housekeeping systemet.
Röda seminarierummet
09-16. Utdelning av hemtenta i Molekylgrafik.
Gröna datarummet
09-16. Hemtentatid. Gröna datarummet
09-16. Hemtentatid. Gröna datarummet
09-16. Hemtentatid. Gröna datarummet
09-16. INLÄMNING AV HEMTENTA. Gröna datarummet
Jullov
Jullov
3 (4)
Preliminärt schema HT 2013.
6/1
v. 8
7/1
8/1
9/1
Reserv/inläsning
Reserv/inläsning
Stefan 09-12. Kemotaxi: från gen till navigerande bakterie.
Introduktion och utdelning av fördjupningsområden.
13-16.Grupparbete, Kemotaxi. Röda seminarierummet.
Stefan 09-16. Grupparbete, Kemotaxi. (planering av konferens).
10/12 Stefan 09-16. Grupparbete, Kemotaxi. (planering av konferens).
13/1
14/1
v.9
Stefan
Stefan
15/1
16/1
17/1
Exam.
09-16. Grupparbete, Kemotaxi. (planering av konferens).
09-15. KONFERENS.
Kemotaxi: från gen till navigerande bakterie.
Reserv/inläsning
Reserv/inläsning
09-14. TENTA. (tentasal)
4 (4)