Transcript PV conseil 26-09-14 - Université de Caen Basse Normandie

EdNBISE
Ecole doctorale Normande
Biologie Intégrative,
Santé, Environnement
PV de la réunion du conseil de l'Ed NBISE du 26 septembre 2014
Présent(e)s: Mme A. KUBRYK, E. LEGRAND. M. L. ADOUI, Y. ANOUAR, M. CASTEX, J-M.
DANGER, F. DAUPHIN, P. DENISE, P. LEROUGE, A. OURRY, V. POCHON, V. RICHARD, L. YON.
Excusés: Mme M. BERNAUDIN, C. SINEL. M. B. LAIGNEL, L. GALAS.
1. Informations générales
L’Université de Caen organise une journée objectifs-moyens le 6 novembre prochain. A cette
occasion, elle a demandé à l’Ed NBISE un bilan des indicateurs pour les années 2011 à 2013. Il
est convenu de transmettre ces indicateurs à la fois pour les universités de Caen et de Rouen pour
une meilleure évaluation du fonctionnement et des performances de l’Ed NBISE.
Suite à la réunion de la Commission des Etudes Doctorales CED du 17 septembre, Patrice
LEROUGE (PL) présente les nouvelles dispositions de la COMUE vis-à-vis des Ed. La CED est
créée en substitution du CIRED. Cette CED est une composante de la COMUE. Sa composition et
ses missions exactes restent à préciser. Des réunions mensuelles auront lieu pour mieux définir
son mode de fonctionnement et ses objectifs. Dans le cadre de sa création, la COMUE demande
au ministère 3 ETP qui viendront en soutien des Ed (gestion, international), ainsi que 6 contrats
doctoraux. Ces contrats doctoraux seront attribués par la CED à des projets de thèse selon des
modalités à définir. Pour l’année 2015, les budgets des Ed seront gérés au niveau de la COMUE.
Par ailleurs, pour le renouvellement des Ed du prochain quinquennat, le dossier de l’Ed,
comprenant le bilan, le projet, le périmètre scientifique et l’équipe de direction, devra être déposé
en mai 2015 auprès de la COMUE. Il sera par la suite évalué au niveau de la CED. En
conséquence, PL propose que lors du conseil de janvier soit abordée la question du porteur de
projet et que la rédaction du bilan soit initiée dès mars–avril 2015.
Matthieu CASTEX, représentant des doctorants, dresse un bilan de l’organisation des
prochaines Journées de l’ED (JED 2015). Ces JED 2015 se dérouleront les 26 et 27 mars 2015 à
la Maison de l’Université de Mont-Saint-Aignan. Elles seront organisées par les doctorants
rouennais. Deux journées seront consacrées aux doctorants avec des sessions de
communications orales, des sessions posters et deux conférences plénières : Gilles BOEUF,
Professeur à
l’UPMC et Président du Muséum national d’histoire naturelle et Joseph
SHOVANEC, Docteur de l’EHESS et Chercheur en Philosophie et en Sciences sociales. Les
conférences et les communications seront ouvertes aux étudiants de Master. Les repas seront pris
au restaurant de l’Ecole Supérieure du Professorat et de l’Education. Le budget Prévisionnel est de
15 000 Euros. Les prévisions de financement reposent à 32% sur les frais d’inscriptions aux JED et
à la soirée festive et à 53% sur le soutien des entreprises, des universités et de l’ADN via
l’association AdBios (Association des Doctorants en Biologie et Santé).
2. Bilan des allocations doctorales 2014
Voir bilan en annexe 1 par Université et origine.
3. Planning de l’année universitaire 2014-2015
Les réunions de rentrée auront lieu le 6 novembre, 14h, à Mont Saint Aignan et le 14 novembre,
14h à Caen. Les prochains conseils de l’Ed NBISE se tiendront le 8 janvier à 14h, à Rouen (OJ:
Lancements des appels à subventions et appel à sujets pour le concours, première discussion sur
l’évaluation de l’Ed NBISE par l’AERES) et le 16 mars à 14h au Havre (OJ : Sélection des sujets
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mis au concours Ed NBISE 2015). Les soutenances à mi-parcours (SMP 2015) sont programmées
le 12 mai et le concours d’attribution des allocations des établissements les 2 et 3 juillet 2015.
4. Modalités des soutenances à mi-parcours
Le conseil décide de modifier les modalités d’organisation des soutenances à mi-parcours (SMP)
pour éviter toute présence de membres du laboratoire dans les jurys d’audition. A compter de
2015, les jurys des SMP seront composés de membres exclusivement externes aux universités de
rattachement des doctorants. Ces SMP se tiendront sur le lieu d’exercice des membres du jury et
en conséquence les doctorants auront à se déplacer. Les frais de déplacements des
doctorants seront pris en charge par l’Ed NBISE sous réserve de l’organisation de co-voiturages.
5. Discussion sur la durée minimale des thèses
Suite à des demandes de soutenances anticipées, la question de la durée minimale d’une thèse
fait l’objet d’un débat. La décision est prise de respecter l'esprit de la réglementation sur la durée
des thèses de Doctorat, soit 3 ans (Article 15, Arrêté du 7 Août 2006), en indiquant que des
ème
dérogations pourraient éventuellement être accordées, uniquement au delà de la 3
inscription
(soit plus de 2 ans de thèse), sur la base d'un dossier de demande de dérogation déposé par le
doctorant. Ces dossiers seront examinés lors des réunions du Conseil de l'Ed NBISE. En
conséquence, les demandes de soutenance anticipées déposées par M. Joachim ALEXANDRE et
Marc-Olivier FICHER et évaluées par François DAUPHIN reçoivent un avis négatif. Par ailleurs,
suite à la demande de soutenance déposée par M. Thomas GABEREL, il lui sera demandé de
déposer auprès du conseil de l’Ed NBISE une demande argumentée de soutenance anticipée.
6. Demandes d’autorisation d'inscription en thèse
Rapport sur la demande d’autorisation d’inscription en thèse déposée par Mme Nadine AbuKaoud (rapporteur : P. LEROUGE)
Mme Nadine ABU-KAOUD a obtenu une Licence en biologie à Calgary (CA) en 2009, puis elle a
rejoint le Qatar pour raison familiale. Depuis cette date, elle occupe un poste de technicienne de
laboratoire dans l’Université américaine Weill Cornell Medical College. Elle travaille depuis deux
ans sous la responsabilité de Jennifer PASQUIER (Research associate). Depuis 2013 : Mme
Nadine ABU-KAOUD suit un Master par correspondance à l’Université Johns Hopkins, USA. Elle a
à cette date non validé ce master. Mme Nadine ABU-KAOUD est co-auteur de 5 publications et est
en premier auteur d’une publication soumise
Le projet thèse de Mme Nadine ABU-KAOUD sera financé par le Qatar et encadré par Frank
LE FOLL, Le Havre et Arash RAFFI, Qatar. Le co-encadrement au Qatar sera assuré par Jennifer
PASQUIER. Le sujet de thèse porte sur l’étude du rôle des cellules endothéliales dans la
résistance des cellules cancéreuses ovariennes à la
chimiothérapie hyperthermique
intrapéritonéale. Les travaux seront réalisés exclusivement au Qatar
A l’heure actuelle, il n’existe ni de doctorat ni de formation à BAC+3 et +5 en biologie au
Qatar. Un suivi régulier sera assuré par Frank LE FOLL qui entretient depuis plusieurs années une
collaboration sur le sujet proposé, collaboration attestées par plusieurs publications communes
avec J PASQUIER sur le sujet.
Après débat, il est convenu que le niveau de formation de la candidate est insuffisant. Le
conseil émet en conséquence un avis réservé.
Rapport sur la demande de dispense de M2R en vue d’une inscription en thèse déposée par
Juliette ALEMANY (rapporteur : A. OURRY)
Mademoiselle Juliette ALEMANY âgée de 22 ans, est titulaire d’un diplôme d’ingénieur,
spécialisation Halieutique de l’ENSAR (Bac+5). Elle a suivi en dernière année un stage de
recherche de 6 mois à EDF, faisant l’objet d’un rapport de stage de niveau équivalent à celui d’un
M2R. Elle sollicite une dispense de M2R en vue de s’inscrire en doctorat au sein de l’UMR CNRS
MNHN BOREA, sous la direction du Pr Jean Paul ROBIN et en bénéficiant d’une allocation de
thèse co-financée par le CRBN et l’IFREMER. Son expérience de la recherche (halieutique et
méthodes statistiques) est en parfaite adéquation avec le sujet de thèse proposé :
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« Développement d’un cadre Bayésien pour les méthodes d’évaluation de stocks de données
limitées et propositions de scénarios de gestion. Application à deux cas d’études, la seiche (sepia
officinalis) et le lieu jaune (Pollachius pollachius) »
Le Conseil de l’EdN BISE émet un avis favorable à cette demande.
Rapport sur la demande de dérogation en vue d’une inscription supplémentaire en thèse
déposée par Oualid BOUGZALA (rapporteur : A. OURRY)
M. O. BOUGZALA souhaite obtenir une dérogation pour une inscription supplémentaire en thèse
au sein de l’EA ABTE et sous la direction du Pr R. MOSRATI. Ce dernier précise les différentes
difficultés auxquelles M. BOUGZALA a du faire face : difficulté relative à la mise en place d’une cotutelle de thèse, retard des travaux expérimentaux liés à l’absence d’approvisionnement d’un
fournisseur, changement de directeur de thèse lié à un départ à la retraite, changement d’école
doctorale, difficulté familiale l’ayant empêché de s’inscrire en 2013… Le dossier fourni comporte
cependant un projet de manuscrit de thèse d’environ 150 pages, un manuscrit de publication en
cours de soumission et un engagement de soutenance pour l’année universitaire 2014-2015.
Le Conseil de l’EdN BISE émet un avis favorable à cette demande, mais indique qu’il s’agira
de la dernière dérogation accordée.
Mme Lin Lin MA souhaite obtenir une dérogation pour une inscription supplémentaire en thèse au
sein de l’unité COMETE sous la direction du Pr. Antoine COQUEREL. Ce dernier précise les
difficultés auxquelles Mme MA a du faire face : difficultés linguistiques, difficultés familiales l’ayant
er
empêché de s’inscrire en 2013. Le dossier fourni comporte deux publications (1 en 1 auteur et 1
ème
en 2
auteur), un projet de publication supplémentaire ainsi qu’un engagement de soutenance au
plus tard en avril 2015.
Le Conseil de l’EdN BISE émet un avis favorable à cette demande, mais indique qu’il s’agira
de la dernière dérogation accordée.
7. Questions diverses.
Rapport sur la demande de subvention pour la prise en charge des déplacements et
logement des membres d’un jury de thèse dans le cadre d’une co-tutelle de thèse avec le
Brésil (rapporteur : A. OURRY)
Cette demande déposée par Mme Christelle Delalande MCU, HDR au sein de l’EA OERECA
concerne la soutenance de thèse d’Ana Paula ZANATTA qui doit soutenir son doctorat au sein de
l’Université de Santa Catarina au Brésil, lors de la prochaine année universitaire. Le Conseil
indique que les frais de soutenance de thèse ne sont usuellement pas pris en charge par l’ED, et
précise que dans le cadre d’une co-tutelle, ces coûts supplémentaires devraient être envisagés et
répartis entre les unités de recherche concernées lors de la négociation de la convention de cotutelle. Le conseil émet donc un avis défavorable à cette demande.
François DAUPHIN expose la situation d’une doctorante dont le directeur de thèse est parti du
laboratoire il y a deux ans. Le conseil rappelle qu’il est de la responsabilité du directeur de
laboratoire de désigner un nouveau directeur de thèse (éventuellement dans le cadre d’une codirection) pour que la soutenance puisse avoir lieu.
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Annexe 1 :
BILAN ALLOCATIONS DOCTORALES – 2014
Allocations Université de Caen (9)
Clément ANFRAY - Mise en place d’une stratégie de surexpression de gènes inductibles par
l’hypoxie dans des cellules vectrices : application à l’inhibition de l’érythropoïétine (EPO) dans les
glioblastomes. UMR 6301. Dirs : S. VALABLE et K. BORDJI.
Emmanuelle FLEUROT - Propriétés anti-métastatiques et interactions du syndécane-1 et des
récepteurs des œstrogènes dans des lignées de cellules mésothéliales pleurales malignes et
tumorales mammaires humaine. EA 2608. Dir : Jérome LEVALLET.
Hélène PARTY - Rôle de l’activateur tissulaire du plasminogène (tPA) dans les processus de type
anxieux. U 919. Dir : Véronique AGIN.
Elise TASSET - Services agronomiques et écosystémiques des prairies de marais : quantification,
déterminisme et pilotage. UMR 950. Dir : Philippe LAINE.
Eva LHUISSIER - Chondrosarcomes : physiopathologie et thérapies innovantes. EA 4652. Dir :
Catherine BAUGE.
Siham HEDIR - Evaluation préclinique du potentiel thérapeutique de molécules inhibitrices de Mcl-1
au sein de la famille des oligopyridines pour le traitement des cancers de l’ovaire chimiorésistants. EA
4656. Dir : Laurent POULAIN.
Frédéric BRIEND - Déterminants anatomiques et métaboliques du déficit de la cognition sociale des
patients souffrant de schizophrénie : étude en imagerie cérébrale multimodale et impact de la
stimulation transcrânienne. UMR 6301. Dir : S. DOLLFUS.
Loïc LEGER - Stress, bactéricidie et virulence chez les entérocoques d’intérêt clinique. EA 4355. Dir :
A. BENACHOUR.
Patrick MORDEL - Impact de la variabilité glycémique sur la fonction mitochondriale cardiaque après
ischémie / reperfusion : étude cellulaire et chez la souris. EA 4650. Dir : Stéphane ALLOUCHE.
Allocations Université de Rouen (6)
Kilan LE GUENNEC - Identification par séquençage d’exome et caractérisation fonctionnelle de
mutations dans les formes précoces de maladie d’Alzheimer. U 1079. Dir : Dominique CAMPION.
Aurélien QUILLET - Rôle des microARN dans le contrôle de la sécrétion des catécholamines par les
phéochromocytomes. U 982. Dir : Laurent YON.
Ophélie CARMON - Rôle de la chromogranine A dans la régulation de la sécrétion des peptides :
identification de ses partenaires moléculaires lors de la biogenèse des granules de sécrétion. U 982.
Dir : Maïté MONTERO.
Marie NICOLLE - Variabilité climatique dans la zone Arctique-Nord Atlantique depuis les derniers
millénaires jusqu’à présent à partir d’enregistrements arctiques : Répartition géographique et forçages.
UMR 6143. Dir : Nicolas MASSEI.
Séverine NOBIS - Identification de facteurs impliqués dans la physiopathologie des troubles
intestinaux dans un modèle murin d'anorexie. U 1076. Dir : Moïse COEFFIER.
Léa DUPATY - Contrôle des réponses immunitaires dirigées contre les antigènes d’expression
musculaire dans le cadre de la thérapie génique par vecteur rAAV. U 905. Dir : Sahil ADRIOUCH.
Allocations Université du Havre (1)
Alexandre ERRAUD - Evaluation de l’atteinte à la fertilité chez les crustacés mâles en milieux
anthropisés. LEMA. Dir: J. FORGET-LERAY.
Allocations Région Haute Normandie
Allocations financées à 100% par le CRHN (13)
Julien SEVESTRE - Evaluation de l’impact de l’expression de la protéine de liaison au facteur H par
les souches de portage de Neisseria meningitidis et conséquences sur la virulence et l'effet protecteur
des nouveaux vaccins recombinants. EA 2656 GRAM. Dir : François CARON.
Estelle DUPEL - Développement de nouvelles stratégies d’immunothérapie cellulaire adoptive antitumorale basées sur l’utilisation de cellules présentatrices d’antigène artificielles. U INSERM 1079.
Dirs : Thierry FREBOURG et Jean-Baptiste LATOUCHE.
Auriane CORBIERE - Recherche de peptides impliqués dans le développement du cortex
cérébelleux. U INSERM 982. Dir : David VAUDRY.
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Karim ATMANI - Modulation neuro-gliale associée à la sensibilisation croisée des organes pelviens :
Effet sur la nociception viscérale. U INSERM1073. Dir : Guillaume GOURCEROL.
Cécile LEGER - Conséquences des altérations de l’angiogenèse corticale par une alcoolisation in
utero sur la mise en place des interneurones GABAergiques chez la Souris Gad67-GFP. INSERM ERI
28. Dir : Bruno Gonzalez.
Karima ALIM - Etudes moléculaires du système 26RFa-GPR103. U INSERM 982. Dir : Jérôme
LEPRINCE
Mathias GALLIQUE - Impact du Système de Sécrétion de Type 6 d'une souche avirulente de
Pseudomonas fluorescens sur la colonisation bactérienne et le microbiote cutané. EA 4312 Dir :
Annabelle MERIEAU.
Djibrilla SALEY - Hydrogéophysique et modélisation des écoulements dans la couverture de
l’aquifère karstique de la craie en Haute Normandie. UMR CNRS 6143. Dir: Jean-Paul DUPONT
Flavie DRUINE - Flux sédimentaires en estuaire de Seine : quantification et variabilité multi-échelle
sur la base de mesure de turbidité. UMR CNRS 6143. Dir: Robert LAFITE.
Antonin Van EXEM - Enregistrements à haute résolution des changements environnementaux dans
les archives continentales par imagerie hyperspectrale. UMR CNRS 6143. Dir: Benoit LAIGNEL.
Arnaud VENNIN - Étude de l’interface eau-sédiment dans des géosystèmes aquatiques : approche
couplée géochimie et modélisation pour l’évaluation des flux de nutriments (C, N, P). UMR CNRS
6143. Dir: Valérie MESNAGE.
Andréa CHANE - Activation et conditionnement de l¹agent de lutte biologique Rhodococcus
erythropolis. EA 4312. Dir: Xavier LATOUR
Romain CASTILLEUX - Etude du Rôle des protéoglycannes de type extensine dans la réponse
immunitaire et l'induction de la résistance chez les plantes. EA 4358. Dirs : Azeddine DRIOUICH et
Maïté VICRE-GIBOUIN.
Matthieu PAIOLA – UMR I-02 SEBIO. Dir Jean-Michel DANGER.
Allocations financées à 50% par le CRHN (4)
Ahmed KARAOUI – Etude par inhalation chez le rat des effets cardiovasculaires du NO seul et en
mélange avec les gaz d’échappements de moteurs Diésel. EA 4651. Dir : Christelle MONTEIL. Cofinancement : ADEME.
Mickaël SAVARY – Modélisation et prévision de l’hydrodynamique et de la réponse turbide d’une
source karstique par apprentissage statistique. UMR CNRS 6143. Dirs : Jean-Paul DUPONT et
Nicolas MASSEI. Co-financement : Agence de l’Eau Seine Normandie.
Mahmoud HOUSSARI – Impact de la lymphangiogenèse cardiaque sur l’inflammation post infarctus.
U INSERM 1096. Dir : Ebba BRAKENHIELM. Co-financement : INSERM.
Benjamin PORET – Développement d’un agent théranostique basé sur un neuropeptide vasoactif. EA
4108 et U INSERM 982. Dirs Pierre VERA et Pierrick GANDOLFO. Co-financement : Centre
BECQUEREL
Khaled HORRY –. UMR I-02 SEBIO Dir Jean Michel DANGER. Co-financement : IFREMER
Allocations Région Basse Normandie
Allocations financées à 100% par le CRBN (2)
Maxime ENDRESS : Etude structurale et fonctionnelle des différents niveaux de régulation de la
ponte chez les mollusques marins : approche comparée chez deux modèles exploités en BasseNormandie, la seiche Sepia Officinalis et l’huitre creuse C. gigas ; UMR BOREA (Directeur de thèse :
Joël HENRY)
Sophie LENOIR : Influence de la signalisation tPA et récepteur NMDA au cours des accidents
vasculaires cérébraux : potentiel thérapeutique d’un anticorps bloquant de cette signalisation,
Glunomab® ; U919 INSERM (Directeur de thèse : Denis VIVIEN)
Allocations co-financées à 100% par le CRBN (10)
Antoine ANFRAY : Réorganisation des réseaux neuronaux consécutive à un accident vasculaire
cérébral : influence du tPA sur le couplage neurovasculaire dans une étude de la connectivité
cérébrale par IRM fonctionnelle ; U919 INSERM (Directeur de thèse : Cyrille ORSET). Co-financement
Institut de Recherche SERVIER
Aurore RAOUX : Approche écosystémiques des ERM : étude des impacts sur le réseau trophique de
la construction et de l’exploitation du champ d’éoliennes de Courseulles-sur-Mer et des cumuls
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d’impact ; UMR BOREA (Directeurs de thèse : Nathalie NIQUIL, Jean-Claude DAUVIN). En attente de
cofinancement par l’Institut France Energie Marine
Antoine FOURNIER : Influence de la signalisation tPA et récepteur NMDA au cours de la sclérose en
plaques : potentiel thérapeutique d’un anticorps bloquant de cette signalisation, Glunomab® ; U919
INSERM (Directeur de thèse : Fabian DOCAGNE). Co-financement Païon GmbH
Juliette ALEMANY : Développement d’un cadre Bayésien pour les méthodes d’évaluation de stocks
de données limitées et propositions de scénarios de gestion. Application à deux cas d’études, la
seiche (sepia officinalis) et le lieu jaune (Pollachius pollachius) ; UMR BOREA (Directeur de thèse :
Jean-Paul ROBIN). Co-financement IFREMER
Clémence RIVA : Recherche de nouveaux traitements anti-varroas ; CERMN (Directeur de thèse :
Marie-Pierre HALM-LEMEILLE). Co-financement VETO-PHARMA
Arora VINEET : Effets d’une thérapie matricielle associée ou non à une thérapie cellulaire sur les
dommages cérébraux et les déficits fonctionnels après une ischémie cérébrale chez le rat ; UMR 6301
CNRS ISTCT (Directeurs de thèse : Myriam BERNAUDIN et Omar TOUZANI). Co-financement OTR3
Marie-Laure BONNEFOND : Rôle de la signalisation calcique dans la sensibilisation des cancers
ovariens chimio-résistants aux stratégies anti-Bcl-XL ; EA4656 BioTICLA (Directeur de thèse : Pascal
GAUDUCHON). Co-financement Centre de Lutte contre le Cancer François Baclesse
Caitlin O’BRIEN : Effets du stress prénatal sur le développement précoce des comportements chez la
seiche (Sepia officinalis) : EA4259 GMPc (Directeur de thèse : Ludovic DICKEL). Co-financement
ANR
Elodie CHEVALIER : Place de la signalisation Hippo dans l’histoire naturelle du mésothéliome pleural
malin (MPM) : dissection de ses rôles dans les lignées mésothéliales pleurales humaines et
application à la caractérisation moléculaire des 445 patients atteints de MPM inclus dans l’essai
clinique de phase 3 « MAPS » ; U1086 INSERM (Directeurs : Gérard ZALCMAN et Guénaëlle
LEVALLET). Co-financement par l’Association des Insuffisants Respiratoires (AIR).
Maroua BELGHALI : La performance en situation de double tâche est-elle un prédicteur de la réserve
cognitive ? Une étude de l'hétérogénéité des stratégies comportementales et neurales chez la
personne âgée ? UMR 1075 COMETE INSERM & UCBN (Directeur de thèse : Damien DAVENNE).
Co-financement INSERM.
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