タイトル - 長崎大学熱帯医学研究所

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Transcript タイトル - 長崎大学熱帯医学研究所

PTLV-1の起源と進化
~ニホンザルに感染してるSTLV-1の系統学的位置の解明 ~
氏名:307102 塚田幸絵
所属:熱帯医学研究所 国際保健学分野
担当教員:江口克之、山本太郎
背景
霊長類T細胞白血病ウイルス1型(PTLV-1)はアフリカ、ア
ジアに分布する真猿類のサル、類人猿、ヒトのT細胞
に感染するレトロウイルス。
• サル、類人猿を自然宿主とするウイルスは
サルT細胞白血病ウイルス1型(STLV-1)
• ヒトを宿主とするウイルスは
成人T細胞白血病ウイルス(HTLV-1)
と便宜的に分類されている。
既知のSTLV-1とHTLV-1はenv、pX、LTRの各遺伝子領域
でほぼ90%の相同性を示すほど非常に近縁である。
でもね、、、
日本内におけるPTLV-1の比較
ニホンザルのSTLV-1
HTLV-1
• 陽性率が群れによって • 陽性率は数%
は50%を超える
• 主要な感染経路は垂
• 青年期以降の水平感 直感染
染が頻繁に起こる
• キャリアは西南日本に
• キャリアは全国各地に 集中
分布
目的
ニホンザルの
STLV-1と
ヒトのHTLV-1の
感染自然史の違
いを理解するため
の一助として、、、
⇒
ニホンザルの
STLV-1とHTLV1の系統学的な
関係性を明らか
にする
PTLV-1の遺伝子構造
5’-LTR-ψ-gag-pol-env-LTR-3'
総塩基数は約9000塩基
LTR(反復配列)
ψ (RNA ゲノムがウィルス粒子内に取り込まれるのに
必要なパッケージングシグナル)
• 本研究では、PTLV-1に属する比較的遠縁なウィルス株の系
統関係の解明を目指しているため進化速度が比較的遅いと
考えられているpol領域の一部(1502塩基)を解析対象とした
。
対象と方法
1. 福井県内で捕獲されたSTLV-1陽性ニホンザル6個体の
末梢血からDNAを抽出。
2. それらのDNAについて、pol領域の一部1502塩基をPCR
法によって増幅。
3. Exosap処理したPCR 産物はサイクルシークエンス反応に
供し、塩基配列を読み取る。
4. 得られた配列をDNA Baserを用いて照合することにより、
1200~1500塩基長の配列を決定。
5.決定された配列をGenBankに登録されているPTLV-1株
の配列とともに、最尤法により系統解析した。
結果
HTLV-1 USA
HTLV-1 日本
HTLV1 中国
84
HTLV-1 ブラジル
HTLV1
100
99 HTLV-1 カリブ
STLV-1
22
100 STLV-1 中央アフリカ
89 STLV-1 ニホンザル富山1
87
STLV-1 ニホンザル富山4
100
98
STLV-1 ニホンザル富山226
HTLV-1 メラネシア亜型
STLV-1 スラウェシ
95
ニホンザルのSTLV-1はHTLV-1と
1つのグループを形成している。
100
69
99
100
HTLV4
HTLV04
99 HTLV002
HTLV2
STLV02
100
STLV2
STLV03
STLV3
100
HTLV3Pyl
89
99
HTLV3Lobak
79
STLV1
AY590142
0.1
黒字:HTLV-1
赤字:STLV-1
HTLV-1 USA(AF139170)
95
HTLV-1 日本(J02029)
HTLV1中国
84
HTLV-1 ブラジル(AY563954)
HTLV1
100
99
HTLV-1 カリブ( D13784)
STLV01
22
100
STLV-1 中央アフリカ(AF074966)
89
87
ニホンザル(toyama1)
ニホンザル(toyama4)
100
ニホンザル(toyama226)
HTLV-1 メラネシア亜型(L02534)
STLV-1 スラウェシ(Z46900)
0.02
•STLV-1株同士が一つのまとまりを作らない。
•日本に存在するHTLV-1とSTLV-1はPTLV-1群の中でかなり遠い位置にある。
Toyama1との比較(%)
STLV-1
11.56
(158)
11.78
(161)
HTLV-1
10.46
(143)
10.24
(140)
10.46
(143)
10.53
(144)
toyama
10.75
(147)
10.46
(143)
0.29
(4)
1.02
(14)
※Pol領域1367塩基中における結果
結論
• ニホンザルのSTLV-1はHTLV-1と1つのグルー
プ(PTLV-1群)を形成している。
• STLV-1株同士が一つのまとまりを作らない。
• PTLV-1群の中では、日本に存在するHTLV-1と
STLV-1はかなり遠い位置にある。
• PTLV-1の中で、系統によって進化速度が違う
可能性が示唆された。
謝辞
• この研究をするにあたり、研究する機会を頂
いた山本太郎先生、何から何まで御助言を
頂いた江口克之先生に深く御礼申し上げま
す。
打ち上げ楽しみです!!